MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET46

Total Repeats: 360

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010693	TGC	2	6	224	229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535864
2	NC_010693	CGT	3	9	339	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535864
3	NC_010693	TCA	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535864
4	NC_010693	CCA	2	6	567	572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535864
5	NC_010693	AGC	2	6	638	643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535864
6	NC_010693	GCT	3	9	855	863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535864
7	NC_010693	CGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535865
8	NC_010693	CGG	2	6	1616	1621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535865
9	NC_010693	TGA	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535865
10	NC_010693	CAC	2	6	1890	1895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535865
11	NC_010693	CAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535865
12	NC_010693	ACG	2	6	1971	1976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535866
13	NC_010693	TAC	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535866
14	NC_010693	CGA	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535866
15	NC_010693	TGC	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535866
16	NC_010693	AGC	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535866
17	NC_010693	ACC	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535866
18	NC_010693	ATG	2	6	2313	2318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535866
19	NC_010693	GCC	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535866
20	NC_010693	GGA	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535866
21	NC_010693	GCA	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535866
22	NC_010693	GCA	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535866
23	NC_010693	ATG	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535866
24	NC_010693	GGT	2	6	2804	2809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535866
25	NC_010693	GAA	2	6	2864	2869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535866
26	NC_010693	ATG	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535866
27	NC_010693	GTG	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535866
28	NC_010693	GAC	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535866
29	NC_010693	GCT	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535866
30	NC_010693	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535867
31	NC_010693	AGT	2	6	3198	3203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535867
32	NC_010693	GGT	2	6	3231	3236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535867
33	NC_010693	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535867
34	NC_010693	TTC	2	6	3410	3415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535867
35	NC_010693	CGC	2	6	3478	3483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535867
36	NC_010693	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535867
37	NC_010693	CGG	2	6	3500	3505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535867
38	NC_010693	AAT	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535867
39	NC_010693	ACA	2	6	3664	3669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535867
40	NC_010693	GAG	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535867
41	NC_010693	GGA	2	6	3788	3793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535867
42	NC_010693	AGG	2	6	3808	3813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535867
43	NC_010693	GGC	2	6	3899	3904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535867
44	NC_010693	TGA	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535867
45	NC_010693	GCA	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535867
46	NC_010693	GCC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535867
47	NC_010693	TGA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535867
48	NC_010693	GTG	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535867
49	NC_010693	ACC	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535867
50	NC_010693	CAG	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535867
51	NC_010693	AAT	2	6	4857	4862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535867
52	NC_010693	GTC	2	6	4927	4932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535867
53	NC_010693	TCA	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535867
54	NC_010693	ATG	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535867
55	NC_010693	GGC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535867
56	NC_010693	TGA	3	9	5142	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535868
57	NC_010693	TGA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535868
58	NC_010693	TCG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535868
59	NC_010693	TCA	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535869
60	NC_010693	TAC	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535869
61	NC_010693	CAC	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535869
62	NC_010693	CAT	2	6	5823	5828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535869
63	NC_010693	GCC	3	9	5949	5957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535869
64	NC_010693	TAC	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535869
65	NC_010693	CCA	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535870
66	NC_010693	TCA	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535870
67	NC_010693	TTG	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535870
68	NC_010693	CAT	2	6	6309	6314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535870
69	NC_010693	ACC	2	6	6532	6537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535871
70	NC_010693	GAC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535871
71	NC_010693	CGA	2	6	6702	6707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535871
72	NC_010693	CAC	2	6	6921	6926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535871
73	NC_010693	GGC	2	6	7014	7019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535871
74	NC_010693	AAC	2	6	8438	8443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535872
75	NC_010693	TAA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535872
76	NC_010693	AAC	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535872
77	NC_010693	TAG	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535872
78	NC_010693	TAA	2	6	8670	8675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535872
79	NC_010693	CAT	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535872
80	NC_010693	TCA	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535872
81	NC_010693	ATT	2	6	8768	8773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535872
