MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

Total Repeats: 1496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007779	ATTGAA	2	12	2431	2442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	388476125
2	NC_007779	TCCGGC	2	12	3578	3589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476126
3	NC_007779	AAATCG	2	12	6152	6163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476129
4	NC_007779	TGCCGC	2	12	7108	7119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476130
5	NC_007779	GTCATG	2	12	14766	14777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476137
6	NC_007779	GTTCAG	2	12	14903	14914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476137
7	NC_007779	GCGCAA	2	12	21535	21546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	388476147
8	NC_007779	GGTGAT	2	12	21553	21564	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	388476147
9	NC_007779	TCTGGC	2	12	21937	21948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	388476147
10	NC_007779	GCGGAA	2	12	22976	22987	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	388476148
11	NC_007779	CGGTGA	2	12	25177	25188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	388476148
12	NC_007779	CTGAAA	2	12	32869	32880	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476155
13	NC_007779	AGTGTC	2	12	35156	35167	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476157
14	NC_007779	GAAACC	2	12	42898	42909	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	388476163
15	NC_007779	CTGGGG	2	12	45676	45687	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	388476166
16	NC_007779	CGCTGG	2	12	46765	46776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476167
17	NC_007779	GCTGGT	2	12	48341	48352	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476169
18	NC_007779	CGATGG	2	12	48487	48498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	388476169
19	NC_007779	GCCCGC	2	12	49251	49262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	388476169
20	NC_007779	GCCATT	2	12	51436	51447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	388476172
21	NC_007779	CGGCGT	2	12	52636	52647	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476174
22	NC_007779	CGTGGC	2	12	57390	57401	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476177
23	NC_007779	GCTCGC	2	12	60073	60084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476180
24	NC_007779	GGTGAT	2	12	60979	60990	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	388476181
25	NC_007779	TCGCTG	2	12	62084	62095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	388476181
26	NC_007779	CCAGCA	2	12	64526	64537	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	388476182
27	NC_007779	GGTTCA	2	12	67965	67976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476184
28	NC_007779	TGCGCC	2	12	69197	69208	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476185
29	NC_007779	CGCTGG	2	12	71433	71444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476187
30	NC_007779	TCGCTG	2	12	72517	72528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	388476188
31	NC_007779	GTGACC	2	12	74900	74911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388476190
32	NC_007779	CTTCCG	2	12	79697	79708	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	388476194
33	NC_007779	CGAAAG	2	12	95245	95256	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	388476207
34	NC_007779	AAGCAC	2	12	97391	97402	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	388476209
35	NC_007779	GCTGGC	2	12	97914	97925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476209
36	NC_007779	TGCGGT	2	12	101661	101672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476212
37	NC_007779	CAGGCA	2	12	103962	103973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	388476214
38	NC_007779	TTGCAG	2	12	104918	104929	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476215
39	NC_007779	TCGGCG	2	12	105351	105362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476216
40	NC_007779	GGCGCT	2	12	105509	105520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476216
41	NC_007779	CTGGAA	2	12	123242	123253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	388476233
42	NC_007779	TGGGTC	2	12	123600	123611	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476233
43	NC_007779	CGGTGA	2	12	123703	123714	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	388476233
44	NC_007779	GCTTAC	2	12	125000	125011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	388476233
45	NC_007779	CCGGCA	2	12	126583	126594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	388476234
46	NC_007779	CAAAGT	2	12	128235	128246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476235
47	NC_007779	GAAAGC	2	12	132016	132027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	388476237
48	NC_007779	CAGTTT	2	12	135565	135576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	388476239
49	NC_007779	AATGCC	2	12	136636	136647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	388476241
50	NC_007779	TAAAGG	2	12	140031	140042	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	388476243
51	NC_007779	TTTATG	2	12	141566	141577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	388476244
52	NC_007779	ACGTGG	2	12	144448	144459	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	388476247
53	NC_007779	TTTGGC	2	12	145282	145293	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	388476249
54	NC_007779	GCCAAT	2	12	148993	149004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	388476253
55	NC_007779	CCAGCA	2	12	149061	149072	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	388476253
56	NC_007779	ACAGAA	2	12	151551	151562	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	388476255
57	NC_007779	TACTGT	2	12	153776	153787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	388476258
58	NC_007779	TTTAGC	2	12	156650	156661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	388476260
59	NC_007779	GCAACT	2	12	157992	158003	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	388476262
60	NC_007779	TTGGCG	2	12	162504	162515	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476267
61	NC_007779	GCAAAG	2	12	164884	164895	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	388476268
62	NC_007779	CAACAG	2	12	165870	165881	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	388476268
