MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 25683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	AATG	2	8	59	66	50 %	25 %	25 %	0 %	58578665
2	NC_006832	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
3	NC_006832	GATT	2	8	154	161	25 %	50 %	25 %	0 %	58578665
4	NC_006832	TAG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
5	NC_006832	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
6	NC_006832	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578665
7	NC_006832	CAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
8	NC_006832	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578665
9	NC_006832	TAC	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578665
10	NC_006832	ACTA	2	8	601	608	50 %	25 %	0 %	25 %	58578665
11	NC_006832	CA	3	6	708	713	50 %	0 %	0 %	50 %	58578665
12	NC_006832	TCT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
13	NC_006832	TTAG	2	8	758	765	25 %	50 %	25 %	0 %	58578665
14	NC_006832	TAT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578665
15	NC_006832	GTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578665
16	NC_006832	TCT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578665
17	NC_006832	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
18	NC_006832	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578666
19	NC_006832	TAT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
20	NC_006832	CAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578666
21	NC_006832	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	58578666
22	NC_006832	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
23	NC_006832	TTG	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578666
24	NC_006832	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
25	NC_006832	TCT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578666
26	NC_006832	GCT	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578666
27	NC_006832	T	6	6	1251	1256	0 %	100 %	0 %	0 %	58578666
28	NC_006832	AGG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578666
29	NC_006832	TATT	2	8	1297	1304	25 %	75 %	0 %	0 %	58578666
30	NC_006832	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
31	NC_006832	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	58578666
32	NC_006832	ATC	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578666
33	NC_006832	ATT	3	9	1403	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578666
34	NC_006832	TAA	3	9	1468	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578666
35	NC_006832	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58578666
36	NC_006832	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	58578667
37	NC_006832	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	58578667
38	NC_006832	AT	3	6	1638	1643	50 %	50 %	0 %	0 %	58578667
39	NC_006832	AAT	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
40	NC_006832	TAG	3	9	1756	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578667
41	NC_006832	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58578667
42	NC_006832	TTTA	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	58578667
43	NC_006832	TTC	2	6	1822	1827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578667
44	NC_006832	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578667
45	NC_006832	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
46	NC_006832	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578667
47	NC_006832	ACAG	2	8	1976	1983	50 %	0 %	25 %	25 %	58578667
48	NC_006832	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578667
49	NC_006832	CAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578668
50	NC_006832	TCT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578668
51	NC_006832	AT	3	6	2430	2435	50 %	50 %	0 %	0 %	58578668
52	NC_006832	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
53	NC_006832	ATA	2	6	2603	2608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578668
54	NC_006832	GTA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
55	NC_006832	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	58578668
56	NC_006832	TA	3	6	2711	2716	50 %	50 %	0 %	0 %	58578668
57	NC_006832	T	7	7	2811	2817	0 %	100 %	0 %	0 %	58578668
58	NC_006832	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578668
59	NC_006832	CCA	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58578668
60	NC_006832	AGT	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578668
61	NC_006832	CTA	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578669
62	NC_006832	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
63	NC_006832	ATT	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
64	NC_006832	T	8	8	3258	3265	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
65	NC_006832	CTT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
66	NC_006832	AGTA	2	8	3299	3306	50 %	25 %	25 %	0 %	58578669
67	NC_006832	TAT	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
68	NC_006832	TA	3	6	3417	3422	50 %	50 %	0 %	0 %	58578669
69	NC_006832	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
70	NC_006832	TAT	2	6	3508	3513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
71	NC_006832	TTA	2	6	3597	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
72	NC_006832	T	6	6	3639	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
73	NC_006832	TCC	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578669
74	NC_006832	CTTTAT	2	12	3756	3767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58578669
75	NC_006832	CTT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578669
76	NC_006832	TGT	2	6	3840	3845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578669
77	NC_006832	ATT	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578669
78	NC_006832	GCA	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58578669
79	NC_006832	T	6	6	4046	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
80	NC_006832	T	6	6	4056	4061	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
81	NC_006832	GGTA	2	8	4070	4077	25 %	25 %	50 %	0 %	58578669
82	NC_006832	T	7	7	4112	4118	0 %	100 %	0 %	0 %	58578669
83	NC_006832	ATA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
84	NC_006832	T	7	7	4613	4619	0 %	100 %	0 %	0 %	58578670
