MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET49

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010697	GAAT	2	8	168	175	50 %	25 %	25 %	0 %	189017122
2	NC_010697	TTCA	2	8	411	418	25 %	50 %	0 %	25 %	189017122
3	NC_010697	AACG	2	8	501	508	50 %	0 %	25 %	25 %	189017122
4	NC_010697	GGTT	2	8	1205	1212	0 %	50 %	50 %	0 %	189017123
5	NC_010697	AGCG	2	8	1300	1307	25 %	0 %	50 %	25 %	189017123
6	NC_010697	ACTT	2	8	1696	1703	25 %	50 %	0 %	25 %	189017124
7	NC_010697	GAAA	2	8	1781	1788	75 %	0 %	25 %	0 %	189017124
8	NC_010697	TTAT	2	8	1946	1953	25 %	75 %	0 %	0 %	189017125
9	NC_010697	GAAA	2	8	2127	2134	75 %	0 %	25 %	0 %	189017125
10	NC_010697	AGAA	2	8	2150	2157	75 %	0 %	25 %	0 %	189017125
11	NC_010697	ACTT	2	8	2655	2662	25 %	50 %	0 %	25 %	189017126
12	NC_010697	GTGA	2	8	3111	3118	25 %	25 %	50 %	0 %	189017127
13	NC_010697	AGGT	2	8	3286	3293	25 %	25 %	50 %	0 %	189017127
14	NC_010697	AACT	2	8	3542	3549	50 %	25 %	0 %	25 %	189017127
15	NC_010697	AACA	2	8	3694	3701	75 %	0 %	0 %	25 %	189017128
16	NC_010697	AATG	2	8	3923	3930	50 %	25 %	25 %	0 %	189017129
17	NC_010697	TTAC	2	8	3946	3953	25 %	50 %	0 %	25 %	189017129
18	NC_010697	AGAT	2	8	4626	4633	50 %	25 %	25 %	0 %	189017130
19	NC_010697	CAGC	2	8	5029	5036	25 %	0 %	25 %	50 %	189017130
20	NC_010697	GCAC	2	8	5243	5250	25 %	0 %	25 %	50 %	189017130
21	NC_010697	CCAG	2	8	6243	6250	25 %	0 %	25 %	50 %	189017130
22	NC_010697	ACGA	2	8	6412	6419	50 %	0 %	25 %	25 %	189017130
23	NC_010697	TTAA	2	8	6957	6964	50 %	50 %	0 %	0 %	189017131
24	NC_010697	AATA	2	8	8542	8549	75 %	25 %	0 %	0 %	189017133
25	NC_010697	ATGA	2	8	8608	8615	50 %	25 %	25 %	0 %	189017133
26	NC_010697	CAAT	2	8	9949	9956	50 %	25 %	0 %	25 %	189017135
27	NC_010697	GCCT	3	12	10565	10576	0 %	25 %	25 %	50 %	189017135
28	NC_010697	ATTG	3	12	10850	10861	25 %	50 %	25 %	0 %	189017135
29	NC_010697	ATCA	2	8	10948	10955	50 %	25 %	0 %	25 %	189017136
30	NC_010697	TGGT	2	8	12084	12091	0 %	50 %	50 %	0 %	189017137
31	NC_010697	GAAA	2	8	14417	14424	75 %	0 %	25 %	0 %	189017139
32	NC_010697	GTGG	2	8	14702	14709	0 %	25 %	75 %	0 %	189017139
33	NC_010697	GATT	2	8	14777	14784	25 %	50 %	25 %	0 %	189017139
34	NC_010697	TAAA	2	8	14928	14935	75 %	25 %	0 %	0 %	189017140
35	NC_010697	CCTG	2	8	15115	15122	0 %	25 %	25 %	50 %	189017140
36	NC_010697	CTAC	2	8	15535	15542	25 %	25 %	0 %	50 %	189017140
37	NC_010697	CTTA	2	8	16209	16216	25 %	50 %	0 %	25 %	189017140
