MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	ATTC	2	8	536	543	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
2	NC_011603	CAGT	2	8	622	629	25 %	25 %	25 %	25 %	215276193
3	NC_011603	CTCA	2	8	661	668	25 %	25 %	0 %	50 %	215276193
4	NC_011603	CATT	2	8	1081	1088	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
5	NC_011603	GCCA	2	8	1144	1151	25 %	0 %	25 %	50 %	215276193
6	NC_011603	GTCT	2	8	2683	2690	0 %	50 %	25 %	25 %	215276194
7	NC_011603	TTGA	2	8	2691	2698	25 %	50 %	25 %	0 %	215276194
8	NC_011603	AACC	2	8	2933	2940	50 %	0 %	0 %	50 %	215276194
9	NC_011603	ACAG	2	8	3859	3866	50 %	0 %	25 %	25 %	215276196
10	NC_011603	ATTC	2	8	6046	6053	25 %	50 %	0 %	25 %	215276197
11	NC_011603	CCGT	2	8	6369	6376	0 %	25 %	25 %	50 %	215276197
12	NC_011603	TTCT	2	8	6448	6455	0 %	75 %	0 %	25 %	215276197
13	NC_011603	AAAT	2	8	6654	6661	75 %	25 %	0 %	0 %	215276198
14	NC_011603	GTGA	2	8	6934	6941	25 %	25 %	50 %	0 %	215276198
15	NC_011603	AACG	2	8	7944	7951	50 %	0 %	25 %	25 %	215276199
16	NC_011603	TCGA	2	8	8138	8145	25 %	25 %	25 %	25 %	215276199
17	NC_011603	GGTT	2	8	8429	8436	0 %	50 %	50 %	0 %	215276199
18	NC_011603	GCAT	2	8	8505	8512	25 %	25 %	25 %	25 %	215276199
19	NC_011603	TAAA	2	8	8555	8562	75 %	25 %	0 %	0 %	215276199
20	NC_011603	GGGT	2	8	8866	8873	0 %	25 %	75 %	0 %	215276200
21	NC_011603	ATGA	2	8	8953	8960	50 %	25 %	25 %	0 %	215276200
22	NC_011603	CCTG	2	8	9081	9088	0 %	25 %	25 %	50 %	215276200
23	NC_011603	GCAG	2	8	9106	9113	25 %	0 %	50 %	25 %	215276200
24	NC_011603	TAGT	2	8	10071	10078	25 %	50 %	25 %	0 %	215276201
25	NC_011603	GATG	2	8	10231	10238	25 %	25 %	50 %	0 %	215276201
26	NC_011603	TGAT	2	8	11061	11068	25 %	50 %	25 %	0 %	215276202
27	NC_011603	ATTA	2	8	11427	11434	50 %	50 %	0 %	0 %	215276202
28	NC_011603	CATG	2	8	11590	11597	25 %	25 %	25 %	25 %	215276203
29	NC_011603	CAAT	2	8	11833	11840	50 %	25 %	0 %	25 %	215276203
30	NC_011603	GTAA	2	8	11856	11863	50 %	25 %	25 %	0 %	215276203
31	NC_011603	TCAG	2	8	11975	11982	25 %	25 %	25 %	25 %	215276204
32	NC_011603	TTGT	2	8	12097	12104	0 %	75 %	25 %	0 %	215276204
33	NC_011603	ATGT	2	8	12710	12717	25 %	50 %	25 %	0 %	215276205
34	NC_011603	TTCC	2	8	12918	12925	0 %	50 %	0 %	50 %	215276205
35	NC_011603	TATT	2	8	13036	13043	25 %	75 %	0 %	0 %	215276206
36	NC_011603	CAGC	2	8	15919	15926	25 %	0 %	25 %	50 %	215276208
37	NC_011603	CAGG	2	8	16017	16024	25 %	0 %	50 %	25 %	215276208
38	NC_011603	AAGA	2	8	17311	17318	75 %	0 %	25 %	0 %	215276210
39	NC_011603	ATTA	2	8	17442	17449	50 %	50 %	0 %	0 %	215276210
40	NC_011603	TATT	2	8	17602	17609	25 %	75 %	0 %	0 %	215276210
41	NC_011603	TTGG	2	8	17887	17894	0 %	50 %	50 %	0 %	215276210
42	NC_011603	AGAA	2	8	18070	18077	75 %	0 %	25 %	0 %	215276211
43	NC_011603	GATG	2	8	18087	18094	25 %	25 %	50 %	0 %	215276211
44	NC_011603	GCAA	2	8	18360	18367	50 %	0 %	25 %	25 %	215276211
45	NC_011603	TTCT	2	8	18409	18416	0 %	75 %	0 %	25 %	215276211
46	NC_011603	ATAA	2	8	29894	29901	75 %	25 %	0 %	0 %	215276213
47	NC_011603	ACTG	2	8	30069	30076	25 %	25 %	25 %	25 %	215276214
