MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 90462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008563	TGC	2	6	216160	216165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622471
4002	NC_008563	AGA	2	6	216179	216184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622471
4003	NC_008563	GAT	2	6	216299	216304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622471
4004	NC_008563	AAC	2	6	216367	216372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622471
4005	NC_008563	GCT	2	6	216425	216430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622471
4006	NC_008563	AG	3	6	216455	216460	50 %	0 %	50 %	0 %	117622471
4007	NC_008563	ATT	2	6	216686	216691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622472
4008	NC_008563	GC	3	6	216770	216775	0 %	0 %	50 %	50 %	117622472
4009	NC_008563	CCG	2	6	216842	216847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622472
4010	NC_008563	TGA	2	6	216901	216906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622472
4011	NC_008563	CAT	2	6	217103	217108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622473
4012	NC_008563	TC	3	6	217133	217138	0 %	50 %	0 %	50 %	117622473
4013	NC_008563	TGG	2	6	217153	217158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622473
4014	NC_008563	GCG	2	6	217165	217170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622473
4015	NC_008563	CGGA	2	8	217212	217219	25 %	0 %	50 %	25 %	117622473
4016	NC_008563	GC	3	6	217238	217243	0 %	0 %	50 %	50 %	117622473
4017	NC_008563	TGG	2	6	217330	217335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622473
4018	NC_008563	AGGCTC	2	12	217375	217386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	117622473
4019	NC_008563	TTG	2	6	217419	217424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622473
4020	NC_008563	CGA	2	6	217457	217462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622473
4021	NC_008563	CTG	2	6	217479	217484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622473
4022	NC_008563	TTGC	2	8	217569	217576	0 %	50 %	25 %	25 %	117622473
4023	NC_008563	G	6	6	217585	217590	0 %	0 %	100 %	0 %	117622473
4024	NC_008563	GAT	2	6	217650	217655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622473
4025	NC_008563	CTGCGC	2	12	217674	217685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	117622473
4026	NC_008563	GCA	2	6	217700	217705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622473
4027	NC_008563	AG	3	6	217763	217768	50 %	0 %	50 %	0 %	117622473
4028	NC_008563	CTG	2	6	217782	217787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622473
4029	NC_008563	GAT	2	6	217791	217796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622473
4030	NC_008563	CG	3	6	217866	217871	0 %	0 %	50 %	50 %	117622473
4031	NC_008563	CCG	2	6	217880	217885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622473
4032	NC_008563	CTGG	2	8	217886	217893	0 %	25 %	50 %	25 %	117622473
4033	NC_008563	TGGCGC	2	12	217951	217962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117622473
4034	NC_008563	CCG	2	6	218006	218011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622473
4035	NC_008563	TGG	2	6	218028	218033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622473
4036	NC_008563	CGG	2	6	218104	218109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622473
4037	NC_008563	GCGT	2	8	218176	218183	0 %	25 %	50 %	25 %	117622473
4038	NC_008563	CTG	2	6	218199	218204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622473
4039	NC_008563	CGG	2	6	218222	218227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622473
4040	NC_008563	GAA	2	6	218237	218242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622473
4041	NC_008563	CCG	2	6	218265	218270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622473
4042	NC_008563	CTG	2	6	218292	218297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622473
4043	NC_008563	GCG	2	6	218319	218324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622473
4044	NC_008563	AAG	2	6	218344	218349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622473
4045	NC_008563	GAA	2	6	218387	218392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622473
4046	NC_008563	CAC	3	9	218465	218473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622474
4047	NC_008563	CGA	2	6	218545	218550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622474
4048	NC_008563	ATG	2	6	218639	218644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622474
4049	NC_008563	ATC	2	6	218672	218677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622474
4050	NC_008563	ATTG	2	8	218681	218688	25 %	50 %	25 %	0 %	117622474
4051	NC_008563	CT	3	6	219140	219145	0 %	50 %	0 %	50 %	117622475
4052	NC_008563	GC	3	6	219153	219158	0 %	0 %	50 %	50 %	117622475
4053	NC_008563	ATG	2	6	219183	219188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622475
4054	NC_008563	CTG	2	6	219195	219200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622475
