MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 chromosome

Total Repeats: 2593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011601	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	215485163
2	NC_011601	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	215485164
3	NC_011601	CGCAG	2	10	8256	8265	20 %	0 %	40 %	40 %	215485169
4	NC_011601	CGTAC	2	10	9684	9693	20 %	20 %	20 %	40 %	215485170
5	NC_011601	CGCGC	2	10	12229	12238	0 %	0 %	40 %	60 %	215485173
6	NC_011601	GTTTC	2	10	13125	13134	0 %	60 %	20 %	20 %	215485174
7	NC_011601	CTGGA	2	10	19499	19508	20 %	20 %	40 %	20 %	215485180
8	NC_011601	ACCAC	2	10	20338	20347	40 %	0 %	0 %	60 %	215485181
9	NC_011601	TCCTT	2	10	21177	21186	0 %	60 %	0 %	40 %	215485181
10	NC_011601	AGCGA	2	10	22257	22266	40 %	0 %	40 %	20 %	215485182
11	NC_011601	CAGTA	2	10	29585	29594	40 %	20 %	20 %	20 %	215485190
12	NC_011601	CGATG	2	10	34439	34448	20 %	20 %	40 %	20 %	215485194
13	NC_011601	GCGAA	2	10	35380	35389	40 %	0 %	40 %	20 %	215485194
14	NC_011601	CCGTT	2	10	36274	36283	0 %	40 %	20 %	40 %	215485194
15	NC_011601	CACGG	2	10	36651	36660	20 %	0 %	40 %	40 %	215485194
16	NC_011601	CGAAT	2	10	39393	39402	40 %	20 %	20 %	20 %	215485199
17	NC_011601	CCATG	2	10	40930	40939	20 %	20 %	20 %	40 %	215485200
18	NC_011601	CCGTA	2	10	42565	42574	20 %	20 %	20 %	40 %	215485201
19	NC_011601	TTAAA	2	10	43303	43312	60 %	40 %	0 %	0 %	215485201
20	NC_011601	ACCCA	2	10	44046	44055	40 %	0 %	0 %	60 %	215485202
21	NC_011601	TTTGA	2	10	45613	45622	20 %	60 %	20 %	0 %	215485203
22	NC_011601	CGGCG	2	10	45864	45873	0 %	0 %	60 %	40 %	215485203
23	NC_011601	AATCA	2	10	46146	46155	60 %	20 %	0 %	20 %	215485204
24	NC_011601	CGGTT	2	10	47101	47110	0 %	40 %	40 %	20 %	215485205
25	NC_011601	TGGCG	2	10	48793	48802	0 %	20 %	60 %	20 %	215485207
26	NC_011601	TGCAC	2	10	50555	50564	20 %	20 %	20 %	40 %	215485208
27	NC_011601	AACGT	2	10	54960	54969	40 %	20 %	20 %	20 %	215485214
28	NC_011601	GCGTC	2	10	57944	57953	0 %	20 %	40 %	40 %	215485217
29	NC_011601	ATGTT	2	10	58758	58767	20 %	60 %	20 %	0 %	215485218
30	NC_011601	AAAGT	2	10	65212	65221	60 %	20 %	20 %	0 %	215485221
31	NC_011601	GGTGA	2	10	67460	67469	20 %	20 %	60 %	0 %	215485222
32	NC_011601	CAGCG	2	10	68743	68752	20 %	0 %	40 %	40 %	215485224
33	NC_011601	TCGCG	2	10	70013	70022	0 %	20 %	40 %	40 %	215485224
34	NC_011601	TCGCT	2	10	74463	74472	0 %	40 %	20 %	40 %	215485227
35	NC_011601	GCGAA	2	10	76180	76189	40 %	0 %	40 %	20 %	215485229
36	NC_011601	TTTTA	2	10	76877	76886	20 %	80 %	0 %	0 %	215485230
37	NC_011601	AAGGT	2	10	77314	77323	40 %	20 %	40 %	0 %	215485231
38	NC_011601	CAGCA	2	10	79008	79017	40 %	0 %	20 %	40 %	215485232
39	NC_011601	TTGCT	2	10	83105	83114	0 %	60 %	20 %	20 %	215485236
40	NC_011601	GATGG	2	10	83841	83850	20 %	20 %	60 %	0 %	215485236