85	NC_006832	A	8	8	4655	4662	100 %	0 %	0 %	0 %	58578670
86	NC_006832	A	7	7	4673	4679	100 %	0 %	0 %	0 %	58578670
87	NC_006832	ATTA	2	8	4850	4857	50 %	50 %	0 %	0 %	58578670
88	NC_006832	AAT	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
89	NC_006832	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
90	NC_006832	AAT	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
91	NC_006832	TCC	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578670
92	NC_006832	ATTT	2	8	5017	5024	25 %	75 %	0 %	0 %	58578670
93	NC_006832	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
94	NC_006832	TGG	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
95	NC_006832	TAG	2	6	5122	5127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
96	NC_006832	GAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
97	NC_006832	ATA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578670
98	NC_006832	AGA	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578670
99	NC_006832	GGT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
100	NC_006832	GTG	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578670
101	NC_006832	GAT	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578670
102	NC_006832	TA	4	8	5390	5397	50 %	50 %	0 %	0 %	58578670
103	NC_006832	GATT	2	8	5429	5436	25 %	50 %	25 %	0 %	58578670
104	NC_006832	ATG	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
105	NC_006832	TTC	2	6	5505	5510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
106	NC_006832	ACTAA	2	10	5562	5571	60 %	20 %	0 %	20 %	58578671
107	NC_006832	T	8	8	5587	5594	0 %	100 %	0 %	0 %	58578671
108	NC_006832	CTT	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578671
109	NC_006832	TAG	2	6	5714	5719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
110	NC_006832	CTCA	2	8	5753	5760	25 %	25 %	0 %	50 %	58578671
111	NC_006832	TAG	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578671
112	NC_006832	TAT	3	9	5855	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
113	NC_006832	ACA	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578671
114	NC_006832	A	6	6	5908	5913	100 %	0 %	0 %	0 %	58578671
115	NC_006832	T	6	6	5922	5927	0 %	100 %	0 %	0 %	58578671
116	NC_006832	TTA	2	6	5934	5939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578671
117	NC_006832	T	6	6	5959	5964	0 %	100 %	0 %	0 %	58578671
118	NC_006832	GTG	2	6	6386	6391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161598458
119	NC_006832	AGC	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598458
120	NC_006832	T	6	6	6410	6415	0 %	100 %	0 %	0 %	161598458
121	NC_006832	T	6	6	6467	6472	0 %	100 %	0 %	0 %	161598458
122	NC_006832	ATT	2	6	6543	6548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
123	NC_006832	AAT	2	6	6558	6563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
124	NC_006832	GTA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161598458
125	NC_006832	TGTT	2	8	6585	6592	0 %	75 %	25 %	0 %	161598458
126	NC_006832	TAT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
127	NC_006832	TGG	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161598458
128	NC_006832	TCC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161598458
129	NC_006832	TAA	2	6	6771	6776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
130	NC_006832	GTC	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
131	NC_006832	ATT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
132	NC_006832	T	6	6	6874	6879	0 %	100 %	0 %	0 %	161598458
133	NC_006832	CTATA	2	10	6962	6971	40 %	40 %	0 %	20 %	161598458
134	NC_006832	GCT	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598458
135	NC_006832	ATGG	2	8	7013	7020	25 %	25 %	50 %	0 %	161598458
136	NC_006832	T	6	6	7024	7029	0 %	100 %	0 %	0 %	161598458
137	NC_006832	TTA	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
138	NC_006832	TAT	2	6	7118	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
139	NC_006832	AAT	2	6	7134	7139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
140	NC_006832	TAA	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161598458
141	NC_006832	TTA	2	6	7186	7191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
142	NC_006832	ATC	2	6	7198	7203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161598458
143	NC_006832	TAT	2	6	7274	7279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161598458
144	NC_006832	GAT	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161598458
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146	NC_006832	T	6	6	7333	7338	0 %	100 %	0 %	0 %	161598458
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156	NC_006832	ATA	2	6	8078	8083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578673
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160	NC_006832	TGG	2	6	8261	8266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578673
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162	NC_006832	GGA	2	6	8293	8298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578673
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167	NC_006832	ATATA	2	10	8475	8484	60 %	40 %	0 %	0 %	58578673
168	NC_006832	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578673
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173	NC_006832	ATT	2	6	8811	8816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578674
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175	NC_006832	A	6	6	8895	8900	100 %	0 %	0 %	0 %	58578674
176	NC_006832	AT	3	6	8936	8941	50 %	50 %	0 %	0 %	58578674
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179	NC_006832	A	7	7	9030	9036	100 %	0 %	0 %	0 %	58578674
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192	NC_006832	ATTT	2	8	9819	9826	25 %	75 %	0 %	0 %	58578675
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305	NC_006832	TAC	3	9	13953	13961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578677
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399	NC_006832	ATT	2	6	17387	17392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578680
400	NC_006832	CTT	2	6	17424	17429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578680
401	NC_006832	TGTT	2	8	17452	17459	0 %	75 %	25 %	0 %	58578680
402	NC_006832	T	7	7	17466	17472	0 %	100 %	0 %	0 %	58578680
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