MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	ATAGAT	2	12	5614	5625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75994459
2	NC_007414	GCAGAA	2	12	11005	11016	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75994465
3	NC_007414	AAAGCA	2	12	13399	13410	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	75994466
4	NC_007414	AAGGAC	2	12	14824	14835	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75994466
5	NC_007414	CAAAGA	2	12	23966	23977	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	75994477
6	NC_007414	AAATAA	2	12	26607	26618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	75994478
7	NC_007414	GCGAAG	2	12	27503	27514	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	75994479
8	NC_007414	TTTTCC	2	12	28690	28701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994480
9	NC_007414	ATGGAC	2	12	29860	29871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75994480
10	NC_007414	AGGGGG	2	12	29999	30010	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	75994480
11	NC_007414	ATAAGG	2	12	31506	31517	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75994482
12	NC_007414	TAGAGG	2	12	32674	32685	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75994484
13	NC_007414	ATTTTA	2	12	39789	39800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994493
14	NC_007414	TTTATG	2	12	42313	42324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75994494
15	NC_007414	TTCTGT	2	12	46227	46238	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75994496
16	NC_007414	TATCCA	2	12	49294	49305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161367664
17	NC_007414	GTGTCA	2	12	49492	49503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161367664
18	NC_007414	GCAGCG	2	12	50905	50916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	75994506
19	NC_007414	GACAGC	2	12	51919	51930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994508
20	NC_007414	ACCGGA	2	12	63562	63573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994522
21	NC_007414	TCCTCT	2	12	65804	65815	0 %	50 %	0 %	50 %	75994525
22	NC_007414	TCAGCA	2	12	67733	67744	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75994527
23	NC_007414	GCAGAA	2	12	68139	68150	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75994527
24	NC_007414	TACCGC	2	12	68163	68174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75994527
25	NC_007414	TGCTAC	7	42	69043	69084	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75994529
26	NC_007414	TCAGCC	2	12	70094	70105	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75994530
27	NC_007414	GGCGCT	2	12	71106	71117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	161367665
28	NC_007414	CAGGTG	2	12	71137	71148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161367665
29	NC_007414	GCCGGA	2	12	71478	71489	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161367665
30	NC_007414	CACTGG	2	12	72872	72883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75994533
31	NC_007414	TGGCAG	2	12	73548	73559	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75994534
32	NC_007414	GGAAAA	2	12	76569	76580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994538
33	NC_007414	TGGATT	2	12	85314	85325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75994541
34	NC_007414	ATAAAA	2	12	85845	85856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	75994541
35	NC_007414	CGTATT	2	12	87630	87641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75994541
36	NC_007414	CGGGAG	2	12	90171	90182	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	75994544
37	NC_007414	AACACG	2	12	90322	90333	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75994545
38	NC_007414	TGGGGA	2	12	90589	90600	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	75994545

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.