4055	NC_008563	TG	3	6	219247	219252	0 %	50 %	50 %	0 %	117622475
4056	NC_008563	GAT	2	6	219255	219260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622475
4057	NC_008563	GCG	2	6	219396	219401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622475
4058	NC_008563	TGG	2	6	219408	219413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622475
4059	NC_008563	GAC	2	6	219468	219473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622475
4060	NC_008563	AGC	2	6	219475	219480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622475
4061	NC_008563	GAT	2	6	219558	219563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622475
4062	NC_008563	AAT	2	6	219567	219572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622475
4063	NC_008563	CAA	2	6	219597	219602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622475
4064	NC_008563	GCGG	2	8	219680	219687	0 %	0 %	75 %	25 %	117622476
4065	NC_008563	GCA	2	6	219688	219693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622476
4066	NC_008563	TAA	2	6	219697	219702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622476
4067	NC_008563	CGC	2	6	219778	219783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622476
4068	NC_008563	CAG	2	6	219799	219804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622476
4069	NC_008563	GCG	2	6	219863	219868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622476
4070	NC_008563	TGG	2	6	219879	219884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622476
4071	NC_008563	AAC	2	6	219901	219906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622476
4072	NC_008563	CGA	2	6	219920	219925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622476
4073	NC_008563	ATGG	2	8	220040	220047	25 %	25 %	50 %	0 %	117622477
4074	NC_008563	A	6	6	220050	220055	100 %	0 %	0 %	0 %	117622477
4075	NC_008563	TAA	2	6	220106	220111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622477
4076	NC_008563	GCG	2	6	220180	220185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622477
4077	NC_008563	TGC	2	6	220186	220191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622477
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4079	NC_008563	TGA	2	6	220252	220257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622477
4080	NC_008563	GAA	2	6	220281	220286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622477
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4082	NC_008563	CG	3	6	220374	220379	0 %	0 %	50 %	50 %	117622477
4083	NC_008563	GCG	2	6	220518	220523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622477
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4086	NC_008563	AGT	2	6	220737	220742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622477
4087	NC_008563	AGTC	2	8	220916	220923	25 %	25 %	25 %	25 %	117622478
4088	NC_008563	CAA	2	6	220924	220929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622478
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4091	NC_008563	TTG	2	6	221321	221326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622478
4092	NC_008563	T	6	6	221381	221386	0 %	100 %	0 %	0 %	117622478
4093	NC_008563	TTA	2	6	221430	221435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622478
4094	NC_008563	GAG	2	6	221514	221519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117622478
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4096	NC_008563	TGA	2	6	221642	221647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622478
4097	NC_008563	CTGG	2	8	221650	221657	0 %	25 %	50 %	25 %	117622478
4098	NC_008563	AAAG	2	8	221686	221693	75 %	0 %	25 %	0 %	117622478
4099	NC_008563	GGC	2	6	221707	221712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622478
4100	NC_008563	CGA	2	6	221816	221821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622479
4101	NC_008563	TTAA	2	8	221833	221840	50 %	50 %	0 %	0 %	117622479
4102	NC_008563	ACG	2	6	221856	221861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622479
4103	NC_008563	ATC	2	6	221877	221882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622479
4104	NC_008563	CAG	2	6	221979	221984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622479
4105	NC_008563	GC	3	6	222001	222006	0 %	0 %	50 %	50 %	117622479
4106	NC_008563	TCG	2	6	222121	222126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622479
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4108	NC_008563	CAG	2	6	222294	222299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622479
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4110	NC_008563	AGT	2	6	222395	222400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622479
4111	NC_008563	CAG	2	6	222422	222427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622479
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4113	NC_008563	ACGGT	2	10	222448	222457	20 %	20 %	40 %	20 %	117622479
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4117	NC_008563	CAG	2	6	222660	222665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622479
