MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-2

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011413	AT	3	6	1442	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	209916831
2	NC_011413	AT	3	6	3264	3269	50 %	50 %	0 %	0 %	209916831
3	NC_011413	AT	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	209916832
4	NC_011413	TC	3	6	4862	4867	0 %	50 %	0 %	50 %	209916834
5	NC_011413	GC	3	6	5486	5491	0 %	0 %	50 %	50 %	209916835
6	NC_011413	TG	3	6	6081	6086	0 %	50 %	50 %	0 %	209916838
7	NC_011413	AG	4	8	6790	6797	50 %	0 %	50 %	0 %	209916840
8	NC_011413	GC	3	6	7309	7314	0 %	0 %	50 %	50 %	209916841
9	NC_011413	CT	3	6	7468	7473	0 %	50 %	0 %	50 %	209916841
10	NC_011413	GA	3	6	10477	10482	50 %	0 %	50 %	0 %	209916843
11	NC_011413	AT	3	6	11095	11100	50 %	50 %	0 %	0 %	209916843
12	NC_011413	GA	3	6	11388	11393	50 %	0 %	50 %	0 %	209916844
13	NC_011413	TC	4	8	11628	11635	0 %	50 %	0 %	50 %	209916844
14	NC_011413	GA	3	6	11928	11933	50 %	0 %	50 %	0 %	209916844
15	NC_011413	TC	3	6	12821	12826	0 %	50 %	0 %	50 %	209916845
16	NC_011413	GC	4	8	12867	12874	0 %	0 %	50 %	50 %	209916845
17	NC_011413	TG	3	6	13517	13522	0 %	50 %	50 %	0 %	209916846
18	NC_011413	GA	3	6	13738	13743	50 %	0 %	50 %	0 %	209916846
19	NC_011413	GC	3	6	13989	13994	0 %	0 %	50 %	50 %	209916846
20	NC_011413	TC	3	6	14112	14117	0 %	50 %	0 %	50 %	209916846
21	NC_011413	CA	3	6	14218	14223	50 %	0 %	0 %	50 %	209916846
22	NC_011413	AT	3	6	15924	15929	50 %	50 %	0 %	0 %	209916848
23	NC_011413	AC	3	6	18335	18340	50 %	0 %	0 %	50 %	209916850
24	NC_011413	CA	3	6	18577	18582	50 %	0 %	0 %	50 %	209916850
25	NC_011413	GA	3	6	19776	19781	50 %	0 %	50 %	0 %	209916851
26	NC_011413	CA	3	6	20438	20443	50 %	0 %	0 %	50 %	209916851
27	NC_011413	GA	3	6	20447	20452	50 %	0 %	50 %	0 %	209916851
28	NC_011413	AG	3	6	20471	20476	50 %	0 %	50 %	0 %	209916851
29	NC_011413	CA	3	6	21674	21679	50 %	0 %	0 %	50 %	209916852
30	NC_011413	GC	3	6	22043	22048	0 %	0 %	50 %	50 %	209916853
31	NC_011413	AC	3	6	23115	23120	50 %	0 %	0 %	50 %	209916854
32	NC_011413	TG	3	6	23320	23325	0 %	50 %	50 %	0 %	209916854
33	NC_011413	CA	3	6	24649	24654	50 %	0 %	0 %	50 %	209916856
34	NC_011413	GC	3	6	25245	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	209916858
35	NC_011413	GC	3	6	27465	27470	0 %	0 %	50 %	50 %	209916861
36	NC_011413	CG	3	6	27876	27881	0 %	0 %	50 %	50 %	209916863
37	NC_011413	CG	3	6	29211	29216	0 %	0 %	50 %	50 %	209916866
38	NC_011413	GA	3	6	29386	29391	50 %	0 %	50 %	0 %	209916866
39	NC_011413	GC	3	6	30595	30600	0 %	0 %	50 %	50 %	209916867
40	NC_011413	TG	3	6	30786	30791	0 %	50 %	50 %	0 %	209916867
41	NC_011413	CG	3	6	31178	31183	0 %	0 %	50 %	50 %	209916868
42	NC_011413	GC	3	6	32212	32217	0 %	0 %	50 %	50 %	209916870
43	NC_011413	GA	3	6	32579	32584	50 %	0 %	50 %	0 %	209916871
44	NC_011413	AG	3	6	32823	32828	50 %	0 %	50 %	0 %	209916871
45	NC_011413	TG	4	8	34061	34068	0 %	50 %	50 %	0 %	209916872
46	NC_011413	TG	3	6	34783	34788	0 %	50 %	50 %	0 %	209916872
47	NC_011413	AC	3	6	35018	35023	50 %	0 %	0 %	50 %	209916873
48	NC_011413	TC	3	6	35169	35174	0 %	50 %	0 %	50 %	209916873
49	NC_011413	GC	3	6	35357	35362	0 %	0 %	50 %	50 %	209916874
50	NC_011413	AG	3	6	36001	36006	50 %	0 %	50 %	0 %	209916874
51	NC_011413	AT	3	6	38185	38190	50 %	50 %	0 %	0 %	209916880
52	NC_011413	TA	4	8	39042	39049	50 %	50 %	0 %	0 %	209916881
53	NC_011413	TG	4	8	39110	39117	0 %	50 %	50 %	0 %	209916881
54	NC_011413	TA	3	6	41279	41284	50 %	50 %	0 %	0 %	209916885
55	NC_011413	GA	3	6	41653	41658	50 %	0 %	50 %	0 %	209916886
