MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas

Total Repeats: 896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007799	TATCA	2	10	1160	1169	40 %	40 %	0 %	20 %	88658505
2	NC_007799	ACTAT	2	10	1843	1852	40 %	40 %	0 %	20 %	88658005
3	NC_007799	TAATA	2	10	3674	3683	60 %	40 %	0 %	0 %	88657649
4	NC_007799	GAAAA	2	10	4043	4052	80 %	0 %	20 %	0 %	88657649
5	NC_007799	GGCAA	2	10	4296	4305	40 %	0 %	40 %	20 %	88657649
6	NC_007799	AATGA	2	10	5645	5654	60 %	20 %	20 %	0 %	88658160
7	NC_007799	AAAAT	2	10	6124	6133	80 %	20 %	0 %	0 %	88658160
8	NC_007799	TACCA	2	10	7218	7227	40 %	20 %	0 %	40 %	88657820
9	NC_007799	TGTCT	2	10	7693	7702	0 %	60 %	20 %	20 %	88657571
10	NC_007799	CAAAA	2	10	7829	7838	80 %	0 %	0 %	20 %	88657571
11	NC_007799	CTTTT	2	10	8354	8363	0 %	80 %	0 %	20 %	88657571
12	NC_007799	CTGCA	2	10	11652	11661	20 %	20 %	20 %	40 %	88657880
13	NC_007799	GTTAT	2	10	13008	13017	20 %	60 %	20 %	0 %	88657800
14	NC_007799	ACAAT	2	10	17139	17148	60 %	20 %	0 %	20 %	88657937
15	NC_007799	AGCAA	2	10	17641	17650	60 %	0 %	20 %	20 %	88657937
16	NC_007799	CATGT	2	10	22384	22393	20 %	40 %	20 %	20 %	88657578
17	NC_007799	ATATC	2	10	23219	23228	40 %	40 %	0 %	20 %	88658330
18	NC_007799	GAAAA	2	10	24499	24508	80 %	0 %	20 %	0 %	88658210
19	NC_007799	TGTAA	2	10	26775	26784	40 %	40 %	20 %	0 %	88657828
20	NC_007799	ACTAA	2	10	28356	28365	60 %	20 %	0 %	20 %	88657926
21	NC_007799	AGAAT	2	10	29331	29340	60 %	20 %	20 %	0 %	88658099
22	NC_007799	ATCAT	2	10	29707	29716	40 %	40 %	0 %	20 %	88658099
23	NC_007799	TAATA	2	10	30221	30230	60 %	40 %	0 %	0 %	88657644
24	NC_007799	AATAT	2	10	31031	31040	60 %	40 %	0 %	0 %	88658129
25	NC_007799	AGAAA	2	10	31635	31644	80 %	0 %	20 %	0 %	88657840
26	NC_007799	TCATT	2	10	31791	31800	20 %	60 %	0 %	20 %	88657840
27	NC_007799	ATCAG	2	10	33742	33751	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
28	NC_007799	ATCAG	2	10	33982	33991	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
29	NC_007799	ATCAG	2	10	34222	34231	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
30	NC_007799	ATCAG	2	10	34462	34471	40 %	20 %	20 %	20 %	88658043
31	NC_007799	TTTAT	2	10	35028	35037	20 %	80 %	0 %	0 %	88658043
32	NC_007799	TTACT	2	10	35047	35056	20 %	60 %	0 %	20 %	88658043
33	NC_007799	ATCCA	2	10	37550	37559	40 %	20 %	0 %	40 %	88657566
34	NC_007799	ATACT	2	10	37944	37953	40 %	40 %	0 %	20 %	88657566
35	NC_007799	TATTT	2	10	40186	40195	20 %	80 %	0 %	0 %	88658039
36	NC_007799	TTTTA	2	10	45877	45886	20 %	80 %	0 %	0 %	88658257
37	NC_007799	ATAGT	2	10	47691	47700	40 %	40 %	20 %	0 %	88658071
38	NC_007799	GTTGT	2	10	48436	48445	0 %	60 %	40 %	0 %	88658248
39	NC_007799	TTATT	2	10	49530	49539	20 %	80 %	0 %	0 %	88657931
40	NC_007799	TAAAG	2	10	49989	49998	60 %	20 %	20 %	0 %	88657931
41	NC_007799	AAGTA	2	10	52348	52357	60 %	20 %	20 %	0 %	88657848
42	NC_007799	ATTTT	2	10	54357	54366	20 %	80 %	0 %	0 %	88658181
43	NC_007799	GAAAA	2	10	55232	55241	80 %	0 %	20 %	0 %	88658514
44	NC_007799	CTATA	2	10	55749	55758	40 %	40 %	0 %	20 %	88658514
45	NC_007799	GTAAG	2	10	56041	56050	40 %	20 %	40 %	0 %	88658514
