MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 88029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009801	TCAT	2	8	214555	214562	25 %	50 %	0 %	25 %	157155017
4002	NC_009801	TGC	2	6	214600	214605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157154914
4003	NC_009801	CGT	2	6	214632	214637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157154914
4004	NC_009801	TTCA	2	8	214648	214655	25 %	50 %	0 %	25 %	157154914
4005	NC_009801	CT	3	6	214995	215000	0 %	50 %	0 %	50 %	157156424
4006	NC_009801	GC	3	6	215008	215013	0 %	0 %	50 %	50 %	157156424
4007	NC_009801	ATG	2	6	215038	215043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156424
4008	NC_009801	TGA	2	6	215073	215078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156424
4009	NC_009801	TG	3	6	215102	215107	0 %	50 %	50 %	0 %	157156424
4010	NC_009801	GAT	2	6	215110	215115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156424
4011	NC_009801	GCG	2	6	215187	215192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156424
4012	NC_009801	GCG	2	6	215251	215256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156424
4013	NC_009801	TGG	2	6	215263	215268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156424
4014	NC_009801	TG	3	6	215287	215292	0 %	50 %	50 %	0 %	157156424
4015	NC_009801	AAC	2	6	215330	215335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156424
4016	NC_009801	AAT	2	6	215422	215427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157156424
4017	NC_009801	TTAAC	2	10	215435	215444	40 %	40 %	0 %	20 %	157156424
4018	NC_009801	CAA	2	6	215452	215457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156424
4019	NC_009801	GCGG	2	8	215535	215542	0 %	0 %	75 %	25 %	157157087
4020	NC_009801	GCA	2	6	215543	215548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157087
4021	NC_009801	TAA	2	6	215552	215557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157157087
4022	NC_009801	CGC	2	6	215633	215638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157087
4023	NC_009801	CAT	2	6	215643	215648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157157087
4024	NC_009801	CAG	2	6	215654	215659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157087
4025	NC_009801	TGG	2	6	215734	215739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157157087
4026	NC_009801	AAC	2	6	215756	215761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157157087
4027	NC_009801	CGA	2	6	215775	215780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157087
4028	NC_009801	A	6	6	215905	215910	100 %	0 %	0 %	0 %	157157173
4029	NC_009801	TAA	2	6	215961	215966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157157173
4030	NC_009801	GCG	2	6	216035	216040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157173
4031	NC_009801	TGC	2	6	216041	216046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157173
4032	NC_009801	CT	3	6	216075	216080	0 %	50 %	0 %	50 %	157157173
4033	NC_009801	TGA	2	6	216107	216112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157173
4034	NC_009801	GAA	2	6	216136	216141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157157173
4035	NC_009801	TCC	2	6	216145	216150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157157173
4036	NC_009801	GCG	2	6	216373	216378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157173
4037	NC_009801	GC	3	6	216454	216459	0 %	0 %	50 %	50 %	157157173
4038	NC_009801	CCAA	2	8	216535	216542	50 %	0 %	0 %	50 %	157157173
4039	NC_009801	CGG	2	6	216560	216565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157173
4040	NC_009801	AGT	2	6	216592	216597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157173
4041	NC_009801	GTC	2	6	216935	216940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157308
4042	NC_009801	A	6	6	216949	216954	100 %	0 %	0 %	0 %	157157308
4043	NC_009801	GCTG	2	8	216992	216999	0 %	25 %	50 %	25 %	157157308
4044	NC_009801	GTCA	2	8	217098	217105	25 %	25 %	25 %	25 %	157157308
4045	NC_009801	GC	3	6	217174	217179	0 %	0 %	50 %	50 %	157157308
4046	NC_009801	GTC	2	6	217196	217201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157308
4047	NC_009801	CG	3	6	217243	217248	0 %	0 %	50 %	50 %	157157308
4048	NC_009801	CCA	2	6	217269	217274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157157308
4049	NC_009801	GAT	2	6	217417	217422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157308
4050	NC_009801	CTG	2	6	217447	217452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157308
4051	NC_009801	GA	3	6	217472	217477	50 %	0 %	50 %	0 %	157157308
4052	NC_009801	CGC	2	6	217542	217547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157308
4053	NC_009801	GCC	2	6	217666	217671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157157308
4054	NC_009801	GGC	2	6	217710	217715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157308
4055	NC_009801	GAAAG	2	10	217725	217734	60 %	0 %	40 %	0 %	157157308
4056	NC_009801	GAT	2	6	217749	217754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157157308
4057	NC_009801	GCG	2	6	217831	217836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157308
4058	NC_009801	AT	3	6	217961	217966	50 %	50 %	0 %	0 %	157156272
4059	NC_009801	CGC	2	6	218005	218010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156272
4060	NC_009801	GGCT	2	8	218031	218038	0 %	25 %	50 %	25 %	157156272
4061	NC_009801	CAA	2	6	218056	218061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156272
4062	NC_009801	CGA	2	6	218948	218953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4063	NC_009801	TTAA	2	8	218965	218972	50 %	50 %	0 %	0 %	157156008
4064	NC_009801	CGA	2	6	218989	218994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4065	NC_009801	TCG	2	6	219010	219015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4066	NC_009801	CAG	2	6	219111	219116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4067	NC_009801	TCGT	2	8	219249	219256	0 %	50 %	25 %	25 %	157156008
4068	NC_009801	CGC	2	6	219273	219278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156008
4069	NC_009801	CAG	2	6	219426	219431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4070	NC_009801	GCCA	2	8	219459	219466	25 %	0 %	25 %	50 %	157156008
