MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022650	A	6	6	383	388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022650	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	556555104
3	NC_022650	T	6	6	1811	1816	0 %	100 %	0 %	0 %	556555104
4	NC_022650	T	6	6	2021	2026	0 %	100 %	0 %	0 %	556555104
5	NC_022650	T	6	6	2186	2191	0 %	100 %	0 %	0 %	556555104
6	NC_022650	G	6	6	2538	2543	0 %	0 %	100 %	0 %	556555104
7	NC_022650	T	6	6	3979	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022650	A	6	6	4008	4013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022650	A	6	6	4183	4188	100 %	0 %	0 %	0 %	556555106
10	NC_022650	A	6	6	4551	4556	100 %	0 %	0 %	0 %	556555106
11	NC_022650	A	6	6	4593	4598	100 %	0 %	0 %	0 %	556555107
12	NC_022650	G	7	7	4997	5003	0 %	0 %	100 %	0 %	556555107
13	NC_022650	A	6	6	5824	5829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022650	A	6	6	6031	6036	100 %	0 %	0 %	0 %	556555109
15	NC_022650	G	6	6	6356	6361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022650	A	8	8	6377	6384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022650	G	7	7	7039	7045	0 %	0 %	100 %	0 %	556555110
18	NC_022650	T	6	6	8052	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	556555111
19	NC_022650	T	6	6	8115	8120	0 %	100 %	0 %	0 %	556555111
20	NC_022650	G	6	6	8236	8241	0 %	0 %	100 %	0 %	556555112
21	NC_022650	A	9	9	8401	8409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022650	T	8	8	9449	9456	0 %	100 %	0 %	0 %	556555113
23	NC_022650	T	7	7	9758	9764	0 %	100 %	0 %	0 %	556555114
24	NC_022650	T	8	8	10517	10524	0 %	100 %	0 %	0 %	556555115
25	NC_022650	T	6	6	10528	10533	0 %	100 %	0 %	0 %	556555115
26	NC_022650	T	6	6	10691	10696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022650	T	6	6	10765	10770	0 %	100 %	0 %	0 %	556555116
28	NC_022650	C	6	6	10779	10784	0 %	0 %	0 %	100 %	556555116
29	NC_022650	T	7	7	11096	11102	0 %	100 %	0 %	0 %	556555116
30	NC_022650	T	7	7	13232	13238	0 %	100 %	0 %	0 %	556555118
31	NC_022650	A	9	9	14134	14142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022650	T	6	6	14539	14544	0 %	100 %	0 %	0 %	556555121
33	NC_022650	A	6	6	15814	15819	100 %	0 %	0 %	0 %	556555123
34	NC_022650	A	6	6	17538	17543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022650	T	6	6	17694	17699	0 %	100 %	0 %	0 %	556555126
36	NC_022650	A	6	6	17891	17896	100 %	0 %	0 %	0 %	556555126
37	NC_022650	T	6	6	17938	17943	0 %	100 %	0 %	0 %	556555126
38	NC_022650	T	7	7	18015	18021	0 %	100 %	0 %	0 %	556555126
39	NC_022650	T	6	6	18312	18317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022650	A	6	6	18909	18914	100 %	0 %	0 %	0 %	556555128
41	NC_022650	C	6	6	19990	19995	0 %	0 %	0 %	100 %	556555130
42	NC_022650	G	6	6	20789	20794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022650	G	6	6	20830	20835	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022650	C	6	6	20839	20844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_022650	A	8	8	20864	20871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022650	A	6	6	20889	20894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022650	A	7	7	20927	20933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022650	T	8	8	20961	20968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022650	A	7	7	21036	21042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022650	A	6	6	21187	21192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022650	A	6	6	21411	21416	100 %	0 %	0 %	0 %	556555131
52	NC_022650	T	6	6	21829	21834	0 %	100 %	0 %	0 %	556555131
53	NC_022650	T	7	7	22045	22051	0 %	100 %	0 %	0 %	556555131
54	NC_022650	T	8	8	22845	22852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022650	T	6	6	22930	22935	0 %	100 %	0 %	0 %	556555132
56	NC_022650	A	6	6	23208	23213	100 %	0 %	0 %	0 %	556555132