46	NC_007799	AATGT	2	10	56089	56098	40 %	40 %	20 %	0 %	88658514
47	NC_007799	AGCAA	2	10	57551	57560	60 %	0 %	20 %	20 %	88658323
48	NC_007799	GTAAA	2	10	57757	57766	60 %	20 %	20 %	0 %	88658323
49	NC_007799	AATTA	2	10	61563	61572	60 %	40 %	0 %	0 %	88658657
50	NC_007799	TTATT	2	10	61982	61991	20 %	80 %	0 %	0 %	88658044
51	NC_007799	TATGA	2	10	62226	62235	40 %	40 %	20 %	0 %	88658044
52	NC_007799	CTTTA	2	10	63475	63484	20 %	60 %	0 %	20 %	88658635
53	NC_007799	TTGTT	2	10	63549	63558	0 %	80 %	20 %	0 %	88658635
54	NC_007799	TGAAC	2	10	64081	64090	40 %	20 %	20 %	20 %	88658635
55	NC_007799	TATGC	2	10	66309	66318	20 %	40 %	20 %	20 %	88657868
56	NC_007799	TGTTT	2	10	67250	67259	0 %	80 %	20 %	0 %	88658291
57	NC_007799	TGCTT	2	10	67672	67681	0 %	60 %	20 %	20 %	88658291
58	NC_007799	ATGTA	2	10	67821	67830	40 %	40 %	20 %	0 %	88658291
59	NC_007799	TCCAA	2	10	69130	69139	40 %	20 %	0 %	40 %	88658104
60	NC_007799	CTGTG	2	10	69246	69255	0 %	40 %	40 %	20 %	88658104
61	NC_007799	TCTAT	2	10	72691	72700	20 %	60 %	0 %	20 %	88658019
62	NC_007799	TTTGG	2	10	73023	73032	0 %	60 %	40 %	0 %	88658019
63	NC_007799	ATTAT	2	10	76097	76106	40 %	60 %	0 %	0 %	88658302
64	NC_007799	AATTT	2	10	76687	76696	40 %	60 %	0 %	0 %	88658167
65	NC_007799	TGTAT	2	10	76757	76766	20 %	60 %	20 %	0 %	88658167
66	NC_007799	CTTGT	2	10	77487	77496	0 %	60 %	20 %	20 %	88658224
67	NC_007799	TGTAT	2	10	78369	78378	20 %	60 %	20 %	0 %	88658224
68	NC_007799	TGTAT	2	10	78646	78655	20 %	60 %	20 %	0 %	88658224
69	NC_007799	ATTTT	2	10	80266	80275	20 %	80 %	0 %	0 %	88658390
70	NC_007799	AAATA	2	10	80940	80949	80 %	20 %	0 %	0 %	88658390
71	NC_007799	CCTAG	2	10	86300	86309	20 %	20 %	20 %	40 %	161486751
72	NC_007799	ATATT	2	10	89572	89581	40 %	60 %	0 %	0 %	88658267
73	NC_007799	AAGGC	2	10	91174	91183	40 %	0 %	40 %	20 %	88658533
74	NC_007799	TGTTT	2	10	92597	92606	0 %	80 %	20 %	0 %	88657757
75	NC_007799	AATAG	2	10	92656	92665	60 %	20 %	20 %	0 %	88657757
76	NC_007799	TAATG	2	10	93375	93384	40 %	40 %	20 %	0 %	88657757
77	NC_007799	AAGGG	2	10	95210	95219	40 %	0 %	60 %	0 %	88657565
78	NC_007799	AGAGA	2	10	95742	95751	60 %	0 %	40 %	0 %	88657565
79	NC_007799	TAAAT	3	15	98480	98494	60 %	40 %	0 %	0 %	88658262
80	NC_007799	AAGAG	2	10	99136	99145	60 %	0 %	40 %	0 %	88657907
81	NC_007799	TGTAA	2	10	100752	100761	40 %	40 %	20 %	0 %	88657907
82	NC_007799	CCAGA	2	10	104381	104390	40 %	0 %	20 %	40 %	88657659
83	NC_007799	TGTAG	2	10	107786	107795	20 %	40 %	40 %	0 %	88658059
84	NC_007799	ACTTC	2	10	108978	108987	20 %	40 %	0 %	40 %	88658055
85	NC_007799	TGTAG	2	10	109920	109929	20 %	40 %	40 %	0 %	88658530
86	NC_007799	TTATT	2	10	112743	112752	20 %	80 %	0 %	0 %	88657897
87	NC_007799	TATGG	2	10	114092	114101	20 %	40 %	40 %	0 %	88658400
88	NC_007799	TTTAT	2	10	114264	114273	20 %	80 %	0 %	0 %	88658400
89	NC_007799	TAATG	2	10	114460	114469	40 %	40 %	20 %	0 %	88658400
90	NC_007799	GTAAT	2	10	117168	117177	40 %	40 %	20 %	0 %	88658053
91	NC_007799	AAGGG	2	10	118737	118746	40 %	0 %	60 %	0 %	88658307
92	NC_007799	TAAAG	2	10	120396	120405	60 %	20 %	20 %	0 %	88658063
