MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TC	3	6	1050	1055	0 %	50 %	0 %	50 %	529229873
2	NC_021987	AT	3	6	1162	1167	50 %	50 %	0 %	0 %	529229873
3	NC_021987	AT	3	6	1449	1454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021987	AT	3	6	1530	1535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021987	TA	3	6	2408	2413	50 %	50 %	0 %	0 %	529229875
6	NC_021987	AG	3	6	2843	2848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021987	AT	3	6	3511	3516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021987	TA	3	6	3708	3713	50 %	50 %	0 %	0 %	529229876
9	NC_021987	CA	3	6	3834	3839	50 %	0 %	0 %	50 %	529229876
10	NC_021987	TA	3	6	3885	3890	50 %	50 %	0 %	0 %	529229876
11	NC_021987	TA	3	6	4990	4995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021987	TA	3	6	5012	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021987	AT	3	6	5098	5103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021987	TA	3	6	5741	5746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021987	TC	3	6	5784	5789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021987	TA	3	6	5801	5806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021987	AT	3	6	6061	6066	50 %	50 %	0 %	0 %	529229878
18	NC_021987	TA	3	6	6103	6108	50 %	50 %	0 %	0 %	529229878
19	NC_021987	AG	3	6	6770	6775	50 %	0 %	50 %	0 %	529229878
20	NC_021987	TA	3	6	7079	7084	50 %	50 %	0 %	0 %	529229878
21	NC_021987	TA	3	6	8753	8758	50 %	50 %	0 %	0 %	529229880
22	NC_021987	TA	3	6	9846	9851	50 %	50 %	0 %	0 %	529229881
23	NC_021987	CT	3	6	10349	10354	0 %	50 %	0 %	50 %	529229881
24	NC_021987	CA	3	6	10558	10563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021987	AT	3	6	10582	10587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021987	GC	3	6	11495	11500	0 %	0 %	50 %	50 %	529229882
27	NC_021987	TA	3	6	13025	13030	50 %	50 %	0 %	0 %	529229884
28	NC_021987	CT	3	6	13416	13421	0 %	50 %	0 %	50 %	529229884
29	NC_021987	TC	3	6	13532	13537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021987	TC	3	6	13732	13737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021987	TC	3	6	13985	13990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021987	TA	3	6	14123	14128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021987	AC	3	6	15489	15494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021987	AT	3	6	15919	15924	50 %	50 %	0 %	0 %	529229887
35	NC_021987	AT	3	6	17131	17136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021987	TC	3	6	17422	17427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021987	AC	3	6	19609	19614	50 %	0 %	0 %	50 %	529229892
38	NC_021987	CT	3	6	20742	20747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021987	AT	3	6	20788	20793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021987	GT	3	6	22102	22107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021987	AC	3	6	22121	22126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021987	TA	4	8	22266	22273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021987	CT	4	8	22494	22501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021987	AG	3	6	22627	22632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021987	TA	3	6	23090	23095	50 %	50 %	0 %	0 %	529229896
46	NC_021987	AT	3	6	23236	23241	50 %	50 %	0 %	0 %	529229896
47	NC_021987	AG	3	6	23337	23342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021987	TC	3	6	23867	23872	0 %	50 %	0 %	50 %	529229897
49	NC_021987	CG	3	6	24259	24264	0 %	0 %	50 %	50 %	529229899
50	NC_021987	AG	3	6	24284	24289	50 %	0 %	50 %	0 %	529229899
51	NC_021987	AT	4	8	25017	25024	50 %	50 %	0 %	0 %	529229900
52	NC_021987	TA	3	6	25456	25461	50 %	50 %	0 %	0 %	529229901
53	NC_021987	TA	3	6	25867	25872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021987	AT	3	6	27520	27525	50 %	50 %	0 %	0 %	529229902
55	NC_021987	TA	3	6	27959	27964	50 %	50 %	0 %	0 %	529229902
56	NC_021987	AT	4	8	29578	29585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021987	AC	3	6	30001	30006	50 %	0 %	0 %	50 %	529229905
58	NC_021987	TA	3	6	30271	30276	50 %	50 %	0 %	0 %	529229905
59	NC_021987	CT	3	6	30298	30303	0 %	50 %	0 %	50 %	529229905
60	NC_021987	AT	3	6	30549	30554	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
61	NC_021987	TA	4	8	30650	30657	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
62	NC_021987	TA	3	6	30761	30766	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
63	NC_021987	AT	3	6	30781	30786	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
64	NC_021987	TA	3	6	31584	31589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021987	TC	3	6	31776	31781	0 %	50 %	0 %	50 %	529229907
66	NC_021987	TA	4	8	31848	31855	50 %	50 %	0 %	0 %	529229907
67	NC_021987	CT	3	6	32382	32387	0 %	50 %	0 %	50 %	529229907
68	NC_021987	AT	3	6	32422	32427	50 %	50 %	0 %	0 %	529229907
69	NC_021987	CT	4	8	34201	34208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021987	GC	3	6	36264	36269	0 %	0 %	50 %	50 %	529229912
