MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p4

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021989	ATA	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230078
2	NC_021989	AGA	2	6	123	128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
3	NC_021989	TAA	2	6	206	211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230078
4	NC_021989	ATT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230078
5	NC_021989	GAA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
6	NC_021989	AGA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
7	NC_021989	AGA	2	6	498	503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
8	NC_021989	GAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
9	NC_021989	ATA	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230078
10	NC_021989	AGG	2	6	752	757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021989	ATT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230079
12	NC_021989	TTA	2	6	865	870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230079
13	NC_021989	GAA	2	6	1048	1053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
14	NC_021989	AAC	2	6	1070	1075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230079
15	NC_021989	AAT	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230079
16	NC_021989	CAA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230079
17	NC_021989	GAA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
18	NC_021989	AGA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
19	NC_021989	ACT	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230079
20	NC_021989	GAA	2	6	1237	1242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
21	NC_021989	GAA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
22	NC_021989	TGG	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230079
23	NC_021989	TCT	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230080
24	NC_021989	ATT	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230080
25	NC_021989	ACA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230080
26	NC_021989	GAA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230080
27	NC_021989	AGC	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021989	AAG	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021989	TAA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
30	NC_021989	AAT	2	6	1816	1821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
31	NC_021989	AAT	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
32	NC_021989	ATA	2	6	2021	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
33	NC_021989	ATT	2	6	2044	2049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230081
34	NC_021989	GTT	2	6	2141	2146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529230081
35	NC_021989	TCC	2	6	2258	2263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230081
36	NC_021989	ATT	2	6	2285	2290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021989	TTA	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230082
38	NC_021989	GGA	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230082
39	NC_021989	GGA	3	9	2515	2523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230082
40	NC_021989	AGA	2	6	2535	2540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230082
41	NC_021989	TCT	2	6	2548	2553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230082
42	NC_021989	TGC	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230082
43	NC_021989	GGC	2	6	2575	2580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529230082
44	NC_021989	TAC	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230082
45	NC_021989	CTA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
46	NC_021989	GAT	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230083
47	NC_021989	CTG	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230083
48	NC_021989	TAA	2	6	3158	3163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
49	NC_021989	CTA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
50	NC_021989	TAC	2	6	3410	3415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
51	NC_021989	TCT	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230083
52	NC_021989	GTA	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230083
53	NC_021989	TAA	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
54	NC_021989	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
55	NC_021989	ACT	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
56	NC_021989	ACA	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230083
57	NC_021989	AGA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
58	NC_021989	ACT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
59	NC_021989	AGA	2	6	3946	3951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
60	NC_021989	TAT	2	6	3965	3970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
61	NC_021989	AAT	2	6	4002	4007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
62	NC_021989	CTG	2	6	4066	4071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230083
63	NC_021989	GAA	2	6	4128	4133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
64	NC_021989	TAA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
65	NC_021989	AGA	2	6	4235	4240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
66	NC_021989	CTC	3	9	4264	4272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230083
67	NC_021989	TAA	3	9	4328	4336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
68	NC_021989	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
69	NC_021989	ATT	2	6	4439	4444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
70	NC_021989	TGG	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230083
71	NC_021989	ATT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
72	NC_021989	ATT	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
73	NC_021989	ATT	2	6	4664	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
74	NC_021989	TAA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
75	NC_021989	CTA	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
76	NC_021989	TAA	2	6	4879	4884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
77	NC_021989	TAT	3	9	4898	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
78	NC_021989	TAA	2	6	4984	4989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230084
79	NC_021989	TAT	2	6	5038	5043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230084
80	NC_021989	ACT	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230084
81	NC_021989	AAT	2	6	5084	5089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230084
82	NC_021989	GAA	2	6	5172	5177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230084
83	NC_021989	CTT	2	6	5210	5215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230084
84	NC_021989	TTA	2	6	5294	5299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230084
85	NC_021989	AAC	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230084
86	NC_021989	CAC	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021989	AAT	2	6	5652	5657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021989	TAA	2	6	5662	5667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021989	AGG	2	6	5670	5675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021989	GAA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230085
91	NC_021989	TAA	2	6	5913	5918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230086
92	NC_021989	TTC	2	6	6294	6299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230087
93	NC_021989	GTG	2	6	6531	6536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230087
94	NC_021989	CAA	2	6	6628	6633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230087
95	NC_021989	CTT	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230088
96	NC_021989	GAC	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230088
97	NC_021989	AGA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230088
98	NC_021989	AAC	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230088
99	NC_021989	AAC	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230088
100	NC_021989	GAA	2	6	7477	7482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230088
101	NC_021989	AAC	2	6	7489	7494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230088
102	NC_021989	ACC	2	6	7513	7518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529230088
103	NC_021989	AAC	2	6	7571	7576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021989	TTA	2	6	7991	7996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230089
105	NC_021989	AGA	2	6	8257	8262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230089
106	NC_021989	GAA	3	9	8309	8317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230089
107	NC_021989	ACA	2	6	8329	8334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230089
108	NC_021989	CAA	2	6	8369	8374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230089
109	NC_021989	CAA	3	9	8453	8461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230089
110	NC_021989	CTT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021989	AAG	2	6	8645	8650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021989	CCT	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021989	TTA	2	6	8721	8726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021989	GTT	2	6	8779	8784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021989	CCT	2	6	8887	8892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021989	AAC	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021989	GGA	2	6	9023	9028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021989	TAA	3	9	9106	9114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.