MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 25191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005295	ATG	2	6	290780	290785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238903
5002	NC_005295	TGA	3	9	290820	290828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238903
5003	NC_005295	TTA	2	6	290830	290835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238903
5004	NC_005295	GCA	2	6	290872	290877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238903
5005	NC_005295	ATG	2	6	290963	290968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238903
5006	NC_005295	AT	6	12	291009	291020	50 %	50 %	0 %	0 %	57238903
5007	NC_005295	TGA	2	6	291042	291047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238903
5008	NC_005295	CAA	2	6	291091	291096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238903
5009	NC_005295	AGG	2	6	291102	291107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238903
5010	NC_005295	TGG	2	6	291120	291125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238903
5011	NC_005295	TGC	2	6	291171	291176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238903
5012	NC_005295	TGA	2	6	291210	291215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238903
5013	NC_005295	TTG	2	6	291218	291223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238903
5014	NC_005295	GAT	2	6	291602	291607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5015	NC_005295	A	7	7	291631	291637	100 %	0 %	0 %	0 %	57238904
5016	NC_005295	GTG	2	6	291666	291671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238904
5017	NC_005295	TCA	2	6	291683	291688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238904
5018	NC_005295	GTG	2	6	291825	291830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238904
5019	NC_005295	TTA	2	6	291879	291884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5020	NC_005295	AG	3	6	291962	291967	50 %	0 %	50 %	0 %	57238904
5021	NC_005295	TGCA	2	8	291987	291994	25 %	25 %	25 %	25 %	57238904
5022	NC_005295	GAGT	2	8	292012	292019	25 %	25 %	50 %	0 %	57238904
5023	NC_005295	AGAA	2	8	292046	292053	75 %	0 %	25 %	0 %	57238904
5024	NC_005295	TTA	2	6	292086	292091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5025	NC_005295	TAA	2	6	292099	292104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238904
5026	NC_005295	GAT	2	6	292114	292119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5027	NC_005295	CCT	2	6	292142	292147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238904
5028	NC_005295	ATC	2	6	292203	292208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238904
5029	NC_005295	TAT	2	6	292219	292224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5030	NC_005295	TAA	2	6	292231	292236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238904
5031	NC_005295	TCC	2	6	292264	292269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238904
5032	NC_005295	A	6	6	292290	292295	100 %	0 %	0 %	0 %	57238904
5033	NC_005295	AAG	2	6	292305	292310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238904
5034	NC_005295	CGT	2	6	292337	292342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238904
5035	NC_005295	TAA	2	6	292354	292359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238904
5036	NC_005295	TTA	2	6	292433	292438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5037	NC_005295	ATT	2	6	292452	292457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5038	NC_005295	GTT	2	6	292475	292480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238904
5039	NC_005295	GAT	2	6	292606	292611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5040	NC_005295	TAT	2	6	292671	292676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5041	NC_005295	TGA	2	6	292857	292862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5042	NC_005295	CTA	2	6	292866	292871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238904
5043	NC_005295	ATA	2	6	292872	292877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238904
5044	NC_005295	AAT	2	6	292903	292908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238904
5045	NC_005295	ATA	2	6	292925	292930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238904
5046	NC_005295	TA	3	6	292936	292941	50 %	50 %	0 %	0 %	57238904
5047	NC_005295	GAA	2	6	292973	292978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238904
5048	NC_005295	TGCAT	2	10	293014	293023	20 %	40 %	20 %	20 %	57238904
5049	NC_005295	AT	3	6	293037	293042	50 %	50 %	0 %	0 %	57238904
5050	NC_005295	GTA	2	6	293043	293048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5051	NC_005295	ATT	2	6	293067	293072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5052	NC_005295	TCA	2	6	293081	293086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238904
