MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 2344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022651	GCGA	2	8	47626	47633	25 %	0 %	50 %	25 %	556555239
1002	NC_022651	CAG	2	6	47638	47643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555239
1003	NC_022651	CAT	2	6	47678	47683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555239
1004	NC_022651	ATA	2	6	47945	47950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555240
1005	NC_022651	GGCCT	2	10	47960	47969	0 %	20 %	40 %	40 %	556555240
1006	NC_022651	TGG	2	6	48004	48009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555240
1007	NC_022651	GTT	2	6	48089	48094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555240
1008	NC_022651	GAGCA	2	10	48149	48158	40 %	0 %	40 %	20 %	556555240
1009	NC_022651	GC	3	6	48160	48165	0 %	0 %	50 %	50 %	556555240
1010	NC_022651	GGCG	2	8	48173	48180	0 %	0 %	75 %	25 %	556555240
1011	NC_022651	TGA	2	6	48193	48198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555240
1012	NC_022651	CTT	2	6	48215	48220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555240
1013	NC_022651	GTT	2	6	48224	48229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555240
1014	NC_022651	ACG	2	6	48269	48274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555240
1015	NC_022651	GGA	2	6	48275	48280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555240
1016	NC_022651	GA	3	6	48279	48284	50 %	0 %	50 %	0 %	556555240
1017	NC_022651	CAGC	2	8	48490	48497	25 %	0 %	25 %	50 %	556555240
1018	NC_022651	ATG	2	6	48558	48563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555240
1019	NC_022651	GAT	2	6	48622	48627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022651	CAC	2	6	48636	48641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555241
1021	NC_022651	GGA	2	6	48664	48669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555241
1022	NC_022651	G	6	6	48697	48702	0 %	0 %	100 %	0 %	556555241
1023	NC_022651	TTG	2	6	48768	48773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555241
1024	NC_022651	T	8	8	48789	48796	0 %	100 %	0 %	0 %	556555241
1025	NC_022651	TCCTTG	2	12	48837	48848	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556555241
1026	NC_022651	CTG	2	6	48962	48967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555241
1027	NC_022651	C	7	7	48992	48998	0 %	0 %	0 %	100 %	556555241
1028	NC_022651	A	6	6	49118	49123	100 %	0 %	0 %	0 %	556555241
1029	NC_022651	GCA	2	6	49131	49136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555241
1030	NC_022651	TAA	2	6	49180	49185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555241
1031	NC_022651	GCC	2	6	49214	49219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555241
1032	NC_022651	CCA	2	6	49296	49301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555241
1033	NC_022651	CGG	2	6	49312	49317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555241
1034	NC_022651	CCTGCC	2	12	49318	49329	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	556555241
1035	NC_022651	CGCC	2	8	49333	49340	0 %	0 %	25 %	75 %	556555241
1036	NC_022651	TTA	2	6	49368	49373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555241
1037	NC_022651	AGA	2	6	49449	49454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555241
1038	NC_022651	CCCT	2	8	49480	49487	0 %	25 %	0 %	75 %	556555242
1039	NC_022651	C	6	6	49536	49541	0 %	0 %	0 %	100 %	556555242
1040	NC_022651	TTA	2	6	49544	49549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555242
1041	NC_022651	ACAT	2	8	49621	49628	50 %	25 %	0 %	25 %	556555242
1042	NC_022651	ATT	2	6	49653	49658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555242
1043	NC_022651	A	6	6	49723	49728	100 %	0 %	0 %	0 %	556555242
1044	NC_022651	GCA	2	6	49735	49740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555242
1045	NC_022651	A	6	6	49749	49754	100 %	0 %	0 %	0 %	556555242
1046	NC_022651	AT	4	8	49764	49771	50 %	50 %	0 %	0 %	556555242
1047	NC_022651	TCATAA	2	12	49786	49797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556555242
1048	NC_022651	T	6	6	49816	49821	0 %	100 %	0 %	0 %	556555242
1049	NC_022651	CAT	2	6	49829	49834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555242
1050	NC_022651	T	6	6	49838	49843	0 %	100 %	0 %	0 %	556555242
1051	NC_022651	TGA	2	6	49873	49878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555243
1052	NC_022651	TTCA	2	8	49879	49886	25 %	50 %	0 %	25 %	556555243
1053	NC_022651	ATCC	2	8	49919	49926	25 %	25 %	0 %	50 %	556555243
1054	NC_022651	A	6	6	49942	49947	100 %	0 %	0 %	0 %	556555243
1055	NC_022651	AACAGA	2	12	49951	49962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	556555243
1056	NC_022651	A	6	6	50010	50015	100 %	0 %	0 %	0 %	556555243
1057	NC_022651	ATT	2	6	50051	50056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555243
1058	NC_022651	ACC	2	6	50093	50098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555243
1059	NC_022651	ATCC	2	8	50144	50151	25 %	25 %	0 %	50 %	556555244
1060	NC_022651	GGC	2	6	50165	50170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555244
1061	NC_022651	GT	3	6	50206	50211	0 %	50 %	50 %	0 %	556555244
