MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 25191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005295	TAA	2	6	132	137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
2	NC_005295	AT	3	6	143	148	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
3	NC_005295	TA	3	6	160	165	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
4	NC_005295	ATG	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238732
5	NC_005295	ATA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
6	NC_005295	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
7	NC_005295	AAG	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
8	NC_005295	A	7	7	439	445	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
9	NC_005295	GGA	2	6	466	471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238732
10	NC_005295	CTG	2	6	537	542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238732
11	NC_005295	ACA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
12	NC_005295	ATGA	2	8	584	591	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
13	NC_005295	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
14	NC_005295	AAC	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
15	NC_005295	ACA	2	6	660	665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
16	NC_005295	AAG	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
17	NC_005295	CAA	3	9	714	722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
18	NC_005295	AAT	2	6	748	753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
19	NC_005295	ACA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238732
20	NC_005295	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
21	NC_005295	TAACA	2	10	907	916	60 %	20 %	0 %	20 %	57238732
22	NC_005295	A	6	6	920	925	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
23	NC_005295	AT	3	6	953	958	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
24	NC_005295	TAG	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238732
25	NC_005295	GAA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238732
26	NC_005295	ATA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238732
27	NC_005295	AATG	2	8	1031	1038	50 %	25 %	25 %	0 %	57238732
28	NC_005295	TTA	2	6	1073	1078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238732
29	NC_005295	ATTA	2	8	1088	1095	50 %	50 %	0 %	0 %	57238732
30	NC_005295	A	6	6	1095	1100	100 %	0 %	0 %	0 %	57238732
31	NC_005295	GAT	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238733
32	NC_005295	TTA	2	6	2820	2825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
33	NC_005295	CAAT	2	8	2856	2863	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
34	NC_005295	TCC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238733
35	NC_005295	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238733
36	NC_005295	TTA	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
37	NC_005295	A	6	6	2999	3004	100 %	0 %	0 %	0 %	57238733
38	NC_005295	TCA	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238733
39	NC_005295	AAAT	2	8	3062	3069	75 %	25 %	0 %	0 %	57238733
40	NC_005295	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	57238733
41	NC_005295	ACC	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238733
42	NC_005295	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238733
43	NC_005295	ATTT	2	8	3131	3138	25 %	75 %	0 %	0 %	57238733
44	NC_005295	AT	3	6	3149	3154	50 %	50 %	0 %	0 %	57238733
45	NC_005295	T	7	7	3211	3217	0 %	100 %	0 %	0 %	57238733
46	NC_005295	ATT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238733
47	NC_005295	TAAC	2	8	3301	3308	50 %	25 %	0 %	25 %	57238733
48	NC_005295	CCAT	2	8	3330	3337	25 %	25 %	0 %	50 %	57238733
49	NC_005295	TAG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238734
50	NC_005295	A	9	9	3610	3618	100 %	0 %	0 %	0 %	57238734
51	NC_005295	ATAA	2	8	3632	3639	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
52	NC_005295	AAAT	2	8	3666	3673	75 %	25 %	0 %	0 %	57238734
53	NC_005295	TAA	2	6	3754	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238734
54	NC_005295	A	7	7	3808	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	57238734
55	NC_005295	GAA	3	9	3896	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
56	NC_005295	TACA	2	8	3927	3934	50 %	25 %	0 %	25 %	57238734
57	NC_005295	AGA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
58	NC_005295	TTTCT	2	10	4024	4033	0 %	80 %	0 %	20 %	57238734
59	NC_005295	GAA	2	6	4040	4045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
60	NC_005295	A	6	6	4051	4056	100 %	0 %	0 %	0 %	57238734
61	NC_005295	AGA	3	9	4078	4086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238734
62	NC_005295	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238734
63	NC_005295	GTG	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238734
64	NC_005295	GCA	2	6	4202	4207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238734
65	NC_005295	GAT	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238734
66	NC_005295	AGC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238735
67	NC_005295	CATTT	2	10	5225	5234	20 %	60 %	0 %	20 %	57238735
68	NC_005295	ACT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
69	NC_005295	AAT	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
