MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 90462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008563	CTG	2	6	29238	29243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622319
502	NC_008563	CTGG	2	8	29500	29507	0 %	25 %	50 %	25 %	117622319
503	NC_008563	ACG	2	6	29579	29584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622319
504	NC_008563	GTT	2	6	29585	29590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622319
505	NC_008563	CTGGAT	2	12	29636	29647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	117622319
506	NC_008563	TAA	3	9	29696	29704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622319
507	NC_008563	TCTG	2	8	29827	29834	0 %	50 %	25 %	25 %	117622320
508	NC_008563	TGG	2	6	29850	29855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622320
509	NC_008563	T	8	8	29893	29900	0 %	100 %	0 %	0 %	117622320
510	NC_008563	ATTT	2	8	29915	29922	25 %	75 %	0 %	0 %	117622320
511	NC_008563	GTG	2	6	29993	29998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622320
512	NC_008563	TGC	2	6	30051	30056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622320
513	NC_008563	ATG	2	6	30251	30256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622321
514	NC_008563	GCC	2	6	30299	30304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622321
515	NC_008563	GGC	2	6	30315	30320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622321
516	NC_008563	GCG	2	6	30349	30354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622321
517	NC_008563	TCT	2	6	30370	30375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622321
518	NC_008563	AGT	2	6	30436	30441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622321
519	NC_008563	GAT	2	6	30457	30462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622321
520	NC_008563	CGC	3	9	30594	30602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622321
521	NC_008563	GCC	2	6	30622	30627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622321
522	NC_008563	CTG	2	6	30661	30666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622321
523	NC_008563	AGC	2	6	30672	30677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622321
524	NC_008563	ATT	2	6	30709	30714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622321
525	NC_008563	CAT	2	6	30721	30726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622321
526	NC_008563	CGTG	2	8	30876	30883	0 %	25 %	50 %	25 %	117622321
527	NC_008563	AAT	2	6	31057	31062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622321
528	NC_008563	AGTG	2	8	31496	31503	25 %	25 %	50 %	0 %	117622322
529	NC_008563	CGG	2	6	31597	31602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622322
530	NC_008563	TCCT	2	8	31658	31665	0 %	50 %	0 %	50 %	117622322
531	NC_008563	CTTA	2	8	31686	31693	25 %	50 %	0 %	25 %	117622322
532	NC_008563	GAA	2	6	31731	31736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622322
533	NC_008563	TCT	2	6	31737	31742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622322
534	NC_008563	CT	3	6	31815	31820	0 %	50 %	0 %	50 %	117622322
535	NC_008563	GCG	2	6	31941	31946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622322
536	NC_008563	CG	3	6	31965	31970	0 %	0 %	50 %	50 %	117622322
537	NC_008563	ACC	2	6	32010	32015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622322
538	NC_008563	CGG	2	6	32057	32062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622322
539	NC_008563	A	6	6	32076	32081	100 %	0 %	0 %	0 %	117622322
540	NC_008563	CGT	2	6	32102	32107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622322
541	NC_008563	TGG	2	6	32149	32154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622322
542	NC_008563	TCA	2	6	32336	32341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622322
543	NC_008563	GCT	2	6	32342	32347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622322
544	NC_008563	CAC	2	6	32391	32396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622322
545	NC_008563	GGC	2	6	32397	32402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622322
546	NC_008563	TGA	2	6	32437	32442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622322
547	NC_008563	CA	3	6	32504	32509	50 %	0 %	0 %	50 %	117622322
548	NC_008563	AGCC	2	8	32588	32595	25 %	0 %	25 %	50 %	117622322
549	NC_008563	ACG	2	6	32605	32610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622322
550	NC_008563	GTT	2	6	32618	32623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622322
551	NC_008563	ACT	2	6	32769	32774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622323
552	NC_008563	GC	3	6	32778	32783	0 %	0 %	50 %	50 %	117622323
553	NC_008563	GACC	2	8	32854	32861	25 %	0 %	25 %	50 %	117622323
554	NC_008563	ATT	2	6	32918	32923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622323
555	NC_008563	TGC	2	6	32946	32951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622323
556	NC_008563	G	7	7	32959	32965	0 %	0 %	100 %	0 %	117622323
557	NC_008563	CCG	3	9	33073	33081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622323
558	NC_008563	GAA	2	6	33097	33102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622323
559	NC_008563	GAA	2	6	33146	33151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622323
560	NC_008563	ATT	2	6	33188	33193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622323
561	NC_008563	GAA	2	6	33245	33250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622323
562	NC_008563	GAA	2	6	33254	33259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622323