1062	NC_022651	GGT	2	6	50228	50233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555244
1063	NC_022651	GAA	2	6	50258	50263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555244
1064	NC_022651	CTG	2	6	50357	50362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555244
1065	NC_022651	GCT	2	6	50368	50373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555244
1066	NC_022651	CAC	2	6	50426	50431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555244
1067	NC_022651	CCTG	2	8	50452	50459	0 %	25 %	25 %	50 %	556555244
1068	NC_022651	TTCTG	2	10	50495	50504	0 %	60 %	20 %	20 %	556555244
1069	NC_022651	CTG	2	6	50515	50520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555244
1070	NC_022651	GGC	2	6	50532	50537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555244
1071	NC_022651	CAT	2	6	50606	50611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555244
1072	NC_022651	CAA	2	6	50612	50617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555244
1073	NC_022651	GA	3	6	50639	50644	50 %	0 %	50 %	0 %	556555244
1074	NC_022651	CTG	2	6	50658	50663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555245
1075	NC_022651	CAT	2	6	50670	50675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555245
1076	NC_022651	CTG	2	6	50679	50684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555245
1077	NC_022651	A	7	7	50793	50799	100 %	0 %	0 %	0 %	556555245
1078	NC_022651	CGA	2	6	50831	50836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555245
1079	NC_022651	TTA	2	6	50931	50936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022651	TG	3	6	50974	50979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022651	ATT	2	6	51000	51005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022651	TTA	2	6	51017	51022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_022651	A	6	6	51060	51065	100 %	0 %	0 %	0 %	556555246
1084	NC_022651	ACA	2	6	51092	51097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555246
1085	NC_022651	TTC	2	6	51113	51118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555246
1086	NC_022651	AAC	2	6	51168	51173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555246
1087	NC_022651	TGC	2	6	51177	51182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555246
1088	NC_022651	CAC	2	6	51200	51205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555246
1089	NC_022651	TAA	2	6	51251	51256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555246
1090	NC_022651	AGAAA	2	10	51306	51315	80 %	0 %	20 %	0 %	556555246
1091	NC_022651	AAT	2	6	51324	51329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555246
1092	NC_022651	AAC	2	6	51345	51350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555246
1093	NC_022651	AAT	2	6	51368	51373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555246
1094	NC_022651	AAATC	2	10	51384	51393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_022651	GTC	2	6	51450	51455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555247
1096	NC_022651	CAT	2	6	51513	51518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555247
1097	NC_022651	A	7	7	51695	51701	100 %	0 %	0 %	0 %	556555247
1098	NC_022651	ATG	2	6	51703	51708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555247
1099	NC_022651	GCT	2	6	51743	51748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555247
1100	NC_022651	GCC	2	6	51760	51765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555247
1101	NC_022651	CTG	2	6	51870	51875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555247
1102	NC_022651	TTG	2	6	51956	51961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555247
1103	NC_022651	ATA	2	6	51988	51993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555247
1104	NC_022651	G	6	6	52007	52012	0 %	0 %	100 %	0 %	556555247
1105	NC_022651	ATTT	2	8	52047	52054	25 %	75 %	0 %	0 %	556555247
1106	NC_022651	AGC	2	6	52106	52111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555247
1107	NC_022651	TCA	2	6	52154	52159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555248
1108	NC_022651	T	6	6	52160	52165	0 %	100 %	0 %	0 %	556555248
1109	NC_022651	TCA	2	6	52169	52174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555248
1110	NC_022651	AGC	2	6	52252	52257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555248
1111	NC_022651	TCA	2	6	52389	52394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555248
1112	NC_022651	CCTG	2	8	52426	52433	0 %	25 %	25 %	50 %	556555249
1113	NC_022651	TCA	2	6	52505	52510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555249
1114	NC_022651	TCA	2	6	52564	52569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555249
1115	NC_022651	CTG	3	9	52638	52646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555249
1116	NC_022651	T	6	6	52689	52694	0 %	100 %	0 %	0 %	556555249
1117	NC_022651	CAGA	2	8	52698	52705	50 %	0 %	25 %	25 %	556555249
1118	NC_022651	TTC	2	6	52717	52722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555249
1119	NC_022651	GTTT	2	8	52751	52758	0 %	75 %	25 %	0 %	556555249
1120	NC_022651	TCA	2	6	52783	52788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555249
1121	NC_022651	CTG	2	6	52789	52794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555249
