MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	T	6	6	3304	3309	0 %	100 %	0 %	0 %	170650792
2	NC_010488	T	7	7	4468	4474	0 %	100 %	0 %	0 %	170650904
3	NC_010488	T	6	6	4677	4682	0 %	100 %	0 %	0 %	170650904
4	NC_010488	T	7	7	4863	4869	0 %	100 %	0 %	0 %	170650904
5	NC_010488	C	6	6	4980	4985	0 %	0 %	0 %	100 %	170650904
6	NC_010488	A	6	6	5140	5145	100 %	0 %	0 %	0 %	170650820
7	NC_010488	A	6	6	5537	5542	100 %	0 %	0 %	0 %	170650820
8	NC_010488	C	6	6	6246	6251	0 %	0 %	0 %	100 %	170650784
9	NC_010488	T	6	6	8488	8493	0 %	100 %	0 %	0 %	170650784
10	NC_010488	T	6	6	8997	9002	0 %	100 %	0 %	0 %	170650784
11	NC_010488	C	6	6	9437	9442	0 %	0 %	0 %	100 %	170650784
12	NC_010488	C	6	6	11013	11018	0 %	0 %	0 %	100 %	170650784
13	NC_010488	C	6	6	11343	11348	0 %	0 %	0 %	100 %	170650889
14	NC_010488	T	6	6	12801	12806	0 %	100 %	0 %	0 %	170650889
15	NC_010488	A	7	7	13186	13192	100 %	0 %	0 %	0 %	170650889
16	NC_010488	T	7	7	14265	14271	0 %	100 %	0 %	0 %	170650825
17	NC_010488	T	7	7	14653	14659	0 %	100 %	0 %	0 %	170650886
18	NC_010488	C	9	9	15166	15174	0 %	0 %	0 %	100 %	170650902
19	NC_010488	C	6	6	15755	15760	0 %	0 %	0 %	100 %	170650902
20	NC_010488	A	6	6	17078	17083	100 %	0 %	0 %	0 %	170650902
21	NC_010488	T	6	6	17549	17554	0 %	100 %	0 %	0 %	170650902
22	NC_010488	A	6	6	18668	18673	100 %	0 %	0 %	0 %	170650800
23	NC_010488	A	6	6	19153	19158	100 %	0 %	0 %	0 %	170650880
24	NC_010488	A	6	6	19221	19226	100 %	0 %	0 %	0 %	170650880
25	NC_010488	T	6	6	19325	19330	0 %	100 %	0 %	0 %	170650880
26	NC_010488	G	6	6	19693	19698	0 %	0 %	100 %	0 %	170650781
27	NC_010488	A	7	7	20004	20010	100 %	0 %	0 %	0 %	170650897
28	NC_010488	A	6	6	20272	20277	100 %	0 %	0 %	0 %	170650822
29	NC_010488	A	7	7	20907	20913	100 %	0 %	0 %	0 %	170650828
30	NC_010488	G	6	6	21219	21224	0 %	0 %	100 %	0 %	170650828
31	NC_010488	A	6	6	21451	21456	100 %	0 %	0 %	0 %	170650840
32	NC_010488	T	6	6	21901	21906	0 %	100 %	0 %	0 %	170650771
33	NC_010488	T	7	7	22585	22591	0 %	100 %	0 %	0 %	170650771
34	NC_010488	A	6	6	24145	24150	100 %	0 %	0 %	0 %	170650862
35	NC_010488	A	6	6	26896	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	170650810
36	NC_010488	G	6	6	27036	27041	0 %	0 %	100 %	0 %	170650810
37	NC_010488	T	6	6	27057	27062	0 %	100 %	0 %	0 %	170650810
38	NC_010488	C	6	6	28117	28122	0 %	0 %	0 %	100 %	170650779
39	NC_010488	C	6	6	28652	28657	0 %	0 %	0 %	100 %	170650779
40	NC_010488	T	7	7	29186	29192	0 %	100 %	0 %	0 %	170650779
41	NC_010488	A	6	6	30257	30262	100 %	0 %	0 %	0 %	170650794
42	NC_010488	T	6	6	30587	30592	0 %	100 %	0 %	0 %	170650794
43	NC_010488	T	7	7	30942	30948	0 %	100 %	0 %	0 %	170650806
44	NC_010488	C	6	6	32462	32467	0 %	0 %	0 %	100 %	170650812
