MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 2344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022651	GCC	2	6	23141	23146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555219
502	NC_022651	TGA	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555219
503	NC_022651	CCGCC	2	10	23162	23171	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
504	NC_022651	GCA	2	6	23184	23189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022651	TGA	2	6	23202	23207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555220
506	NC_022651	ACTGA	2	10	23210	23219	40 %	20 %	20 %	20 %	556555220
507	NC_022651	TGC	2	6	23269	23274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555220
508	NC_022651	TCAC	2	8	23298	23305	25 %	25 %	0 %	50 %	556555220
509	NC_022651	GAT	2	6	23341	23346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555220
510	NC_022651	TC	3	6	23451	23456	0 %	50 %	0 %	50 %	556555220
511	NC_022651	GGT	2	6	23486	23491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555220
512	NC_022651	GGT	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555220
513	NC_022651	GCG	2	6	23518	23523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555220
514	NC_022651	CACTGG	2	12	23550	23561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556555220
515	NC_022651	CAT	2	6	23599	23604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555220
516	NC_022651	AGG	2	6	23623	23628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555220
517	NC_022651	GGCG	2	8	23690	23697	0 %	0 %	75 %	25 %	556555221
518	NC_022651	CGC	2	6	23716	23721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555221
519	NC_022651	GCTG	2	8	23736	23743	0 %	25 %	50 %	25 %	556555221
520	NC_022651	AGA	2	6	23838	23843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555221
521	NC_022651	CCT	2	6	23913	23918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555221
522	NC_022651	GCA	2	6	23935	23940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555221
523	NC_022651	GCC	2	6	24020	24025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555221
524	NC_022651	GAGG	2	8	24033	24040	25 %	0 %	75 %	0 %	556555221
525	NC_022651	CATTC	2	10	24098	24107	20 %	40 %	0 %	40 %	556555221
526	NC_022651	TGGCAG	2	12	24226	24237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556555221
527	NC_022651	GCA	2	6	24277	24282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555221
528	NC_022651	AG	3	6	24283	24288	50 %	0 %	50 %	0 %	556555221
529	NC_022651	CAA	2	6	24360	24365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_022651	ATT	2	6	24402	24407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022651	AGTG	2	8	24417	24424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022651	ATG	2	6	24450	24455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022651	GGT	2	6	24493	24498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022651	TTG	2	6	24499	24504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022651	TG	3	6	24511	24516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022651	AGAA	2	8	24519	24526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022651	GTA	2	6	24536	24541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022651	ACC	2	6	24557	24562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_022651	GAA	2	6	24624	24629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022651	GT	4	8	24663	24670	0 %	50 %	50 %	0 %	556555185
541	NC_022651	GT	3	6	24676	24681	0 %	50 %	50 %	0 %	556555185
542	NC_022651	GGC	2	6	24759	24764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555185
543	NC_022651	GGCG	2	8	24802	24809	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
544	NC_022651	ACT	2	6	24843	24848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_022651	GCT	2	6	24868	24873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_022651	TGT	2	6	24905	24910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022651	AAC	2	6	24920	24925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_022651	CG	3	6	24968	24973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_022651	GCG	2	6	24977	24982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022651	ATCAC	2	10	25026	25035	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
551	NC_022651	ATT	2	6	25046	25051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022651	TTC	2	6	25058	25063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_022651	GGT	2	6	25099	25104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022651	ATC	2	6	25114	25119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_022651	CAT	2	6	25178	25183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555222
556	NC_022651	GCTG	2	8	25244	25251	0 %	25 %	50 %	25 %	556555222
557	NC_022651	TC	3	6	25457	25462	0 %	50 %	0 %	50 %	556555222
558	NC_022651	CGT	2	6	25467	25472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555222
559	NC_022651	CAA	2	6	25511	25516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555222
560	NC_022651	GAA	2	6	25520	25525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555222
561	NC_022651	TCA	2	6	25543	25548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555222
562	NC_022651	CG	3	6	25575	25580	0 %	0 %	50 %	50 %	556555222
563	NC_022651	TGCTC	2	10	25583	25592	0 %	40 %	20 %	40 %	556555222
564	NC_022651	AAC	2	6	25647	25652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555222
565	NC_022651	CCA	2	6	25732	25737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555222
566	NC_022651	AGGCC	2	10	25772	25781	20 %	0 %	40 %	40 %	556555222
567	NC_022651	TAT	2	6	25791	25796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555222
568	NC_022651	GAA	2	6	25936	25941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022651	TGG	2	6	25943	25948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555223
570	NC_022651	TCG	2	6	25965	25970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555223
571	NC_022651	CTG	2	6	25984	25989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555223
572	NC_022651	CGG	2	6	26071	26076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555223
573	NC_022651	T	6	6	26080	26085	0 %	100 %	0 %	0 %	556555223