41	NC_011601	ACCTG	2	10	86093	86102	20 %	20 %	20 %	40 %	215485238
42	NC_011601	ATGCG	2	10	87539	87548	20 %	20 %	40 %	20 %	215485239
43	NC_011601	CTGGT	2	10	87813	87822	0 %	40 %	40 %	20 %	215485239
44	NC_011601	ATGTT	2	10	90909	90918	20 %	60 %	20 %	0 %	215485242
45	NC_011601	AAAAC	2	10	91324	91333	80 %	0 %	0 %	20 %	215485242
46	NC_011601	TGCAT	2	10	91851	91860	20 %	40 %	20 %	20 %	215485243
47	NC_011601	ATTCC	2	10	92021	92030	20 %	40 %	0 %	40 %	215485243
48	NC_011601	AGTTC	2	10	97114	97123	20 %	40 %	20 %	20 %	215485248
49	NC_011601	TGCCT	2	10	97214	97223	0 %	40 %	20 %	40 %	215485249
50	NC_011601	CGTGG	2	10	98487	98496	0 %	20 %	60 %	20 %	215485250
51	NC_011601	TATCG	2	10	98994	99003	20 %	40 %	20 %	20 %	215485250
52	NC_011601	GGGCT	2	10	102866	102875	0 %	20 %	60 %	20 %	215485253
53	NC_011601	GCCTG	2	10	103326	103335	0 %	20 %	40 %	40 %	215485254
54	NC_011601	TCTGG	2	10	104573	104582	0 %	40 %	40 %	20 %	215485255
55	NC_011601	ACCGT	2	10	105239	105248	20 %	20 %	20 %	40 %	215485255
56	NC_011601	ATCAG	2	10	107012	107021	40 %	20 %	20 %	20 %	215485257
57	NC_011601	AGCCG	2	10	108780	108789	20 %	0 %	40 %	40 %	215485258
58	NC_011601	GCGCA	2	10	111108	111117	20 %	0 %	40 %	40 %	215485260
59	NC_011601	CGCGG	2	10	118277	118286	0 %	0 %	60 %	40 %	215485267
60	NC_011601	CATCG	2	10	120535	120544	20 %	20 %	20 %	40 %	215485270
61	NC_011601	TAACG	2	10	121229	121238	40 %	20 %	20 %	20 %	215485270
62	NC_011601	AATGC	2	10	122971	122980	40 %	20 %	20 %	20 %	215485271
63	NC_011601	TCTGT	2	10	123918	123927	0 %	60 %	20 %	20 %	215485273
64	NC_011601	AGCAG	2	10	126349	126358	40 %	0 %	40 %	20 %	215485276
65	NC_011601	CGAAG	2	10	128264	128273	40 %	0 %	40 %	20 %	215485277
66	NC_011601	ACACG	2	10	128397	128406	40 %	0 %	20 %	40 %	215485277
67	NC_011601	TCGCG	2	10	128658	128667	0 %	20 %	40 %	40 %	215485277
68	NC_011601	GCATC	2	10	128748	128757	20 %	20 %	20 %	40 %	215485277
69	NC_011601	GACTG	2	10	130066	130075	20 %	20 %	40 %	20 %	215485278
70	NC_011601	AGAGC	2	10	130476	130485	40 %	0 %	40 %	20 %	215485278
71	NC_011601	CTGCA	2	10	137088	137097	20 %	20 %	20 %	40 %	215485281
72	NC_011601	TCTGG	2	10	139030	139039	0 %	40 %	40 %	20 %	215485282
73	NC_011601	GGGCA	2	10	140441	140450	20 %	0 %	60 %	20 %	215485283
74	NC_011601	CAGCG	2	10	140720	140729	20 %	0 %	40 %	40 %	215485284
75	NC_011601	ACGAC	2	10	142000	142009	40 %	0 %	20 %	40 %	215485285
76	NC_011601	GCGCG	2	10	146759	146768	0 %	0 %	60 %	40 %	215485288
77	NC_011601	CCGTC	2	10	147550	147559	0 %	20 %	20 %	60 %	215485289
78	NC_011601	GTGAA	2	10	147560	147569	40 %	20 %	40 %	0 %	215485289
79	NC_011601	GTTCA	2	10	147947	147956	20 %	40 %	20 %	20 %	215485290
80	NC_011601	ATCCA	2	10	148273	148282	40 %	20 %	0 %	40 %	215485290