57	NC_022650	A	6	6	23281	23286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022650	A	6	6	24376	24381	100 %	0 %	0 %	0 %	556555133
59	NC_022650	A	6	6	25195	25200	100 %	0 %	0 %	0 %	556555135
60	NC_022650	A	6	6	25299	25304	100 %	0 %	0 %	0 %	556555136
61	NC_022650	T	6	6	25407	25412	0 %	100 %	0 %	0 %	556555136
62	NC_022650	A	7	7	27758	27764	100 %	0 %	0 %	0 %	556555137
63	NC_022650	G	6	6	27902	27907	0 %	0 %	100 %	0 %	556555137
64	NC_022650	A	6	6	28306	28311	100 %	0 %	0 %	0 %	556555137
65	NC_022650	A	6	6	31246	31251	100 %	0 %	0 %	0 %	556555141
66	NC_022650	A	6	6	32057	32062	100 %	0 %	0 %	0 %	556555142
67	NC_022650	A	6	6	32117	32122	100 %	0 %	0 %	0 %	556555142
68	NC_022650	T	7	7	32449	32455	0 %	100 %	0 %	0 %	556555143
69	NC_022650	T	6	6	32467	32472	0 %	100 %	0 %	0 %	556555143
70	NC_022650	A	6	6	32485	32490	100 %	0 %	0 %	0 %	556555143
71	NC_022650	A	6	6	33963	33968	100 %	0 %	0 %	0 %	556555144
72	NC_022650	A	6	6	34009	34014	100 %	0 %	0 %	0 %	556555144
73	NC_022650	A	6	6	34640	34645	100 %	0 %	0 %	0 %	556555145
74	NC_022650	T	6	6	34982	34987	0 %	100 %	0 %	0 %	556555146
75	NC_022650	T	7	7	35449	35455	0 %	100 %	0 %	0 %	556555146
76	NC_022650	A	6	6	35649	35654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022650	T	6	6	35990	35995	0 %	100 %	0 %	0 %	556555147
78	NC_022650	T	8	8	36193	36200	0 %	100 %	0 %	0 %	556555148
79	NC_022650	T	6	6	36246	36251	0 %	100 %	0 %	0 %	556555148
80	NC_022650	T	6	6	36319	36324	0 %	100 %	0 %	0 %	556555148
81	NC_022650	T	7	7	37901	37907	0 %	100 %	0 %	0 %	556555152
82	NC_022650	T	6	6	38781	38786	0 %	100 %	0 %	0 %	556555155
83	NC_022650	A	7	7	39390	39396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022650	T	7	7	39435	39441	0 %	100 %	0 %	0 %	556555156
85	NC_022650	T	6	6	39853	39858	0 %	100 %	0 %	0 %	556555156
86	NC_022650	T	6	6	40979	40984	0 %	100 %	0 %	0 %	556555159
87	NC_022650	T	6	6	41858	41863	0 %	100 %	0 %	0 %	556555160
88	NC_022650	T	6	6	41944	41949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022650	A	6	6	41994	41999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022650	T	6	6	42352	42357	0 %	100 %	0 %	0 %	556555161
91	NC_022650	T	6	6	43103	43108	0 %	100 %	0 %	0 %	556555162
92	NC_022650	A	6	6	43522	43527	100 %	0 %	0 %	0 %	556555162
93	NC_022650	T	6	6	43926	43931	0 %	100 %	0 %	0 %	556555162
94	NC_022650	T	8	8	44011	44018	0 %	100 %	0 %	0 %	556555163
95	NC_022650	T	6	6	44663	44668	0 %	100 %	0 %	0 %	556555165
96	NC_022650	A	6	6	44777	44782	100 %	0 %	0 %	0 %	556555165
97	NC_022650	T	6	6	46754	46759	0 %	100 %	0 %	0 %	556555169
98	NC_022650	T	6	6	46832	46837	0 %	100 %	0 %	0 %	556555169
99	NC_022650	T	6	6	47294	47299	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
100	NC_022650	T	6	6	47330	47335	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
101	NC_022650	T	6	6	48095	48100	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
102	NC_022650	T	7	7	48586	48592	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
103	NC_022650	T	7	7	48711	48717	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
104	NC_022650	T	6	6	50341	50346	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
105	NC_022650	T	6	6	50941	50946	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
106	NC_022650	T	6	6	51182	51187	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
107	NC_022650	T	6	6	51511	51516	0 %	100 %	0 %	0 %	556555102
108	NC_022650	T	6	6	51886	51891	0 %	100 %	0 %	0 %	556555102
109	NC_022650	T	6	6	52582	52587	0 %	100 %	0 %	0 %	556555102
110	NC_022650	T	7	7	53244	53250	0 %	100 %	0 %	0 %	556555102
111	NC_022650	T	6	6	53956	53961	0 %	100 %	0 %	0 %	556555173
112	NC_022650	T	6	6	54021	54026	0 %	100 %	0 %	0 %	556555173
113	NC_022650	C	6	6	54390	54395	0 %	0 %	0 %	100 %	556555174
114	NC_022650	T	6	6	54633	54638	0 %	100 %	0 %	0 %	556555174

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.