MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 1001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009790	CAG	2	6	39643	39648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149568
502	NC_009790	AGGTGC	2	12	39685	39696	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149568
503	NC_009790	CGG	2	6	39786	39791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149568
504	NC_009790	CCG	2	6	39818	39823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149568
505	NC_009790	GCA	2	6	39832	39837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149568
506	NC_009790	CT	3	6	39962	39967	0 %	50 %	0 %	50 %	157149568
507	NC_009790	CGG	2	6	40007	40012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149568
508	NC_009790	CGG	2	6	40046	40051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149568
509	NC_009790	CAG	2	6	40156	40161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149568
510	NC_009790	GTC	2	6	40168	40173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149568
511	NC_009790	AGA	2	6	40174	40179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149568
512	NC_009790	CAG	2	6	40298	40303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149566
513	NC_009790	AGG	2	6	40389	40394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149566
514	NC_009790	CAG	2	6	40418	40423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149566
515	NC_009790	ATC	2	6	40584	40589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149566
516	NC_009790	CAG	2	6	40606	40611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149511
517	NC_009790	GCGA	2	8	40706	40713	25 %	0 %	50 %	25 %	157149511
518	NC_009790	CT	3	6	40763	40768	0 %	50 %	0 %	50 %	157149511
519	NC_009790	GAA	2	6	40769	40774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149511
520	NC_009790	AGC	2	6	40781	40786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149511
521	NC_009790	TTG	2	6	40801	40806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149511
522	NC_009790	AAC	2	6	40817	40822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149511
523	NC_009790	AGG	2	6	40881	40886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149511
524	NC_009790	GCT	2	6	40896	40901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149511
525	NC_009790	GGA	2	6	40913	40918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149511
526	NC_009790	GAT	2	6	41788	41793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149532
527	NC_009790	TAC	2	6	41827	41832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149532
528	NC_009790	CAG	2	6	41855	41860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149532
529	NC_009790	TTG	2	6	41889	41894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149532
530	NC_009790	CAGC	2	8	41913	41920	25 %	0 %	25 %	50 %	157149532
531	NC_009790	GCAA	2	8	41937	41944	50 %	0 %	25 %	25 %	157149532
532	NC_009790	AGG	2	6	41949	41954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149532
533	NC_009790	CTG	2	6	41964	41969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149532
534	NC_009790	TGC	3	9	42007	42015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149532
535	NC_009790	A	7	7	42053	42059	100 %	0 %	0 %	0 %	157149532
536	NC_009790	AAG	2	6	42081	42086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149532
537	NC_009790	A	6	6	42106	42111	100 %	0 %	0 %	0 %	157149532
538	NC_009790	CGC	2	6	42235	42240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149536
539	NC_009790	GAT	2	6	42253	42258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149536
540	NC_009790	TCG	2	6	42315	42320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149536
541	NC_009790	GCT	2	6	42330	42335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149536
542	NC_009790	GAAA	2	8	42477	42484	75 %	0 %	25 %	0 %	157149536
543	NC_009790	GTTCGA	2	12	42510	42521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157149536
544	NC_009790	CTG	2	6	42570	42575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149536
545	NC_009790	GCACT	2	10	42586	42595	20 %	20 %	20 %	40 %	157149536
546	NC_009790	GGC	2	6	42610	42615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149536
547	NC_009790	CGC	2	6	42661	42666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149536
548	NC_009790	GAA	2	6	42774	42779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149536
549	NC_009790	CGG	2	6	42782	42787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149536
550	NC_009790	AG	3	6	42816	42821	50 %	0 %	50 %	0 %	157149536
551	NC_009790	GCA	2	6	42883	42888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149536
552	NC_009790	TCGC	2	8	42951	42958	0 %	25 %	25 %	50 %	157149536
553	NC_009790	GCA	2	6	42975	42980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149536
554	NC_009790	GTCA	2	8	43220	43227	25 %	25 %	25 %	25 %	157149525
555	NC_009790	GT	3	6	43295	43300	0 %	50 %	50 %	0 %	157149525
556	NC_009790	ACTTAT	2	12	43309	43320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157149525
