MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF3

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004670	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
2	NC_004670	GTTTT	2	10	144	153	0 %	80 %	20 %	0 %	29377877
3	NC_004670	T	6	6	150	155	0 %	100 %	0 %	0 %	29377877
4	NC_004670	TTA	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
5	NC_004670	A	8	8	233	240	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
6	NC_004670	CTG	2	6	299	304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29377877
7	NC_004670	TAT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
8	NC_004670	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
9	NC_004670	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
10	NC_004670	A	6	6	564	569	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
11	NC_004670	CAG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377877
12	NC_004670	TTAAC	2	10	785	794	40 %	40 %	0 %	20 %	29377877
13	NC_004670	AGT	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
14	NC_004670	ATG	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
15	NC_004670	GAT	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
16	NC_004670	A	6	6	985	990	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
17	NC_004670	CAA	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377877
18	NC_004670	ACAAA	2	10	1068	1077	80 %	0 %	0 %	20 %	29377877
19	NC_004670	GCTAT	2	10	1097	1106	20 %	40 %	20 %	20 %	29377877
20	NC_004670	GTA	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
21	NC_004670	TAAA	2	8	1196	1203	75 %	25 %	0 %	0 %	29377877
22	NC_004670	A	6	6	1201	1206	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
23	NC_004670	A	9	9	1240	1248	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
24	NC_004670	AGA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
25	NC_004670	A	7	7	1272	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	29377877
26	NC_004670	CTT	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377877
27	NC_004670	CTA	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377877
28	NC_004670	AAT	2	6	1430	1435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
29	NC_004670	CAG	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
30	NC_004670	ATT	2	6	1501	1506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
31	NC_004670	CTA	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
32	NC_004670	ACG	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
33	NC_004670	ACT	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
34	NC_004670	GAAAAA	2	12	1647	1658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	29377878
35	NC_004670	ATT	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
36	NC_004670	A	6	6	1777	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	29377878
37	NC_004670	AC	3	6	1787	1792	50 %	0 %	0 %	50 %	29377878
38	NC_004670	AGC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
39	NC_004670	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377878
40	NC_004670	AAT	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377878
41	NC_004670	TTGA	2	8	1954	1961	25 %	50 %	25 %	0 %	29377878
42	NC_004670	TA	3	6	2057	2062	50 %	50 %	0 %	0 %	29377878
43	NC_004670	AAG	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377878
44	NC_004670	CT	3	6	2084	2089	0 %	50 %	0 %	50 %	29377878
45	NC_004670	TAT	2	6	2120	2125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
46	NC_004670	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377879
47	NC_004670	TCA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
48	NC_004670	AAT	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
49	NC_004670	TCT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
50	NC_004670	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
51	NC_004670	CAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
52	NC_004670	ATG	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377879
53	NC_004670	AATC	2	8	3804	3811	50 %	25 %	0 %	25 %	29377879
54	NC_004670	T	8	8	3889	3896	0 %	100 %	0 %	0 %	29377879
55	NC_004670	TGG	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29377879
56	NC_004670	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	29377879
57	NC_004670	TGT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
58	NC_004670	TCT	2	6	4171	4176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
59	NC_004670	TA	3	6	4185	4190	50 %	50 %	0 %	0 %	29377879
60	NC_004670	TAAG	2	8	4206	4213	50 %	25 %	25 %	0 %	29377879
61	NC_004670	T	7	7	4219	4225	0 %	100 %	0 %	0 %	29377879
62	NC_004670	ATA	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
63	NC_004670	CTGTT	2	10	4269	4278	0 %	60 %	20 %	20 %	29377879
64	NC_004670	TTC	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
65	NC_004670	ATAC	2	8	4361	4368	50 %	25 %	0 %	25 %	29377879
66	NC_004670	TCGTT	2	10	4399	4408	0 %	60 %	20 %	20 %	29377879
67	NC_004670	ATA	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
68	NC_004670	GTTC	2	8	4537	4544	0 %	50 %	25 %	25 %	29377879
69	NC_004670	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	29377879
70	NC_004670	GTT	2	6	4603	4608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