574	NC_022651	GAC	2	6	26086	26091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555223
575	NC_022651	TAC	2	6	26264	26269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555223
576	NC_022651	GGCA	2	8	26282	26289	25 %	0 %	50 %	25 %	556555223
577	NC_022651	TCA	2	6	26358	26363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555223
578	NC_022651	ACAG	2	8	26378	26385	50 %	0 %	25 %	25 %	556555223
579	NC_022651	TGC	2	6	26388	26393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555223
580	NC_022651	TGA	2	6	26475	26480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555223
581	NC_022651	CTCC	2	8	26524	26531	0 %	25 %	0 %	75 %	556555223
582	NC_022651	TGC	2	6	26549	26554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555223
583	NC_022651	TGA	2	6	26583	26588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555223
584	NC_022651	TGA	2	6	26622	26627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555223
585	NC_022651	GATCA	2	10	26691	26700	40 %	20 %	20 %	20 %	556555223
586	NC_022651	GGA	2	6	26833	26838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555223
587	NC_022651	CAAT	2	8	26885	26892	50 %	25 %	0 %	25 %	556555223
588	NC_022651	TAA	2	6	26919	26924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555223
589	NC_022651	TCT	2	6	27027	27032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555223
590	NC_022651	CAG	2	6	27077	27082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555223
591	NC_022651	GCT	2	6	27114	27119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555223
592	NC_022651	ATG	2	6	27182	27187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555223
593	NC_022651	GACT	2	8	27350	27357	25 %	25 %	25 %	25 %	556555223
594	NC_022651	CAA	2	6	27384	27389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555223
595	NC_022651	TGA	3	9	27414	27422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555223
596	NC_022651	CCG	2	6	27429	27434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555223
597	NC_022651	CGT	2	6	27579	27584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555223
598	NC_022651	GCAG	2	8	27606	27613	25 %	0 %	50 %	25 %	556555223
599	NC_022651	ATC	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555223
600	NC_022651	ATG	2	6	27650	27655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555223
601	NC_022651	ATT	2	6	27710	27715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555223
602	NC_022651	TA	3	6	27840	27845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022651	GCTG	2	8	27938	27945	0 %	25 %	50 %	25 %	556555224
604	NC_022651	A	6	6	28010	28015	100 %	0 %	0 %	0 %	556555224
605	NC_022651	TTC	2	6	28023	28028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555224
606	NC_022651	CTG	2	6	28053	28058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555224
607	NC_022651	TG	3	6	28057	28062	0 %	50 %	50 %	0 %	556555224
608	NC_022651	CCG	2	6	28076	28081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555224
609	NC_022651	GTG	2	6	28155	28160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555224
610	NC_022651	CTGC	2	8	28197	28204	0 %	25 %	25 %	50 %	556555224
611	NC_022651	CTG	2	6	28346	28351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555224
612	NC_022651	CGT	2	6	28378	28383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555224
613	NC_022651	TGT	2	6	28384	28389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555224
614	NC_022651	TCG	2	6	28390	28395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555224
615	NC_022651	CTG	2	6	28419	28424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555224
616	NC_022651	TGG	2	6	28444	28449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555224
617	NC_022651	GTG	2	6	28480	28485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555224
618	NC_022651	CTG	3	9	28488	28496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555224
619	NC_022651	TGC	2	6	28504	28509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555224
620	NC_022651	TTA	2	6	28559	28564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022651	GT	3	6	28586	28591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022651	T	7	7	28591	28597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022651	GAA	2	6	28635	28640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555186
624	NC_022651	ACC	2	6	28646	28651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555186
625	NC_022651	GGC	2	6	28667	28672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555186
626	NC_022651	CTG	2	6	28700	28705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555186
627	NC_022651	TTG	2	6	28767	28772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555186
628	NC_022651	GAA	2	6	28847	28852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555186
629	NC_022651	AGG	2	6	28884	28889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555186
630	NC_022651	AGC	2	6	28951	28956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555187
631	NC_022651	CGG	2	6	28987	28992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555187
632	NC_022651	GCCT	2	8	29011	29018	0 %	25 %	25 %	50 %	556555187
633	NC_022651	GTT	2	6	29019	29024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555187
634	NC_022651	GCC	2	6	29206	29211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555187
635	NC_022651	TGT	2	6	29289	29294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022651	CCA	2	6	29296	29301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_022651	CAGT	2	8	29403	29410	25 %	25 %	25 %	25 %	556555225
638	NC_022651	GCCCA	2	10	29420	29429	20 %	0 %	20 %	60 %	556555225
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645	NC_022651	GTT	2	6	29758	29763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555225
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649	NC_022651	CTG	2	6	30027	30032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555225
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655	NC_022651	CTG	2	6	30624	30629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555225
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662	NC_022651	GCT	3	9	31022	31030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555225
