MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011350	CT	3	6	326	331	0 %	50 %	0 %	50 %	209395592
2	NC_011350	AT	3	6	399	404	50 %	50 %	0 %	0 %	209395592
3	NC_011350	TA	3	6	500	505	50 %	50 %	0 %	0 %	209395592
4	NC_011350	TC	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	209395598
5	NC_011350	AT	3	6	1537	1542	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
6	NC_011350	CT	3	6	2035	2040	0 %	50 %	0 %	50 %	209395598
7	NC_011350	AT	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
8	NC_011350	AT	3	6	2368	2373	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
9	NC_011350	TA	3	6	2657	2662	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
10	NC_011350	AT	3	6	2877	2882	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
11	NC_011350	TA	3	6	2960	2965	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
12	NC_011350	AG	3	6	3309	3314	50 %	0 %	50 %	0 %	209395598
13	NC_011350	GA	3	6	3471	3476	50 %	0 %	50 %	0 %	209395598
14	NC_011350	TA	3	6	3521	3526	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
15	NC_011350	TA	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
16	NC_011350	CA	3	6	3676	3681	50 %	0 %	0 %	50 %	209395598
17	NC_011350	CA	4	8	3867	3874	50 %	0 %	0 %	50 %	209395565
18	NC_011350	TA	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	209395565
19	NC_011350	TC	3	6	4405	4410	0 %	50 %	0 %	50 %	209395565
20	NC_011350	GA	3	6	4504	4509	50 %	0 %	50 %	0 %	209395565
21	NC_011350	GA	3	6	4966	4971	50 %	0 %	50 %	0 %	209395565
22	NC_011350	TA	3	6	5313	5318	50 %	50 %	0 %	0 %	209395565
23	NC_011350	CA	3	6	5740	5745	50 %	0 %	0 %	50 %	209395565
24	NC_011350	CA	3	6	5813	5818	50 %	0 %	0 %	50 %	209395565
25	NC_011350	CA	3	6	5961	5966	50 %	0 %	0 %	50 %	209395593
26	NC_011350	GA	3	6	5981	5986	50 %	0 %	50 %	0 %	209395593
27	NC_011350	TA	3	6	7953	7958	50 %	50 %	0 %	0 %	209395570
28	NC_011350	CT	3	6	9785	9790	0 %	50 %	0 %	50 %	209395582
29	NC_011350	CA	3	6	10083	10088	50 %	0 %	0 %	50 %	209395582
30	NC_011350	GT	3	6	10505	10510	0 %	50 %	50 %	0 %	209395555
31	NC_011350	TC	4	8	11462	11469	0 %	50 %	0 %	50 %	209395541
32	NC_011350	CG	3	6	11812	11817	0 %	0 %	50 %	50 %	209395535
33	NC_011350	CG	3	6	11961	11966	0 %	0 %	50 %	50 %	209395535
34	NC_011350	CG	3	6	12091	12096	0 %	0 %	50 %	50 %	209395535
35	NC_011350	GC	3	6	13679	13684	0 %	0 %	50 %	50 %	209395601
36	NC_011350	TC	4	8	13783	13790	0 %	50 %	0 %	50 %	209395601
37	NC_011350	CA	3	6	14120	14125	50 %	0 %	0 %	50 %	209395583
38	NC_011350	CT	3	6	15021	15026	0 %	50 %	0 %	50 %	209395611
39	NC_011350	TC	4	8	16879	16886	0 %	50 %	0 %	50 %	209395591
40	NC_011350	GC	3	6	19507	19512	0 %	0 %	50 %	50 %	209395633
41	NC_011350	GC	3	6	20051	20056	0 %	0 %	50 %	50 %	209395635
42	NC_011350	AC	3	6	21846	21851	50 %	0 %	0 %	50 %	209395534
43	NC_011350	TG	3	6	22034	22039	0 %	50 %	50 %	0 %	209395534
44	NC_011350	TG	3	6	22051	22056	0 %	50 %	50 %	0 %	209395534
45	NC_011350	CA	3	6	23382	23387	50 %	0 %	0 %	50 %	209395564
46	NC_011350	TG	3	6	23434	23439	0 %	50 %	50 %	0 %	209395564
47	NC_011350	TG	3	6	23645	23650	0 %	50 %	50 %	0 %	209395625
48	NC_011350	GC	3	6	23978	23983	0 %	0 %	50 %	50 %	209395554
49	NC_011350	CA	3	6	24238	24243	50 %	0 %	0 %	50 %	209395554
50	NC_011350	TC	3	6	25543	25548	0 %	50 %	0 %	50 %	209395626
51	NC_011350	GT	3	6	27210	27215	0 %	50 %	50 %	0 %	209395630
52	NC_011350	CG	3	6	27916	27921	0 %	0 %	50 %	50 %	209395615
53	NC_011350	GA	3	6	28091	28096	50 %	0 %	50 %	0 %	209395615
54	NC_011350	GC	3	6	29299	29304	0 %	0 %	50 %	50 %	209395595
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60	NC_011350	TG	3	6	33384	33389	0 %	50 %	50 %	0 %	209395612
61	NC_011350	AC	3	6	33599	33604	50 %	0 %	0 %	50 %	209395620
62	NC_011350	CT	3	6	34944	34949	0 %	50 %	0 %	50 %	209395606
63	NC_011350	GT	4	8	34956	34963	0 %	50 %	50 %	0 %	209395606
64	NC_011350	GT	3	6	34969	34974	0 %	50 %	50 %	0 %	209395606
65	NC_011350	GT	3	6	35769	35774	0 %	50 %	50 %	0 %	209395548
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68	NC_011350	TG	3	6	36875	36880	0 %	50 %	50 %	0 %	209395548
69	NC_011350	AT	3	6	37144	37149	50 %	50 %	0 %	0 %	209395548
70	NC_011350	AG	3	6	38863	38868	50 %	0 %	50 %	0 %	209395603
71	NC_011350	GA	3	6	39249	39254	50 %	0 %	50 %	0 %	209395603
72	NC_011350	AG	3	6	39622	39627	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
73	NC_011350	AT	3	6	40387	40392	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
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75	NC_011350	AT	3	6	41025	41030	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
76	NC_011350	AT	3	6	41640	41645	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
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78	NC_011350	AT	3	6	42520	42525	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
79	NC_011350	AG	3	6	42529	42534	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
80	NC_011350	TA	3	6	42553	42558	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
81	NC_011350	AT	3	6	42727	42732	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
82	NC_011350	AT	3	6	42810	42815	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
83	NC_011350	AT	3	6	43044	43049	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
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88	NC_011350	TA	3	6	45150	45155	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
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91	NC_011350	AT	4	8	45361	45368	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
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109	NC_011350	GA	3	6	52527	52532	50 %	0 %	50 %	0 %	209395578
110	NC_011350	GA	3	6	52544	52549	50 %	0 %	50 %	0 %	209395578
111	NC_011350	AG	3	6	52747	52752	50 %	0 %	50 %	0 %	209395578
112	NC_011350	GA	3	6	53118	53123	50 %	0 %	50 %	0 %	209395563
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133	NC_011350	AT	3	6	66641	66646	50 %	50 %	0 %	0 %	209395572
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.