MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 25191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_005295	ATT	2	6	237940	237945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238866
4003	NC_005295	ATT	2	6	237962	237967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238866
4004	NC_005295	ATA	2	6	238002	238007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238866
4005	NC_005295	GCT	2	6	238016	238021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238866
4006	NC_005295	T	7	7	238042	238048	0 %	100 %	0 %	0 %	57238866
4007	NC_005295	TCA	2	6	238094	238099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238866
4008	NC_005295	TGA	2	6	238107	238112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238866
4009	NC_005295	TAC	2	6	238125	238130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238866
4010	NC_005295	AAT	2	6	238157	238162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238866
4011	NC_005295	ATT	2	6	238246	238251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238866
4012	NC_005295	AAT	2	6	238369	238374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238866
4013	NC_005295	ATATC	2	10	238424	238433	40 %	40 %	0 %	20 %	57238866
4014	NC_005295	TTA	2	6	238505	238510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238866
4015	NC_005295	TA	3	6	238527	238532	50 %	50 %	0 %	0 %	57238867
4016	NC_005295	AGTGA	2	10	238541	238550	40 %	20 %	40 %	0 %	57238867
4017	NC_005295	ATT	2	6	238577	238582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238867
4018	NC_005295	ATATT	2	10	238608	238617	40 %	60 %	0 %	0 %	57238867
4019	NC_005295	TTCT	2	8	238630	238637	0 %	75 %	0 %	25 %	57238867
4020	NC_005295	T	6	6	238821	238826	0 %	100 %	0 %	0 %	57238867
4021	NC_005295	TAAT	2	8	238848	238855	50 %	50 %	0 %	0 %	57238867
4022	NC_005295	AT	3	6	238893	238898	50 %	50 %	0 %	0 %	57238867
4023	NC_005295	TGA	2	6	238911	238916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238867
4024	NC_005295	TG	3	6	238927	238932	0 %	50 %	50 %	0 %	57238867
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4027	NC_005295	GTA	2	6	239041	239046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238867
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4029	NC_005295	TCT	2	6	239151	239156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238867
4030	NC_005295	CAT	2	6	239167	239172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238867
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4033	NC_005295	AATT	2	8	239338	239345	50 %	50 %	0 %	0 %	57238867
4034	NC_005295	AAC	2	6	239375	239380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238867
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4039	NC_005295	CTT	2	6	239527	239532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238867
4040	NC_005295	TAT	2	6	239548	239553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238867
4041	NC_005295	TAT	2	6	239615	239620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238868
4042	NC_005295	ATAA	2	8	239679	239686	75 %	25 %	0 %	0 %	57238868
4043	NC_005295	CAG	2	6	239717	239722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238868
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4047	NC_005295	TTG	2	6	239891	239896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238868
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4051	NC_005295	T	8	8	240110	240117	0 %	100 %	0 %	0 %	57238869
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4053	NC_005295	TA	3	6	240469	240474	50 %	50 %	0 %	0 %	57238870
4054	NC_005295	GTA	2	6	240481	240486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238870
4055	NC_005295	TAA	3	9	240503	240511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238870
4056	NC_005295	TCT	2	6	240516	240521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238870
4057	NC_005295	GGA	2	6	240527	240532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238870
4058	NC_005295	TAG	2	6	240571	240576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238870
4059	NC_005295	ATA	2	6	240577	240582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238870
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4062	NC_005295	TAA	2	6	240760	240765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238870
4063	NC_005295	CGT	2	6	240822	240827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238870
4064	NC_005295	TGC	2	6	240926	240931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238870
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4083	NC_005295	GTA	2	6	241860	241865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238871
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4091	NC_005295	GAAA	2	8	242018	242025	75 %	0 %	25 %	0 %	57238871
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4095	NC_005295	TAG	2	6	242200	242205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238871
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4106	NC_005295	T	6	6	242607	242612	0 %	100 %	0 %	0 %	57238871
4107	NC_005295	TGC	2	6	242615	242620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238871
4108	NC_005295	AAT	2	6	242651	242656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238871
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4110	NC_005295	ATA	2	6	242736	242741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238871
4111	NC_005295	AG	3	6	242764	242769	50 %	0 %	50 %	0 %	57238871
4112	NC_005295	AAGAA	2	10	242804	242813	80 %	0 %	20 %	0 %	57238871
4113	NC_005295	TG	3	6	242831	242836	0 %	50 %	50 %	0 %	57238871
4114	NC_005295	AAAG	2	8	242840	242847	75 %	0 %	25 %	0 %	57238871
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4120	NC_005295	TAG	2	6	244334	244339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238872
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4124	NC_005295	ATT	2	6	244715	244720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238873
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4497	NC_005295	CTC	2	6	264105	264110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238883
4498	NC_005295	CCT	2	6	264125	264130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238883
4499	NC_005295	TTAT	2	8	264173	264180	25 %	75 %	0 %	0 %	57238883
4500	NC_005295	CAT	2	6	264183	264188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238883

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