MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 2728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008563	CGCTG	2	10	673	682	0 %	20 %	40 %	40 %	229775982
2	NC_008563	ATTGC	2	10	3376	3385	20 %	40 %	20 %	20 %	117622297
3	NC_008563	CGCAG	2	10	8227	8236	20 %	0 %	40 %	40 %	162317588
4	NC_008563	GTGAA	2	10	8904	8913	40 %	20 %	40 %	0 %	162317588
5	NC_008563	CGTAC	2	10	9655	9664	20 %	20 %	20 %	40 %	117622303
6	NC_008563	CGCGC	2	10	10812	10821	0 %	0 %	40 %	60 %	117622305
7	NC_008563	GTTTC	2	10	11708	11717	0 %	60 %	20 %	20 %	117622306
8	NC_008563	CTGGA	2	10	18078	18087	20 %	20 %	40 %	20 %	117622310
9	NC_008563	ACCAC	2	10	18917	18926	40 %	0 %	0 %	60 %	117622311
10	NC_008563	TCCTT	2	10	19756	19765	0 %	60 %	0 %	40 %	117622311
11	NC_008563	CCGAT	2	10	20448	20457	20 %	20 %	20 %	40 %	117622312
12	NC_008563	GCGAA	2	10	34341	34350	40 %	0 %	40 %	20 %	117622323
13	NC_008563	CCGTT	2	10	35235	35244	0 %	40 %	20 %	40 %	117622323
14	NC_008563	CACGG	2	10	35612	35621	20 %	0 %	40 %	40 %	117622323
15	NC_008563	CGAAT	2	10	39065	39074	40 %	20 %	20 %	20 %	117622328
16	NC_008563	CCATG	2	10	40602	40611	20 %	20 %	20 %	40 %	117622329
17	NC_008563	CCGTA	2	10	42247	42256	20 %	20 %	20 %	40 %	117622330
18	NC_008563	TTAAA	2	10	42985	42994	60 %	40 %	0 %	0 %	117622330
19	NC_008563	ACCCA	2	10	43728	43737	40 %	0 %	0 %	60 %	117622331
20	NC_008563	TTTGA	2	10	45354	45363	20 %	60 %	20 %	0 %	117622332
21	NC_008563	CGGCG	2	10	45605	45614	0 %	0 %	60 %	40 %	117622332
22	NC_008563	AATCA	2	10	45887	45896	60 %	20 %	0 %	20 %	117622333
23	NC_008563	CGGTT	2	10	46842	46851	0 %	40 %	40 %	20 %	117622334
24	NC_008563	TGGCG	2	10	48534	48543	0 %	20 %	60 %	20 %	117622335
25	NC_008563	TGCAC	2	10	50296	50305	20 %	20 %	20 %	40 %	117622336
26	NC_008563	AACGT	2	10	54702	54711	40 %	20 %	20 %	20 %	117622340
27	NC_008563	GCGTC	2	10	57686	57695	0 %	20 %	40 %	40 %	117622343
28	NC_008563	ATGTT	2	10	58500	58509	20 %	60 %	20 %	0 %	117622344
29	NC_008563	TGCGT	2	10	59219	59228	0 %	40 %	40 %	20 %	117622344
30	NC_008563	AAAGT	2	10	64986	64995	60 %	20 %	20 %	0 %	117622347
31	NC_008563	CAGCG	2	10	68686	68695	20 %	0 %	40 %	40 %	117622350
32	NC_008563	TCGCG	2	10	69956	69965	0 %	20 %	40 %	40 %	117622350
33	NC_008563	TTTTC	2	10	74375	74384	0 %	80 %	0 %	20 %	117622353
34	NC_008563	AAAGC	2	10	74679	74688	60 %	0 %	20 %	20 %	117622354
35	NC_008563	CAGCA	2	10	75316	75325	40 %	0 %	20 %	40 %	117622355
36	NC_008563	TTGCT	2	10	79413	79422	0 %	60 %	20 %	20 %	117622359
37	NC_008563	GATGG	2	10	80149	80158	20 %	20 %	60 %	0 %	117622359
38	NC_008563	ACCGG	2	10	82146	82155	20 %	0 %	40 %	40 %	117622361
39	NC_008563	CCTGG	2	10	82402	82411	0 %	20 %	40 %	40 %	117622361
40	NC_008563	ATGCG	2	10	83847	83856	20 %	20 %	40 %	20 %	117622362