45	NC_010488	A	7	7	33961	33967	100 %	0 %	0 %	0 %	170650906
46	NC_010488	T	6	6	33996	34001	0 %	100 %	0 %	0 %	170650906
47	NC_010488	T	6	6	34695	34700	0 %	100 %	0 %	0 %	170650856
48	NC_010488	T	6	6	34704	34709	0 %	100 %	0 %	0 %	170650856
49	NC_010488	A	7	7	35206	35212	100 %	0 %	0 %	0 %	170650824
50	NC_010488	A	6	6	35714	35719	100 %	0 %	0 %	0 %	170650783
51	NC_010488	A	6	6	35915	35920	100 %	0 %	0 %	0 %	170650783
52	NC_010488	T	6	6	36511	36516	0 %	100 %	0 %	0 %	170650851
53	NC_010488	A	6	6	36519	36524	100 %	0 %	0 %	0 %	170650851
54	NC_010488	T	6	6	36836	36841	0 %	100 %	0 %	0 %	170650851
55	NC_010488	A	6	6	37299	37304	100 %	0 %	0 %	0 %	170650864
56	NC_010488	A	6	6	37608	37613	100 %	0 %	0 %	0 %	170650864
57	NC_010488	T	6	6	39211	39216	0 %	100 %	0 %	0 %	170650769
58	NC_010488	T	8	8	39266	39273	0 %	100 %	0 %	0 %	170650769
59	NC_010488	T	6	6	44306	44311	0 %	100 %	0 %	0 %	170650901
60	NC_010488	C	6	6	45761	45766	0 %	0 %	0 %	100 %	170650791
61	NC_010488	T	6	6	46854	46859	0 %	100 %	0 %	0 %	170650805
62	NC_010488	T	7	7	47022	47028	0 %	100 %	0 %	0 %	170650805
63	NC_010488	T	6	6	47455	47460	0 %	100 %	0 %	0 %	170650805
64	NC_010488	T	6	6	48261	48266	0 %	100 %	0 %	0 %	170650821
65	NC_010488	A	6	6	48281	48286	100 %	0 %	0 %	0 %	170650821
66	NC_010488	A	6	6	48721	48726	100 %	0 %	0 %	0 %	170650850
67	NC_010488	T	6	6	49813	49818	0 %	100 %	0 %	0 %	170650827
68	NC_010488	A	6	6	51199	51204	100 %	0 %	0 %	0 %	170650843
69	NC_010488	T	6	6	51803	51808	0 %	100 %	0 %	0 %	170650785
70	NC_010488	T	6	6	52592	52597	0 %	100 %	0 %	0 %	170650903
71	NC_010488	T	6	6	52634	52639	0 %	100 %	0 %	0 %	170650903
72	NC_010488	T	6	6	53895	53900	0 %	100 %	0 %	0 %	170650790
73	NC_010488	A	6	6	54005	54010	100 %	0 %	0 %	0 %	170650790
74	NC_010488	T	6	6	54813	54818	0 %	100 %	0 %	0 %	170650895
75	NC_010488	T	6	6	56542	56547	0 %	100 %	0 %	0 %	170650846
76	NC_010488	T	6	6	57622	57627	0 %	100 %	0 %	0 %	170650830
77	NC_010488	A	6	6	57737	57742	100 %	0 %	0 %	0 %	170650830
78	NC_010488	T	6	6	59224	59229	0 %	100 %	0 %	0 %	170650905
79	NC_010488	G	6	6	59695	59700	0 %	0 %	100 %	0 %	170650861
80	NC_010488	A	7	7	59736	59742	100 %	0 %	0 %	0 %	170650861
81	NC_010488	A	6	6	60694	60699	100 %	0 %	0 %	0 %	170650834
82	NC_010488	A	6	6	61518	61523	100 %	0 %	0 %	0 %	170650804
83	NC_010488	A	6	6	61774	61779	100 %	0 %	0 %	0 %	170650804
84	NC_010488	A	6	6	61946	61951	100 %	0 %	0 %	0 %	170650804
85	NC_010488	A	7	7	62649	62655	100 %	0 %	0 %	0 %	170650819
86	NC_010488	A	6	6	62792	62797	100 %	0 %	0 %	0 %	170650819
87	NC_010488	G	6	6	64307	64312	0 %	0 %	100 %	0 %	170650778
88	NC_010488	T	7	7	64818	64824	0 %	100 %	0 %	0 %	170650778