663	NC_022651	ACG	2	6	31093	31098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_022651	TGAGT	2	10	31155	31164	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
665	NC_022651	GGT	2	6	31206	31211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
666	NC_022651	ATC	2	6	31221	31226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_022651	CAT	2	6	31285	31290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555226
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683	NC_022651	GCCA	2	8	32224	32231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
684	NC_022651	GAT	2	6	32272	32277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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741	NC_022651	CAC	2	6	34987	34992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
742	NC_022651	CCTG	2	8	35065	35072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
743	NC_022651	TAA	2	6	35172	35177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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748	NC_022651	TGG	2	6	35535	35540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555188
749	NC_022651	GGA	2	6	35577	35582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555188
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752	NC_022651	TCA	2	6	35713	35718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555188
753	NC_022651	ATA	2	6	35806	35811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
754	NC_022651	AAT	2	6	35936	35941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
755	NC_022651	T	6	6	35995	36000	0 %	100 %	0 %	0 %	556555230
756	NC_022651	GAA	2	6	36139	36144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555230
757	NC_022651	ATG	2	6	36154	36159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555230
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759	NC_022651	CGC	2	6	36229	36234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555230
760	NC_022651	TGC	2	6	36324	36329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555230
761	NC_022651	CTG	2	6	36350	36355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555230
762	NC_022651	ACTT	2	8	36359	36366	25 %	50 %	0 %	25 %	556555230
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773	NC_022651	GCA	2	6	36691	36696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555230
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776	NC_022651	GATT	2	8	36852	36859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
777	NC_022651	TTTAA	2	10	36872	36881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
778	NC_022651	GGC	2	6	37018	37023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_022651	TGT	2	6	37028	37033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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781	NC_022651	TGAT	2	8	37083	37090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
782	NC_022651	GA	3	6	37145	37150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
783	NC_022651	CGA	2	6	37177	37182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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786	NC_022651	GAGG	2	8	37363	37370	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
787	NC_022651	GTT	2	6	37416	37421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
788	NC_022651	TG	3	6	37424	37429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
789	NC_022651	CGC	2	6	37459	37464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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791	NC_022651	AATG	2	8	37527	37534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
792	NC_022651	AGT	2	6	37541	37546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
793	NC_022651	GGC	2	6	37599	37604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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796	NC_022651	T	7	7	37770	37776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
797	NC_022651	CGG	2	6	37783	37788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
798	NC_022651	ATT	2	6	37824	37829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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813	NC_022651	TTG	2	6	38796	38801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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815	NC_022651	GCCA	2	8	38932	38939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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822	NC_022651	TCTG	2	8	39241	39248	0 %	50 %	25 %	25 %	556555232
823	NC_022651	CCT	2	6	39259	39264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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825	NC_022651	T	6	6	39305	39310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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853	NC_022651	TTTA	2	8	40376	40383	25 %	75 %	0 %	0 %	556555234
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875	NC_022651	CTT	2	6	41348	41353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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877	NC_022651	CCT	2	6	41398	41403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
878	NC_022651	AGG	2	6	41413	41418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
879	NC_022651	T	6	6	41420	41425	0 %	100 %	0 %	0 %	556555236
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883	NC_022651	CCT	2	6	41513	41518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555236
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885	NC_022651	CA	3	6	41579	41584	50 %	0 %	0 %	50 %	556555236
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891	NC_022651	TGG	2	6	41883	41888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555236
892	NC_022651	GTG	2	6	41890	41895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555236
893	NC_022651	TGA	2	6	41900	41905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555236
894	NC_022651	TCC	2	6	42012	42017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
895	NC_022651	ACT	2	6	42029	42034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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