MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 3034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009837	GGT	2	6	109812	109817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418213
2002	NC_009837	TGC	2	6	109827	109832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418213
2003	NC_009837	ATC	2	6	109835	109840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418213
2004	NC_009837	CTG	2	6	109846	109851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418213
2005	NC_009837	T	7	7	110026	110032	0 %	100 %	0 %	0 %	157418214
2006	NC_009837	GGC	2	6	110034	110039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418214
2007	NC_009837	TGC	2	6	110173	110178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418214
2008	NC_009837	GTT	2	6	110286	110291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418214
2009	NC_009837	TGG	2	6	110347	110352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418214
2010	NC_009837	A	6	6	110353	110358	100 %	0 %	0 %	0 %	157418214
2011	NC_009837	GCC	2	6	110379	110384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418214
2012	NC_009837	A	6	6	110460	110465	100 %	0 %	0 %	0 %	157418214
2013	NC_009837	A	6	6	110794	110799	100 %	0 %	0 %	0 %	157418215
2014	NC_009837	CTC	3	9	110852	110860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418215
2015	NC_009837	TGC	2	6	110861	110866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418215
2016	NC_009837	GGC	2	6	110876	110881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418215
2017	NC_009837	GCT	2	6	110931	110936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418215
2018	NC_009837	G	6	6	110940	110945	0 %	0 %	100 %	0 %	157418215
2019	NC_009837	ATT	2	6	111022	111027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418215
2020	NC_009837	T	6	6	111045	111050	0 %	100 %	0 %	0 %	157418215
2021	NC_009837	TGG	2	6	111079	111084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418215
2022	NC_009837	CCA	2	6	111106	111111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418215
2023	NC_009837	ATG	2	6	111116	111121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418215
2024	NC_009837	CAT	2	6	111191	111196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418216
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2027	NC_009837	TGC	2	6	111284	111289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418216
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2031	NC_009837	AT	3	6	111598	111603	50 %	50 %	0 %	0 %	157418217
2032	NC_009837	ATTATC	2	12	111624	111635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157418217
2033	NC_009837	TG	3	6	111642	111647	0 %	50 %	50 %	0 %	157418217
2034	NC_009837	GAA	2	6	111775	111780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418218
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2042	NC_009837	TA	3	6	112313	112318	50 %	50 %	0 %	0 %	157418218
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2045	NC_009837	A	8	8	112555	112562	100 %	0 %	0 %	0 %	157418218
2046	NC_009837	TGG	2	6	112587	112592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418218
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2052	NC_009837	TA	3	6	112835	112840	50 %	50 %	0 %	0 %	157418219
2053	NC_009837	TAA	2	6	113051	113056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157418220
2054	NC_009837	A	6	6	113100	113105	100 %	0 %	0 %	0 %	157418220
2055	NC_009837	ATC	2	6	113108	113113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418220
2056	NC_009837	ATG	2	6	113138	113143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418220
2057	NC_009837	CA	4	8	113154	113161	50 %	0 %	0 %	50 %	157418220
2058	NC_009837	TGC	2	6	113197	113202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418220
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2062	NC_009837	GGTTG	2	10	113616	113625	0 %	40 %	60 %	0 %	157418221
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2093	NC_009837	TGG	2	6	115304	115309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418221
2094	NC_009837	GAT	2	6	115380	115385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418221
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2104	NC_009837	CAT	2	6	116093	116098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418222
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2116	NC_009837	AAGA	2	8	116693	116700	75 %	0 %	25 %	0 %	157418222
2117	NC_009837	GAAA	2	8	116702	116709	75 %	0 %	25 %	0 %	157418222
2118	NC_009837	TCAAC	2	10	116833	116842	40 %	20 %	0 %	40 %	157418223
2119	NC_009837	GTA	2	6	116846	116851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418223
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2121	NC_009837	ACC	2	6	116898	116903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418223
2122	NC_009837	GCT	2	6	116957	116962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418223
2123	NC_009837	TACG	2	8	117011	117018	25 %	25 %	25 %	25 %	157418223
2124	NC_009837	CTCA	2	8	117045	117052	25 %	25 %	0 %	50 %	157418223
2125	NC_009837	TTCT	2	8	117095	117102	0 %	75 %	0 %	25 %	157418223
2126	NC_009837	CCA	2	6	117108	117113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418223
2127	NC_009837	CCG	2	6	117187	117192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418223
2128	NC_009837	GTT	2	6	117245	117250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418223
2129	NC_009837	ATC	2	6	117259	117264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418223
2130	NC_009837	GCA	2	6	117266	117271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418223
2131	NC_009837	TGC	2	6	117299	117304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418223