557	NC_009790	A	6	6	43437	43442	100 %	0 %	0 %	0 %	157149525
558	NC_009790	TGA	2	6	43508	43513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149516
559	NC_009790	ACA	2	6	43544	43549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149516
560	NC_009790	ACA	2	6	43567	43572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149516
561	NC_009790	GAA	2	6	43712	43717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149516
562	NC_009790	TAA	2	6	43760	43765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149516
563	NC_009790	CTA	2	6	43877	43882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149516
564	NC_009790	AAT	2	6	44236	44241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149569
565	NC_009790	CAT	2	6	44245	44250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149569
566	NC_009790	GAA	2	6	44315	44320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149569
567	NC_009790	GTA	2	6	44376	44381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149569
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569	NC_009790	A	7	7	44530	44536	100 %	0 %	0 %	0 %	157149569
570	NC_009790	CGG	2	6	44543	44548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149569
571	NC_009790	TG	3	6	44609	44614	0 %	50 %	50 %	0 %	157149569
572	NC_009790	CTG	2	6	44690	44695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149569
573	NC_009790	A	6	6	44704	44709	100 %	0 %	0 %	0 %	157149569
574	NC_009790	GCCGGA	2	12	44740	44751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	157149569
575	NC_009790	TAA	2	6	44752	44757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149569
576	NC_009790	TGT	2	6	44813	44818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149569
577	NC_009790	GCCG	2	8	44830	44837	0 %	0 %	50 %	50 %	157149569
578	NC_009790	TTA	2	6	44873	44878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149569
579	NC_009790	AGC	2	6	44906	44911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149569
580	NC_009790	TGA	2	6	44915	44920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149569
581	NC_009790	TC	3	6	44923	44928	0 %	50 %	0 %	50 %	157149526
582	NC_009790	CTGG	2	8	44946	44953	0 %	25 %	50 %	25 %	157149526
583	NC_009790	CTT	2	6	45202	45207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149526
584	NC_009790	GAACG	2	10	45236	45245	40 %	0 %	40 %	20 %	157149526
585	NC_009790	CGCC	2	8	45310	45317	0 %	0 %	25 %	75 %	157149558
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588	NC_009790	CCGG	2	8	45655	45662	0 %	0 %	50 %	50 %	157149558
589	NC_009790	CCTG	2	8	45677	45684	0 %	25 %	25 %	50 %	157149558
590	NC_009790	TGG	2	6	45685	45690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149558
591	NC_009790	GATGT	2	10	45708	45717	20 %	40 %	40 %	0 %	157149558
592	NC_009790	CAG	2	6	45739	45744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149558
593	NC_009790	TGT	2	6	45871	45876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149558
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595	NC_009790	CTG	2	6	45992	45997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149558
596	NC_009790	TGA	2	6	46054	46059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149558
597	NC_009790	TGA	2	6	46129	46134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149558
598	NC_009790	CGG	2	6	46161	46166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149558
599	NC_009790	CCGGA	2	10	46184	46193	20 %	0 %	40 %	40 %	157149558
600	NC_009790	ATCC	2	8	46199	46206	25 %	25 %	0 %	50 %	157149558
601	NC_009790	GGT	2	6	46256	46261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149558
602	NC_009790	TGCA	2	8	46338	46345	25 %	25 %	25 %	25 %	157149558
603	NC_009790	CAC	2	6	46363	46368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149558
604	NC_009790	CAG	2	6	46428	46433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149558
605	NC_009790	GGC	2	6	46444	46449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149558
606	NC_009790	CTG	2	6	46556	46561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149558
607	NC_009790	ACA	3	9	46614	46622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149558
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609	NC_009790	GCG	2	6	46703	46708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149558
610	NC_009790	T	6	6	47554	47559	0 %	100 %	0 %	0 %	157149572
611	NC_009790	GCGG	2	8	47598	47605	0 %	0 %	75 %	25 %	157149572
612	NC_009790	GT	3	6	47652	47657	0 %	50 %	50 %	0 %	157149572
613	NC_009790	CAC	2	6	47757	47762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149572
614	NC_009790	AGG	2	6	47780	47785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149572
615	NC_009790	GATGGA	2	12	47793	47804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157149572
616	NC_009790	TA	3	6	49301	49306	50 %	50 %	0 %	0 %	157149562
617	NC_009790	TC	3	6	49319	49324	0 %	50 %	0 %	50 %	157149562
618	NC_009790	T	6	6	49335	49340	0 %	100 %	0 %	0 %	157149562
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