MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	TCC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215276193
2	NC_011603	GAA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276193
3	NC_011603	GAA	2	6	428	433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276193
4	NC_011603	TGC	3	9	834	842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276193
5	NC_011603	AGC	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276193
6	NC_011603	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215276193
7	NC_011603	ATG	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
8	NC_011603	CTC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215276193
9	NC_011603	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
10	NC_011603	TAC	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276194
11	NC_011603	ACA	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276194
12	NC_011603	CAT	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276194
13	NC_011603	GCT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
14	NC_011603	CTG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
15	NC_011603	TAA	2	6	3434	3439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276195
16	NC_011603	TAT	2	6	3497	3502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276195
17	NC_011603	GAT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276195
18	NC_011603	ACT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276195
19	NC_011603	TTA	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276195
20	NC_011603	GAA	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
21	NC_011603	ATT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276196
22	NC_011603	TGA	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
23	NC_011603	ATC	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
24	NC_011603	ATC	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
25	NC_011603	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276196
26	NC_011603	AGT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
27	NC_011603	TCT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276196
28	NC_011603	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
29	NC_011603	ACA	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
30	NC_011603	CAG	2	6	4644	4649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276196
31	NC_011603	CAA	2	6	4730	4735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
32	NC_011603	GTG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276196
33	NC_011603	TCA	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
34	NC_011603	ACA	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
35	NC_011603	TGA	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
36	NC_011603	TGA	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
37	NC_011603	TTG	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276196
38	NC_011603	AAT	2	6	5068	5073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276196
39	NC_011603	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
40	NC_011603	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276196
41	NC_011603	AAT	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276197
42	NC_011603	TAT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276197
43	NC_011603	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276197
44	NC_011603	CTG	2	6	5605	5610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276197
45	NC_011603	GAT	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276197
46	NC_011603	GAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276197
47	NC_011603	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276197
48	NC_011603	GAA	2	6	5946	5951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276197
49	NC_011603	AGC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276197
50	NC_011603	ATA	2	6	6312	6317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276197
51	NC_011603	TTC	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276198
52	NC_011603	AGA	2	6	6648	6653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276198
53	NC_011603	ATG	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276198
54	NC_011603	TAA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276198
55	NC_011603	TTC	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276199
56	NC_011603	CAT	2	6	7198	7203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
57	NC_011603	CAA	2	6	7229	7234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276199
58	NC_011603	AAT	2	6	7321	7326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
59	NC_011603	ATG	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276199
60	NC_011603	CAT	2	6	7508	7513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
61	NC_011603	GAT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276199
62	NC_011603	GCT	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276199
63	NC_011603	CAT	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
64	NC_011603	CAA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276199
65	NC_011603	GAA	2	6	7975	7980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276199
66	NC_011603	ATA	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
67	NC_011603	CTT	2	6	8065	8070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276199
68	NC_011603	GCA	2	6	8077	8082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276199
69	NC_011603	CAT	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
70	NC_011603	AAT	2	6	8119	8124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
71	NC_011603	AAT	2	6	8304	8309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
72	NC_011603	TGT	2	6	8359	8364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276199
73	NC_011603	AAT	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
74	NC_011603	ATA	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
75	NC_011603	AGA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276199
76	NC_011603	CAG	2	6	8610	8615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276199
77	NC_011603	TGA	2	6	8769	8774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276200
78	NC_011603	GAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276200
79	NC_011603	AAT	2	6	8892	8897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276200
80	NC_011603	CCG	2	6	8900	8905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215276200
81	NC_011603	GAT	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276200
82	NC_011603	ATT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276200
83	NC_011603	GAC	2	6	9021	9026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276200
84	NC_011603	GTT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276200
85	NC_011603	TAT	2	6	9121	9126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276200
86	NC_011603	CTG	2	6	9163	9168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276200
87	NC_011603	ATG	2	6	9175	9180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276200
88	NC_011603	ATT	2	6	9186	9191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276200
89	NC_011603	TCT	2	6	9233	9238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276200
90	NC_011603	TTA	2	6	9311	9316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276200
91	NC_011603	AAT	3	9	9348	9356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276200
92	NC_011603	ATT	2	6	9408	9413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276200
93	NC_011603	GAT	2	6	9477	9482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276200
94	NC_011603	TGC	2	6	9501	9506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276200
95	NC_011603	TGA	2	6	9519	9524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276200
96	NC_011603	TAA	2	6	9531	9536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276200
97	NC_011603	ATT	2	6	9613	9618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276200
98	NC_011603	ACA	3	9	9663	9671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276200
99	NC_011603	GCA	2	6	9682	9687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276200
100	NC_011603	ATT	2	6	9725	9730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276201
101	NC_011603	GAA	2	6	10051	10056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276201
102	NC_011603	CAA	2	6	10104	10109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276201