563	NC_008563	GCT	2	6	33298	33303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622323
564	NC_008563	TGA	2	6	33307	33312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622323
565	NC_008563	GTG	2	6	33347	33352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622323
566	NC_008563	CAT	2	6	33373	33378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622323
567	NC_008563	GGT	2	6	33527	33532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622323
568	NC_008563	CTC	2	6	33607	33612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622323
569	NC_008563	GGC	2	6	33655	33660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
570	NC_008563	CGA	2	6	33685	33690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622323
571	NC_008563	TGA	2	6	33693	33698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622323
572	NC_008563	CCT	2	6	33726	33731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622323
573	NC_008563	CGCA	2	8	33854	33861	25 %	0 %	25 %	50 %	117622323
574	NC_008563	CGA	2	6	33934	33939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622323
575	NC_008563	CCG	2	6	33961	33966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622323
576	NC_008563	CG	3	6	34019	34024	0 %	0 %	50 %	50 %	117622323
577	NC_008563	CTGT	2	8	34028	34035	0 %	50 %	25 %	25 %	117622323
578	NC_008563	GCGT	2	8	34209	34216	0 %	25 %	50 %	25 %	117622323
579	NC_008563	GAA	2	6	34331	34336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622323
580	NC_008563	GCGAA	2	10	34341	34350	40 %	0 %	40 %	20 %	117622323
581	NC_008563	A	6	6	34368	34373	100 %	0 %	0 %	0 %	117622323
582	NC_008563	CGG	3	9	34384	34392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
583	NC_008563	ACT	2	6	34425	34430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622323
584	NC_008563	CGG	2	6	34615	34620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
585	NC_008563	GC	5	10	34640	34649	0 %	0 %	50 %	50 %	117622323
586	NC_008563	GCT	2	6	34655	34660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622323
587	NC_008563	CTGAAA	2	12	34742	34753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	117622323
588	NC_008563	ACC	2	6	34775	34780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622323
589	NC_008563	TGG	2	6	34824	34829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622323
590	NC_008563	CGTC	2	8	34832	34839	0 %	25 %	25 %	50 %	117622323
591	NC_008563	CGG	2	6	34849	34854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
592	NC_008563	TGA	2	6	34957	34962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622323
593	NC_008563	GGC	2	6	35015	35020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
594	NC_008563	CAG	2	6	35120	35125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622323
595	NC_008563	TGA	2	6	35163	35168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622323
596	NC_008563	AAC	2	6	35189	35194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622323
597	NC_008563	GCG	2	6	35225	35230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
598	NC_008563	CCGTT	2	10	35235	35244	0 %	40 %	20 %	40 %	117622323
599	NC_008563	GGC	2	6	35281	35286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
600	NC_008563	TGGC	2	8	35295	35302	0 %	25 %	50 %	25 %	117622323
601	NC_008563	GCTG	2	8	35308	35315	0 %	25 %	50 %	25 %	117622323
602	NC_008563	AAG	2	6	35331	35336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622323
603	NC_008563	TAC	2	6	35348	35353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622323
604	NC_008563	GTG	2	6	35366	35371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622323
605	NC_008563	GCA	2	6	35490	35495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622323
606	NC_008563	CCA	2	6	35499	35504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622323
607	NC_008563	GAA	2	6	35506	35511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622323
608	NC_008563	GCT	2	6	35524	35529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622323
609	NC_008563	GTG	2	6	35558	35563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622323
610	NC_008563	GGC	2	6	35569	35574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
611	NC_008563	CTG	2	6	35579	35584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622323
612	NC_008563	CACGG	2	10	35612	35621	20 %	0 %	40 %	40 %	117622323
613	NC_008563	CAT	2	6	35725	35730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622323
614	NC_008563	ACC	2	6	35735	35740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622323
615	NC_008563	GTC	2	6	35745	35750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622323
616	NC_008563	ACC	2	6	35813	35818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622323
617	NC_008563	CGG	2	6	35824	35829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622323
618	NC_008563	ATA	2	6	35908	35913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622323
619	NC_008563	AG	3	6	36225	36230	50 %	0 %	50 %	0 %	117622324
620	NC_008563	TG	3	6	36265	36270	0 %	50 %	50 %	0 %	117622324
621	NC_008563	GTAA	2	8	36586	36593	50 %	25 %	25 %	0 %	117622324
622	NC_008563	AT	3	6	36797	36802	50 %	50 %	0 %	0 %	117622325
623	NC_008563	TGC	2	6	36831	36836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622325
624	NC_008563	TG	3	6	36884	36889	0 %	50 %	50 %	0 %	117622325
625	NC_008563	GAT	2	6	36933	36938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622325
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627	NC_008563	AG	3	6	36964	36969	50 %	0 %	50 %	0 %	117622325
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