MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 25191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005295	AAG	2	6	26390	26395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238751
502	NC_005295	TAT	2	6	26677	26682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238752
503	NC_005295	TGC	2	6	26722	26727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238752
504	NC_005295	GA	3	6	26804	26809	50 %	0 %	50 %	0 %	57238752
505	NC_005295	ATA	2	6	26931	26936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238752
506	NC_005295	ATT	2	6	26982	26987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238752
507	NC_005295	TTA	2	6	26994	26999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238752
508	NC_005295	TA	3	6	27084	27089	50 %	50 %	0 %	0 %	57238752
509	NC_005295	TGG	2	6	27114	27119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238752
510	NC_005295	AAT	2	6	27125	27130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238752
511	NC_005295	GGA	2	6	27146	27151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238752
512	NC_005295	GTT	2	6	27152	27157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238752
513	NC_005295	TTTGT	2	10	27223	27232	0 %	80 %	20 %	0 %	57238752
514	NC_005295	A	7	7	27304	27310	100 %	0 %	0 %	0 %	57238752
515	NC_005295	TAA	2	6	27316	27321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238752
516	NC_005295	ATATA	2	10	27328	27337	60 %	40 %	0 %	0 %	57238752
517	NC_005295	ATT	2	6	27416	27421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238752
518	NC_005295	TGA	2	6	27446	27451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238753
519	NC_005295	CGT	2	6	27487	27492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238753
520	NC_005295	ATT	2	6	27527	27532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238753
521	NC_005295	ACA	2	6	27607	27612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238753
522	NC_005295	ATT	2	6	27664	27669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238753
523	NC_005295	A	7	7	27678	27684	100 %	0 %	0 %	0 %	57238753
524	NC_005295	A	6	6	27748	27753	100 %	0 %	0 %	0 %	57238753
525	NC_005295	AT	3	6	27789	27794	50 %	50 %	0 %	0 %	57238753
526	NC_005295	TTC	2	6	27798	27803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238753
527	NC_005295	A	6	6	27854	27859	100 %	0 %	0 %	0 %	57238753
528	NC_005295	A	7	7	27883	27889	100 %	0 %	0 %	0 %	57238753
529	NC_005295	GAA	2	6	27930	27935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238753
530	NC_005295	ATTT	2	8	27948	27955	25 %	75 %	0 %	0 %	57238753
531	NC_005295	TTA	2	6	28069	28074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238753
532	NC_005295	CTG	2	6	28121	28126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238753
533	NC_005295	GAA	2	6	28159	28164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238753
534	NC_005295	CTT	2	6	28223	28228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238753
535	NC_005295	TAA	2	6	28248	28253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238753
536	NC_005295	A	6	6	28302	28307	100 %	0 %	0 %	0 %	57238753
537	NC_005295	ATAA	2	8	28576	28583	75 %	25 %	0 %	0 %	57238754
538	NC_005295	T	6	6	28591	28596	0 %	100 %	0 %	0 %	57238754
539	NC_005295	T	6	6	28654	28659	0 %	100 %	0 %	0 %	57238754
540	NC_005295	CT	3	6	28666	28671	0 %	50 %	0 %	50 %	57238754
541	NC_005295	ATTT	2	8	28672	28679	25 %	75 %	0 %	0 %	57238754
542	NC_005295	TCA	2	6	28706	28711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238754
543	NC_005295	TTG	2	6	28721	28726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238754
544	NC_005295	ATC	2	6	28753	28758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238754
545	NC_005295	TACA	2	8	28791	28798	50 %	25 %	0 %	25 %	57238754
546	NC_005295	GT	3	6	28921	28926	0 %	50 %	50 %	0 %	57238754
547	NC_005295	ATG	2	6	29156	29161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238755
548	NC_005295	A	7	7	29172	29178	100 %	0 %	0 %	0 %	57238755
549	NC_005295	TA	3	6	29195	29200	50 %	50 %	0 %	0 %	57238755
550	NC_005295	AGG	2	6	29222	29227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238755
551	NC_005295	A	6	6	29257	29262	100 %	0 %	0 %	0 %	57238755
552	NC_005295	GAT	2	6	29278	29283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238755
553	NC_005295	ATCT	2	8	29291	29298	25 %	50 %	0 %	25 %	57238755
554	NC_005295	TGA	2	6	29337	29342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238755
555	NC_005295	GAA	2	6	29353	29358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238755
556	NC_005295	ATC	2	6	29360	29365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238755
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558	NC_005295	GTG	2	6	29432	29437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238755
559	NC_005295	GAA	2	6	29449	29454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238755
560	NC_005295	AGT	2	6	29530	29535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238755
561	NC_005295	GAA	2	6	29548	29553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238755
562	NC_005295	GAA	2	6	29572	29577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238755
563	NC_005295	ACA	2	6	29592	29597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238755
564	NC_005295	GTG	2	6	29630	29635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238755
565	NC_005295	GAA	2	6	29647	29652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238755
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584	NC_005295	TGA	2	6	30138	30143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238755
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599	NC_005295	TATT	2	8	31162	31169	25 %	75 %	0 %	0 %	57238756
600	NC_005295	TCT	2	6	31182	31187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238756
601	NC_005295	T	6	6	31202	31207	0 %	100 %	0 %	0 %	57238756
602	NC_005295	T	6	6	31210	31215	0 %	100 %	0 %	0 %	57238756
603	NC_005295	ATT	2	6	31249	31254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238756
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611	NC_005295	ATG	2	6	31408	31413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238756
612	NC_005295	ATC	2	6	31513	31518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238756
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615	NC_005295	TCT	2	6	31547	31552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238756
616	NC_005295	TCATCT	3	18	31565	31582	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	57238756
617	NC_005295	TCA	2	6	31583	31588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238756
618	NC_005295	TGTA	2	8	31599	31606	25 %	50 %	25 %	0 %	57238756
619	NC_005295	AT	4	8	31621	31628	50 %	50 %	0 %	0 %	57238756
620	NC_005295	CAT	2	6	31629	31634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238756
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625	NC_005295	TTC	3	9	31732	31740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238756
626	NC_005295	CATA	2	8	31749	31756	50 %	25 %	0 %	25 %	57238756
627	NC_005295	ATTTTC	2	12	31813	31824	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	57238756
628	NC_005295	TAT	2	6	31842	31847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238756
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