MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009788	CT	3	6	898	903	0 %	50 %	0 %	50 %	157149467
2	NC_009788	GC	3	6	1493	1498	0 %	0 %	50 %	50 %	157149468
3	NC_009788	GC	3	6	2863	2868	0 %	0 %	50 %	50 %	157149470
4	NC_009788	GC	3	6	3462	3467	0 %	0 %	50 %	50 %	157149453
5	NC_009788	GT	3	6	4819	4824	0 %	50 %	50 %	0 %	157149445
6	NC_009788	GC	3	6	5078	5083	0 %	0 %	50 %	50 %	157149445
7	NC_009788	GC	3	6	5443	5448	0 %	0 %	50 %	50 %	157149446
8	NC_009788	GT	3	6	5673	5678	0 %	50 %	50 %	0 %	157149435
9	NC_009788	CA	3	6	7003	7008	50 %	0 %	0 %	50 %	157149483
10	NC_009788	GT	3	6	7208	7213	0 %	50 %	50 %	0 %	157149483
11	NC_009788	AT	3	6	8657	8662	50 %	50 %	0 %	0 %	157149477
12	NC_009788	TC	3	6	9133	9138	0 %	50 %	0 %	50 %	157149477
13	NC_009788	GC	3	6	11411	11416	0 %	0 %	50 %	50 %	157149457
14	NC_009788	GC	3	6	11909	11914	0 %	0 %	50 %	50 %	157149457
15	NC_009788	CT	3	6	15346	15351	0 %	50 %	0 %	50 %	157149473
16	NC_009788	AG	3	6	15626	15631	50 %	0 %	50 %	0 %	157149473
17	NC_009788	CT	3	6	15694	15699	0 %	50 %	0 %	50 %	157149473
18	NC_009788	CT	3	6	17669	17674	0 %	50 %	0 %	50 %	157149433
19	NC_009788	CT	3	6	18470	18475	0 %	50 %	0 %	50 %	157149460
20	NC_009788	GC	3	6	19249	19254	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
21	NC_009788	GC	3	6	19297	19302	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
22	NC_009788	CG	3	6	20791	20796	0 %	0 %	50 %	50 %	157149436
23	NC_009788	AT	3	6	21031	21036	50 %	50 %	0 %	0 %	157149456
24	NC_009788	AT	3	6	21154	21159	50 %	50 %	0 %	0 %	157149456
25	NC_009788	AT	3	6	25779	25784	50 %	50 %	0 %	0 %	157149462
26	NC_009788	AT	3	6	25926	25931	50 %	50 %	0 %	0 %	157149462
27	NC_009788	CA	3	6	28881	28886	50 %	0 %	0 %	50 %	157149469
28	NC_009788	GA	4	8	29584	29591	50 %	0 %	50 %	0 %	157149455
29	NC_009788	AG	3	6	29861	29866	50 %	0 %	50 %	0 %	157149455
30	NC_009788	TA	4	8	30786	30793	50 %	50 %	0 %	0 %	157149450
31	NC_009788	TA	3	6	31706	31711	50 %	50 %	0 %	0 %	157149450
32	NC_009788	AT	3	6	32100	32105	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
33	NC_009788	AG	3	6	32499	32504	50 %	0 %	50 %	0 %	157149430
34	NC_009788	TG	3	6	33150	33155	0 %	50 %	50 %	0 %	157149430
35	NC_009788	GA	3	6	33188	33193	50 %	0 %	50 %	0 %	157149430
36	NC_009788	AT	3	6	33648	33653	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
37	NC_009788	TC	3	6	34021	34026	0 %	50 %	0 %	50 %	157149430
38	NC_009788	AT	3	6	34461	34466	50 %	50 %	0 %	0 %	157149430
39	NC_009788	AT	3	6	35416	35421	50 %	50 %	0 %	0 %	157149448
40	NC_009788	TA	3	6	35683	35688	50 %	50 %	0 %	0 %	157149448
41	NC_009788	AT	3	6	35710	35715	50 %	50 %	0 %	0 %	157149448
42	NC_009788	TC	3	6	38582	38587	0 %	50 %	0 %	50 %	157149479
43	NC_009788	CT	3	6	38650	38655	0 %	50 %	0 %	50 %	157149479
44	NC_009788	TC	3	6	38934	38939	0 %	50 %	0 %	50 %	157149439
45	NC_009788	CA	3	6	39746	39751	50 %	0 %	0 %	50 %	157149494
46	NC_009788	TA	3	6	40539	40544	50 %	50 %	0 %	0 %	157149494
47	NC_009788	CT	3	6	40710	40715	0 %	50 %	0 %	50 %	157149494
48	NC_009788	GC	3	6	42907	42912	0 %	0 %	50 %	50 %	157149471
49	NC_009788	TG	3	6	43336	43341	0 %	50 %	50 %	0 %	157149471
50	NC_009788	GT	3	6	54234	54239	0 %	50 %	50 %	0 %	157149444
51	NC_009788	TC	3	6	54453	54458	0 %	50 %	0 %	50 %	157149444
52	NC_009788	TG	3	6	56496	56501	0 %	50 %	50 %	0 %	157149495
53	NC_009788	TG	3	6	56939	56944	0 %	50 %	50 %	0 %	157149495
54	NC_009788	GA	3	6	58015	58020	50 %	0 %	50 %	0 %	157149495
55	NC_009788	GA	3	6	59234	59239	50 %	0 %	50 %	0 %	157149438
56	NC_009788	GC	3	6	60152	60157	0 %	0 %	50 %	50 %	157149493
57	NC_009788	GA	3	6	62928	62933	50 %	0 %	50 %	0 %	157149431
58	NC_009788	CA	3	6	63242	63247	50 %	0 %	0 %	50 %	157149452
59	NC_009788	TG	3	6	63831	63836	0 %	50 %	50 %	0 %	157149466
60	NC_009788	GC	3	6	65568	65573	0 %	0 %	50 %	50 %	157149459
61	NC_009788	AC	3	6	66670	66675	50 %	0 %	0 %	50 %	157149476
62	NC_009788	GA	3	6	69188	69193	50 %	0 %	50 %	0 %	157149480

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.