MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	TAACA	2	10	907	916	60 %	20 %	0 %	20 %	57238732
2	NC_005295	TTTCT	2	10	4024	4033	0 %	80 %	0 %	20 %	57238734
3	NC_005295	CATTT	2	10	5225	5234	20 %	60 %	0 %	20 %	57238735
4	NC_005295	GATTT	2	10	5648	5657	20 %	60 %	20 %	0 %	57238735
5	NC_005295	GTTAT	2	10	6192	6201	20 %	60 %	20 %	0 %	57238735
6	NC_005295	ACATA	2	10	7357	7366	60 %	20 %	0 %	20 %	57238737
7	NC_005295	ACTAA	2	10	12824	12833	60 %	20 %	0 %	20 %	57238739
8	NC_005295	AATGG	2	10	15053	15062	40 %	20 %	40 %	0 %	57238741
9	NC_005295	TTCAG	2	10	15637	15646	20 %	40 %	20 %	20 %	57238742
10	NC_005295	GTAAT	2	10	16130	16139	40 %	40 %	20 %	0 %	57238742
11	NC_005295	AACAA	2	10	18712	18721	80 %	0 %	0 %	20 %	57238743
12	NC_005295	AAAAT	2	10	20372	20381	80 %	20 %	0 %	0 %	57238745
13	NC_005295	GCATA	2	10	20628	20637	40 %	20 %	20 %	20 %	57238746
14	NC_005295	ACTAA	2	10	24415	24424	60 %	20 %	0 %	20 %	57238750
15	NC_005295	CTATA	2	10	25815	25824	40 %	40 %	0 %	20 %	57238751
16	NC_005295	TTTGT	2	10	27223	27232	0 %	80 %	20 %	0 %	57238752
17	NC_005295	ATATA	2	10	27328	27337	60 %	40 %	0 %	0 %	57238752
18	NC_005295	ATGTA	2	10	30309	30318	40 %	40 %	20 %	0 %	57238755
19	NC_005295	GTAGA	2	10	33808	33817	40 %	20 %	40 %	0 %	57238757
20	NC_005295	TGGTA	2	10	34055	34064	20 %	40 %	40 %	0 %	57238757
21	NC_005295	TTTAT	2	10	36322	36331	20 %	80 %	0 %	0 %	57238759
22	NC_005295	TTGAC	2	10	36839	36848	20 %	40 %	20 %	20 %	57238760
23	NC_005295	CTATC	2	10	36897	36906	20 %	40 %	0 %	40 %	57238760
24	NC_005295	TTATT	2	10	37922	37931	20 %	80 %	0 %	0 %	57238761
25	NC_005295	ATGTA	2	10	40781	40790	40 %	40 %	20 %	0 %	57238762
26	NC_005295	GTGTT	2	10	41161	41170	0 %	60 %	40 %	0 %	57238762
27	NC_005295	TGCCT	2	10	41279	41288	0 %	40 %	20 %	40 %	57238762
28	NC_005295	ATTTT	2	10	41498	41507	20 %	80 %	0 %	0 %	57238762
29	NC_005295	ATACT	2	10	41991	42000	40 %	40 %	0 %	20 %	57238763
30	NC_005295	ATTTT	2	10	42081	42090	20 %	80 %	0 %	0 %	57238763
31	NC_005295	TTCTT	2	10	47689	47698	0 %	80 %	0 %	20 %	57238767
32	NC_005295	TATAA	2	10	47717	47726	60 %	40 %	0 %	0 %	57238767
33	NC_005295	TTTTA	2	10	47817	47826	20 %	80 %	0 %	0 %	57238767
34	NC_005295	TTTTA	2	10	47904	47913	20 %	80 %	0 %	0 %	57238767
35	NC_005295	TCTAT	2	10	49753	49762	20 %	60 %	0 %	20 %	57238768
36	NC_005295	ATTCT	2	10	49784	49793	20 %	60 %	0 %	20 %	57238768
37	NC_005295	CAAGC	2	10	51796	51805	40 %	0 %	20 %	40 %	57238770
38	NC_005295	TTGAT	2	10	55010	55019	20 %	60 %	20 %	0 %	57238771
39	NC_005295	TTAAT	2	10	56633	56642	40 %	60 %	0 %	0 %	57238772
40	NC_005295	ATTTC	2	10	63217	63226	20 %	60 %	0 %	20 %	57238774
41	NC_005295	ATAGT	2	10	63436	63445	40 %	40 %	20 %	0 %	57238774
42	NC_005295	TTTTA	2	10	63651	63660	20 %	80 %	0 %	0 %	57238775
43	NC_005295	AGTTT	2	10	64183	64192	20 %	60 %	20 %	0 %	57238775
44	NC_005295	TTATA	2	10	64193	64202	40 %	60 %	0 %	0 %	57238775
45	NC_005295	TTTTG	2	10	65774	65783	0 %	80 %	20 %	0 %	57238777
46	NC_005295	TATGA	2	10	66120	66129	40 %	40 %	20 %	0 %	57238777
47	NC_005295	TGGAG	2	10	69301	69310	20 %	20 %	60 %	0 %	57238779