56	NC_011413	CT	3	6	42136	42141	0 %	50 %	0 %	50 %	209916887
57	NC_011413	CA	3	6	44526	44531	50 %	0 %	0 %	50 %	209916891
58	NC_011413	GT	3	6	46231	46236	0 %	50 %	50 %	0 %	209916893
59	NC_011413	TC	3	6	47371	47376	0 %	50 %	0 %	50 %	209916893
60	NC_011413	TC	3	6	47977	47982	0 %	50 %	0 %	50 %	209916893
61	NC_011413	CT	3	6	48796	48801	0 %	50 %	0 %	50 %	209916894
62	NC_011413	CA	4	8	49397	49404	50 %	0 %	0 %	50 %	209916896
63	NC_011413	TG	3	6	49853	49858	0 %	50 %	50 %	0 %	209916897
64	NC_011413	TG	3	6	52165	52170	0 %	50 %	50 %	0 %	209916900
65	NC_011413	CG	3	6	53975	53980	0 %	0 %	50 %	50 %	209916901
66	NC_011413	GT	3	6	54406	54411	0 %	50 %	50 %	0 %	209916901
67	NC_011413	GA	3	6	55498	55503	50 %	0 %	50 %	0 %	209916903
68	NC_011413	CT	3	6	57900	57905	0 %	50 %	0 %	50 %	209916905
69	NC_011413	AC	3	6	58081	58086	50 %	0 %	0 %	50 %	209916905
70	NC_011413	AC	3	6	58739	58744	50 %	0 %	0 %	50 %	209916906
71	NC_011413	AG	4	8	61106	61113	50 %	0 %	50 %	0 %	209916907
72	NC_011413	GA	3	6	61621	61626	50 %	0 %	50 %	0 %	209916907
73	NC_011413	TG	3	6	61643	61648	0 %	50 %	50 %	0 %	209916907
74	NC_011413	AT	3	6	62746	62751	50 %	50 %	0 %	0 %	209916909
75	NC_011413	AT	3	6	62785	62790	50 %	50 %	0 %	0 %	209916909
76	NC_011413	GC	3	6	63545	63550	0 %	0 %	50 %	50 %	209916910
77	NC_011413	CG	3	6	63578	63583	0 %	0 %	50 %	50 %	209916910
78	NC_011413	GA	3	6	65194	65199	50 %	0 %	50 %	0 %	209916911
79	NC_011413	GA	3	6	66326	66331	50 %	0 %	50 %	0 %	209916912
80	NC_011413	GT	3	6	66393	66398	0 %	50 %	50 %	0 %	209916912
81	NC_011413	GA	3	6	66513	66518	50 %	0 %	50 %	0 %	209916912
82	NC_011413	CA	4	8	67973	67980	50 %	0 %	0 %	50 %	209916912
83	NC_011413	CA	3	6	69016	69021	50 %	0 %	0 %	50 %	209916912
84	NC_011413	TC	3	6	69050	69055	0 %	50 %	0 %	50 %	209916912
85	NC_011413	CA	3	6	69157	69162	50 %	0 %	0 %	50 %	209916912
86	NC_011413	AC	3	6	69405	69410	50 %	0 %	0 %	50 %	209916912
87	NC_011413	AG	3	6	69714	69719	50 %	0 %	50 %	0 %	209916912
88	NC_011413	AG	3	6	71149	71154	50 %	0 %	50 %	0 %	209916912
89	NC_011413	AG	3	6	71333	71338	50 %	0 %	50 %	0 %	209916912
90	NC_011413	AG	3	6	73042	73047	50 %	0 %	50 %	0 %	209916915
91	NC_011413	AT	4	8	73554	73561	50 %	50 %	0 %	0 %	209916916
92	NC_011413	GT	3	6	73711	73716	0 %	50 %	50 %	0 %	209916916
93	NC_011413	GC	3	6	73796	73801	0 %	0 %	50 %	50 %	209916916
94	NC_011413	AC	3	6	74600	74605	50 %	0 %	0 %	50 %	209916917
95	NC_011413	AC	3	6	75359	75364	50 %	0 %	0 %	50 %	209916920
96	NC_011413	GC	3	6	75538	75543	0 %	0 %	50 %	50 %	209916920
97	NC_011413	CA	4	8	75759	75766	50 %	0 %	0 %	50 %	209916920
98	NC_011413	GC	3	6	76188	76193	0 %	0 %	50 %	50 %	209916920
99	NC_011413	GC	3	6	79371	79376	0 %	0 %	50 %	50 %	209916926
100	NC_011413	GA	3	6	81595	81600	50 %	0 %	50 %	0 %	209916928
101	NC_011413	TA	3	6	82848	82853	50 %	50 %	0 %	0 %	209916929
102	NC_011413	GA	3	6	83036	83041	50 %	0 %	50 %	0 %	209916930
103	NC_011413	GA	3	6	83775	83780	50 %	0 %	50 %	0 %	209916931
104	NC_011413	TA	4	8	83836	83843	50 %	50 %	0 %	0 %	209916931
105	NC_011413	TC	4	8	84069	84076	0 %	50 %	0 %	50 %	209916932
106	NC_011413	TC	3	6	86722	86727	0 %	50 %	0 %	50 %	209916935
107	NC_011413	AC	3	6	87038	87043	50 %	0 %	0 %	50 %	209916935
108	NC_011413	GA	3	6	87463	87468	50 %	0 %	50 %	0 %	209916935
109	NC_011413	CA	3	6	88352	88357	50 %	0 %	0 %	50 %	209916936
110	NC_011413	TA	4	8	88792	88799	50 %	50 %	0 %	0 %	209916937
111	NC_011413	GA	3	6	89815	89820	50 %	0 %	50 %	0 %	209916939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.