81	NC_011601	CTTTA	2	10	149536	149545	20 %	60 %	0 %	20 %	215485292
82	NC_011601	CGGGC	2	10	150951	150960	0 %	0 %	60 %	40 %	215485294
83	NC_011601	TGGTG	2	10	153377	153386	0 %	40 %	60 %	0 %	215485296
84	NC_011601	GGGAG	2	10	153401	153410	20 %	0 %	80 %	0 %	215485296
85	NC_011601	TCCTG	2	10	157335	157344	0 %	40 %	20 %	40 %	215485299
86	NC_011601	TTGTT	2	10	158845	158854	0 %	80 %	20 %	0 %	215485300
87	NC_011601	TTCAA	2	10	158995	159004	40 %	40 %	0 %	20 %	215485300
88	NC_011601	TCGGC	2	10	164260	164269	0 %	20 %	40 %	40 %	215485303
89	NC_011601	TGGCG	2	10	164684	164693	0 %	20 %	60 %	20 %	215485303
90	NC_011601	ACCAC	2	10	167588	167597	40 %	0 %	0 %	60 %	215485307
91	NC_011601	CGACG	2	10	170330	170339	20 %	0 %	40 %	40 %	215485308
92	NC_011601	GATCT	2	10	175628	175637	20 %	40 %	20 %	20 %	215485311
93	NC_011601	ACATC	2	10	176437	176446	40 %	20 %	0 %	40 %	215485311
94	NC_011601	GTTCC	2	10	177749	177758	0 %	40 %	20 %	40 %	215485312
95	NC_011601	CAGTA	2	10	178804	178813	40 %	20 %	20 %	20 %	215485313
96	NC_011601	TGGTC	2	10	181756	181765	0 %	40 %	40 %	20 %	215485315
97	NC_011601	CGGCG	2	10	183631	183640	0 %	0 %	60 %	40 %	215485316
98	NC_011601	TTCCA	2	10	184242	184251	20 %	40 %	0 %	40 %	215485316
99	NC_011601	GACCG	2	10	184767	184776	20 %	0 %	40 %	40 %	215485317
100	NC_011601	GGTCC	2	10	188565	188574	0 %	20 %	40 %	40 %	215485321
101	NC_011601	ACGGG	2	10	190482	190491	20 %	0 %	60 %	20 %	215485323
102	NC_011601	TGCGC	2	10	192189	192198	0 %	20 %	40 %	40 %	215485324
103	NC_011601	GTGAT	2	10	192932	192941	20 %	40 %	40 %	0 %	215485324
104	NC_011601	GCCAG	2	10	196610	196619	20 %	0 %	40 %	40 %	215485328
105	NC_011601	GGCGT	2	10	197448	197457	0 %	20 %	60 %	20 %	215485328
106	NC_011601	GTTCT	2	10	198051	198060	0 %	60 %	20 %	20 %	215485328
107	NC_011601	CTGAA	2	10	200043	200052	40 %	20 %	20 %	20 %	215485330
108	NC_011601	AAGCG	2	10	200107	200116	40 %	0 %	40 %	20 %	215485330
109	NC_011601	TGGTG	2	10	202013	202022	0 %	40 %	60 %	0 %	215485332
110	NC_011601	TGCAC	2	10	202139	202148	20 %	20 %	20 %	40 %	215485332
111	NC_011601	TGCGC	2	10	202532	202541	0 %	20 %	40 %	40 %	215485332
112	NC_011601	TGGTG	2	10	204054	204063	0 %	40 %	60 %	0 %	215485334
113	NC_011601	CATGG	2	10	204375	204384	20 %	20 %	40 %	20 %	215485334
114	NC_011601	CAGAT	2	10	205414	205423	40 %	20 %	20 %	20 %	215485335
115	NC_011601	ACTTT	2	10	205547	205556	20 %	60 %	0 %	20 %	215485335
116	NC_011601	GACGT	2	10	209467	209476	20 %	20 %	40 %	20 %	215485338
117	NC_011601	ATGCC	2	10	213862	213871	20 %	20 %	20 %	40 %	215485343
118	NC_011601	TGGCC	2	10	215183	215192	0 %	20 %	40 %	40 %	215485345
119	NC_011601	ACCGC	2	10	215196	215205	20 %	0 %	20 %	60 %	215485345
120	NC_011601	GTAAC	2	10	215926	215935	40 %	20 %	20 %	20 %	215485345
121	NC_011601	AGCCG	2	10	216554	216563	20 %	0 %	40 %	40 %	215485345