48	NC_005295	AAACA	2	10	73110	73119	80 %	0 %	0 %	20 %	57238780
49	NC_005295	ATGCT	2	10	77130	77139	20 %	40 %	20 %	20 %	57238783
50	NC_005295	TTGAT	2	10	77714	77723	20 %	60 %	20 %	0 %	57238783
51	NC_005295	TGTAT	2	10	83015	83024	20 %	60 %	20 %	0 %	57238788
52	NC_005295	ACGAT	2	10	84348	84357	40 %	20 %	20 %	20 %	57238789
53	NC_005295	ACCAA	2	10	85013	85022	60 %	0 %	0 %	40 %	57238789
54	NC_005295	TCTGA	2	10	88940	88949	20 %	40 %	20 %	20 %	57238791
55	NC_005295	ATTAC	2	10	89243	89252	40 %	40 %	0 %	20 %	57238791
56	NC_005295	AAATC	2	10	92795	92804	60 %	20 %	0 %	20 %	57238794
57	NC_005295	TTATT	2	10	98381	98390	20 %	80 %	0 %	0 %	57238797
58	NC_005295	GAAAA	2	10	98922	98931	80 %	0 %	20 %	0 %	57238797
59	NC_005295	CATTA	2	10	99685	99694	40 %	40 %	0 %	20 %	57238797
60	NC_005295	TATGA	2	10	101017	101026	40 %	40 %	20 %	0 %	57238797
61	NC_005295	TCATA	2	10	101493	101502	40 %	40 %	0 %	20 %	57238797
62	NC_005295	AAAAT	2	10	101891	101900	80 %	20 %	0 %	0 %	57238797
63	NC_005295	AGTTT	2	10	102436	102445	20 %	60 %	20 %	0 %	57238797
64	NC_005295	ATCAC	2	10	103165	103174	40 %	20 %	0 %	40 %	57238797
65	NC_005295	AAGTA	2	10	104034	104043	60 %	20 %	20 %	0 %	57238797
66	NC_005295	TGTAT	2	10	104798	104807	20 %	60 %	20 %	0 %	57238797
67	NC_005295	ACTTT	2	10	104919	104928	20 %	60 %	0 %	20 %	57238797
68	NC_005295	GAACA	2	10	105590	105599	60 %	0 %	20 %	20 %	57238797
69	NC_005295	AAATT	2	10	113209	113218	60 %	40 %	0 %	0 %	57238799
70	NC_005295	GAGCA	2	10	113672	113681	40 %	0 %	40 %	20 %	57238799
71	NC_005295	GTATA	2	10	113915	113924	40 %	40 %	20 %	0 %	57238799
72	NC_005295	CTACC	2	10	119659	119668	20 %	20 %	0 %	60 %	57238801
73	NC_005295	TACTA	2	10	119826	119835	40 %	40 %	0 %	20 %	57238801
74	NC_005295	AGTCA	2	10	120887	120896	40 %	20 %	20 %	20 %	57238803
75	NC_005295	ATGGC	2	10	121648	121657	20 %	20 %	40 %	20 %	57238803
76	NC_005295	AGATG	2	10	121818	121827	40 %	20 %	40 %	0 %	57238803
77	NC_005295	AAACT	2	10	122315	122324	60 %	20 %	0 %	20 %	57238803
78	NC_005295	AGCTG	2	10	123876	123885	20 %	20 %	40 %	20 %	57238804
79	NC_005295	TAATC	2	10	126169	126178	40 %	40 %	0 %	20 %	57238805
80	NC_005295	GATAT	2	10	128423	128432	40 %	40 %	20 %	0 %	57238806
81	NC_005295	CTTAT	2	10	128772	128781	20 %	60 %	0 %	20 %	57238806
82	NC_005295	TAGTT	2	10	132143	132152	20 %	60 %	20 %	0 %	57238807
83	NC_005295	ATAAA	2	10	135540	135549	80 %	20 %	0 %	0 %	57238808
84	NC_005295	AACAT	2	10	136377	136386	60 %	20 %	0 %	20 %	57238808
85	NC_005295	GGTAT	2	10	136726	136735	20 %	40 %	40 %	0 %	57238808
86	NC_005295	TAGTA	2	10	141162	141171	40 %	40 %	20 %	0 %	57238810
87	NC_005295	CTAAT	2	10	146408	146417	40 %	40 %	0 %	20 %	57238815
88	NC_005295	TACAA	2	10	148423	148432	60 %	20 %	0 %	20 %	57238817
89	NC_005295	CTTAT	2	10	150710	150719	20 %	60 %	0 %	20 %	57238818
90	NC_005295	TGGAA	2	10	153680	153689	40 %	20 %	40 %	0 %	57238819
91	NC_005295	TATAT	2	10	158572	158581	40 %	60 %	0 %	0 %	57238821
92	NC_005295	GTATT	2	10	163229	163238	20 %	60 %	20 %	0 %	57238824
93	NC_005295	TTTTA	2	10	169367	169376	20 %	80 %	0 %	0 %	57238828
