MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022650	GGATGT	2	12	1690	1701	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	556555104
2	NC_022650	GCTACA	2	12	1794	1805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556555104
3	NC_022650	GATATG	2	12	3041	3052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555104
4	NC_022650	TTTTAA	2	12	4533	4544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555106
5	NC_022650	CAAGGC	2	12	9429	9440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555113
6	NC_022650	CTGCAG	2	12	12179	12190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556555117
7	NC_022650	ATCTCT	2	12	22733	22744	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022650	GTTCTT	2	12	24761	24772	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556555134
9	NC_022650	TACGGT	2	12	27023	27034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556555136
10	NC_022650	TATGAG	2	12	27720	27731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555136
11	NC_022650	GCAATG	2	12	30028	30039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556555140
12	NC_022650	GCTGCA	2	12	33071	33082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556555143
13	NC_022650	TAGCTG	2	12	34159	34170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556555145
14	NC_022650	AAAAGA	2	12	36852	36863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	556555149
15	NC_022650	ACTGAG	2	12	43597	43608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556555162
16	NC_022650	CCTTCA	2	12	47707	47718	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	556555170
17	NC_022650	CTGCAG	2	12	48718	48729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556555170
18	NC_022650	TTTCAA	2	12	52791	52802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	556555102
19	NC_022650	CTTCTC	2	12	54053	54064	0 %	50 %	0 %	50 %	556555173

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.