MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 1907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007941	CAT	2	6	31791	31796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206282
502	NC_007941	GGT	2	6	31859	31864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91206282
503	NC_007941	CGG	2	6	31898	31903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91206282
504	NC_007941	GAT	2	6	31954	31959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206282
505	NC_007941	GAG	2	6	32008	32013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91206282
506	NC_007941	CGC	2	6	32187	32192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91206282
507	NC_007941	AAC	2	6	32249	32254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91206282
508	NC_007941	CGTGT	2	10	32332	32341	0 %	40 %	40 %	20 %	91206282
509	NC_007941	CTGG	2	8	32358	32365	0 %	25 %	50 %	25 %	91206282
510	NC_007941	TGA	2	6	32396	32401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206282
511	NC_007941	GGT	3	9	32402	32410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91206282
512	NC_007941	GCG	2	6	32480	32485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91206282
513	NC_007941	TACTG	2	10	32489	32498	20 %	40 %	20 %	20 %	91206282
514	NC_007941	TGG	2	6	32501	32506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91206282
515	NC_007941	GGCAA	2	10	32507	32516	40 %	0 %	40 %	20 %	91206282
516	NC_007941	GGC	2	6	32531	32536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91206282
517	NC_007941	A	7	7	33154	33160	100 %	0 %	0 %	0 %	91206283
518	NC_007941	TCAAAA	2	12	33182	33193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91206283
519	NC_007941	CTCG	2	8	33235	33242	0 %	25 %	25 %	50 %	91206283
520	NC_007941	TCC	2	6	33309	33314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91206283
521	NC_007941	CAA	2	6	33317	33322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91206283
522	NC_007941	AAC	2	6	33328	33333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91206283
523	NC_007941	GCT	2	6	33342	33347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206283
524	NC_007941	TGT	2	6	33372	33377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91206283
525	NC_007941	C	6	6	33389	33394	0 %	0 %	0 %	100 %	91206283
526	NC_007941	GCT	2	6	33409	33414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206283
527	NC_007941	CTG	2	6	33508	33513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206283
528	NC_007941	CTGG	2	8	33560	33567	0 %	25 %	50 %	25 %	91206284
529	NC_007941	GGC	2	6	33608	33613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91206284
530	NC_007941	GAC	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206284
531	NC_007941	CTC	2	6	33696	33701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91206284
532	NC_007941	CTG	2	6	33726	33731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206284
533	NC_007941	GGC	2	6	33835	33840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91206284
534	NC_007941	TGT	2	6	33871	33876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91206284
535	NC_007941	GCC	2	6	35086	35091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91206285
536	NC_007941	CGC	2	6	35100	35105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91206285
537	NC_007941	CTG	2	6	35109	35114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206285
538	NC_007941	TCGC	2	8	35199	35206	0 %	25 %	25 %	50 %	91206285
539	NC_007941	ATTC	2	8	35254	35261	25 %	50 %	0 %	25 %	91206285
540	NC_007941	TC	4	8	35264	35271	0 %	50 %	0 %	50 %	91206285
541	NC_007941	CAGGAG	2	12	35279	35290	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91206285
542	NC_007941	GTTCG	2	10	35297	35306	0 %	40 %	40 %	20 %	91206285
543	NC_007941	GAC	2	6	35319	35324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206285
544	NC_007941	TGT	2	6	35406	35411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91206285
545	NC_007941	CTT	2	6	35476	35481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91206285
546	NC_007941	TGG	2	6	35482	35487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91206285
547	NC_007941	CG	3	6	35493	35498	0 %	0 %	50 %	50 %	91206285
548	NC_007941	TC	3	6	35607	35612	0 %	50 %	0 %	50 %	91206285
549	NC_007941	AAGGT	2	10	35646	35655	40 %	20 %	40 %	0 %	91206285
550	NC_007941	GCTG	2	8	35766	35773	0 %	25 %	50 %	25 %	91206285
551	NC_007941	AGC	2	6	35841	35846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206285
552	NC_007941	A	6	6	35873	35878	100 %	0 %	0 %	0 %	91206285
553	NC_007941	TGA	2	6	35896	35901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206285
554	NC_007941	CAT	2	6	35933	35938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206285
555	NC_007941	TGA	2	6	35978	35983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206285
556	NC_007941	AGCGC	2	10	36046	36055	20 %	0 %	40 %	40 %	91206286
557	NC_007941	GAA	2	6	36124	36129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91206286
558	NC_007941	TCA	2	6	36141	36146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206286
559	NC_007941	CGG	2	6	36185	36190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91206286
560	NC_007941	CTCA	2	8	36261	36268	25 %	25 %	0 %	50 %	91206286
561	NC_007941	CAG	3	9	36389	36397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206286
562	NC_007941	ACG	2	6	36445	36450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206286
563	NC_007941	C	6	6	36470	36475	0 %	0 %	0 %	100 %	91206286
