MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 88029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009801	TGA	2	6	28675	28680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155523
502	NC_009801	ATT	2	6	28731	28736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157155523
503	NC_009801	GGC	2	6	28737	28742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155523
504	NC_009801	GC	3	6	28741	28746	0 %	0 %	50 %	50 %	157155523
505	NC_009801	T	6	6	28886	28891	0 %	100 %	0 %	0 %	157155523
506	NC_009801	A	6	6	28905	28910	100 %	0 %	0 %	0 %	157155523
507	NC_009801	AAT	2	6	28912	28917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157155523
508	NC_009801	CGA	2	6	29077	29082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158699
509	NC_009801	CAC	2	6	29086	29091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158699
510	NC_009801	CAA	2	6	29107	29112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157158699
511	NC_009801	ACC	2	6	29201	29206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158699
512	NC_009801	GCG	2	6	29225	29230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158699
513	NC_009801	CCG	2	6	29269	29274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158699
514	NC_009801	ATGG	2	8	29330	29337	25 %	25 %	50 %	0 %	157158699
515	NC_009801	TTG	2	6	29533	29538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155637
516	NC_009801	AT	3	6	29568	29573	50 %	50 %	0 %	0 %	157155637
517	NC_009801	GAA	2	6	29811	29816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155637
518	NC_009801	CAGTA	2	10	29868	29877	40 %	20 %	20 %	20 %	157155637
519	NC_009801	TG	3	6	29918	29923	0 %	50 %	50 %	0 %	157155637
520	NC_009801	TGG	2	6	30124	30129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155637
521	NC_009801	CTC	2	6	30143	30148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157155637
522	NC_009801	CG	3	6	30192	30197	0 %	0 %	50 %	50 %	157155637
523	NC_009801	TTGA	2	8	30201	30208	25 %	50 %	25 %	0 %	157155637
524	NC_009801	TGG	2	6	30304	30309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155637
525	NC_009801	GCA	2	6	30317	30322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155637
526	NC_009801	GGT	2	6	30330	30335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155637
527	NC_009801	GAA	2	6	30360	30365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155637
528	NC_009801	GCC	2	6	30545	30550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156462
529	NC_009801	TGA	2	6	30582	30587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156462
530	NC_009801	ACC	2	6	30620	30625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157156462
531	NC_009801	CTG	2	6	30641	30646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156462
532	NC_009801	TGGC	2	8	30744	30751	0 %	25 %	50 %	25 %	157156462
533	NC_009801	TTG	2	6	30759	30764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157156462
534	NC_009801	TGG	2	6	30846	30851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156462
535	NC_009801	TCG	2	6	30916	30921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156462
536	NC_009801	CTG	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156462
537	NC_009801	CTGG	2	8	31204	31211	0 %	25 %	50 %	25 %	157156462
538	NC_009801	ACG	2	6	31283	31288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156462
539	NC_009801	CAG	2	6	31364	31369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156462
540	NC_009801	CGT	2	6	31395	31400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156462
541	NC_009801	ATG	2	6	31573	31578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156976
542	NC_009801	G	6	6	31608	31613	0 %	0 %	100 %	0 %	157156976
543	NC_009801	GCC	2	6	31621	31626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156976
544	NC_009801	GGC	2	6	31637	31642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156976
545	NC_009801	GCG	2	6	31671	31676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156976
546	NC_009801	TCT	2	6	31692	31697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156976
547	NC_009801	GCTG	2	8	31721	31728	0 %	25 %	50 %	25 %	157156976
548	NC_009801	AGC	2	6	31758	31763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156976
549	NC_009801	GAT	2	6	31779	31784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156976
550	NC_009801	CGC	3	9	31916	31924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156976
551	NC_009801	GCC	2	6	31944	31949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156976
552	NC_009801	GCT	2	6	31982	31987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156976
553	NC_009801	AGC	2	6	31994	31999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156976
554	NC_009801	ATT	2	6	32031	32036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157156976
555	NC_009801	CAT	2	6	32043	32048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156976
556	NC_009801	CGTG	2	8	32198	32205	0 %	25 %	50 %	25 %	157156976
557	NC_009801	CATG	2	8	32668	32675	25 %	25 %	25 %	25 %	157157922
558	NC_009801	ATA	2	6	32685	32690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157157922
559	NC_009801	A	6	6	32692	32697	100 %	0 %	0 %	0 %	157157922
560	NC_009801	CGG	2	6	32919	32924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158284
561	NC_009801	TCCT	2	8	32980	32987	0 %	50 %	0 %	50 %	157158284
562	NC_009801	CTTA	2	8	33008	33015	25 %	50 %	0 %	25 %	157158284