71	NC_021987	TG	3	6	38273	38278	0 %	50 %	50 %	0 %	529229914
72	NC_021987	AT	3	6	39461	39466	50 %	50 %	0 %	0 %	529229916
73	NC_021987	TC	3	6	40188	40193	0 %	50 %	0 %	50 %	529229916
74	NC_021987	GA	3	6	40402	40407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021987	TA	3	6	40693	40698	50 %	50 %	0 %	0 %	529229917
76	NC_021987	TA	3	6	41321	41326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021987	CT	3	6	41767	41772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021987	TG	3	6	41805	41810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021987	AC	3	6	43209	43214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021987	AC	3	6	43229	43234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021987	TA	3	6	43551	43556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021987	TG	3	6	44891	44896	0 %	50 %	50 %	0 %	529229921
83	NC_021987	AT	3	6	45793	45798	50 %	50 %	0 %	0 %	529229922
84	NC_021987	AT	3	6	45997	46002	50 %	50 %	0 %	0 %	529229922
85	NC_021987	TC	3	6	46302	46307	0 %	50 %	0 %	50 %	529229922
86	NC_021987	AT	3	6	47271	47276	50 %	50 %	0 %	0 %	529229923
87	NC_021987	AT	3	6	47538	47543	50 %	50 %	0 %	0 %	529229923
88	NC_021987	AT	3	6	47775	47780	50 %	50 %	0 %	0 %	529229923
89	NC_021987	AT	3	6	48216	48221	50 %	50 %	0 %	0 %	529247612
90	NC_021987	AT	3	6	49046	49051	50 %	50 %	0 %	0 %	529229926
91	NC_021987	CT	3	6	49086	49091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021987	GT	3	6	49283	49288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021987	TA	3	6	51337	51342	50 %	50 %	0 %	0 %	529229930
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95	NC_021987	AT	3	6	51776	51781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021987	GT	3	6	51892	51897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021987	AT	3	6	53572	53577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021987	AT	3	6	53808	53813	50 %	50 %	0 %	0 %	529229935
99	NC_021987	CT	3	6	54359	54364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021987	AT	3	6	54558	54563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021987	TA	3	6	55295	55300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021987	TA	3	6	55689	55694	50 %	50 %	0 %	0 %	529229937
103	NC_021987	AT	3	6	56059	56064	50 %	50 %	0 %	0 %	529229938
104	NC_021987	TA	3	6	56145	56150	50 %	50 %	0 %	0 %	529229938
105	NC_021987	TA	5	10	56441	56450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021987	TA	5	10	56471	56480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021987	TA	3	6	57002	57007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021987	AT	4	8	57316	57323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021987	TA	3	6	57507	57512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021987	AT	4	8	57530	57537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021987	TA	3	6	57661	57666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021987	CT	3	6	58727	58732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021987	AG	3	6	58748	58753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021987	GA	3	6	58796	58801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021987	AT	4	8	58942	58949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021987	TA	3	6	59063	59068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021987	AT	3	6	59651	59656	50 %	50 %	0 %	0 %	529229942
118	NC_021987	TA	3	6	60027	60032	50 %	50 %	0 %	0 %	529229942
119	NC_021987	AT	3	6	60671	60676	50 %	50 %	0 %	0 %	529229942
120	NC_021987	TA	3	6	60931	60936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021987	TA	4	8	61046	61053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021987	CT	3	6	61307	61312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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124	NC_021987	TC	3	6	64714	64719	0 %	50 %	0 %	50 %	529229948
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129	NC_021987	AT	3	6	66950	66955	50 %	50 %	0 %	0 %	529229952
130	NC_021987	TA	3	6	67007	67012	50 %	50 %	0 %	0 %	529229952
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132	NC_021987	TC	3	6	67810	67815	0 %	50 %	0 %	50 %	529229953
133	NC_021987	CA	3	6	67868	67873	50 %	0 %	0 %	50 %	529229953
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136	NC_021987	TA	3	6	70071	70076	50 %	50 %	0 %	0 %	529229955
137	NC_021987	AT	3	6	71036	71041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_021987	TA	3	6	72028	72033	50 %	50 %	0 %	0 %	529229957
140	NC_021987	AT	3	6	72105	72110	50 %	50 %	0 %	0 %	529229957
141	NC_021987	TA	3	6	72188	72193	50 %	50 %	0 %	0 %	529229957
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145	NC_021987	AT	3	6	74140	74145	50 %	50 %	0 %	0 %	529229962
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148	NC_021987	TA	3	6	74743	74748	50 %	50 %	0 %	0 %	529229963
149	NC_021987	GT	3	6	75120	75125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.