71	NC_004670	AAT	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
72	NC_004670	TGT	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
73	NC_004670	GAA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
74	NC_004670	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
75	NC_004670	AGA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
76	NC_004670	AGA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
77	NC_004670	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
78	NC_004670	ATA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
79	NC_004670	ATT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
80	NC_004670	A	6	6	5370	5375	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
81	NC_004670	ATT	2	6	5387	5392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
82	NC_004670	TGA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
83	NC_004670	CAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377880
84	NC_004670	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
85	NC_004670	T	6	6	5516	5521	0 %	100 %	0 %	0 %	29377880
86	NC_004670	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
87	NC_004670	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
88	NC_004670	TCC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29377880
89	NC_004670	AAG	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
90	NC_004670	CTAT	2	8	5900	5907	25 %	50 %	0 %	25 %	29377880
91	NC_004670	GTT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
92	NC_004670	TTTA	2	8	5973	5980	25 %	75 %	0 %	0 %	29377880
93	NC_004670	A	6	6	6011	6016	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
94	NC_004670	A	6	6	6065	6070	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
95	NC_004670	ATT	2	6	6088	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
96	NC_004670	AGTAA	2	10	6184	6193	60 %	20 %	20 %	0 %	29377880
97	NC_004670	ATTTA	2	10	6246	6255	40 %	60 %	0 %	0 %	29377880
98	NC_004670	GGA	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29377880
99	NC_004670	T	6	6	6356	6361	0 %	100 %	0 %	0 %	29377880
100	NC_004670	A	7	7	6367	6373	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
101	NC_004670	ATA	2	6	6410	6415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
102	NC_004670	AT	3	6	6444	6449	50 %	50 %	0 %	0 %	29377880
103	NC_004670	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377880
104	NC_004670	ATT	2	6	6538	6543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
105	NC_004670	GTT	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
106	NC_004670	ATA	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
107	NC_004670	TA	4	8	6798	6805	50 %	50 %	0 %	0 %	29377880
108	NC_004670	A	6	6	6805	6810	100 %	0 %	0 %	0 %	29377880
109	NC_004670	GATT	2	8	6831	6838	25 %	50 %	25 %	0 %	29377880
110	NC_004670	TGA	2	6	6864	6869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
111	NC_004670	AAT	2	6	6880	6885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
112	NC_004670	ATT	2	6	7530	7535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377881
113	NC_004670	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377881
114	NC_004670	AGAA	2	8	7603	7610	75 %	0 %	25 %	0 %	29377881
115	NC_004670	AAC	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377881
116	NC_004670	TTG	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377881
117	NC_004670	CTT	2	6	7683	7688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377881
118	NC_004670	A	6	6	7699	7704	100 %	0 %	0 %	0 %	29377881
119	NC_004670	GGTAT	2	10	7707	7716	20 %	40 %	40 %	0 %	29377881
120	NC_004670	TGT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377881
121	NC_004670	CCA	2	6	7778	7783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377881
122	NC_004670	TA	3	6	7794	7799	50 %	50 %	0 %	0 %	29377881
123	NC_004670	ATA	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377881
124	NC_004670	AGA	2	6	7832	7837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
125	NC_004670	TGA	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377881
126	NC_004670	TCGA	2	8	7868	7875	25 %	25 %	25 %	25 %	29377881
127	NC_004670	AATC	2	8	7878	7885	50 %	25 %	0 %	25 %	29377881
128	NC_004670	AGAA	2	8	7943	7950	75 %	0 %	25 %	0 %	29377881
129	NC_004670	GCTC	2	8	7951	7958	0 %	25 %	25 %	50 %	29377881
130	NC_004670	AGA	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
131	NC_004670	GATT	2	8	7992	7999	25 %	50 %	25 %	0 %	29377881
132	NC_004670	CGAAG	2	10	8053	8062	40 %	0 %	40 %	20 %	29377881
133	NC_004670	A	7	7	8165	8171	100 %	0 %	0 %	0 %	29377881
134	NC_004670	AGA	2	6	8372	8377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
135	NC_004670	CTA	2	6	8556	8561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377881
136	NC_004670	CAG	2	6	8634	8639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
137	NC_004670	ATT	2	6	8646	8651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377882
138	NC_004670	CTA	2	6	8663	8668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377882
139	NC_004670	ACG	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
140	NC_004670	ACT	2	6	8774	8779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377882
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.