MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 chromosome

Total Repeats: 2945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011353	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	209398223
2	NC_011353	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	209395861
3	NC_011353	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	209399547
4	NC_011353	CGTAC	2	10	9805	9814	20 %	20 %	20 %	40 %	209398876
5	NC_011353	CGCGC	2	10	10792	10801	0 %	0 %	40 %	60 %	209396480
6	NC_011353	CCGAT	2	10	16509	16518	20 %	20 %	20 %	40 %	209397822
7	NC_011353	AGCGA	2	10	16897	16906	40 %	0 %	40 %	20 %	209397822
8	NC_011353	AATGT	2	10	21847	21856	40 %	40 %	20 %	0 %	209397389
9	NC_011353	TGCAA	2	10	22060	22069	40 %	20 %	20 %	20 %	209397389
10	NC_011353	ATAAA	2	10	22131	22140	80 %	20 %	0 %	0 %	209397389
11	NC_011353	TAAAA	2	10	22404	22413	80 %	20 %	0 %	0 %	209397389
12	NC_011353	ATTGC	2	10	24146	24155	20 %	40 %	20 %	20 %	209398029
13	NC_011353	GCGAA	2	10	36843	36852	40 %	0 %	40 %	20 %	209396701
14	NC_011353	CCGTT	2	10	37737	37746	0 %	40 %	20 %	40 %	209396701
15	NC_011353	CACGG	2	10	38114	38123	20 %	0 %	40 %	40 %	209396701
16	NC_011353	CGAAT	2	10	40856	40865	40 %	20 %	20 %	20 %	209400477
17	NC_011353	CCATG	2	10	42394	42403	20 %	20 %	20 %	40 %	209397439
18	NC_011353	CCGTA	2	10	44040	44049	20 %	20 %	20 %	40 %	209399530
19	NC_011353	GTACA	2	10	44530	44539	40 %	20 %	20 %	20 %	209399530
20	NC_011353	TTAAA	2	10	44778	44787	60 %	40 %	0 %	0 %	209399530
21	NC_011353	ACCCA	2	10	45521	45530	40 %	0 %	0 %	60 %	209399200
22	NC_011353	TTTGA	2	10	47148	47157	20 %	60 %	20 %	0 %	209398664
23	NC_011353	CGGCG	2	10	47399	47408	0 %	0 %	60 %	40 %	209398664
24	NC_011353	AATCA	2	10	47681	47690	60 %	20 %	0 %	20 %	209400372
25	NC_011353	CGGTT	2	10	48636	48645	0 %	40 %	40 %	20 %	209399776
26	NC_011353	TGGCG	2	10	50327	50336	0 %	20 %	60 %	20 %	209398741
27	NC_011353	TGCAC	2	10	52089	52098	20 %	20 %	20 %	40 %	209400858
28	NC_011353	AGGGC	2	10	53174	53183	20 %	0 %	60 %	20 %	209399091
29	NC_011353	GGCGC	2	10	53208	53217	0 %	0 %	60 %	40 %	209399091
30	NC_011353	GAAAC	2	10	54021	54030	60 %	0 %	20 %	20 %	209399091
31	NC_011353	AACGT	2	10	56494	56503	40 %	20 %	20 %	20 %	209398324
32	NC_011353	GCGTC	2	10	59478	59487	0 %	20 %	40 %	40 %	209398433
33	NC_011353	ATGTT	2	10	60292	60301	20 %	60 %	20 %	0 %	209398538
34	NC_011353	CTTCG	2	10	60725	60734	0 %	40 %	20 %	40 %	209398538
35	NC_011353	TGCGT	2	10	61011	61020	0 %	40 %	40 %	20 %	209398538
36	NC_011353	GTGCT	2	10	69341	69350	0 %	40 %	40 %	20 %	209398156
37	NC_011353	GGTGA	2	10	70325	70334	20 %	20 %	60 %	0 %	209398156
38	NC_011353	CAGCG	2	10	71693	71702	20 %	0 %	40 %	40 %	209396986
39	NC_011353	GGATC	2	10	74188	74197	20 %	20 %	40 %	20 %	209400593
40	NC_011353	GGCAA	2	10	80840	80849	40 %	0 %	40 %	20 %	209398238
41	NC_011353	TTGCT	2	10	81575	81584	0 %	60 %	20 %	20 %	209397844
42	NC_011353	GATGG	2	10	82311	82320	20 %	20 %	60 %	0 %	209397844
43	NC_011353	GCTTC	2	10	83456	83465	0 %	40 %	20 %	40 %	209397741
44	NC_011353	CCTGG	2	10	84564	84573	0 %	20 %	40 %	40 %	209397303
45	NC_011353	GACCG	2	10	86831	86840	20 %	0 %	40 %	40 %	209398496
46	NC_011353	ATGTT	2	10	89378	89387	20 %	60 %	20 %	0 %	209396725
47	NC_011353	TGCAT	2	10	90320	90329	20 %	40 %	20 %	20 %	209398207