70	NC_005295	TAA	2	6	5361	5366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
71	NC_005295	A	6	6	5379	5384	100 %	0 %	0 %	0 %	57238735
72	NC_005295	ATC	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
73	NC_005295	AATAGA	2	12	5403	5414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	57238735
74	NC_005295	GCA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238735
75	NC_005295	AGA	2	6	5436	5441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
76	NC_005295	TA	4	8	5498	5505	50 %	50 %	0 %	0 %	57238735
77	NC_005295	AGA	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
78	NC_005295	A	8	8	5610	5617	100 %	0 %	0 %	0 %	57238735
79	NC_005295	GATTT	2	10	5648	5657	20 %	60 %	20 %	0 %	57238735
80	NC_005295	AAT	2	6	5697	5702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
81	NC_005295	AGA	2	6	5709	5714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
82	NC_005295	TGA	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238735
83	NC_005295	TTA	2	6	5791	5796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238735
84	NC_005295	AT	3	6	5809	5814	50 %	50 %	0 %	0 %	57238735
85	NC_005295	TAA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
86	NC_005295	AGA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
87	NC_005295	A	8	8	5844	5851	100 %	0 %	0 %	0 %	57238735
88	NC_005295	ATA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
89	NC_005295	TAAA	2	8	5927	5934	75 %	25 %	0 %	0 %	57238735
90	NC_005295	GAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
91	NC_005295	GAT	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238735
92	NC_005295	A	8	8	6025	6032	100 %	0 %	0 %	0 %	57238735
93	NC_005295	ATA	2	6	6074	6079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
94	NC_005295	TCT	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238735
95	NC_005295	AAG	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238735
96	NC_005295	ATC	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
97	NC_005295	CAAG	2	8	6162	6169	50 %	0 %	25 %	25 %	57238735
98	NC_005295	GTTAT	2	10	6192	6201	20 %	60 %	20 %	0 %	57238735
99	NC_005295	ATA	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
100	NC_005295	AAT	2	6	6247	6252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
101	NC_005295	ATT	2	6	6303	6308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238735
102	NC_005295	TAA	2	6	6315	6320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
103	NC_005295	TA	3	6	6332	6337	50 %	50 %	0 %	0 %	57238735
104	NC_005295	TACA	2	8	6366	6373	50 %	25 %	0 %	25 %	57238735
105	NC_005295	ATA	2	6	6394	6399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
106	NC_005295	TAA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238735
107	NC_005295	A	6	6	6466	6471	100 %	0 %	0 %	0 %	57238735
108	NC_005295	AT	3	6	6476	6481	50 %	50 %	0 %	0 %	57238735
109	NC_005295	A	8	8	6487	6494	100 %	0 %	0 %	0 %	57238735
110	NC_005295	CTA	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
111	NC_005295	TAC	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238735
112	NC_005295	A	7	7	6588	6594	100 %	0 %	0 %	0 %	57238735
113	NC_005295	AAC	2	6	6596	6601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238735
114	NC_005295	A	6	6	6658	6663	100 %	0 %	0 %	0 %	57238736
115	NC_005295	ATA	2	6	6687	6692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238736
116	NC_005295	TCA	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238736
117	NC_005295	TGG	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238736
118	NC_005295	CAT	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238736
119	NC_005295	AGA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238736
120	NC_005295	TAA	2	6	6834	6839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238736
121	NC_005295	AGC	2	6	6841	6846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238736
122	NC_005295	ATG	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238736
123	NC_005295	A	6	6	6862	6867	100 %	0 %	0 %	0 %	57238736
124	NC_005295	CTA	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238736
125	NC_005295	A	6	6	6921	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	57238736
126	NC_005295	AGT	2	6	6946	6951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238737
127	NC_005295	TGT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238737
128	NC_005295	A	7	7	7042	7048	100 %	0 %	0 %	0 %	57238737
129	NC_005295	GAAA	2	8	7056	7063	75 %	0 %	25 %	0 %	57238737
130	NC_005295	CAA	2	6	7163	7168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238737
131	NC_005295	ATA	2	6	7209	7214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238737
132	NC_005295	CTT	2	6	7215	7220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238737
133	NC_005295	T	7	7	7219	7225	0 %	100 %	0 %	0 %	57238737
134	NC_005295	AGA	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238737
135	NC_005295	AACA	2	8	7289	7296	75 %	0 %	0 %	25 %	57238737
136	NC_005295	CAA	2	6	7323	7328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238737
137	NC_005295	ACATA	2	10	7357	7366	60 %	20 %	0 %	20 %	57238737
138	NC_005295	AG	3	6	7377	7382	50 %	0 %	50 %	0 %	57238737
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140	NC_005295	T	7	7	7440	7446	0 %	100 %	0 %	0 %	57238737
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