89	NC_010488	A	6	6	65442	65447	100 %	0 %	0 %	0 %	170650859
90	NC_010488	A	6	6	67616	67621	100 %	0 %	0 %	0 %	170650818
91	NC_010488	A	6	6	68558	68563	100 %	0 %	0 %	0 %	170650816
92	NC_010488	A	6	6	69060	69065	100 %	0 %	0 %	0 %	170650881
93	NC_010488	A	8	8	69198	69205	100 %	0 %	0 %	0 %	170650788
94	NC_010488	T	6	6	72242	72247	0 %	100 %	0 %	0 %	170650860
95	NC_010488	T	7	7	72288	72294	0 %	100 %	0 %	0 %	170650860
96	NC_010488	A	7	7	72366	72372	100 %	0 %	0 %	0 %	170650860
97	NC_010488	A	7	7	72507	72513	100 %	0 %	0 %	0 %	170650860
98	NC_010488	T	7	7	72596	72602	0 %	100 %	0 %	0 %	170650860
99	NC_010488	C	6	6	74582	74587	0 %	0 %	0 %	100 %	170650768
100	NC_010488	A	6	6	77162	77167	100 %	0 %	0 %	0 %	170650823
101	NC_010488	A	6	6	78781	78786	100 %	0 %	0 %	0 %	170650848
102	NC_010488	A	7	7	81228	81234	100 %	0 %	0 %	0 %	170650863
103	NC_010488	A	6	6	81281	81286	100 %	0 %	0 %	0 %	170650863
104	NC_010488	T	6	6	82993	82998	0 %	100 %	0 %	0 %	170650908
105	NC_010488	A	6	6	83051	83056	100 %	0 %	0 %	0 %	170650908
106	NC_010488	T	6	6	83831	83836	0 %	100 %	0 %	0 %	170650761
107	NC_010488	T	6	6	83950	83955	0 %	100 %	0 %	0 %	170650761
108	NC_010488	A	7	7	84019	84025	100 %	0 %	0 %	0 %	170650761
109	NC_010488	A	7	7	84118	84124	100 %	0 %	0 %	0 %	170650761
110	NC_010488	A	6	6	85012	85017	100 %	0 %	0 %	0 %	170650847
111	NC_010488	T	6	6	88959	88964	0 %	100 %	0 %	0 %	170650789
112	NC_010488	A	6	6	96151	96156	100 %	0 %	0 %	0 %	170650868
113	NC_010488	T	6	6	98287	98292	0 %	100 %	0 %	0 %	170650912
114	NC_010488	T	8	8	98645	98652	0 %	100 %	0 %	0 %	170650773
115	NC_010488	A	6	6	100911	100916	100 %	0 %	0 %	0 %	170650838
116	NC_010488	A	6	6	101318	101323	100 %	0 %	0 %	0 %	170650838
117	NC_010488	T	7	7	103045	103051	0 %	100 %	0 %	0 %	170650888
118	NC_010488	G	6	6	103504	103509	0 %	0 %	100 %	0 %	170650888
119	NC_010488	T	6	6	109790	109795	0 %	100 %	0 %	0 %	170650811
120	NC_010488	T	6	6	110360	110365	0 %	100 %	0 %	0 %	170650811
121	NC_010488	A	7	7	113155	113161	100 %	0 %	0 %	0 %	170650802
122	NC_010488	A	7	7	113163	113169	100 %	0 %	0 %	0 %	170650802
123	NC_010488	T	7	7	113372	113378	0 %	100 %	0 %	0 %	170650802
124	NC_010488	A	7	7	113587	113593	100 %	0 %	0 %	0 %	170650802
125	NC_010488	A	6	6	114941	114946	100 %	0 %	0 %	0 %	170650894
126	NC_010488	A	6	6	114978	114983	100 %	0 %	0 %	0 %	170650894
127	NC_010488	A	8	8	115091	115098	100 %	0 %	0 %	0 %	170650894
128	NC_010488	A	6	6	115497	115502	100 %	0 %	0 %	0 %	170650894
129	NC_010488	A	6	6	116602	116607	100 %	0 %	0 %	0 %	170650831
130	NC_010488	C	6	6	121034	121039	0 %	0 %	0 %	100 %	170650807
131	NC_010488	T	6	6	130283	130288	0 %	100 %	0 %	0 %	170650867

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.