5053	NC_005295	ATT	2	6	293106	293111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5054	NC_005295	ACT	2	6	293126	293131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238904
5055	NC_005295	TGT	2	6	293145	293150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238904
5056	NC_005295	TA	3	6	293241	293246	50 %	50 %	0 %	0 %	57238904
5057	NC_005295	ATG	2	6	293507	293512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5058	NC_005295	ATG	2	6	293529	293534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5059	NC_005295	AAGT	2	8	293539	293546	50 %	25 %	25 %	0 %	57238904
5060	NC_005295	TCTA	2	8	293552	293559	25 %	50 %	0 %	25 %	57238904
5061	NC_005295	ATG	2	6	293561	293566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238904
5062	NC_005295	ATT	2	6	293651	293656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5063	NC_005295	TTCAA	2	10	293708	293717	40 %	40 %	0 %	20 %	57238904
5064	NC_005295	TTG	2	6	293790	293795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238904
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5069	NC_005295	TGC	2	6	293920	293925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238904
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5071	NC_005295	A	6	6	294062	294067	100 %	0 %	0 %	0 %	57238904
5072	NC_005295	TTATG	2	10	294080	294089	20 %	60 %	20 %	0 %	57238904
5073	NC_005295	TGT	2	6	294112	294117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238904
5074	NC_005295	TGC	2	6	294145	294150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238904
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5087	NC_005295	GATCCT	2	12	295031	295042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	57238904
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5095	NC_005295	GTAG	2	8	295448	295455	25 %	25 %	50 %	0 %	57238904
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5099	NC_005295	TAT	2	6	295535	295540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238904
5100	NC_005295	CATG	2	8	295580	295587	25 %	25 %	25 %	25 %	57238904
5101	NC_005295	GTG	2	6	295623	295628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238904
5102	NC_005295	AT	4	8	296922	296929	50 %	50 %	0 %	0 %	57238905
5103	NC_005295	AG	3	6	296930	296935	50 %	0 %	50 %	0 %	57238905
5104	NC_005295	ATG	2	6	296955	296960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238905
5105	NC_005295	AT	3	6	296965	296970	50 %	50 %	0 %	0 %	57238905
5106	NC_005295	ATG	2	6	296979	296984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238905
5107	NC_005295	TAA	2	6	297010	297015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238905
5108	NC_005295	A	6	6	297046	297051	100 %	0 %	0 %	0 %	57238905
5109	NC_005295	GGAGCT	2	12	297086	297097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	57238905
5110	NC_005295	TCT	2	6	297121	297126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238905
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5112	NC_005295	TAG	2	6	297187	297192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238905
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5114	NC_005295	ATGAT	2	10	297240	297249	40 %	40 %	20 %	0 %	57238905
5115	NC_005295	TTC	2	6	297271	297276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238905
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5118	NC_005295	A	7	7	297358	297364	100 %	0 %	0 %	0 %	57238905
5119	NC_005295	GTT	2	6	297384	297389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238905
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5121	NC_005295	ATGG	2	8	297416	297423	25 %	25 %	50 %	0 %	57238905
5122	NC_005295	CTA	2	6	297435	297440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238905
5123	NC_005295	ATG	2	6	297468	297473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238905
5124	NC_005295	ATG	2	6	297512	297517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238905
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5127	NC_005295	AT	3	6	297607	297612	50 %	50 %	0 %	0 %	57238905
5128	NC_005295	TA	4	8	297634	297641	50 %	50 %	0 %	0 %	57238905
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5133	NC_005295	A	6	6	297825	297830	100 %	0 %	0 %	0 %	57238905
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5372	NC_005295	AT	3	6	310055	310060	50 %	50 %	0 %	0 %	57238912
5373	NC_005295	T	8	8	310060	310067	0 %	100 %	0 %	0 %	57238912
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5498	NC_005295	TGA	2	6	319209	319214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238918
5499	NC_005295	TA	3	6	319247	319252	50 %	50 %	0 %	0 %	57238918
5500	NC_005295	GTA	2	6	319259	319264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238918

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