122	NC_011601	GGTGG	2	10	216663	216672	0 %	20 %	80 %	0 %	215485345
123	NC_011601	ACGGT	2	10	227674	227683	20 %	20 %	40 %	20 %	215485356
124	NC_011601	AGCTC	2	10	228362	228371	20 %	20 %	20 %	40 %	215485356
125	NC_011601	TGATT	2	10	230515	230524	20 %	60 %	20 %	0 %	215485359
126	NC_011601	GTGAA	2	10	242350	242359	40 %	20 %	40 %	0 %	215485366
127	NC_011601	TAATT	2	10	242534	242543	40 %	60 %	0 %	0 %	215485366
128	NC_011601	CGGAG	2	10	246520	246529	20 %	0 %	60 %	20 %	215485371
129	NC_011601	TGAAC	2	10	251434	251443	40 %	20 %	20 %	20 %	215485375
130	NC_011601	AAACG	2	10	253619	253628	60 %	0 %	20 %	20 %	215485377
131	NC_011601	CGATG	2	10	257673	257682	20 %	20 %	40 %	20 %	215485380
132	NC_011601	GATGC	2	10	264441	264450	20 %	20 %	40 %	20 %	215485387
133	NC_011601	TCGCG	2	10	264626	264635	0 %	20 %	40 %	40 %	215485387
134	NC_011601	TTTAT	2	10	265650	265659	20 %	80 %	0 %	0 %	215485389
135	NC_011601	GTGAT	2	10	267645	267654	20 %	40 %	40 %	0 %	215485390
136	NC_011601	AGCGA	2	10	268207	268216	40 %	0 %	40 %	20 %	215485391
137	NC_011601	TTCTC	2	10	277257	277266	0 %	60 %	0 %	40 %	215485397
138	NC_011601	ACGCC	2	10	278700	278709	20 %	0 %	20 %	60 %	215485398
139	NC_011601	CGCAG	2	10	279162	279171	20 %	0 %	40 %	40 %	215485398
140	NC_011601	TCAAT	2	10	284433	284442	40 %	40 %	0 %	20 %	215485405
141	NC_011601	ACGAT	2	10	285221	285230	40 %	20 %	20 %	20 %	215485405
142	NC_011601	GTAAG	2	10	286084	286093	40 %	20 %	40 %	0 %	215485406
143	NC_011601	GGTAA	2	10	286096	286105	40 %	20 %	40 %	0 %	215485406
144	NC_011601	TTTCA	2	10	286381	286390	20 %	60 %	0 %	20 %	215485406
145	NC_011601	GTCTG	2	10	287988	287997	0 %	40 %	40 %	20 %	215485408
146	NC_011601	GTTTA	2	10	288731	288740	20 %	60 %	20 %	0 %	215485409
147	NC_011601	ACCTT	2	10	289137	289146	20 %	40 %	0 %	40 %	215485409
148	NC_011601	GCGTG	2	10	291087	291096	0 %	20 %	60 %	20 %	215485411
149	NC_011601	AGCAA	2	10	292178	292187	60 %	0 %	20 %	20 %	215485411
150	NC_011601	GGGCA	2	10	292253	292262	20 %	0 %	60 %	20 %	215485411
151	NC_011601	AGATC	2	10	292528	292537	40 %	20 %	20 %	20 %	215485411
152	NC_011601	ATGAA	2	10	295206	295215	60 %	20 %	20 %	0 %	215485411
153	NC_011601	TACCG	2	10	295656	295665	20 %	20 %	20 %	40 %	215485412
154	NC_011601	GCGTG	2	10	296866	296875	0 %	20 %	60 %	20 %	215485413
155	NC_011601	ATGTT	2	10	303735	303744	20 %	60 %	20 %	0 %	215485420
156	NC_011601	AATGC	2	10	303885	303894	40 %	20 %	20 %	20 %	215485420
157	NC_011601	AGCAG	2	10	303937	303946	40 %	0 %	40 %	20 %	215485420
158	NC_011601	GCAGG	2	10	305936	305945	20 %	0 %	60 %	20 %	215485422
159	NC_011601	CCGCG	2	10	310646	310655	0 %	0 %	40 %	60 %	215485425
160	NC_011601	GCGCG	2	10	310797	310806	0 %	0 %	60 %	40 %	215485425
161	NC_011601	TTATT	2	10	316130	316139	20 %	80 %	0 %	0 %	215485430