63	NC_007779	TATGCG	2	12	168722	168733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476269
64	NC_007779	GCAACC	2	12	169704	169715	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	388476269
65	NC_007779	TGGCGG	2	12	172672	172683	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	388476272
66	NC_007779	TTCTGG	2	12	176335	176346	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	388476274
67	NC_007779	TGCGGT	2	12	176925	176936	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476275
68	NC_007779	ATCGGT	2	12	181667	181678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476280
69	NC_007779	TGGCGC	2	12	187179	187190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476285
70	NC_007779	ACAGCT	2	12	192198	192209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	388476289
71	NC_007779	ACGCCG	2	12	193010	193021	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	388476290
72	NC_007779	CGCCAG	2	12	194240	194251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	388476291
73	NC_007779	CAGAAA	2	12	198570	198581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	388476295
74	NC_007779	CGATAC	2	12	199121	199132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	388476295
75	NC_007779	AACTGA	2	12	209399	209410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476303
76	NC_007779	CTGCGC	2	12	212898	212909	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476306
77	NC_007779	TGGCGC	2	12	213175	213186	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476306
78	NC_007779	CTGGCA	2	12	219143	219154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388476314
79	NC_007779	CCAGTG	2	12	220868	220879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388476316
80	NC_007779	TTTGAA	2	12	220911	220922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	388476316
81	NC_007779	TCCAGC	2	12	222317	222328	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	388476318
82	NC_007779	TTTCTG	2	12	233707	233718	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	388476324
83	NC_007779	CCCATT	2	12	235642	235653	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	388476327
84	NC_007779	AACAAA	2	12	237701	237712	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	388476329
85	NC_007779	TTATAT	2	12	247978	247989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	388476341
86	NC_007779	CTATTG	2	12	250980	250991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	388476342
87	NC_007779	AGCAAC	2	12	254084	254095	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	388476347
88	NC_007779	CAGATG	2	12	259270	259281	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	388476352
89	NC_007779	TTTTCA	2	12	259318	259329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	388476352
90	NC_007779	CGATAA	2	12	260052	260063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476353
91	NC_007779	CGCTTG	2	12	264711	264722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	388476360
92	NC_007779	TTCTGC	2	12	267664	267675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	388476364
93	NC_007779	ATGCAG	2	12	282704	282715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	388476381
94	NC_007779	TGACCG	2	12	283572	283583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388476381
95	NC_007779	CCGGCA	2	12	283938	283949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	388476381
96	NC_007779	CCGCAC	2	12	284822	284833	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	388476382
97	NC_007779	TCCTGT	2	12	285592	285603	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	388476382
98	NC_007779	GAATAA	2	12	293435	293446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	388476391
99	NC_007779	TGTAAA	2	12	293498	293509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	388476391
100	NC_007779	TCGGGG	2	12	294463	294474	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	388476392
101	NC_007779	TTCTGC	2	12	295943	295954	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	388476393
102	NC_007779	AGCGGC	2	12	297702	297713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	388476395
103	NC_007779	GCCCAT	2	12	298254	298265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	388476396
104	NC_007779	GGAGGT	2	12	298608	298619	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	388476396
105	NC_007779	TCTGGT	2	12	302735	302746	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	388476399
106	NC_007779	ACAAAC	2	12	305920	305931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	388476402
107	NC_007779	GGTTCG	2	12	306229	306240	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476403
108	NC_007779	ATTTCC	2	12	310106	310117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	388476406
109	NC_007779	AGCTAA	2	12	313883	313894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476408
110	NC_007779	TTGGTG	2	12	314170	314181	0 %	50 %	50 %	0 %	388476408
111	NC_007779	TGCACT	2	12	318522	318533	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	388476414
112	NC_007779	CGAGAT	2	12	327150	327161	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	388476421
113	NC_007779	CGCTGG	2	12	329483	329494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476423
114	NC_007779	GTTGCG	2	12	330369	330380	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476423
115	NC_007779	TGCGGA	2	12	335163	335174	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	388476428
116	NC_007779	TGGCGA	2	12	336108	336119	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	388476429
117	NC_007779	CCGGCA	2	12	336594	336605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	388476429
118	NC_007779	CGCCTG	2	12	336774	336785	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476429
119	NC_007779	AAGCGA	2	12	337356	337367	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	388476429
120	NC_007779	AGGCGG	2	12	339465	339476	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	388476432
121	NC_007779	AAATCG	2	12	342199	342210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476434
122	NC_007779	GCGTTA	2	12	345738	345749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476438
123	NC_007779	CGCTGC	2	12	348141	348152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476440
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128	NC_007779	CGCTGG	2	12	354732	354743	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476444