103	NC_011603	CAA	2	6	10380	10385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276201
104	NC_011603	CAG	2	6	10424	10429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276201
105	NC_011603	CTG	2	6	10437	10442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276201
106	NC_011603	GCA	2	6	10464	10469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276201
107	NC_011603	TCA	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276201
108	NC_011603	TTC	2	6	10579	10584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276201
109	NC_011603	AAG	2	6	10591	10596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276201
110	NC_011603	AGT	2	6	10616	10621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276201
111	NC_011603	CAA	2	6	10631	10636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276201
112	NC_011603	TAT	2	6	10701	10706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276202
113	NC_011603	TAA	2	6	10834	10839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276202
114	NC_011603	TAT	2	6	10862	10867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276202
115	NC_011603	TTA	2	6	10977	10982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276202
116	NC_011603	ATG	2	6	11010	11015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276202
117	NC_011603	GAT	2	6	11150	11155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276202
118	NC_011603	AAT	2	6	11185	11190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276202
119	NC_011603	AGG	2	6	11226	11231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215276202
120	NC_011603	GCA	2	6	11443	11448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276203
121	NC_011603	AAT	2	6	11473	11478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276203
122	NC_011603	GGT	2	6	11518	11523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276203
123	NC_011603	GTA	2	6	11531	11536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276203
124	NC_011603	TAA	2	6	11544	11549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276203
125	NC_011603	TAT	2	6	11571	11576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276203
126	NC_011603	GAT	2	6	11662	11667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276203
127	NC_011603	TCC	2	6	11699	11704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215276203
128	NC_011603	TAT	2	6	11712	11717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276203
129	NC_011603	GGT	2	6	11725	11730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276203
130	NC_011603	ATT	2	6	11943	11948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276204
131	NC_011603	ATT	2	6	11994	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276204
132	NC_011603	ATG	2	6	12028	12033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276204
133	NC_011603	CAT	2	6	12073	12078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276204
134	NC_011603	TAA	2	6	12146	12151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276204
135	NC_011603	TGG	2	6	12330	12335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276204
136	NC_011603	TGA	2	6	12347	12352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276204
137	NC_011603	ATA	3	9	12373	12381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276204
138	NC_011603	AAT	2	6	12399	12404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276204
139	NC_011603	ACA	2	6	12513	12518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276205
140	NC_011603	AAC	2	6	12528	12533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276205
141	NC_011603	AAT	2	6	12542	12547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276205
142	NC_011603	CTA	2	6	12586	12591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276205
143	NC_011603	CCA	2	6	12665	12670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215276205
144	NC_011603	TGG	2	6	12751	12756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276205
145	NC_011603	TAT	2	6	12761	12766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276205
146	NC_011603	GTG	2	6	12807	12812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276205
147	NC_011603	ATA	2	6	12825	12830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276205
148	NC_011603	TAT	2	6	12851	12856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276205
149	NC_011603	ATT	2	6	13020	13025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276206
150	NC_011603	TGT	2	6	13094	13099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276206
151	NC_011603	ATC	2	6	13131	13136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276206
152	NC_011603	ATG	2	6	13168	13173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276206
153	NC_011603	ATC	2	6	13175	13180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276206
154	NC_011603	TAA	2	6	13202	13207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276206
155	NC_011603	ATG	2	6	13228	13233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276206
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158	NC_011603	TTA	2	6	13380	13385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276206
159	NC_011603	ATT	2	6	13402	13407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276206
160	NC_011603	GTG	2	6	13417	13422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276206
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162	NC_011603	ATT	2	6	13553	13558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276207
163	NC_011603	TGC	2	6	13594	13599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276207
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169	NC_011603	ATT	2	6	15599	15604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276208
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239	NC_011603	CTG	2	6	34037	34042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276218
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242	NC_011603	TGG	2	6	34197	34202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276218
243	NC_011603	GAA	2	6	34259	34264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276218
244	NC_011603	CTG	2	6	34313	34318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276218
245	NC_011603	TGA	2	6	34494	34499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276218
246	NC_011603	TAT	2	6	34553	34558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276219
247	NC_011603	TTC	3	9	34636	34644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276219
248	NC_011603	AAG	2	6	34825	34830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276219
249	NC_011603	CCA	2	6	34861	34866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215276219
250	NC_011603	CGC	2	6	34948	34953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215276219
251	NC_011603	TGG	2	6	35011	35016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276219
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253	NC_011603	TGA	2	6	35028	35033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276219
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378	NC_011603	TAT	2	6	46615	46620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276228
379	NC_011603	CAT	2	6	46800	46805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276228
380	NC_011603	AAT	2	6	46837	46842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276228
381	NC_011603	AAT	2	6	46867	46872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276228
382	NC_011603	CCA	2	6	46883	46888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215276228
383	NC_011603	GCG	2	6	47055	47060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215276228
384	NC_011603	TCA	2	6	47067	47072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276228
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387	NC_011603	CAT	2	6	47349	47354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276228
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394	NC_011603	TGT	2	6	47780	47785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276228
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402	NC_011603	TTG	2	6	48317	48322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276228
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485	NC_011603	AAT	2	6	52921	52926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276235
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