2132	NC_009837	CCG	2	6	117307	117312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418223
2133	NC_009837	GTTCAT	2	12	117326	117337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157418223
2134	NC_009837	TGT	2	6	117341	117346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418223
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2136	NC_009837	GGC	2	6	117390	117395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418223
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2144	NC_009837	GTTG	2	8	118016	118023	0 %	50 %	50 %	0 %	157418223
2145	NC_009837	TGT	2	6	118048	118053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418223
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2148	NC_009837	CTG	2	6	118220	118225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418224
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2153	NC_009837	TCG	2	6	118454	118459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418224
2154	NC_009837	AGC	2	6	118460	118465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418224
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2156	NC_009837	CCG	2	6	118538	118543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418224
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2162	NC_009837	CGAC	2	8	118838	118845	25 %	0 %	25 %	50 %	157418224
2163	NC_009837	TCA	2	6	118931	118936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418224
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2168	NC_009837	CTG	2	6	119038	119043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418224
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2220	NC_009837	GCGCA	2	10	121471	121480	20 %	0 %	40 %	40 %	157418224
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2223	NC_009837	GCCA	2	8	121628	121635	25 %	0 %	25 %	50 %	157418224
2224	NC_009837	CAG	2	6	121687	121692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418224
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2227	NC_009837	CG	3	6	121773	121778	0 %	0 %	50 %	50 %	157418224
2228	NC_009837	CCT	2	6	121835	121840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418224
2229	NC_009837	A	6	6	121880	121885	100 %	0 %	0 %	0 %	157418224
2230	NC_009837	GCC	2	6	122028	122033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418225
2231	NC_009837	GCT	2	6	122040	122045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418225
2232	NC_009837	TTG	2	6	122076	122081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418225
2233	NC_009837	CAA	2	6	122149	122154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418225
2234	NC_009837	ATG	2	6	122246	122251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418225
2235	NC_009837	AGCG	2	8	122322	122329	25 %	0 %	50 %	25 %	157418225
2236	NC_009837	GAT	2	6	122363	122368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418225
2237	NC_009837	CAG	2	6	122456	122461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418225
2238	NC_009837	TC	3	6	122480	122485	0 %	50 %	0 %	50 %	157418225
2239	NC_009837	CCA	2	6	122486	122491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418225
2240	NC_009837	AAT	2	6	122537	122542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157418225
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2242	NC_009837	CGG	2	6	122576	122581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418225
2243	NC_009837	GTG	2	6	122608	122613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418225
2244	NC_009837	CGA	2	6	122631	122636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418225
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2350	NC_009837	GA	3	6	130475	130480	50 %	0 %	50 %	0 %	157418235
2351	NC_009837	TCAG	2	8	130502	130509	25 %	25 %	25 %	25 %	157418235
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2354	NC_009837	GCT	2	6	130645	130650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418235
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2356	NC_009837	GAA	3	9	130725	130733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418235
2357	NC_009837	GTG	2	6	130739	130744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418235
2358	NC_009837	CTGACT	2	12	130975	130986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157418236
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2360	NC_009837	CGG	2	6	131044	131049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418236
2361	NC_009837	AG	3	6	131078	131083	50 %	0 %	50 %	0 %	157418236
2362	NC_009837	T	6	6	131141	131146	0 %	100 %	0 %	0 %	157418236
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2488	NC_009837	GCCA	2	8	140417	140424	25 %	0 %	25 %	50 %	157418250
2489	NC_009837	CAC	2	6	140439	140444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418250
2490	NC_009837	CAG	2	6	140457	140462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418250
2491	NC_009837	CAA	2	6	140513	140518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418250
2492	NC_009837	CAGC	2	8	140550	140557	25 %	0 %	25 %	50 %	157418250
2493	NC_009837	T	6	6	140664	140669	0 %	100 %	0 %	0 %	157418250
2494	NC_009837	CGG	2	6	140845	140850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418243
2495	NC_009837	CAC	2	6	140867	140872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418243
2496	NC_009837	AGG	2	6	140890	140895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418243
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2499	NC_009837	ATTT	2	8	141247	141254	25 %	75 %	0 %	0 %	157418251
2500	NC_009837	TTCTT	2	10	141276	141285	0 %	80 %	0 %	20 %	157418251

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