MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas

Total Repeats: 15780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007799	AAC	3	9	62	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657847
2	NC_007799	TTA	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657847
3	NC_007799	ATA	2	6	194	199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
4	NC_007799	AAT	2	6	205	210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
5	NC_007799	ATA	2	6	245	250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
6	NC_007799	AGA	2	6	260	265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657847
7	NC_007799	TCA	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657847
8	NC_007799	TAA	2	6	570	575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657847
9	NC_007799	ACA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657847
10	NC_007799	CAT	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658505
11	NC_007799	AGA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88658505
12	NC_007799	ATA	2	6	1152	1157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
13	NC_007799	ATA	2	6	1176	1181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
14	NC_007799	ATG	3	9	1279	1287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658505
15	NC_007799	TAT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658505
16	NC_007799	GTT	2	6	1320	1325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88658505
17	NC_007799	AAT	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
18	NC_007799	ATA	3	9	1479	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658505
19	NC_007799	AAT	2	6	1581	1586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658005
20	NC_007799	CGG	2	6	1683	1688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88658005
21	NC_007799	TGG	2	6	1935	1940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88658005
22	NC_007799	TGA	2	6	2019	2024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658005
23	NC_007799	AAC	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88658630
24	NC_007799	TTG	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88658630
25	NC_007799	CAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88658630
26	NC_007799	TAG	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658630
27	NC_007799	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658630
28	NC_007799	TAT	2	6	2519	2524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658630
29	NC_007799	TGA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658230
30	NC_007799	TCA	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658230
31	NC_007799	TAA	2	6	3118	3123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658230
32	NC_007799	CTG	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88658230
33	NC_007799	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658230
34	NC_007799	GAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
35	NC_007799	CAT	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
36	NC_007799	TAT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657649
37	NC_007799	CAA	2	6	4002	4007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657649
38	NC_007799	TGA	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657649
39	NC_007799	ATA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
40	NC_007799	AGA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
41	NC_007799	TTC	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88657649
42	NC_007799	ATA	2	6	4157	4162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
43	NC_007799	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657649
44	NC_007799	AAT	2	6	4310	4315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
45	NC_007799	GAA	3	9	4355	4363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
46	NC_007799	AAT	2	6	4379	4384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
47	NC_007799	GTT	2	6	4435	4440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88657649
48	NC_007799	TAT	2	6	4504	4509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657649
49	NC_007799	AGA	2	6	4645	4650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
50	NC_007799	GAT	2	6	4823	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657649
51	NC_007799	AGC	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88657649
52	NC_007799	CTA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
53	NC_007799	CAT	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
54	NC_007799	CAT	2	6	5261	5266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
55	NC_007799	GAA	2	6	5366	5371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
56	NC_007799	ATA	2	6	5373	5378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657649
57	NC_007799	TAC	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657649
58	NC_007799	TAG	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657649
59	NC_007799	GAA	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657649
60	NC_007799	AGC	2	6	5523	5528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88657649
61	NC_007799	ATT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657649
62	NC_007799	TAA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658160
63	NC_007799	TTG	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88658160
64	NC_007799	GAA	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88658160
65	NC_007799	ATG	2	6	5772	5777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658160
66	NC_007799	AAG	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88658160
67	NC_007799	CAT	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658160
68	NC_007799	TAA	2	6	6042	6047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658160
69	NC_007799	ATC	3	9	6456	6464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658287
70	NC_007799	TAA	2	6	6467	6472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658287
71	NC_007799	TAA	2	6	6549	6554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658287
72	NC_007799	CAT	2	6	6581	6586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658287
73	NC_007799	TTA	2	6	6667	6672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88658287
74	NC_007799	TAA	2	6	6686	6691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658287
75	NC_007799	AGT	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658287
76	NC_007799	AGT	2	6	6967	6972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657820
77	NC_007799	AGA	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657820
78	NC_007799	CAT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657820
79	NC_007799	CAT	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657820
80	NC_007799	ACC	2	6	7082	7087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88657820
81	NC_007799	CAA	2	6	7089	7094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657820
82	NC_007799	ATC	2	6	7346	7351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657820
83	NC_007799	TAT	2	6	7443	7448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657820
84	NC_007799	CAG	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88657820
85	NC_007799	GAA	2	6	7472	7477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657820
86	NC_007799	CTA	2	6	7491	7496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657820
87	NC_007799	CAA	2	6	7705	7710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657571
88	NC_007799	TGT	3	9	7792	7800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88657571
89	NC_007799	CAC	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88657571
90	NC_007799	TTA	2	6	8050	8055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657571
91	NC_007799	ATA	2	6	8218	8223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657571
92	NC_007799	GTA	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657571
93	NC_007799	TAG	2	6	8294	8299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657571
94	NC_007799	TCA	2	6	8311	8316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657571
95	NC_007799	AAT	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657571
96	NC_007799	TCT	2	6	8655	8660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88657571
97	NC_007799	CAA	2	6	8693	8698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657571
98	NC_007799	TAA	2	6	8924	8929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
99	NC_007799	ATT	2	6	8949	8954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657991
100	NC_007799	AGA	2	6	9069	9074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657991
101	NC_007799	AAT	2	6	9084	9089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
102	NC_007799	TAA	2	6	9189	9194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
103	NC_007799	AAC	2	6	9209	9214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657991
104	NC_007799	CAA	2	6	9272	9277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657991
105	NC_007799	AAT	2	6	9292	9297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
106	NC_007799	CAA	2	6	9344	9349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657991
107	NC_007799	AAT	2	6	9397	9402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
108	NC_007799	AAG	2	6	9471	9476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88657991
109	NC_007799	CTA	2	6	9506	9511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657991
110	NC_007799	CAA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88657991
111	NC_007799	TAA	2	6	9539	9544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
112	NC_007799	ACT	2	6	9640	9645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88657991
113	NC_007799	ATA	2	6	9664	9669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
114	NC_007799	TTC	2	6	9675	9680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88657991
115	NC_007799	TAA	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
116	NC_007799	TAG	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657991
117	NC_007799	TGA	2	6	9768	9773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88657991
118	NC_007799	AAT	3	9	9787	9795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88657991
119	NC_007799	AGC	2	6	9807	9812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88657991
120	NC_007799	TAT	2	6	9866	9871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657991
121	NC_007799	GAT	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658510
122	NC_007799	CAT	2	6	10277	10282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658510
123	NC_007799	TAG	2	6	10298	10303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658510
124	NC_007799	CTC	2	6	10319	10324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88658510
125	NC_007799	TCT	2	6	10351	10356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88658510
126	NC_007799	TAA	2	6	10389	10394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88658510
127	NC_007799	ACT	3	9	10399	10407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658510
128	NC_007799	GTA	2	6	10481	10486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88658510
129	NC_007799	TCA	2	6	10507	10512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88658510
130	NC_007799	CCA	2	6	10546	10551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88658510
131	NC_007799	CTT	2	6	10665	10670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88658510
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133	NC_007799	TAT	2	6	10989	10994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88657880
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