MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TGCT	2	8	77	84	0 %	50 %	25 %	25 %	529229872
2	NC_021987	GATA	2	8	532	539	50 %	25 %	25 %	0 %	529229872
3	NC_021987	TCAT	2	8	659	666	25 %	50 %	0 %	25 %	529229872
4	NC_021987	TAAA	2	8	810	817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021987	TTTC	2	8	1125	1132	0 %	75 %	0 %	25 %	529229873
6	NC_021987	TGTA	2	8	2483	2490	25 %	50 %	25 %	0 %	529229875
7	NC_021987	AAAT	2	8	2677	2684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021987	AAAT	2	8	3489	3496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021987	GTTG	2	8	3605	3612	0 %	50 %	50 %	0 %	529229876
10	NC_021987	TTGG	2	8	4136	4143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021987	TAAA	2	8	4531	4538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021987	AATA	2	8	4587	4594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021987	TCCC	2	8	5721	5728	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_021987	TTCT	2	8	5816	5823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021987	ATTT	2	8	5891	5898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021987	AAAT	2	8	5937	5944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021987	ATCA	2	8	6140	6147	50 %	25 %	0 %	25 %	529229878
18	NC_021987	TGAG	2	8	6203	6210	25 %	25 %	50 %	0 %	529229878
19	NC_021987	TCTA	2	8	6360	6367	25 %	50 %	0 %	25 %	529229878
20	NC_021987	AGTC	2	8	6966	6973	25 %	25 %	25 %	25 %	529229878
21	NC_021987	CGAC	2	8	7357	7364	25 %	0 %	25 %	50 %	529229879
22	NC_021987	GTCC	2	8	7409	7416	0 %	25 %	25 %	50 %	529229879
23	NC_021987	AAAT	2	8	7461	7468	75 %	25 %	0 %	0 %	529229879
24	NC_021987	CATT	2	8	7569	7576	25 %	50 %	0 %	25 %	529229879
25	NC_021987	TACT	2	8	7873	7880	25 %	50 %	0 %	25 %	529229879
26	NC_021987	TAAT	2	8	8537	8544	50 %	50 %	0 %	0 %	529229880
27	NC_021987	GTAA	2	8	9250	9257	50 %	25 %	25 %	0 %	529229880
28	NC_021987	TTAA	2	8	9587	9594	50 %	50 %	0 %	0 %	529229881
29	NC_021987	ATTT	2	8	9824	9831	25 %	75 %	0 %	0 %	529229881
30	NC_021987	TAAT	2	8	10007	10014	50 %	50 %	0 %	0 %	529229881
31	NC_021987	ACTT	2	8	10611	10618	25 %	50 %	0 %	25 %	529229882
32	NC_021987	TTCA	2	8	10653	10660	25 %	50 %	0 %	25 %	529229882
33	NC_021987	TAAA	2	8	11106	11113	75 %	25 %	0 %	0 %	529229882
34	NC_021987	GATT	2	8	11174	11181	25 %	50 %	25 %	0 %	529229882
35	NC_021987	CGCT	2	8	11336	11343	0 %	25 %	25 %	50 %	529229882
36	NC_021987	GATC	2	8	11507	11514	25 %	25 %	25 %	25 %	529229882
37	NC_021987	TCTT	2	8	12165	12172	0 %	75 %	0 %	25 %	529229883
38	NC_021987	TTGC	2	8	12181	12188	0 %	50 %	25 %	25 %	529229883
39	NC_021987	TTTG	2	8	12264	12271	0 %	75 %	25 %	0 %	529229883
40	NC_021987	AAAC	2	8	12639	12646	75 %	0 %	0 %	25 %	529229883
41	NC_021987	TTGA	2	8	12999	13006	25 %	50 %	25 %	0 %	529229884
42	NC_021987	TTGA	2	8	13505	13512	25 %	50 %	25 %	0 %	529229884
43	NC_021987	AACC	2	8	14367	14374	50 %	0 %	0 %	50 %	529229885