82	NC_010693	CTT	2	6	8824	8829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535872
83	NC_010693	TTA	2	6	8910	8915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535872
84	NC_010693	CAA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535872
85	NC_010693	AGC	2	6	8985	8990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535872
86	NC_010693	ATT	2	6	9303	9308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535873
87	NC_010693	TTA	3	9	9348	9356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535873
88	NC_010693	ATG	2	6	9570	9575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535873
89	NC_010693	GGT	2	6	9597	9602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535873
90	NC_010693	GAT	2	6	9653	9658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535873
91	NC_010693	AGC	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535873
92	NC_010693	TGG	2	6	9755	9760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188535873
93	NC_010693	AAT	2	6	9846	9851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535873
94	NC_010693	CGC	2	6	9868	9873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188535873
95	NC_010693	TTC	2	6	9957	9962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535873
96	NC_010693	CGG	2	6	10007	10012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535873
97	NC_010693	TAC	2	6	10021	10026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535873
98	NC_010693	TCG	2	6	10109	10114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535873
99	NC_010693	CAG	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535873
100	NC_010693	TGA	2	6	10214	10219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535873
101	NC_010693	ATG	2	6	10378	10383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535874
102	NC_010693	TTG	2	6	10452	10457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535874
103	NC_010693	CCA	2	6	10522	10527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188535874
104	NC_010693	TGA	2	6	10634	10639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535874
105	NC_010693	GGC	2	6	10644	10649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535874
106	NC_010693	CGG	2	6	10668	10673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188535874
107	NC_010693	GTC	2	6	10693	10698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535874
108	NC_010693	TGT	2	6	10854	10859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535874
109	NC_010693	GAG	2	6	10906	10911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188535874
110	NC_010693	CAT	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535874
111	NC_010693	AGT	2	6	11178	11183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535874
112	NC_010693	ACT	2	6	11199	11204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535874
113	NC_010693	ACA	2	6	11405	11410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535875
114	NC_010693	AGC	2	6	11423	11428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535875
115	NC_010693	GAA	2	6	11463	11468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188535875
116	NC_010693	CAG	2	6	11631	11636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535875
117	NC_010693	ACT	2	6	11761	11766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535875
118	NC_010693	CGT	2	6	13081	13086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535876
119	NC_010693	AAC	2	6	13145	13150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535876
120	NC_010693	TTA	2	6	13171	13176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535876
121	NC_010693	ACA	2	6	13590	13595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535876
122	NC_010693	AAT	2	6	13679	13684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535876
123	NC_010693	TCA	2	6	13723	13728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535876
124	NC_010693	TTC	2	6	13766	13771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535876
125	NC_010693	TCC	2	6	13996	14001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188535876
126	NC_010693	TGT	2	6	14088	14093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535876
127	NC_010693	GTT	2	6	14164	14169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535876
128	NC_010693	AGC	2	6	14255	14260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535876
129	NC_010693	TCC	2	6	14301	14306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188535876
130	NC_010693	GTT	3	9	14427	14435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535876
131	NC_010693	TAA	2	6	14477	14482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188535876
132	NC_010693	TCA	2	6	14514	14519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535876
133	NC_010693	ATC	2	6	14540	14545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535876
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135	NC_010693	TTA	2	6	14798	14803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535877
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138	NC_010693	TGA	2	6	14919	14924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535877
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142	NC_010693	GTA	2	6	15323	15328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535877
143	NC_010693	TGA	2	6	15427	15432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188535877
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149	NC_010693	TGT	2	6	16086	16091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188535878
150	NC_010693	CCT	2	6	16243	16248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188535878
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154	NC_010693	CAG	2	6	16534	16539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535878
155	NC_010693	CTG	2	6	16649	16654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188535878
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158	NC_010693	TTA	2	6	16745	16750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188535878
159	NC_010693	TTC	2	6	16779	16784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188535878
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161	NC_010693	AGC	2	6	16874	16879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535878
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239	NC_010693	TAC	2	6	29246	29251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188535884
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241	NC_010693	ACG	3	9	30107	30115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188535885
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249	NC_010693	CAA	2	6	31502	31507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535886
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253	NC_010693	AAC	2	6	31779	31784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188535886
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.