48	NC_011353	ATTCC	2	10	90490	90499	20 %	40 %	0 %	40 %	209398207
49	NC_011353	TTACG	2	10	91382	91391	20 %	40 %	20 %	20 %	209398207
50	NC_011353	AGTTC	2	10	95583	95592	20 %	40 %	20 %	20 %	209400403
51	NC_011353	CGTGG	2	10	96956	96965	0 %	20 %	60 %	20 %	209397671
52	NC_011353	GGGCT	2	10	101335	101344	0 %	20 %	60 %	20 %	209398077
53	NC_011353	GCCTG	2	10	101795	101804	0 %	20 %	40 %	40 %	209398858
54	NC_011353	ACCGT	2	10	103708	103717	20 %	20 %	20 %	40 %	209398089
55	NC_011353	ATCAG	2	10	105481	105490	40 %	20 %	20 %	20 %	209400617
56	NC_011353	TGACG	2	10	106953	106962	20 %	20 %	40 %	20 %	209399854
57	NC_011353	AGCCG	2	10	107249	107258	20 %	0 %	40 %	40 %	209399854
58	NC_011353	GCGCA	2	10	109577	109586	20 %	0 %	40 %	40 %	209396843
59	NC_011353	TGGCG	2	10	110571	110580	0 %	20 %	60 %	20 %	209396274
60	NC_011353	CCGGC	2	10	113541	113550	0 %	0 %	40 %	60 %	209399217
61	NC_011353	CGCGG	2	10	116750	116759	0 %	0 %	60 %	40 %	209399348
62	NC_011353	ATCCC	2	10	118994	119003	20 %	20 %	0 %	60 %	209397106
63	NC_011353	CATCG	2	10	119007	119016	20 %	20 %	20 %	40 %	209397106
64	NC_011353	TAACG	2	10	119701	119710	40 %	20 %	20 %	20 %	209397106
65	NC_011353	ATGCC	2	10	120160	120169	20 %	20 %	20 %	40 %	209397106
66	NC_011353	AATGC	2	10	121443	121452	40 %	20 %	20 %	20 %	209396061
67	NC_011353	TCTGT	2	10	122389	122398	0 %	60 %	20 %	20 %	209398277
68	NC_011353	GCATG	2	10	123482	123491	20 %	20 %	40 %	20 %	209396354
69	NC_011353	AGCAG	2	10	124820	124829	40 %	0 %	40 %	20 %	209397094
70	NC_011353	CGAAG	2	10	126735	126744	40 %	0 %	40 %	20 %	209400019
71	NC_011353	ACACG	2	10	126868	126877	40 %	0 %	20 %	40 %	209400019
72	NC_011353	TCGCG	2	10	127129	127138	0 %	20 %	40 %	40 %	209400019
73	NC_011353	GCATC	2	10	127219	127228	20 %	20 %	20 %	40 %	209400019
74	NC_011353	GACTG	2	10	128537	128546	20 %	20 %	40 %	20 %	209398489
75	NC_011353	AGAGC	2	10	128947	128956	40 %	0 %	40 %	20 %	209398489
76	NC_011353	AGGCG	2	10	134102	134111	20 %	0 %	60 %	20 %	209398273
77	NC_011353	GGTTG	2	10	134855	134864	0 %	40 %	60 %	0 %	209398273
78	NC_011353	TCTGG	2	10	137501	137510	0 %	40 %	40 %	20 %	209396098
79	NC_011353	GGGCA	2	10	138913	138922	20 %	0 %	60 %	20 %	209396818
80	NC_011353	CAGCG	2	10	139192	139201	20 %	0 %	40 %	40 %	209397177
81	NC_011353	ACGAC	2	10	140472	140481	40 %	0 %	20 %	40 %	209395821
82	NC_011353	CCGTC	2	10	146177	146186	0 %	20 %	20 %	60 %	209400257
83	NC_011353	GTGAA	2	10	146187	146196	40 %	20 %	40 %	0 %	209400257
84	NC_011353	GTTCA	2	10	146574	146583	20 %	40 %	20 %	20 %	209399514
85	NC_011353	ATCCA	2	10	146900	146909	40 %	20 %	0 %	40 %	209399514
86	NC_011353	CTTTA	2	10	148163	148172	20 %	60 %	0 %	20 %	209396497
87	NC_011353	TGGCG	2	10	148390	148399	0 %	20 %	60 %	20 %	209396497
88	NC_011353	TTTCA	2	10	150703	150712	20 %	60 %	0 %	20 %	209396925
89	NC_011353	CCGCA	2	10	153439	153448	20 %	0 %	20 %	60 %	209399403
90	NC_011353	CCTTT	2	10	155404	155413	0 %	60 %	0 %	40 %	209396930
91	NC_011353	TTTAA	2	10	156964	156973	40 %	60 %	0 %	0 %	209400978
92	NC_011353	TGGTT	2	10	157326	157335	0 %	60 %	40 %	0 %	209396258
93	NC_011353	GCGAG	2	10	162726	162735	20 %	0 %	60 %	20 %	209398537
94	NC_011353	GGCGT	2	10	163164	163173	0 %	20 %	60 %	20 %	209398537
95	NC_011353	ACCAC	2	10	166067	166076	40 %	0 %	0 %	60 %	209400335