1122	NC_022651	CAG	2	6	52837	52842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555249
1123	NC_022651	CTT	2	6	52863	52868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555249
1124	NC_022651	TGC	2	6	52947	52952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555249
1125	NC_022651	AGA	2	6	53024	53029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555249
1126	NC_022651	CTT	2	6	53108	53113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555249
1127	NC_022651	CTG	2	6	53189	53194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555249
1128	NC_022651	TG	3	6	53197	53202	0 %	50 %	50 %	0 %	556555249
1129	NC_022651	CAG	2	6	53224	53229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555249
1130	NC_022651	TGAC	2	8	53247	53254	25 %	25 %	25 %	25 %	556555249
1131	NC_022651	CAGAC	2	10	53342	53351	40 %	0 %	20 %	40 %	556555249
1132	NC_022651	T	7	7	53373	53379	0 %	100 %	0 %	0 %	556555249
1133	NC_022651	CAGT	2	8	53474	53481	25 %	25 %	25 %	25 %	556555249
1134	NC_022651	CTG	2	6	53510	53515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555249
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1138	NC_022651	GCACT	2	10	53827	53836	20 %	20 %	20 %	40 %	556555249
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1141	NC_022651	GTG	2	6	53986	53991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555249
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1152	NC_022651	CTG	2	6	54752	54757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555250
1153	NC_022651	CTG	2	6	54823	54828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555250
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1161	NC_022651	AAT	2	6	55088	55093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555251
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1164	NC_022651	TTG	2	6	55167	55172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555251
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1169	NC_022651	CAGAA	2	10	55558	55567	60 %	0 %	20 %	20 %	556555252
1170	NC_022651	CTG	2	6	55604	55609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555252
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1238	NC_022651	AGG	2	6	58835	58840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555255
1239	NC_022651	CCA	3	9	58907	58915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555255
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1241	NC_022651	GCTGT	2	10	59044	59053	0 %	40 %	40 %	20 %	556555255
1242	NC_022651	TCC	2	6	59116	59121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555255
1243	NC_022651	AC	3	6	59122	59127	50 %	0 %	0 %	50 %	556555255
1244	NC_022651	TCAGA	2	10	59135	59144	40 %	20 %	20 %	20 %	556555255
1245	NC_022651	AG	3	6	59176	59181	50 %	0 %	50 %	0 %	556555255
1246	NC_022651	ATC	2	6	59197	59202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555255
1247	NC_022651	CTGT	2	8	59237	59244	0 %	50 %	25 %	25 %	556555255
1248	NC_022651	GTG	2	6	59245	59250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555255
1249	NC_022651	GAT	2	6	59277	59282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555255
1250	NC_022651	TTTCCA	2	12	59294	59305	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556555255
1251	NC_022651	T	7	7	59321	59327	0 %	100 %	0 %	0 %	556555255
1252	NC_022651	ATA	2	6	59430	59435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555255
1253	NC_022651	ACCA	2	8	59514	59521	50 %	0 %	0 %	50 %	556555255
1254	NC_022651	CG	3	6	59558	59563	0 %	0 %	50 %	50 %	556555255
1255	NC_022651	GCA	2	6	59576	59581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555255
1256	NC_022651	GTG	2	6	59653	59658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555255
1257	NC_022651	TCAT	2	8	59659	59666	25 %	50 %	0 %	25 %	556555255
1258	NC_022651	GCA	2	6	59702	59707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555255
1259	NC_022651	GACT	2	8	59987	59994	25 %	25 %	25 %	25 %	556555256
1260	NC_022651	CCG	2	6	60069	60074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555190
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1262	NC_022651	GTT	2	6	60173	60178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555190
1263	NC_022651	TCA	2	6	60205	60210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555190
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1286	NC_022651	T	7	7	61077	61083	0 %	100 %	0 %	0 %	556555258
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1335	NC_022651	ACG	2	6	63145	63150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555261
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1375	NC_022651	AAC	2	6	65168	65173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555265
1376	NC_022651	GTG	2	6	65205	65210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555265
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1379	NC_022651	CAT	2	6	65267	65272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555265
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1500	NC_022651	T	6	6	71000	71005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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