563	NC_009801	GAA	2	6	33053	33058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158284
564	NC_009801	TCT	2	6	33059	33064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158284
565	NC_009801	CT	3	6	33137	33142	0 %	50 %	0 %	50 %	157158284
566	NC_009801	GCG	2	6	33263	33268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158284
567	NC_009801	CG	3	6	33287	33292	0 %	0 %	50 %	50 %	157158284
568	NC_009801	ACC	2	6	33332	33337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158284
569	NC_009801	CGG	2	6	33379	33384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158284
570	NC_009801	A	6	6	33398	33403	100 %	0 %	0 %	0 %	157158284
571	NC_009801	CGT	2	6	33424	33429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158284
572	NC_009801	TGG	2	6	33471	33476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158284
573	NC_009801	TCA	2	6	33658	33663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158284
574	NC_009801	GCT	2	6	33664	33669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158284
575	NC_009801	CAC	2	6	33713	33718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158284
576	NC_009801	GGC	2	6	33719	33724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158284
577	NC_009801	GTG	2	6	33755	33760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158284
578	NC_009801	AGCC	2	8	33910	33917	25 %	0 %	25 %	50 %	157158284
579	NC_009801	ACG	2	6	33927	33932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158284
580	NC_009801	GTT	2	6	33940	33945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158284
581	NC_009801	ACT	2	6	34091	34096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157159012
582	NC_009801	GC	3	6	34100	34105	0 %	0 %	50 %	50 %	157159012
583	NC_009801	CAT	2	6	34170	34175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157159012
584	NC_009801	GACC	2	8	34176	34183	25 %	0 %	25 %	50 %	157159012
585	NC_009801	AGT	2	6	34227	34232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157159012
586	NC_009801	ATT	2	6	34240	34245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157159012
587	NC_009801	TGC	2	6	34268	34273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159012
588	NC_009801	GC	3	6	34304	34309	0 %	0 %	50 %	50 %	157159012
589	NC_009801	TGGAGC	2	12	34310	34321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157159012
590	NC_009801	CCG	2	6	34367	34372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157159012
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592	NC_009801	CCG	2	6	34395	34400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157159012
593	NC_009801	GAA	2	6	34419	34424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159012
594	NC_009801	CG	3	6	34440	34445	0 %	0 %	50 %	50 %	157159012
595	NC_009801	CA	3	6	34457	34462	50 %	0 %	0 %	50 %	157159012
596	NC_009801	GAA	2	6	34468	34473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159012
597	NC_009801	ATT	2	6	34510	34515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157159012
598	NC_009801	GCG	3	9	34541	34549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159012
599	NC_009801	GAA	2	6	34576	34581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159012
600	NC_009801	TC	3	6	34602	34607	0 %	50 %	0 %	50 %	157159012
601	NC_009801	GCT	2	6	34620	34625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159012
602	NC_009801	TGA	2	6	34629	34634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157159012
603	NC_009801	GTG	2	6	34669	34674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157159012
604	NC_009801	CAT	2	6	34695	34700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157159012
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607	NC_009801	TTC	2	6	34929	34934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157159012
608	NC_009801	GGC	2	6	34977	34982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159012
609	NC_009801	CGA	2	6	35007	35012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159012
610	NC_009801	TGA	2	6	35015	35020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157159012
611	NC_009801	CCT	2	6	35048	35053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157159012
612	NC_009801	CGCA	2	8	35176	35183	25 %	0 %	25 %	50 %	157159012
613	NC_009801	CTGT	2	8	35350	35357	0 %	50 %	25 %	25 %	157159012
614	NC_009801	GAA	2	6	35410	35415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159012
615	NC_009801	GGCG	2	8	35526	35533	0 %	0 %	75 %	25 %	157159012
616	NC_009801	GAA	2	6	35653	35658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159012
617	NC_009801	GCGAA	2	10	35663	35672	40 %	0 %	40 %	20 %	157159012
618	NC_009801	ACCG	2	8	35680	35687	25 %	0 %	25 %	50 %	157159012
619	NC_009801	A	6	6	35690	35695	100 %	0 %	0 %	0 %	157159012
620	NC_009801	CGG	3	9	35706	35714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159012
621	NC_009801	ACT	2	6	35747	35752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157159012
622	NC_009801	CGG	2	6	35937	35942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159012
623	NC_009801	GC	5	10	35962	35971	0 %	0 %	50 %	50 %	157159012
624	NC_009801	GCT	2	6	35977	35982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159012
625	NC_009801	AGA	2	6	36027	36032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159012
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628	NC_009801	CGTC	2	8	36154	36161	0 %	25 %	25 %	50 %	157159012
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