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132	NC_007779	GGCAGG	2	12	368742	368753	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	388476455
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140	NC_007779	TACGGT	2	12	392425	392436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476481
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143	NC_007779	ACAGGC	2	12	401717	401728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	388476490
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146	NC_007779	TATCGA	2	12	403664	403675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	388476492
147	NC_007779	CTGGTA	2	12	405072	405083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476494
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151	NC_007779	TGCCGC	2	12	424674	424685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476511
152	NC_007779	ATTAAT	2	12	426484	426495	50 %	50 %	0 %	0 %	388476512
153	NC_007779	TTTGAT	2	12	426576	426587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	388476513
154	NC_007779	GTTGCC	2	12	430410	430421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	388476517
155	NC_007779	ATCTGG	2	12	433511	433522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476520
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199	NC_007779	ATCCTG	2	12	544658	544669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	388476621
200	NC_007779	GATGGT	2	12	554607	554618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	388476629
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209	NC_007779	CAGCAA	2	12	591259	591270	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	388476670
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213	NC_007779	GCGGAA	2	12	598609	598620	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	388476676
214	NC_007779	GGCGAA	2	12	598774	598785	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	388476676
215	NC_007779	ATACTG	2	12	603081	603092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	388476678
216	NC_007779	GCCAGC	2	12	605319	605330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	388476681
217	NC_007779	TTTACG	2	12	609162	609173	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	388476685
218	NC_007779	CAGCGT	2	12	610557	610568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388476686
219	NC_007779	TTCCAG	2	12	610902	610913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	388476686
220	NC_007779	CTGGTA	2	12	613766	613777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476689
221	NC_007779	CTGGAT	2	12	617750	617761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476690
222	NC_007779	GAAAAA	2	12	618128	618139	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	388476690
223	NC_007779	CCGATA	2	12	619954	619965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	388476692
224	NC_007779	CGGTGC	2	12	621638	621649	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476694
225	NC_007779	GCCACC	2	12	622119	622130	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	388476694
226	NC_007779	TGCTGG	2	12	622706	622717	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476694
227	NC_007779	CATGAA	2	12	624825	624836	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	388476696
228	NC_007779	TGCCGA	2	12	626393	626404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388476697
229	NC_007779	CACCGA	2	12	628301	628312	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	388476699
230	NC_007779	TGGCGA	2	12	635255	635266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	388476706
231	NC_007779	CAGGCT	2	12	640947	640958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388476711
232	NC_007779	TCCTAT	2	12	658208	658219	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	388476727
233	NC_007779	GCTGGC	2	12	658913	658924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	388476729
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330	NC_007779	TGGCCC	2	12	895885	895896	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476940
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332	NC_007779	ATGCTG	2	12	897584	897595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	388476942
333	NC_007779	GCTGGT	2	12	899845	899856	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388476944
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340	NC_007779	GGCTGG	2	12	921160	921171	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	388476964
341	NC_007779	CCTGCG	2	12	921833	921844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476964
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343	NC_007779	TTCCAG	2	12	931693	931704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	388476972
344	NC_007779	CGTGAA	2	12	935158	935169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	388476974
345	NC_007779	AGAACC	2	12	935211	935222	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	388476974
346	NC_007779	GCCGCT	2	12	935275	935286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	388476974
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443	NC_007779	TTGCGC	2	12	1268038	1268049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	388477291
444	NC_007779	CTGTTA	2	12	1268651	1268662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	388477292
445	NC_007779	ATCCGG	2	12	1270463	1270474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388477294
446	NC_007779	ATAAAG	2	12	1273802	1273813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	388477299
447	NC_007779	CTTGAT	2	12	1274501	1274512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	388477300
448	NC_007779	CCAGCG	2	12	1278070	1278081	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	388477304
449	NC_007779	GCGTCA	2	12	1280063	1280074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	388477305
450	NC_007779	CGAGAA	2	12	1286038	1286049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	388477307
451	NC_007779	ATCCTG	2	12	1287804	1287815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	388477309
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453	NC_007779	ATGAAT	2	12	1293455	1293466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	388477316
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455	NC_007779	GTGCTG	2	12	1305680	1305691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	388477325
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