48	NC_011603	CAGA	2	8	30122	30129	50 %	0 %	25 %	25 %	215276214
49	NC_011603	CTGT	2	8	31429	31436	0 %	50 %	25 %	25 %	215276215
50	NC_011603	GTCG	2	8	31525	31532	0 %	25 %	50 %	25 %	215276215
51	NC_011603	GGTA	2	8	31569	31576	25 %	25 %	50 %	0 %	215276215
52	NC_011603	TCTG	2	8	32514	32521	0 %	50 %	25 %	25 %	215276216
53	NC_011603	AAAG	2	8	33641	33648	75 %	0 %	25 %	0 %	215276218
54	NC_011603	CTGT	2	8	33717	33724	0 %	50 %	25 %	25 %	215276218
55	NC_011603	GGCG	2	8	33896	33903	0 %	0 %	75 %	25 %	215276218
56	NC_011603	GCAG	2	8	34009	34016	25 %	0 %	50 %	25 %	215276218
57	NC_011603	GCTG	2	8	34104	34111	0 %	25 %	50 %	25 %	215276218
58	NC_011603	GGAA	2	8	34330	34337	50 %	0 %	50 %	0 %	215276218
59	NC_011603	TCTG	2	8	34596	34603	0 %	50 %	25 %	25 %	215276219
60	NC_011603	GGCA	2	8	34686	34693	25 %	0 %	50 %	25 %	215276219
61	NC_011603	TTCA	2	8	35641	35648	25 %	50 %	0 %	25 %	215276220
62	NC_011603	GCTG	2	8	35688	35695	0 %	25 %	50 %	25 %	215276220
63	NC_011603	ACCC	2	8	35745	35752	25 %	0 %	0 %	75 %	215276220
64	NC_011603	ATAC	2	8	35789	35796	50 %	25 %	0 %	25 %	215276220
65	NC_011603	TTCC	2	8	36012	36019	0 %	50 %	0 %	50 %	215276220
66	NC_011603	GGCC	2	8	36265	36272	0 %	0 %	50 %	50 %	215276221
67	NC_011603	CAGC	2	8	36316	36323	25 %	0 %	25 %	50 %	215276221
68	NC_011603	AGGC	2	8	36324	36331	25 %	0 %	50 %	25 %	215276221
69	NC_011603	CAGC	2	8	37415	37422	25 %	0 %	25 %	50 %	215276222
70	NC_011603	CCTG	2	8	37657	37664	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
71	NC_011603	TCCG	2	8	38040	38047	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
72	NC_011603	ACCG	2	8	39078	39085	25 %	0 %	25 %	50 %	215276222
73	NC_011603	CAGG	2	8	39893	39900	25 %	0 %	50 %	25 %	215276222
74	NC_011603	GCCC	2	8	39913	39920	0 %	0 %	25 %	75 %	215276222
75	NC_011603	TCGC	2	8	40020	40027	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
76	NC_011603	CCGG	2	8	40049	40056	0 %	0 %	50 %	50 %	215276222
77	NC_011603	CCAG	2	8	40253	40260	25 %	0 %	25 %	50 %	215276222
78	NC_011603	GCGA	2	8	40754	40761	25 %	0 %	50 %	25 %	215276222
79	NC_011603	TGCG	2	8	41260	41267	0 %	25 %	50 %	25 %	215276222
80	NC_011603	ACCA	2	8	41514	41521	50 %	0 %	0 %	50 %	215276222
81	NC_011603	GTCC	2	8	41783	41790	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
82	NC_011603	TCCG	2	8	41982	41989	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
83	NC_011603	CAGC	2	8	43894	43901	25 %	0 %	25 %	50 %	215276225
84	NC_011603	GGAT	2	8	44019	44026	25 %	25 %	50 %	0 %	215276225
85	NC_011603	CAGA	2	8	44470	44477	50 %	0 %	25 %	25 %	215276225
86	NC_011603	GTCA	2	8	44578	44585	25 %	25 %	25 %	25 %	215276225
87	NC_011603	CTGA	2	8	44968	44975	25 %	25 %	25 %	25 %	215276225
88	NC_011603	GATT	2	8	45307	45314	25 %	50 %	25 %	0 %	215276226
89	NC_011603	TAAC	2	8	46038	46045	50 %	25 %	0 %	25 %	215276227
90	NC_011603	ATAA	2	8	46115	46122	75 %	25 %	0 %	0 %	215276227
91	NC_011603	CATA	2	8	46234	46241	50 %	25 %	0 %	25 %	215276227
92	NC_011603	AGTG	2	8	46534	46541	25 %	25 %	50 %	0 %	215276227
