MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET35

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010696	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535912
2	NC_010696	AGA	2	6	402	407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535912
3	NC_010696	TTA	2	6	674	679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535912
4	NC_010696	TAC	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535912
5	NC_010696	TTG	2	6	758	763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535912
6	NC_010696	GCC	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535912
7	NC_010696	AGT	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535912
8	NC_010696	ATT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535912
9	NC_010696	GCA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535913
10	NC_010696	TCA	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535913
11	NC_010696	GCC	2	6	1185	1190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535913
12	NC_010696	GAA	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535913
13	NC_010696	TGT	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535913
14	NC_010696	GAA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535913
15	NC_010696	AGG	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535914
16	NC_010696	AGA	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535914
17	NC_010696	ATG	3	9	1920	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535914
18	NC_010696	AAG	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535914
19	NC_010696	TGC	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535914
20	NC_010696	GAT	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535914
21	NC_010696	CTG	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535915
22	NC_010696	TTA	2	6	2592	2597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535915
23	NC_010696	TGC	2	6	2646	2651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535915
24	NC_010696	TAC	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535915
25	NC_010696	AAT	2	6	2671	2676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535915
26	NC_010696	TAA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535915
27	NC_010696	GTA	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535915
28	NC_010696	AGA	2	6	2850	2855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535915
29	NC_010696	AAG	2	6	2942	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535915
30	NC_010696	GCA	2	6	2975	2980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535916
31	NC_010696	TCT	2	6	2997	3002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535916
32	NC_010696	TTG	2	6	3012	3017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535916
33	NC_010696	GCT	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535916
34	NC_010696	GGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535916
35	NC_010696	GTG	2	6	3066	3071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535916
36	NC_010696	GCG	2	6	3128	3133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535916
37	NC_010696	CTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535916
38	NC_010696	GTT	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535916
39	NC_010696	TTG	2	6	3204	3209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535916
40	NC_010696	CGG	2	6	3262	3267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535916
41	NC_010696	TAA	2	6	3272	3277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535916
42	NC_010696	TAT	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535917
43	NC_010696	ATG	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535917
44	NC_010696	AAG	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535917
45	NC_010696	GAT	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535917
46	NC_010696	CGT	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535917
47	NC_010696	ATC	2	6	3529	3534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535917
48	NC_010696	GGC	2	6	3628	3633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535917
49	NC_010696	CTT	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535917
50	NC_010696	ATG	3	9	3843	3851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
51	NC_010696	AAT	2	6	3983	3988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535918
52	NC_010696	TAC	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535918
53	NC_010696	TTA	2	6	4057	4062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535918
54	NC_010696	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
55	NC_010696	GCA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535918
56	NC_010696	ATC	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535918
57	NC_010696	AGA	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535918
58	NC_010696	AGT	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
59	NC_010696	ATG	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
60	NC_010696	TGT	2	6	4354	4359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535918
61	NC_010696	TGC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535918
62	NC_010696	TGA	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
63	NC_010696	AAG	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535918
64	NC_010696	AGG	2	6	4722	4727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535918
65	NC_010696	CAA	2	6	4785	4790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535918
66	NC_010696	ATG	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
67	NC_010696	CAG	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535918
68	NC_010696	ACA	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535918
69	NC_010696	ATG	3	9	5093	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
70	NC_010696	GTA	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
71	NC_010696	GAT	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
72	NC_010696	GAA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535918
73	NC_010696	AAC	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535918
74	NC_010696	ATG	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
75	NC_010696	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535918
76	NC_010696	GTT	2	6	5587	5592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535918
77	NC_010696	GCG	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535918
78	NC_010696	TGA	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535918
79	NC_010696	AGC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535918
80	NC_010696	CAT	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535918
81	NC_010696	AAT	2	6	6077	6082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535918
82	NC_010696	TAA	2	6	6161	6166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535918
83	NC_010696	ACA	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535919
84	NC_010696	ACA	2	6	6293	6298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535919
85	NC_010696	TGA	2	6	6413	6418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535919
86	NC_010696	AGT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535919
87	NC_010696	TAA	2	6	6443	6448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535919
88	NC_010696	CTG	2	6	6454	6459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535919
89	NC_010696	GTG	2	6	6607	6612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535919
90	NC_010696	CAG	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535919
91	NC_010696	CAG	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535920
92	NC_010696	CGG	2	6	6994	6999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535920
93	NC_010696	AGC	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535920
94	NC_010696	AGG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535920
95	NC_010696	GAA	2	6	7100	7105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535921
96	NC_010696	TGT	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535921
97	NC_010696	TGA	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535921
98	NC_010696	TTG	2	6	7557	7562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535921
99	NC_010696	AAT	2	6	7603	7608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535921
100	NC_010696	GCC	2	6	7626	7631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535921
101	NC_010696	TGA	3	9	7774	7782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535921
102	NC_010696	TTC	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535922
103	NC_010696	TGA	2	6	7989	7994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535922
104	NC_010696	GAT	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535922
105	NC_010696	GAT	2	6	8065	8070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535922
106	NC_010696	TAA	2	6	8184	8189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535922
107	NC_010696	CTT	2	6	8231	8236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535922
108	NC_010696	GAT	2	6	8386	8391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535922
109	NC_010696	CAT	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535922
110	NC_010696	TGA	2	6	8646	8651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535922
111	NC_010696	GAT	2	6	8705	8710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535923
112	NC_010696	CGG	2	6	8776	8781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535923
113	NC_010696	TAA	2	6	8793	8798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535923
114	NC_010696	GGT	2	6	8811	8816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535923
115	NC_010696	CCG	2	6	8865	8870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535923
116	NC_010696	GAA	2	6	8884	8889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535923
117	NC_010696	TGA	2	6	8896	8901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535923
118	NC_010696	GAA	2	6	8993	8998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535923
119	NC_010696	GCG	2	6	9001	9006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535923
120	NC_010696	GGC	2	6	9063	9068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535923
121	NC_010696	CAG	2	6	9092	9097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535923
122	NC_010696	TAA	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535923
123	NC_010696	TTG	2	6	9308	9313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535923
124	NC_010696	ACG	2	6	9414	9419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535923
125	NC_010696	GCA	2	6	9420	9425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535923
126	NC_010696	GGC	2	6	9626	9631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535923
127	NC_010696	CAG	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535923
128	NC_010696	TAA	3	9	9697	9705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535923
129	NC_010696	ATA	2	6	9720	9725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535923
130	NC_010696	GCA	2	6	9734	9739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535923
131	NC_010696	AAT	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535923
132	NC_010696	GAT	2	6	9943	9948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535924
133	NC_010696	GAT	2	6	9952	9957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535924
134	NC_010696	TTA	2	6	10003	10008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535924
135	NC_010696	GGT	2	6	10159	10164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535924
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252	NC_010696	AAC	2	6	23589	23594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535939
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254	NC_010696	GTA	2	6	23629	23634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535939
255	NC_010696	TGC	2	6	23655	23660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535939
256	NC_010696	TAT	2	6	23867	23872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535939
257	NC_010696	GCT	3	9	23876	23884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535939
258	NC_010696	CTG	2	6	23892	23897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535939
259	NC_010696	GTG	2	6	23903	23908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535939
260	NC_010696	CTG	2	6	23931	23936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535939
261	NC_010696	CTT	2	6	23964	23969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535939
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267	NC_010696	TCA	2	6	24754	24759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535939
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368	NC_010696	GCC	2	6	34437	34442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535953

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.