41	NC_008563	GACCG	2	10	84669	84678	20 %	0 %	40 %	40 %	117622363
42	NC_008563	ATGTT	2	10	87215	87224	20 %	60 %	20 %	0 %	117622364
43	NC_008563	AAAAC	2	10	87630	87639	80 %	0 %	0 %	20 %	117622364
44	NC_008563	TGCAT	2	10	88157	88166	20 %	40 %	20 %	20 %	117622365
45	NC_008563	ATTCC	2	10	88327	88336	20 %	40 %	0 %	40 %	117622365
46	NC_008563	AGTTC	2	10	93420	93429	20 %	40 %	20 %	20 %	117622368
47	NC_008563	TGCCT	2	10	93520	93529	0 %	40 %	20 %	40 %	117622369
48	NC_008563	CGTGG	2	10	94793	94802	0 %	20 %	60 %	20 %	117622370
49	NC_008563	TATCG	2	10	95300	95309	20 %	40 %	20 %	20 %	117622370
50	NC_008563	GGGCT	2	10	99172	99181	0 %	20 %	60 %	20 %	117622373
51	NC_008563	GCCTG	2	10	99632	99641	0 %	20 %	40 %	40 %	117622374
52	NC_008563	TCTGG	2	10	100879	100888	0 %	40 %	40 %	20 %	117622375
53	NC_008563	ACCGT	2	10	101545	101554	20 %	20 %	20 %	40 %	117622375
54	NC_008563	ATCAG	2	10	103318	103327	40 %	20 %	20 %	20 %	117622377
55	NC_008563	AGCCG	2	10	105086	105095	20 %	0 %	40 %	40 %	117622378
56	NC_008563	GCGCA	2	10	107414	107423	20 %	0 %	40 %	40 %	117622380
57	NC_008563	CCGGC	2	10	111378	111387	0 %	0 %	40 %	60 %	117622384
58	NC_008563	TGGTC	2	10	111532	111541	0 %	40 %	40 %	20 %	117622384
59	NC_008563	CGCGG	2	10	114584	114593	0 %	0 %	60 %	40 %	117622386
60	NC_008563	CATCG	2	10	116841	116850	20 %	20 %	20 %	40 %	117622389
61	NC_008563	TAACG	2	10	117535	117544	40 %	20 %	20 %	20 %	117622389
62	NC_008563	ATGCC	2	10	117994	118003	20 %	20 %	20 %	40 %	117622389
63	NC_008563	AATGC	2	10	119277	119286	40 %	20 %	20 %	20 %	117622390
64	NC_008563	TCTGT	2	10	120224	120233	0 %	60 %	20 %	20 %	117622392
65	NC_008563	GCAGG	2	10	122656	122665	20 %	0 %	60 %	20 %	117622395
66	NC_008563	TCATT	2	10	127696	127705	20 %	60 %	0 %	20 %	117622399
67	NC_008563	CGAAG	2	10	128475	128484	40 %	0 %	40 %	20 %	117622400
68	NC_008563	ACACG	2	10	128608	128617	40 %	0 %	20 %	40 %	117622400
69	NC_008563	TCGCG	2	10	128869	128878	0 %	20 %	40 %	40 %	117622400
70	NC_008563	GCATC	2	10	128959	128968	20 %	20 %	20 %	40 %	117622400
71	NC_008563	GACTG	2	10	130277	130286	20 %	20 %	40 %	20 %	117622401
72	NC_008563	AGAGC	2	10	130687	130696	40 %	0 %	40 %	20 %	117622401
73	NC_008563	CTTCT	2	10	135948	135957	0 %	60 %	0 %	40 %	117622404
74	NC_008563	TCTGG	2	10	139315	139324	0 %	40 %	40 %	20 %	117622405
75	NC_008563	GGGCA	2	10	140726	140735	20 %	0 %	60 %	20 %	117622406
76	NC_008563	CAGCG	2	10	141001	141010	20 %	0 %	40 %	40 %	117622407
77	NC_008563	ACGAC	2	10	142281	142290	40 %	0 %	20 %	40 %	117622408
78	NC_008563	GCGCG	2	10	147040	147049	0 %	0 %	60 %	40 %	117622411
79	NC_008563	CCGTC	2	10	147831	147840	0 %	20 %	20 %	60 %	117622412
80	NC_008563	GTGAA	2	10	147841	147850	40 %	20 %	40 %	0 %	117622412