564	NC_007941	TCA	2	6	36482	36487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206286
565	NC_007941	TGA	2	6	36489	36494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206286
566	NC_007941	TCAG	2	8	36512	36519	25 %	25 %	25 %	25 %	91206286
567	NC_007941	GAA	2	6	36520	36525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91206286
568	NC_007941	TTC	2	6	36535	36540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91206286
569	NC_007941	GCA	2	6	36631	36636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206286
570	NC_007941	TCAAA	2	10	36684	36693	60 %	20 %	0 %	20 %	91206286
571	NC_007941	CAGA	2	8	36711	36718	50 %	0 %	25 %	25 %	91206286
572	NC_007941	TCA	2	6	37538	37543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206287
573	NC_007941	CA	3	6	37542	37547	50 %	0 %	0 %	50 %	91206287
574	NC_007941	GCCA	2	8	37586	37593	25 %	0 %	25 %	50 %	91206287
575	NC_007941	GAT	2	6	37703	37708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206287
576	NC_007941	CTG	2	6	37870	37875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206287
577	NC_007941	CAT	2	6	37929	37934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206287
578	NC_007941	AT	3	6	37997	38002	50 %	50 %	0 %	0 %	91206287
579	NC_007941	TTGC	2	8	38027	38034	0 %	50 %	25 %	25 %	91206287
580	NC_007941	TGT	2	6	38187	38192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91206287
581	NC_007941	TCA	2	6	38283	38288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206287
582	NC_007941	TTG	2	6	38369	38374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91206288
583	NC_007941	AGCC	2	8	38457	38464	25 %	0 %	25 %	50 %	91206288
584	NC_007941	T	6	6	38479	38484	0 %	100 %	0 %	0 %	91206288
585	NC_007941	GCT	2	6	38495	38500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206288
586	NC_007941	CTC	2	6	38532	38537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91206288
587	NC_007941	TGA	2	6	38565	38570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206288
588	NC_007941	GT	3	6	38571	38576	0 %	50 %	50 %	0 %	91206288
589	NC_007941	CTG	3	9	38603	38611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206288
590	NC_007941	AAT	2	6	38655	38660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91206288
591	NC_007941	ATCCC	2	10	38683	38692	20 %	20 %	0 %	60 %	91206288
592	NC_007941	TAAGAA	2	12	38717	38728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91206288
593	NC_007941	CG	3	6	38748	38753	0 %	0 %	50 %	50 %	91206288
594	NC_007941	CAT	2	6	38934	38939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206288
595	NC_007941	CAT	2	6	38995	39000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206288
596	NC_007941	CGC	2	6	39028	39033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91206288
597	NC_007941	CGA	2	6	39108	39113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206288
598	NC_007941	TTCC	2	8	39180	39187	0 %	50 %	0 %	50 %	91206288
599	NC_007941	CTG	3	9	39217	39225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206288
600	NC_007941	TAACT	2	10	39245	39254	40 %	40 %	0 %	20 %	91206288
601	NC_007941	ACA	2	6	39293	39298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91206288
602	NC_007941	TGT	2	6	39315	39320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91206288
603	NC_007941	TGT	2	6	39339	39344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91206288
604	NC_007941	TGA	2	6	39396	39401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91206288
605	NC_007941	GTG	2	6	39512	39517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91206288
606	NC_007941	CTGT	2	8	39557	39564	0 %	50 %	25 %	25 %	91206288
607	NC_007941	GC	3	6	39617	39622	0 %	0 %	50 %	50 %	91206288
608	NC_007941	GATA	2	8	39636	39643	50 %	25 %	25 %	0 %	91206288
609	NC_007941	CTGTG	2	10	39720	39729	0 %	40 %	40 %	20 %	91206288
610	NC_007941	CAC	2	6	39732	39737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91206288
611	NC_007941	TC	3	6	39771	39776	0 %	50 %	0 %	50 %	91206288
612	NC_007941	G	6	6	39778	39783	0 %	0 %	100 %	0 %	91206288
613	NC_007941	CTG	2	6	39792	39797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206288
614	NC_007941	CAA	2	6	39951	39956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91206288
615	NC_007941	GTCC	2	8	40010	40017	0 %	25 %	25 %	50 %	91206288
616	NC_007941	GAC	2	6	40102	40107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206288
617	NC_007941	AGA	2	6	40183	40188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91206288
618	NC_007941	GAT	2	6	40547	40552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577730
619	NC_007941	TAC	2	6	40586	40591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577730
620	NC_007941	CAG	2	6	40614	40619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577730
621	NC_007941	TTG	2	6	40648	40653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229577730
622	NC_007941	CAGC	2	8	40672	40679	25 %	0 %	25 %	50 %	229577730
623	NC_007941	GCAA	2	8	40696	40703	50 %	0 %	25 %	25 %	229577730
624	NC_007941	AGG	2	6	40708	40713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229577730
625	NC_007941	CTG	2	6	40723	40728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577730
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627	NC_007941	A	7	7	40812	40818	100 %	0 %	0 %	0 %	229577730
628	NC_007941	AAG	2	6	40840	40845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577730
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