MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R

Total Repeats: 2447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009838	AAC	2	6	10	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412015
2	NC_009838	TGA	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412015
3	NC_009838	GAC	2	6	226	231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412015
4	NC_009838	ATC	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412015
5	NC_009838	CAA	2	6	377	382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412015
6	NC_009838	CAA	2	6	387	392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412015
7	NC_009838	GTT	2	6	675	680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412015
8	NC_009838	CTT	2	6	712	717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412015
9	NC_009838	AAG	2	6	797	802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412015
10	NC_009838	AAG	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412015
11	NC_009838	CTG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412016
12	NC_009838	GAT	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412016
13	NC_009838	ATT	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412016
14	NC_009838	ATG	2	6	2310	2315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412016
15	NC_009838	ACG	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412017
16	NC_009838	TGT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412017
17	NC_009838	AGC	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412017
18	NC_009838	AGC	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412017
19	NC_009838	TGG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412017
20	NC_009838	TAG	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412017
21	NC_009838	GTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412018
22	NC_009838	GTG	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412018
23	NC_009838	ATC	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412018
24	NC_009838	TGA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412018
25	NC_009838	GAA	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
26	NC_009838	CAA	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412019
27	NC_009838	TAA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412019
28	NC_009838	ATT	2	6	3711	3716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412019
29	NC_009838	AAT	2	6	3876	3881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412019
30	NC_009838	CAG	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412019
31	NC_009838	AAG	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
32	NC_009838	GCC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157412019
33	NC_009838	TGG	2	6	4061	4066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412019
34	NC_009838	CTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412019
35	NC_009838	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412019
36	NC_009838	TGT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412019
37	NC_009838	GAT	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412019
38	NC_009838	TAC	2	6	4310	4315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412019
39	NC_009838	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
40	NC_009838	ACA	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412019
41	NC_009838	CAG	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412019
42	NC_009838	GAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412019
43	NC_009838	ATA	2	6	4814	4819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412019
44	NC_009838	TAC	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412020
45	NC_009838	TAA	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412020
46	NC_009838	GAG	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157412020
47	NC_009838	ATC	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412020
48	NC_009838	CTG	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412021
49	NC_009838	TAT	2	6	5347	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412021
50	NC_009838	TGT	2	6	5424	5429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412021
51	NC_009838	GAT	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412021
52	NC_009838	GAA	2	6	5462	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412021
53	NC_009838	GCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157412021
54	NC_009838	CAG	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412021
55	NC_009838	TGC	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412021
56	NC_009838	TTC	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412021
57	NC_009838	TAT	2	6	6004	6009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412021
58	NC_009838	TTC	2	6	6052	6057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412021
59	NC_009838	TCA	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412021
60	NC_009838	AAT	2	6	6113	6118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412021
61	NC_009838	TTC	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412021
62	NC_009838	TCG	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412021
63	NC_009838	TAC	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412021
64	NC_009838	AAC	2	6	6528	6533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412021
65	NC_009838	ACA	2	6	6708	6713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412022
66	NC_009838	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412022
67	NC_009838	ATT	2	6	6789	6794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412022
68	NC_009838	CTG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412022
69	NC_009838	GAA	2	6	6948	6953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412022
70	NC_009838	ATT	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412022
71	NC_009838	AAG	2	6	7107	7112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412022
72	NC_009838	GGC	2	6	7155	7160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157412023
73	NC_009838	TGC	3	9	7221	7229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412023
74	NC_009838	GGC	2	6	7252	7257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157412023
75	NC_009838	TGG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412023
76	NC_009838	TTG	2	6	7421	7426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412023
77	NC_009838	AGA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412023
78	NC_009838	TTA	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412023
79	NC_009838	TGA	2	6	7491	7496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412023
80	NC_009838	AGC	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412023
81	NC_009838	AGA	2	6	7680	7685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412023
82	NC_009838	GTA	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412023
83	NC_009838	AAC	2	6	7726	7731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412023
84	NC_009838	TTC	2	6	7739	7744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412023
85	NC_009838	AGA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412023
86	NC_009838	CGG	2	6	7814	7819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157412023
87	NC_009838	ACT	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412023
88	NC_009838	TAA	2	6	8145	8150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412024
89	NC_009838	GAT	2	6	8155	8160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412024
90	NC_009838	CTG	2	6	8525	8530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412024
91	NC_009838	CAC	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157412024
92	NC_009838	GAT	2	6	8746	8751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412024
93	NC_009838	GCA	3	9	8886	8894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412024
94	NC_009838	AAT	2	6	8967	8972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412025
95	NC_009838	ACT	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412025
96	NC_009838	TCA	2	6	9654	9659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412025
97	NC_009838	GAC	2	6	9672	9677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412025
98	NC_009838	AAC	2	6	9700	9705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412025
99	NC_009838	TAG	2	6	9757	9762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412025
100	NC_009838	TAA	2	6	9878	9883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412025
101	NC_009838	GTA	2	6	10018	10023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412025
102	NC_009838	CAG	2	6	10042	10047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412025
103	NC_009838	GAT	2	6	10095	10100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412025
104	NC_009838	AGT	2	6	10184	10189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412025
105	NC_009838	TAA	2	6	10415	10420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412025
106	NC_009838	GAT	3	9	10473	10481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412025
107	NC_009838	ACG	2	6	10630	10635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412025
108	NC_009838	GAT	2	6	10764	10769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412025
109	NC_009838	CAA	2	6	10773	10778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412025
110	NC_009838	AGA	2	6	10802	10807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412025
111	NC_009838	AAG	2	6	10869	10874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412025
112	NC_009838	CAG	2	6	10982	10987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412025
113	NC_009838	GGA	2	6	11006	11011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157412025
114	NC_009838	GTT	2	6	11040	11045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412025
115	NC_009838	GCT	2	6	11064	11069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412025
116	NC_009838	TCA	2	6	11083	11088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412025
117	NC_009838	CGT	2	6	11100	11105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412025
118	NC_009838	TCA	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412025
119	NC_009838	TTC	2	6	11184	11189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412025
120	NC_009838	ATT	2	6	11269	11274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412025
121	NC_009838	CTT	2	6	11278	11283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412025
122	NC_009838	TAA	2	6	11366	11371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412025
123	NC_009838	TAC	2	6	11516	11521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412025
124	NC_009838	AAG	2	6	11608	11613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412025
125	NC_009838	AGC	2	6	11615	11620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412025
126	NC_009838	TCA	2	6	16310	16315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412026
127	NC_009838	TGA	2	6	16330	16335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412026
128	NC_009838	AGA	2	6	16447	16452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412026
129	NC_009838	TTG	2	6	16461	16466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412026
130	NC_009838	ATC	2	6	16491	16496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412026
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132	NC_009838	AGA	2	6	16735	16740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412026
133	NC_009838	GAA	2	6	16784	16789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412026
134	NC_009838	GAA	3	9	16829	16837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412026
135	NC_009838	ATC	2	6	16838	16843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412026
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137	NC_009838	TAC	2	6	16962	16967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412026
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143	NC_009838	AGA	2	6	17401	17406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412026
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500	NC_009838	GTT	2	6	48925	48930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412052

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