4071	NC_009801	AGT	2	6	219527	219532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156008
4072	NC_009801	CAG	2	6	219554	219559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4073	NC_009801	CGC	2	6	219573	219578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156008
4074	NC_009801	ACGGT	2	10	219580	219589	20 %	20 %	40 %	20 %	157156008
4075	NC_009801	CAC	2	6	219594	219599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156008
4076	NC_009801	TCT	2	6	219661	219666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156008
4077	NC_009801	CAG	2	6	219747	219752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4078	NC_009801	CAG	2	6	219792	219797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4079	NC_009801	AGC	3	9	219894	219902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4080	NC_009801	GC	3	6	219901	219906	0 %	0 %	50 %	50 %	157156008
4081	NC_009801	GCC	2	6	220026	220031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156008
4082	NC_009801	TCA	2	6	220166	220171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156008
4083	NC_009801	TCG	2	6	220213	220218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4084	NC_009801	CTT	2	6	220301	220306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156008
4085	NC_009801	CAA	2	6	220346	220351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156008
4086	NC_009801	GCA	2	6	220355	220360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156008
4087	NC_009801	CT	3	6	220390	220395	0 %	50 %	0 %	50 %	157156008
4088	NC_009801	GCTG	2	8	220408	220415	0 %	25 %	50 %	25 %	157156008
4089	NC_009801	ACC	2	6	220417	220422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156008
4090	NC_009801	GTT	2	6	220449	220454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156008
4091	NC_009801	CACG	2	8	220463	220470	25 %	0 %	25 %	50 %	157156008
4092	NC_009801	T	6	6	220482	220487	0 %	100 %	0 %	0 %	157156008
4093	NC_009801	TA	3	6	220517	220522	50 %	50 %	0 %	0 %	157156008
4094	NC_009801	ATC	2	6	220543	220548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156008
4095	NC_009801	GC	3	6	220552	220557	0 %	0 %	50 %	50 %	157156008
4096	NC_009801	TGT	2	6	220637	220642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156008
4097	NC_009801	GCT	2	6	220940	220945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155318
4098	NC_009801	CTGGCA	2	12	221005	221016	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157155318
4099	NC_009801	AAC	2	6	221124	221129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157155318
4100	NC_009801	CCG	2	6	221212	221217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155318
4101	NC_009801	GCC	2	6	221247	221252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155318
4102	NC_009801	TGA	2	6	221263	221268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155318
4103	NC_009801	CTGG	2	8	221378	221385	0 %	25 %	50 %	25 %	157155318
4104	NC_009801	GCGA	2	8	221414	221421	25 %	0 %	50 %	25 %	157155318
4105	NC_009801	ATAC	2	8	221484	221491	50 %	25 %	0 %	25 %	157154956
4106	NC_009801	AGC	2	6	221503	221508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154956
4107	NC_009801	CG	3	6	221592	221597	0 %	0 %	50 %	50 %	157154956
4108	NC_009801	CGG	2	6	221609	221614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157154956
4109	NC_009801	TTC	2	6	221687	221692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157154956
4110	NC_009801	GC	3	6	221721	221726	0 %	0 %	50 %	50 %	157154956
4111	NC_009801	CTA	2	6	221830	221835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157154956
4112	NC_009801	GCC	2	6	221993	221998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157159295
4113	NC_009801	TTTG	2	8	222008	222015	0 %	75 %	25 %	0 %	157159295
4114	NC_009801	TCA	2	6	222030	222035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157159295
4115	NC_009801	TTC	2	6	222057	222062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157159295
4116	NC_009801	TACG	2	8	222107	222114	25 %	25 %	25 %	25 %	157159295
4117	NC_009801	CTGG	2	8	222167	222174	0 %	25 %	50 %	25 %	157159295
4118	NC_009801	GGT	2	6	222179	222184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157159295
4119	NC_009801	CGT	2	6	222211	222216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159295
4120	NC_009801	CAA	2	6	222250	222255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157159295
4121	NC_009801	T	6	6	222264	222269	0 %	100 %	0 %	0 %	157159295
4122	NC_009801	CAA	2	6	222277	222282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157159295
4123	NC_009801	GCA	2	6	222298	222303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159295
4124	NC_009801	GCA	4	12	222343	222354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159295
4125	NC_009801	TGATT	2	10	222422	222431	20 %	60 %	20 %	0 %	157159295
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4488	NC_009801	CTG	3	9	247437	247445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156439
4489	NC_009801	GCC	2	6	247552	247557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156439
4490	NC_009801	GCCA	2	8	247648	247655	25 %	0 %	25 %	50 %	157156439
4491	NC_009801	GT	3	6	247682	247687	0 %	50 %	50 %	0 %	157156439
4492	NC_009801	CAG	2	6	247698	247703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156439
4493	NC_009801	CCAG	2	8	247817	247824	25 %	0 %	25 %	50 %	157156439
4494	NC_009801	CAG	2	6	247833	247838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156439
4495	NC_009801	CTG	2	6	247854	247859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156439
4496	NC_009801	CCA	2	6	247904	247909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156439
4497	NC_009801	CGG	2	6	247913	247918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156439
4498	NC_009801	GGC	2	6	247991	247996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156439
4499	NC_009801	GCC	2	6	248044	248049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156439
4500	NC_009801	GTC	2	6	248079	248084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156439

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