MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET09

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010695	CAG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535904
2	NC_010695	GAT	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535904
3	NC_010695	ATC	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535904
4	NC_010695	TTA	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535904
5	NC_010695	GCT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535904
6	NC_010695	CAG	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535904
7	NC_010695	CTA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535904
8	NC_010695	TTC	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535904
9	NC_010695	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535904
10	NC_010695	GAC	2	6	944	949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535904
11	NC_010695	AGC	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
12	NC_010695	CAA	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535905
13	NC_010695	ACG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
14	NC_010695	GCA	2	6	1159	1164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
15	NC_010695	GCA	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535905
16	NC_010695	CAA	2	6	1205	1210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535905
17	NC_010695	TGC	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535905
18	NC_010695	TGA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535905
19	NC_010695	GAA	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535905
20	NC_010695	AGC	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
21	NC_010695	CTT	2	6	1890	1895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535906
22	NC_010695	AAT	2	6	1914	1919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
23	NC_010695	AGA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535906
24	NC_010695	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535906
25	NC_010695	AGC	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
26	NC_010695	ATT	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535906
27	NC_010695	TGA	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
28	NC_010695	ATC	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
29	NC_010695	AAT	2	6	2211	2216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
30	NC_010695	TGA	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
31	NC_010695	TGC	2	6	2406	2411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535906
32	NC_010695	GAC	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
33	NC_010695	ATT	2	6	2434	2439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535906
34	NC_010695	TAA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
35	NC_010695	CAT	2	6	2693	2698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
36	NC_010695	TGA	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
37	NC_010695	TCC	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188535906
38	NC_010695	GAA	2	6	2831	2836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535906
39	NC_010695	TGA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
40	NC_010695	CAA	2	6	2929	2934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535906
41	NC_010695	TAC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
42	NC_010695	ACC	2	6	2994	2999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535906
43	NC_010695	CAT	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535906
44	NC_010695	AAT	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535906
45	NC_010695	GAG	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535906
46	NC_010695	AGA	2	6	3389	3394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535906
47	NC_010695	TGA	2	6	3415	3420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535906
48	NC_010695	AGC	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535906
49	NC_010695	GCT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
50	NC_010695	TGA	2	6	3732	3737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535907
51	NC_010695	GCT	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
52	NC_010695	CTG	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
53	NC_010695	TCT	2	6	3980	3985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535907
54	NC_010695	ACG	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
55	NC_010695	TGA	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535907
56	NC_010695	GAG	2	6	4318	4323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535907
57	NC_010695	CCA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535907
58	NC_010695	GTG	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535907
59	NC_010695	TGC	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
60	NC_010695	ACG	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
61	NC_010695	TGG	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535907
62	NC_010695	AGG	2	6	4658	4663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535907
63	NC_010695	CTG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
64	NC_010695	CAA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535907
65	NC_010695	CTG	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
66	NC_010695	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535907
67	NC_010695	CTG	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
68	NC_010695	AGC	3	9	5005	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
69	NC_010695	AAC	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535907
70	NC_010695	CGG	3	9	5232	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535907
71	NC_010695	CCG	2	6	5282	5287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
72	NC_010695	AGC	3	9	5335	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
73	NC_010695	CCG	2	6	5396	5401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
74	NC_010695	GAG	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535907
75	NC_010695	TTC	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535907
76	NC_010695	CCG	2	6	5636	5641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
77	NC_010695	CTG	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
78	NC_010695	CTG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
79	NC_010695	CCG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535907
80	NC_010695	ACG	2	6	5939	5944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
81	NC_010695	TGC	2	6	5954	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
82	NC_010695	CGG	2	6	6000	6005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535907
83	NC_010695	TCA	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535907
84	NC_010695	CTG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535907
85	NC_010695	ACG	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535907
86	NC_010695	ATC	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535908
87	NC_010695	TCT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535908
88	NC_010695	GAA	2	6	6565	6570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535908
89	NC_010695	CGG	2	6	6681	6686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535908
90	NC_010695	CTG	2	6	6691	6696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535908
91	NC_010695	CTC	2	6	6859	6864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188535908
92	NC_010695	TGA	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535908
93	NC_010695	GGC	2	6	6913	6918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535908
94	NC_010695	TCG	2	6	6932	6937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535908
95	NC_010695	CTG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535909
96	NC_010695	TGA	2	6	7082	7087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535909
97	NC_010695	CAT	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535909
98	NC_010695	TTC	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535909
99	NC_010695	GGT	2	6	7297	7302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535909
100	NC_010695	TCA	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535909
101	NC_010695	CTG	2	6	7336	7341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535909
102	NC_010695	CGC	2	6	7599	7604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535909
103	NC_010695	GCT	2	6	7701	7706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535909
104	NC_010695	CGC	2	6	7707	7712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535909
105	NC_010695	GTT	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535909
106	NC_010695	GCC	2	6	7916	7921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535909
107	NC_010695	GAG	2	6	8010	8015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535909
108	NC_010695	CCG	2	6	8030	8035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535909
109	NC_010695	GAT	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535909
110	NC_010695	GGC	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535910
111	NC_010695	CAG	2	6	8305	8310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535910
112	NC_010695	TGA	2	6	8429	8434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535910
113	NC_010695	TCA	2	6	8519	8524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535910
114	NC_010695	TGA	2	6	8562	8567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535910
115	NC_010695	GCT	2	6	8572	8577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535910
116	NC_010695	GCT	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535910

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.