38	NC_010697	AAGG	2	8	16526	16533	50 %	0 %	50 %	0 %	189017140
39	NC_010697	GAAA	2	8	16766	16773	75 %	0 %	25 %	0 %	189017141
40	NC_010697	CAGG	2	8	16836	16843	25 %	0 %	50 %	25 %	189017141
41	NC_010697	GCTT	2	8	16898	16905	0 %	50 %	25 %	25 %	189017141
42	NC_010697	ATCC	2	8	17004	17011	25 %	25 %	0 %	50 %	189017141
43	NC_010697	CAGG	2	8	17348	17355	25 %	0 %	50 %	25 %	189017141
44	NC_010697	GTCA	2	8	17426	17433	25 %	25 %	25 %	25 %	189017141
45	NC_010697	CTGG	2	8	17488	17495	0 %	25 %	50 %	25 %	189017141
46	NC_010697	AGTG	2	8	17702	17709	25 %	25 %	50 %	0 %	189017141
47	NC_010697	TCAG	2	8	17949	17956	25 %	25 %	25 %	25 %	189017141
48	NC_010697	ACAG	2	8	18253	18260	50 %	0 %	25 %	25 %	189017142
49	NC_010697	CGGG	2	8	18280	18287	0 %	0 %	75 %	25 %	189017142
50	NC_010697	GTCT	2	8	18318	18325	0 %	50 %	25 %	25 %	189017142
51	NC_010697	TGGC	2	8	19184	19191	0 %	25 %	50 %	25 %	189017143
52	NC_010697	AAAC	2	8	19277	19284	75 %	0 %	0 %	25 %	189017143
53	NC_010697	CGGG	2	8	19647	19654	0 %	0 %	75 %	25 %	189017143
54	NC_010697	TTAA	2	8	19820	19827	50 %	50 %	0 %	0 %	189017143
55	NC_010697	GATA	2	8	20037	20044	50 %	25 %	25 %	0 %	189017144
56	NC_010697	TTTC	2	8	20517	20524	0 %	75 %	0 %	25 %	189017144
57	NC_010697	GATG	2	8	20595	20602	25 %	25 %	50 %	0 %	189017144
58	NC_010697	TTAA	2	8	20972	20979	50 %	50 %	0 %	0 %	189017144
59	NC_010697	GTAT	2	8	21964	21971	25 %	50 %	25 %	0 %	189017146
60	NC_010697	CAGC	2	8	22153	22160	25 %	0 %	25 %	50 %	189017146
61	NC_010697	CAGC	2	8	23086	23093	25 %	0 %	25 %	50 %	189017147
62	NC_010697	GGGT	2	8	23911	23918	0 %	25 %	75 %	0 %	189017147
63	NC_010697	TTAG	2	8	24981	24988	25 %	50 %	25 %	0 %	189017148
64	NC_010697	TGGT	2	8	25929	25936	0 %	50 %	50 %	0 %	189017149
65	NC_010697	CCGG	2	8	27113	27120	0 %	0 %	50 %	50 %	189017150
66	NC_010697	TCTT	2	8	27645	27652	0 %	75 %	0 %	25 %	189017151
67	NC_010697	TATT	2	8	28206	28213	25 %	75 %	0 %	0 %	189017153
68	NC_010697	TGCT	2	8	28563	28570	0 %	50 %	25 %	25 %	189017154
69	NC_010697	TGCC	2	8	30134	30141	0 %	25 %	25 %	50 %	189017154
70	NC_010697	AAAG	2	8	30464	30471	75 %	0 %	25 %	0 %	189017154
71	NC_010697	ATTC	2	8	30899	30906	25 %	50 %	0 %	25 %	189017155
72	NC_010697	GTTT	2	8	32776	32783	0 %	75 %	25 %	0 %	189017159
73	NC_010697	GTTA	2	8	33701	33708	25 %	50 %	25 %	0 %	189017162
74	NC_010697	TGCT	2	8	34791	34798	0 %	50 %	25 %	25 %	189017163
75	NC_010697	TCAT	2	8	36055	36062	25 %	50 %	0 %	25 %	189017166