96	NC_011353	GGCGT	2	10	167770	167779	0 %	20 %	60 %	20 %	209396555
97	NC_011353	CGACG	2	10	168809	168818	20 %	0 %	40 %	40 %	209396555
98	NC_011353	CTGCG	2	10	170945	170954	0 %	20 %	40 %	40 %	209400125
99	NC_011353	AAAAC	2	10	172796	172805	80 %	0 %	0 %	20 %	209398761
100	NC_011353	TGGTT	2	10	173053	173062	0 %	60 %	40 %	0 %	209398761
101	NC_011353	AACCT	2	10	175134	175143	40 %	20 %	0 %	40 %	209400721
102	NC_011353	TGGTC	2	10	175176	175185	0 %	40 %	40 %	20 %	209400721
103	NC_011353	TGGCG	2	10	176421	176430	0 %	20 %	60 %	20 %	209396292
104	NC_011353	GGTCC	2	10	181985	181994	0 %	20 %	40 %	40 %	209397803
105	NC_011353	ACGGG	2	10	183902	183911	20 %	0 %	60 %	20 %	209396609
106	NC_011353	GTGAT	2	10	186061	186070	20 %	40 %	40 %	0 %	209395925
107	NC_011353	GTGAT	2	10	186352	186361	20 %	40 %	40 %	0 %	209395925
108	NC_011353	GCCAG	2	10	190071	190080	20 %	0 %	40 %	40 %	209399551
109	NC_011353	GTTCT	2	10	191512	191521	0 %	60 %	20 %	20 %	209399551
110	NC_011353	CTGAA	2	10	193504	193513	40 %	20 %	20 %	20 %	209399355
111	NC_011353	AAGCG	2	10	193568	193577	40 %	0 %	40 %	20 %	209399355
112	NC_011353	TGGTG	2	10	195474	195483	0 %	40 %	60 %	0 %	209397446
113	NC_011353	TGCAC	2	10	195600	195609	20 %	20 %	20 %	40 %	209397446
114	NC_011353	TGCGC	2	10	195993	196002	0 %	20 %	40 %	40 %	209397446
115	NC_011353	CATGG	2	10	197694	197703	20 %	20 %	40 %	20 %	209395740
116	NC_011353	CAGAT	2	10	198733	198742	40 %	20 %	20 %	20 %	209396854
117	NC_011353	ACTTT	2	10	198866	198875	20 %	60 %	0 %	20 %	209396854
118	NC_011353	GACGT	2	10	202786	202795	20 %	20 %	40 %	20 %	209400867
119	NC_011353	CGACG	2	10	204612	204621	20 %	0 %	40 %	40 %	209398323
120	NC_011353	CCACG	2	10	206453	206462	20 %	0 %	20 %	60 %	209396534
121	NC_011353	ATGCC	2	10	207180	207189	20 %	20 %	20 %	40 %	209399982
122	NC_011353	TGGCC	2	10	208506	208515	0 %	20 %	40 %	40 %	209398477
123	NC_011353	ACCGC	2	10	208519	208528	20 %	0 %	20 %	60 %	209398477
124	NC_011353	GTAAC	2	10	209249	209258	40 %	20 %	20 %	20 %	209398477
125	NC_011353	AGCCG	2	10	209877	209886	20 %	0 %	40 %	40 %	209398477
126	NC_011353	GGTGG	2	10	209986	209995	0 %	20 %	80 %	0 %	209398477
127	NC_011353	TTAGT	2	10	216947	216956	20 %	60 %	20 %	0 %	209399704
128	NC_011353	ACGGT	2	10	221030	221039	20 %	20 %	40 %	20 %	209398549
129	NC_011353	TGATT	2	10	223871	223880	20 %	60 %	20 %	0 %	209400462
130	NC_011353	CGCAA	2	10	225321	225330	40 %	0 %	20 %	40 %	209399329
131	NC_011353	GTGAA	2	10	235703	235712	40 %	20 %	40 %	0 %	209398090
132	NC_011353	TAATT	2	10	235887	235896	40 %	60 %	0 %	0 %	209398090
133	NC_011353	ACTGG	2	10	238825	238834	20 %	20 %	40 %	20 %	209400502
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251	NC_011353	TGACA	2	10	453978	453987	40 %	20 %	20 %	20 %	209399774
252	NC_011353	GTTGA	2	10	461131	461140	20 %	40 %	40 %	0 %	209395719
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254	NC_011353	GATGG	2	10	465327	465336	20 %	20 %	60 %	0 %	209398220
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256	NC_011353	GCAAC	2	10	466894	466903	40 %	0 %	20 %	40 %	209397649
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258	NC_011353	TTTTC	2	10	468996	469005	0 %	80 %	0 %	20 %	209396678
259	NC_011353	GTTTA	2	10	472372	472381	20 %	60 %	20 %	0 %	209400752
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