81	NC_008563	GTTCA	2	10	148228	148237	20 %	40 %	20 %	20 %	117622413
82	NC_008563	ATCCA	2	10	148554	148563	40 %	20 %	0 %	40 %	117622413
83	NC_008563	CTTTA	2	10	149817	149826	20 %	60 %	0 %	20 %	117622415
84	NC_008563	TGGTG	2	10	153658	153667	0 %	40 %	60 %	0 %	117622419
85	NC_008563	GGGAG	2	10	153682	153691	20 %	0 %	80 %	0 %	117622419
86	NC_008563	CGCCA	2	10	156459	156468	20 %	0 %	20 %	60 %	117622422
87	NC_008563	ATTTT	2	10	156632	156641	20 %	80 %	0 %	0 %	117622422
88	NC_008563	GTTGG	2	10	156753	156762	0 %	40 %	60 %	0 %	117622422
89	NC_008563	CTGTA	2	10	157370	157379	20 %	40 %	20 %	20 %	117622423
90	NC_008563	TCCTG	2	10	157530	157539	0 %	40 %	20 %	40 %	117622423
91	NC_008563	ATTTT	2	10	157962	157971	20 %	80 %	0 %	0 %	117622424
92	NC_008563	CATAA	2	10	158229	158238	60 %	20 %	0 %	20 %	117622424
93	NC_008563	TTGTT	2	10	159041	159050	0 %	80 %	20 %	0 %	117622426
94	NC_008563	TTCAA	2	10	159191	159200	40 %	40 %	0 %	20 %	117622426
95	NC_008563	GCGAG	2	10	164445	164454	20 %	0 %	60 %	20 %	117622430
96	NC_008563	TGGCG	2	10	164882	164891	0 %	20 %	60 %	20 %	117622430
97	NC_008563	ACCAC	2	10	167786	167795	40 %	0 %	0 %	60 %	117622434
98	NC_008563	GGCGT	2	10	169489	169498	0 %	20 %	60 %	20 %	117622435
99	NC_008563	CGACG	2	10	170528	170537	20 %	0 %	40 %	40 %	117622435
100	NC_008563	AAAAC	2	10	174413	174422	80 %	0 %	0 %	20 %	117622437
101	NC_008563	TGGTT	2	10	174670	174679	0 %	60 %	40 %	0 %	117622437
102	NC_008563	TGGTC	2	10	176793	176802	0 %	40 %	40 %	20 %	117622439
103	NC_008563	TGGCG	2	10	178038	178047	0 %	20 %	60 %	20 %	117622440
104	NC_008563	CGGCG	2	10	178668	178677	0 %	0 %	60 %	40 %	117622440
105	NC_008563	TTCCA	2	10	179279	179288	20 %	40 %	0 %	40 %	117622440
106	NC_008563	GACCG	2	10	179804	179813	20 %	0 %	40 %	40 %	117622441
107	NC_008563	GGTCC	2	10	183602	183611	0 %	20 %	40 %	40 %	117622445
108	NC_008563	ACGGG	2	10	185519	185528	20 %	0 %	60 %	20 %	117622447
109	NC_008563	TGCGC	2	10	187226	187235	0 %	20 %	40 %	40 %	117622448
110	NC_008563	GTGAT	2	10	187678	187687	20 %	40 %	40 %	0 %	117622448
111	NC_008563	GTGAT	2	10	187969	187978	20 %	40 %	40 %	0 %	117622448
112	NC_008563	GCCAG	2	10	191646	191655	20 %	0 %	40 %	40 %	117622452
113	NC_008563	GGCGT	2	10	192484	192493	0 %	20 %	60 %	20 %	117622452
114	NC_008563	GTTCT	2	10	193087	193096	0 %	60 %	20 %	20 %	117622452
115	NC_008563	CTGAA	2	10	195079	195088	40 %	20 %	20 %	20 %	117622454
116	NC_008563	AAGCG	2	10	195143	195152	40 %	0 %	40 %	20 %	117622454
117	NC_008563	TGGTG	2	10	196926	196935	0 %	40 %	60 %	0 %	117622456
118	NC_008563	TGCAC	2	10	197052	197061	20 %	20 %	20 %	40 %	117622456
119	NC_008563	TGCGC	2	10	197445	197454	0 %	20 %	40 %	40 %	117622456