76	NC_010697	ATTT	2	8	36287	36294	25 %	75 %	0 %	0 %	189017166
77	NC_010697	TTGT	2	8	36431	36438	0 %	75 %	25 %	0 %	189017167
78	NC_010697	TGAT	2	8	37593	37600	25 %	50 %	25 %	0 %	189017168
79	NC_010697	TCTT	2	8	37632	37639	0 %	75 %	0 %	25 %	189017168
80	NC_010697	GAAA	2	8	38064	38071	75 %	0 %	25 %	0 %	189017169
81	NC_010697	GTAC	2	8	38302	38309	25 %	25 %	25 %	25 %	189017169
82	NC_010697	CAAA	2	8	38375	38382	75 %	0 %	0 %	25 %	189017169
83	NC_010697	GACG	2	8	38385	38392	25 %	0 %	50 %	25 %	189017169
84	NC_010697	GTGC	2	8	38480	38487	0 %	25 %	50 %	25 %	189017169
85	NC_010697	GATT	2	8	38571	38578	25 %	50 %	25 %	0 %	189017169
86	NC_010697	TACA	2	8	38636	38643	50 %	25 %	0 %	25 %	189017170
87	NC_010697	CATA	2	8	38645	38652	50 %	25 %	0 %	25 %	189017170
88	NC_010697	TGGC	2	8	38673	38680	0 %	25 %	50 %	25 %	189017170
89	NC_010697	ATTG	2	8	38710	38717	25 %	50 %	25 %	0 %	189017170
90	NC_010697	CGGA	2	8	38781	38788	25 %	0 %	50 %	25 %	189017170
91	NC_010697	ACGA	2	8	39174	39181	50 %	0 %	25 %	25 %	189017171
92	NC_010697	CTGC	2	8	39632	39639	0 %	25 %	25 %	50 %	189017171
93	NC_010697	TGAT	2	8	40004	40011	25 %	50 %	25 %	0 %	189017171
94	NC_010697	CTTG	2	8	40348	40355	0 %	50 %	25 %	25 %	189017171
95	NC_010697	TGCT	2	8	40404	40411	0 %	50 %	25 %	25 %	189017171
96	NC_010697	ATCC	2	8	40526	40533	25 %	25 %	0 %	50 %	189017171
97	NC_010697	CTCC	2	8	40859	40866	0 %	25 %	0 %	75 %	189017171
98	NC_010697	ATTA	2	8	41169	41176	50 %	50 %	0 %	0 %	189017171
99	NC_010697	CTTT	2	8	41652	41659	0 %	75 %	0 %	25 %	189017171
100	NC_010697	TTGA	2	8	42131	42138	25 %	50 %	25 %	0 %	189017173
101	NC_010697	ACTG	2	8	42801	42808	25 %	25 %	25 %	25 %	189017174
102	NC_010697	GTTT	2	8	43009	43016	0 %	75 %	25 %	0 %	189017174
103	NC_010697	TGAT	2	8	43427	43434	25 %	50 %	25 %	0 %	189017175
104	NC_010697	TACC	2	8	43634	43641	25 %	25 %	0 %	50 %	189017175
105	NC_010697	TGAT	2	8	43849	43856	25 %	50 %	25 %	0 %	189017175
106	NC_010697	CAAA	2	8	44108	44115	75 %	0 %	0 %	25 %	189017176
107	NC_010697	TGAT	2	8	45717	45724	25 %	50 %	25 %	0 %	189017178
108	NC_010697	GCCA	2	8	46538	46545	25 %	0 %	25 %	50 %	189017179
109	NC_010697	TTTC	2	8	46997	47004	0 %	75 %	0 %	25 %	189017180
110	NC_010697	GTAA	2	8	47021	47028	50 %	25 %	25 %	0 %	189017181
111	NC_010697	TACA	2	8	47622	47629	50 %	25 %	0 %	25 %	189017182

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.