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4119	NC_008563	GC	3	6	222769	222774	0 %	0 %	50 %	50 %	117622479
4120	NC_008563	TCT	2	6	222850	222855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622479
4121	NC_008563	CCG	2	6	222895	222900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622479
4122	NC_008563	TCA	2	6	223034	223039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622479
4123	NC_008563	TCG	2	6	223081	223086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622479
4124	NC_008563	AGCTC	2	10	223136	223145	20 %	20 %	20 %	40 %	117622479
4125	NC_008563	CTT	2	6	223169	223174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622479
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4127	NC_008563	CAC	2	6	223205	223210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622479
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4129	NC_008563	CT	3	6	223258	223263	0 %	50 %	0 %	50 %	117622479
4130	NC_008563	ACC	2	6	223285	223290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622479
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4133	NC_008563	T	6	6	223350	223355	0 %	100 %	0 %	0 %	117622479
4134	NC_008563	TA	3	6	223385	223390	50 %	50 %	0 %	0 %	117622479
4135	NC_008563	ATC	2	6	223411	223416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622479
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4147	NC_008563	GCGA	2	8	224281	224288	25 %	0 %	50 %	25 %	117622480
4148	NC_008563	TACA	2	8	224352	224359	50 %	25 %	0 %	25 %	117622481
4149	NC_008563	CGG	2	6	224476	224481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622481
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4155	NC_008563	TTC	2	6	224924	224929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622482
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4159	NC_008563	GGT	2	6	225046	225051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622482
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4233	NC_008563	CTG	2	6	234206	234211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622489
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4239	NC_008563	CTT	2	6	234548	234553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622489
4240	NC_008563	CTA	2	6	234554	234559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622489
4241	NC_008563	A	6	6	234619	234624	100 %	0 %	0 %	0 %	117622489
4242	NC_008563	CGC	2	6	234630	234635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622489
4243	NC_008563	CT	3	6	234696	234701	0 %	50 %	0 %	50 %	117622489
4244	NC_008563	CTC	2	6	234707	234712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622490
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4361	NC_008563	TGT	2	6	242297	242302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622499
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4366	NC_008563	A	7	7	242366	242372	100 %	0 %	0 %	0 %	117622499
4367	NC_008563	CA	3	6	242380	242385	50 %	0 %	0 %	50 %	117622499
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4477	NC_008563	CCAG	2	8	248161	248168	25 %	0 %	25 %	50 %	117622502
4478	NC_008563	GGC	3	9	248179	248187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622502
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4484	NC_008563	GGC	2	6	248422	248427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622502
4485	NC_008563	GCA	2	6	248434	248439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622502
4486	NC_008563	TGC	2	6	248457	248462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622502
4487	NC_008563	TCC	2	6	248499	248504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622502
4488	NC_008563	GCT	2	6	248506	248511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622502
4489	NC_008563	CTG	2	6	248516	248521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622502
4490	NC_008563	TCA	2	6	248545	248550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622502
4491	NC_008563	CCAGA	2	10	248564	248573	40 %	0 %	20 %	40 %	117622502
4492	NC_008563	CGG	2	6	248590	248595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622502
4493	NC_008563	GCCA	2	8	248598	248605	25 %	0 %	25 %	50 %	117622502
4494	NC_008563	AGCC	2	8	248621	248628	25 %	0 %	25 %	50 %	117622502
4495	NC_008563	TGC	2	6	248631	248636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622502
4496	NC_008563	CCA	2	6	248663	248668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622502
4497	NC_008563	CAG	2	6	248678	248683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622502
4498	NC_008563	CAG	2	6	248853	248858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622503
4499	NC_008563	CAT	2	6	248880	248885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622503
4500	NC_008563	CTG	2	6	248916	248921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622503

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