162	NC_011601	ATGGC	2	10	316376	316385	20 %	20 %	40 %	20 %	215485430
163	NC_011601	ACGGC	2	10	316953	316962	20 %	0 %	40 %	40 %	215485431
164	NC_011601	GGGCA	2	10	318088	318097	20 %	0 %	60 %	20 %	215485432
165	NC_011601	AAAAC	2	10	318482	318491	80 %	0 %	0 %	20 %	215485432
166	NC_011601	CCGGC	2	10	318962	318971	0 %	0 %	40 %	60 %	215485432
167	NC_011601	TCGCC	2	10	320212	320221	0 %	20 %	20 %	60 %	215485434
168	NC_011601	GCGAA	2	10	320800	320809	40 %	0 %	40 %	20 %	215485435
169	NC_011601	TGGCG	2	10	320885	320894	0 %	20 %	60 %	20 %	215485435
170	NC_011601	CACGG	2	10	325428	325437	20 %	0 %	40 %	40 %	215485437
171	NC_011601	TGGCG	2	10	327526	327535	0 %	20 %	60 %	20 %	215485439
172	NC_011601	GGCAA	2	10	333626	333635	40 %	0 %	40 %	20 %	215485443
173	NC_011601	TGATG	2	10	334033	334042	20 %	40 %	40 %	0 %	215485443
174	NC_011601	TGCGC	2	10	335675	335684	0 %	20 %	40 %	40 %	215485444
175	NC_011601	AATTC	2	10	338137	338146	40 %	40 %	0 %	20 %	215485447
176	NC_011601	CGCAG	2	10	338155	338164	20 %	0 %	40 %	40 %	215485447
177	NC_011601	AGACC	2	10	339151	339160	40 %	0 %	20 %	40 %	215485447
178	NC_011601	TGACC	2	10	339874	339883	20 %	20 %	20 %	40 %	215485447
179	NC_011601	TTTTC	2	10	341200	341209	0 %	80 %	0 %	20 %	215485448
180	NC_011601	CTTAC	2	10	342391	342400	20 %	40 %	0 %	40 %	215485449
181	NC_011601	TGTGT	2	10	344540	344549	0 %	60 %	40 %	0 %	215485451
182	NC_011601	GACCG	2	10	346543	346552	20 %	0 %	40 %	40 %	215485453
183	NC_011601	GTTGA	2	10	356915	356924	20 %	40 %	40 %	0 %	215485460
184	NC_011601	GATGG	2	10	361119	361128	20 %	20 %	60 %	0 %	215485465
185	NC_011601	CGCTG	2	10	361436	361445	0 %	20 %	40 %	40 %	215485465
186	NC_011601	ATTAC	2	10	362443	362452	40 %	40 %	0 %	20 %	215485466
187	NC_011601	CAACA	2	10	362687	362696	60 %	0 %	0 %	40 %	215485466
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189	NC_011601	TTTTC	2	10	364788	364797	0 %	80 %	0 %	20 %	215485468
190	NC_011601	CAAAC	2	10	371483	371492	60 %	0 %	0 %	40 %	215485477
191	NC_011601	TCGCG	2	10	381004	381013	0 %	20 %	40 %	40 %	215485483
192	NC_011601	TCGCT	2	10	381107	381116	0 %	40 %	20 %	40 %	215485483
193	NC_011601	CAAAG	2	10	381603	381612	60 %	0 %	20 %	20 %	215485484
194	NC_011601	CGCAT	2	10	381655	381664	20 %	20 %	20 %	40 %	215485484
195	NC_011601	CCTGG	2	10	382975	382984	0 %	20 %	40 %	40 %	215485484
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198	NC_011601	AAGCG	2	10	388056	388065	40 %	0 %	40 %	20 %	215485489
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200	NC_011601	TGACC	2	10	389257	389266	20 %	20 %	20 %	40 %	215485490
201	NC_011601	AGTTC	2	10	390229	390238	20 %	40 %	20 %	20 %	215485492
202	NC_011601	CACTT	2	10	391803	391812	20 %	40 %	0 %	40 %	215485493