93	NC_007799	AGGTG	2	10	120816	120825	20 %	20 %	60 %	0 %	88657691
94	NC_007799	GTTGG	2	10	121096	121105	0 %	40 %	60 %	0 %	88657691
95	NC_007799	ATACT	2	10	123212	123221	40 %	40 %	0 %	20 %	88658144
96	NC_007799	GTATT	2	10	123597	123606	20 %	60 %	20 %	0 %	88658487
97	NC_007799	AAGTC	2	10	123618	123627	40 %	20 %	20 %	20 %	88658487
98	NC_007799	TTTTA	2	10	124439	124448	20 %	80 %	0 %	0 %	88658365
99	NC_007799	TGAAT	2	10	124545	124554	40 %	40 %	20 %	0 %	88658365
100	NC_007799	TTCTA	2	10	127319	127328	20 %	60 %	0 %	20 %	88657620
101	NC_007799	GTTGG	2	10	131042	131051	0 %	40 %	60 %	0 %	88658320
102	NC_007799	ATGTA	2	10	134484	134493	40 %	40 %	20 %	0 %	88658293
103	NC_007799	ATGCA	2	10	134633	134642	40 %	20 %	20 %	20 %	88658293
104	NC_007799	TTTAT	2	10	134858	134867	20 %	80 %	0 %	0 %	88658597
105	NC_007799	TTTAT	2	10	135263	135272	20 %	80 %	0 %	0 %	88658597
106	NC_007799	ATCAT	2	10	135284	135293	40 %	40 %	0 %	20 %	88658597
107	NC_007799	GTTGT	2	10	141810	141819	0 %	60 %	40 %	0 %	88658341
108	NC_007799	TAGTG	2	10	142147	142156	20 %	40 %	40 %	0 %	88658341
109	NC_007799	GTTTG	2	10	143596	143605	0 %	60 %	40 %	0 %	88658109
110	NC_007799	TTTAA	2	10	144828	144837	40 %	60 %	0 %	0 %	88658109
111	NC_007799	TACAT	2	10	145694	145703	40 %	40 %	0 %	20 %	88658475
112	NC_007799	TGTAG	2	10	146706	146715	20 %	40 %	40 %	0 %	88657887
113	NC_007799	TTAAT	2	10	147929	147938	40 %	60 %	0 %	0 %	88657713
114	NC_007799	GAAGC	2	10	149734	149743	40 %	0 %	40 %	20 %	88658184
115	NC_007799	TGCAT	2	10	151008	151017	20 %	40 %	20 %	20 %	88658615
116	NC_007799	ATAGA	2	10	151858	151867	60 %	20 %	20 %	0 %	88658416
117	NC_007799	GAAAA	2	10	153451	153460	80 %	0 %	20 %	0 %	88658228
118	NC_007799	ATCTT	2	10	154977	154986	20 %	60 %	0 %	20 %	88657782
119	NC_007799	TTGCT	2	10	156565	156574	0 %	60 %	20 %	20 %	88658497
120	NC_007799	TAAAT	2	10	160586	160595	60 %	40 %	0 %	0 %	88658204
121	NC_007799	ATTAT	2	10	166035	166044	40 %	60 %	0 %	0 %	88658354
122	NC_007799	TGGAA	2	10	167059	167068	40 %	20 %	40 %	0 %	88658354
123	NC_007799	TCTTT	2	10	168075	168084	0 %	80 %	0 %	20 %	88658243
124	NC_007799	TGATT	2	10	168520	168529	20 %	60 %	20 %	0 %	88658243
125	NC_007799	TAATG	2	10	168943	168952	40 %	40 %	20 %	0 %	88658243
126	NC_007799	GATCT	2	10	168999	169008	20 %	40 %	20 %	20 %	88658243
127	NC_007799	GATTG	2	10	169645	169654	20 %	40 %	40 %	0 %	88658243
128	NC_007799	TGGCA	2	10	169753	169762	20 %	20 %	40 %	20 %	88658243
129	NC_007799	GTTTT	2	10	170053	170062	0 %	80 %	20 %	0 %	88657681
130	NC_007799	CTTGT	2	10	171481	171490	0 %	60 %	20 %	20 %	88658471
131	NC_007799	TCTTG	2	10	174367	174376	0 %	60 %	20 %	20 %	88658535
132	NC_007799	TCAAA	2	10	176438	176447	60 %	20 %	0 %	20 %	88657742
133	NC_007799	AAAGA	2	10	176964	176973	80 %	0 %	20 %	0 %	88657742
134	NC_007799	TTGTA	2	10	177388	177397	20 %	60 %	20 %	0 %	88657742
135	NC_007799	TATAG	2	10	179051	179060	40 %	40 %	20 %	0 %	88658025
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137	NC_007799	GTGAT	2	10	179895	179904	20 %	40 %	40 %	0 %	88658025
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