94	NC_005295	GTTGT	2	10	175115	175124	0 %	60 %	40 %	0 %	57238830
95	NC_005295	CTTAT	2	10	182765	182774	20 %	60 %	0 %	20 %	57238835
96	NC_005295	ACAAT	2	10	182870	182879	60 %	20 %	0 %	20 %	57238835
97	NC_005295	TATGA	2	10	183438	183447	40 %	40 %	20 %	0 %	57238835
98	NC_005295	TAGAA	2	10	188176	188185	60 %	20 %	20 %	0 %	57238837
99	NC_005295	TATAT	2	10	188753	188762	40 %	60 %	0 %	0 %	57238838
100	NC_005295	ATGTT	2	10	191518	191527	20 %	60 %	20 %	0 %	57238841
101	NC_005295	ATGTT	2	10	192117	192126	20 %	60 %	20 %	0 %	57238842
102	NC_005295	GTATT	2	10	195965	195974	20 %	60 %	20 %	0 %	57238843
103	NC_005295	TTGTA	2	10	202818	202827	20 %	60 %	20 %	0 %	57238847
104	NC_005295	TAGTT	2	10	203246	203255	20 %	60 %	20 %	0 %	57238847
105	NC_005295	ACATT	2	10	208339	208348	40 %	40 %	0 %	20 %	57238850
106	NC_005295	CTTTG	2	10	210486	210495	0 %	60 %	20 %	20 %	57238851
107	NC_005295	ATTAT	2	10	210767	210776	40 %	60 %	0 %	0 %	57238851
108	NC_005295	GTTTG	2	10	211362	211371	0 %	60 %	40 %	0 %	57238851
109	NC_005295	CAGCT	2	10	211686	211695	20 %	20 %	20 %	40 %	57238851
110	NC_005295	TAGTT	2	10	212267	212276	20 %	60 %	20 %	0 %	57238852
111	NC_005295	TAAAT	2	10	214731	214740	60 %	40 %	0 %	0 %	57238852
112	NC_005295	GGTAA	2	10	216239	216248	40 %	20 %	40 %	0 %	57238853
113	NC_005295	CTTGT	2	10	217077	217086	0 %	60 %	20 %	20 %	57238853
114	NC_005295	TGAGT	2	10	219012	219021	20 %	40 %	40 %	0 %	57238854
115	NC_005295	TGAGT	2	10	219249	219258	20 %	40 %	40 %	0 %	57238854
116	NC_005295	TGGTT	2	10	221076	221085	0 %	60 %	40 %	0 %	57238855
117	NC_005295	ATAAA	2	10	223833	223842	80 %	20 %	0 %	0 %	57238859
118	NC_005295	TAATA	2	10	224011	224020	60 %	40 %	0 %	0 %	57238859
119	NC_005295	CAGTG	2	10	225932	225941	20 %	20 %	40 %	20 %	57238860
120	NC_005295	GTATG	2	10	226949	226958	20 %	40 %	40 %	0 %	57238860
121	NC_005295	ATATG	2	10	228024	228033	40 %	40 %	20 %	0 %	57238861
122	NC_005295	TTTGG	2	10	232675	232684	0 %	60 %	40 %	0 %	57238862
123	NC_005295	AAGAT	2	10	232780	232789	60 %	20 %	20 %	0 %	57238862
124	NC_005295	TGGTA	2	10	234679	234688	20 %	40 %	40 %	0 %	57238864
125	NC_005295	ATAGT	2	10	235901	235910	40 %	40 %	20 %	0 %	57238864
126	NC_005295	ATATC	2	10	238424	238433	40 %	40 %	0 %	20 %	57238866
127	NC_005295	AGTGA	2	10	238541	238550	40 %	20 %	40 %	0 %	57238867
128	NC_005295	ATATT	2	10	238608	238617	40 %	60 %	0 %	0 %	57238867
129	NC_005295	ATTTA	2	10	241964	241973	40 %	60 %	0 %	0 %	57238871
130	NC_005295	AAGAA	2	10	242804	242813	80 %	0 %	20 %	0 %	57238871
131	NC_005295	ATATC	2	10	244977	244986	40 %	40 %	0 %	20 %	57238873
132	NC_005295	ATGTG	2	10	246805	246814	20 %	40 %	40 %	0 %	57238874
133	NC_005295	TATAA	2	10	248712	248721	60 %	40 %	0 %	0 %	57238874
134	NC_005295	TTGAT	2	10	250487	250496	20 %	60 %	20 %	0 %	57238875
135	NC_005295	ATTTG	2	10	251329	251338	20 %	60 %	20 %	0 %	57238876
136	NC_005295	AATAT	2	10	253177	253186	60 %	40 %	0 %	0 %	57238878
137	NC_005295	TTTTG	2	10	255467	255476	0 %	80 %	20 %	0 %	57238879
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