203	NC_011601	CTCGT	2	10	392077	392086	0 %	40 %	20 %	40 %	215485494
204	NC_011601	GCGAC	2	10	393011	393020	20 %	0 %	40 %	40 %	215485495
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210	NC_011601	CACAA	2	10	404684	404693	60 %	0 %	0 %	40 %	215485508
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212	NC_011601	GTGAT	2	10	405981	405990	20 %	40 %	40 %	0 %	215485509
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226	NC_011601	GTTCA	2	10	444299	444308	20 %	40 %	20 %	20 %	215485542
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231	NC_011601	AAATA	2	10	460078	460087	80 %	20 %	0 %	0 %	215485556
232	NC_011601	CTTCT	2	10	462379	462388	0 %	60 %	0 %	40 %	215485558
233	NC_011601	CCAGC	2	10	463273	463282	20 %	0 %	20 %	60 %	215485558
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241	NC_011601	GTTGC	2	10	481067	481076	0 %	40 %	40 %	20 %	215485575
242	NC_011601	AATGG	2	10	481204	481213	40 %	20 %	40 %	0 %	215485575
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244	NC_011601	GCTGG	2	10	485126	485135	0 %	20 %	60 %	20 %	215485579
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246	NC_011601	ATTCC	2	10	492156	492165	20 %	40 %	0 %	40 %	215485585
247	NC_011601	GCTGG	2	10	493138	493147	0 %	20 %	60 %	20 %	215485585
248	NC_011601	GGTTG	2	10	494375	494384	0 %	40 %	60 %	0 %	215485586
249	NC_011601	GTCTG	2	10	497248	497257	0 %	40 %	40 %	20 %	215485589
250	NC_011601	CGCGG	2	10	500454	500463	0 %	0 %	60 %	40 %	215485591
251	NC_011601	CATCG	2	10	502662	502671	20 %	20 %	20 %	40 %	215485593
252	NC_011601	TTTCG	2	10	503196	503205	0 %	60 %	20 %	20 %	215485594
253	NC_011601	GAGCA	2	10	503574	503583	40 %	0 %	40 %	20 %	215485594
254	NC_011601	CGACC	2	10	505719	505728	20 %	0 %	20 %	60 %	215485595
255	NC_011601	TCGCC	2	10	508152	508161	0 %	20 %	20 %	60 %	215485597
256	NC_011601	AGCTC	2	10	509842	509851	20 %	20 %	20 %	40 %	215485599
257	NC_011601	TGCGC	2	10	510779	510788	0 %	20 %	40 %	40 %	215485600
258	NC_011601	GTGAA	2	10	513603	513612	40 %	20 %	40 %	0 %	215485603
259	NC_011601	AACCC	2	10	514398	514407	40 %	0 %	0 %	60 %	215485604
260	NC_011601	GGCGC	2	10	520045	520054	0 %	0 %	60 %	40 %	215485609
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262	NC_011601	CACGC	2	10	524003	524012	20 %	0 %	20 %	60 %	215485611
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381	NC_011601	TTTGC	2	10	721257	721266	0 %	60 %	20 %	20 %	215485788
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384	NC_011601	CGGCA	2	10	723582	723591	20 %	0 %	40 %	40 %	215485794
385	NC_011601	TTGCG	2	10	724461	724470	0 %	40 %	40 %	20 %	215485796
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389	NC_011601	ATCGA	2	10	729057	729066	40 %	20 %	20 %	20 %	215485808
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