93	NC_011603	ATCA	2	8	46576	46583	50 %	25 %	0 %	25 %	215276228
94	NC_011603	TATT	2	8	46646	46653	25 %	75 %	0 %	0 %	215276228
95	NC_011603	ACTG	2	8	47688	47695	25 %	25 %	25 %	25 %	215276228
96	NC_011603	CATC	2	8	47847	47854	25 %	25 %	0 %	50 %	215276228
97	NC_011603	CTGC	2	8	48008	48015	0 %	25 %	25 %	50 %	215276228
98	NC_011603	GGAC	2	8	48300	48307	25 %	0 %	50 %	25 %	215276228
99	NC_011603	CTGG	2	8	48559	48566	0 %	25 %	50 %	25 %	215276228
100	NC_011603	TTCA	2	8	49360	49367	25 %	50 %	0 %	25 %	215276228
101	NC_011603	CTCC	2	8	49375	49382	0 %	25 %	0 %	75 %	215276229
102	NC_011603	GCGG	2	8	49416	49423	0 %	0 %	75 %	25 %	215276229
103	NC_011603	GAAC	2	8	50457	50464	50 %	0 %	25 %	25 %	215276229
104	NC_011603	CCCT	2	8	50747	50754	0 %	25 %	0 %	75 %	215276230
105	NC_011603	ATCC	2	8	51193	51200	25 %	25 %	0 %	50 %	215276231
106	NC_011603	ATCC	2	8	51418	51425	25 %	25 %	0 %	50 %	215276231
107	NC_011603	CCTG	2	8	51726	51733	0 %	25 %	25 %	50 %	215276232
108	NC_011603	CATT	2	8	52378	52385	25 %	50 %	0 %	25 %	215276234
109	NC_011603	TATT	2	8	52476	52483	25 %	75 %	0 %	0 %	215276234
110	NC_011603	ATTT	2	8	53600	53607	25 %	75 %	0 %	0 %	215276236
111	NC_011603	GTCA	2	8	53739	53746	25 %	25 %	25 %	25 %	215276237
112	NC_011603	CCTG	2	8	53980	53987	0 %	25 %	25 %	50 %	215276238
113	NC_011603	CAGA	2	8	54252	54259	50 %	0 %	25 %	25 %	215276238
114	NC_011603	GTTT	2	8	54305	54312	0 %	75 %	25 %	0 %	215276238
115	NC_011603	CAGG	2	8	54703	54710	25 %	0 %	50 %	25 %	215276238
116	NC_011603	TGAC	2	8	54801	54808	25 %	25 %	25 %	25 %	215276238
117	NC_011603	CAGT	2	8	55028	55035	25 %	25 %	25 %	25 %	215276238
118	NC_011603	AAGT	2	8	55135	55142	50 %	25 %	25 %	0 %	215276238
119	NC_011603	ATGA	2	8	55492	55499	50 %	25 %	25 %	0 %	215276238
120	NC_011603	GTCC	2	8	56899	56906	0 %	25 %	25 %	50 %	215276240
121	NC_011603	CGTC	2	8	57135	57142	0 %	25 %	25 %	50 %	215276240
122	NC_011603	CTGA	2	8	57256	57263	25 %	25 %	25 %	25 %	215276240
123	NC_011603	GACG	2	8	57774	57781	25 %	0 %	50 %	25 %	215276241
124	NC_011603	GGCT	2	8	58168	58175	0 %	25 %	50 %	25 %	215276242
125	NC_011603	GACG	2	8	59060	59067	25 %	0 %	50 %	25 %	215276243
126	NC_011603	GCCA	2	8	59297	59304	25 %	0 %	25 %	50 %	215276243
127	NC_011603	GGTG	2	8	59674	59681	0 %	25 %	75 %	0 %	215276243
128	NC_011603	GCAG	2	8	59814	59821	25 %	0 %	50 %	25 %	215276243
129	NC_011603	ACGG	2	8	60032	60039	25 %	0 %	50 %	25 %	215276243
130	NC_011603	ACCA	2	8	60733	60740	50 %	0 %	0 %	50 %	215276243
131	NC_011603	TCAT	2	8	60878	60885	25 %	50 %	0 %	25 %	215276243
132	NC_011603	GACT	2	8	61206	61213	25 %	25 %	25 %	25 %	215276244
133	NC_011603	ATTT	2	8	61351	61358	25 %	75 %	0 %	0 %	215276244
134	NC_011603	TTAA	2	8	61569	61576	50 %	50 %	0 %	0 %	215276245
135	NC_011603	CGGA	2	8	61832	61839	25 %	0 %	50 %	25 %	215276245
136	NC_011603	AAAG	2	8	62064	62071	75 %	0 %	25 %	0 %	215276245
137	NC_011603	ATTT	2	8	62291	62298	25 %	75 %	0 %	0 %	215276246
138	NC_011603	GCAT	2	8	62569	62576	25 %	25 %	25 %	25 %	215276247
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.