120	NC_008563	CATGG	2	10	199146	199155	20 %	20 %	40 %	20 %	117622458
121	NC_008563	CAGAT	2	10	200185	200194	40 %	20 %	20 %	20 %	117622459
122	NC_008563	ACTTT	2	10	200318	200327	20 %	60 %	0 %	20 %	117622459
123	NC_008563	GACGT	2	10	204238	204247	20 %	20 %	40 %	20 %	117622462
124	NC_008563	ATGCC	2	10	208633	208642	20 %	20 %	20 %	40 %	117622467
125	NC_008563	TGGCC	2	10	209959	209968	0 %	20 %	40 %	40 %	117622469
126	NC_008563	ACCGC	2	10	209972	209981	20 %	0 %	20 %	60 %	117622469
127	NC_008563	GTAAC	2	10	210702	210711	40 %	20 %	20 %	20 %	117622469
128	NC_008563	AGCCG	2	10	211330	211339	20 %	0 %	40 %	40 %	117622469
129	NC_008563	GGTGG	2	10	211439	211448	0 %	20 %	80 %	0 %	117622469
130	NC_008563	ACGGT	2	10	222448	222457	20 %	20 %	40 %	20 %	117622479
131	NC_008563	AGCTC	2	10	223136	223145	20 %	20 %	20 %	40 %	117622479
132	NC_008563	TGATT	2	10	225289	225298	20 %	60 %	20 %	0 %	117622482
133	NC_008563	GTGAA	2	10	237114	237123	40 %	20 %	40 %	0 %	117622492
134	NC_008563	TAATT	2	10	237298	237307	40 %	60 %	0 %	0 %	117622492
135	NC_008563	CGCGG	2	10	241280	241289	0 %	0 %	60 %	40 %	117622497
136	NC_008563	TGATC	2	10	243766	243775	20 %	40 %	20 %	20 %	117622500
137	NC_008563	GGTTC	2	10	243920	243929	0 %	40 %	40 %	20 %	117622501
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247	NC_008563	TTTTC	2	10	421453	421462	0 %	80 %	0 %	20 %	117622649
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251	NC_008563	CAAAG	2	10	438403	438412	60 %	0 %	20 %	20 %	117622664
252	NC_008563	CCTGG	2	10	439775	439784	0 %	20 %	40 %	40 %	117622664
253	NC_008563	CACAT	2	10	440520	440529	40 %	20 %	0 %	40 %	117622665
254	NC_008563	TGGCG	2	10	444337	444346	0 %	20 %	60 %	20 %	117622669
255	NC_008563	AAGCG	2	10	444856	444865	40 %	0 %	40 %	20 %	117622669
256	NC_008563	CTTGC	2	10	444981	444990	0 %	40 %	20 %	40 %	117622669
257	NC_008563	TGACC	2	10	446057	446066	20 %	20 %	20 %	40 %	117622670
258	NC_008563	AGTTC	2	10	447030	447039	20 %	40 %	20 %	20 %	117622672
259	NC_008563	CACTT	2	10	448603	448612	20 %	40 %	0 %	40 %	117622673
260	NC_008563	CTCGT	2	10	448877	448886	0 %	40 %	20 %	40 %	117622674
261	NC_008563	GCGAC	2	10	449811	449820	20 %	0 %	40 %	40 %	117622675
262	NC_008563	GCGCT	2	10	452222	452231	0 %	20 %	40 %	40 %	117622678
263	NC_008563	AGCGT	2	10	454296	454305	20 %	20 %	40 %	20 %	117622681
264	NC_008563	AAGGC	2	10	456150	456159	40 %	0 %	40 %	20 %	117622682
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381	NC_008563	TACCA	2	10	648786	648795	40 %	20 %	0 %	40 %	117622849
382	NC_008563	CGCAC	2	10	655479	655488	20 %	0 %	20 %	60 %	117622857
383	NC_008563	GCATA	2	10	658295	658304	40 %	20 %	20 %	20 %	117622858
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