44	NC_021987	TCTT	2	8	15068	15075	0 %	75 %	0 %	25 %	529229885
45	NC_021987	TGAT	2	8	15082	15089	25 %	50 %	25 %	0 %	529229885
46	NC_021987	TGAA	2	8	15293	15300	50 %	25 %	25 %	0 %	529229886
47	NC_021987	AGTT	2	8	15569	15576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021987	AAAT	2	8	15804	15811	75 %	25 %	0 %	0 %	529229887
49	NC_021987	TTGG	2	8	15866	15873	0 %	50 %	50 %	0 %	529229887
50	NC_021987	CAAT	2	8	16427	16434	50 %	25 %	0 %	25 %	529229888
51	NC_021987	ATCT	3	12	16624	16635	25 %	50 %	0 %	25 %	529229888
52	NC_021987	ATTT	2	8	16646	16653	25 %	75 %	0 %	0 %	529229888
53	NC_021987	AAAG	2	8	17266	17273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021987	TCAT	2	8	17314	17321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021987	TAAA	2	8	17615	17622	75 %	25 %	0 %	0 %	529229890
56	NC_021987	ACAT	2	8	18201	18208	50 %	25 %	0 %	25 %	529229890
57	NC_021987	GGGC	2	8	18246	18253	0 %	0 %	75 %	25 %	529229890
58	NC_021987	AGGA	2	8	18272	18279	50 %	0 %	50 %	0 %	529229890
59	NC_021987	TTAC	2	8	18806	18813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021987	ATTT	2	8	19000	19007	25 %	75 %	0 %	0 %	529229891
61	NC_021987	ATGA	2	8	19518	19525	50 %	25 %	25 %	0 %	529229892
62	NC_021987	ATCA	2	8	19707	19714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021987	CTGA	2	8	19936	19943	25 %	25 %	25 %	25 %	529229893
64	NC_021987	ACGG	2	8	20194	20201	25 %	0 %	50 %	25 %	529229893
65	NC_021987	ATAC	2	8	20609	20616	50 %	25 %	0 %	25 %	529229893
66	NC_021987	ATTT	2	8	20717	20724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021987	CAAA	2	8	21034	21041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021987	TTTG	2	8	21104	21111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021987	TGAT	2	8	21113	21120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021987	TCTT	2	8	21386	21393	0 %	75 %	0 %	25 %	529229894
71	NC_021987	TAAG	2	8	21479	21486	50 %	25 %	25 %	0 %	529229894
72	NC_021987	TAGA	2	8	21599	21606	50 %	25 %	25 %	0 %	529229894
73	NC_021987	GCTT	2	8	21830	21837	0 %	50 %	25 %	25 %	529229895
74	NC_021987	TCTT	2	8	21872	21879	0 %	75 %	0 %	25 %	529229895
75	NC_021987	TGCT	2	8	21945	21952	0 %	50 %	25 %	25 %	529229895
76	NC_021987	AATA	2	8	22240	22247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021987	GAAA	2	8	22955	22962	75 %	0 %	25 %	0 %	529229896
78	NC_021987	GCCG	2	8	23731	23738	0 %	0 %	50 %	50 %	529229897
79	NC_021987	AAAG	2	8	23892	23899	75 %	0 %	25 %	0 %	529229897
80	NC_021987	ATTC	2	8	23925	23932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021987	TTGA	2	8	24353	24360	25 %	50 %	25 %	0 %	529229899
82	NC_021987	TATC	2	8	24493	24500	25 %	50 %	0 %	25 %	529229900
83	NC_021987	TTTC	2	8	24652	24659	0 %	75 %	0 %	25 %	529229900
84	NC_021987	TCTA	2	8	24913	24920	25 %	50 %	0 %	25 %	529229900
85	NC_021987	TAGA	2	8	24928	24935	50 %	25 %	25 %	0 %	529229900
86	NC_021987	TCGA	2	8	25067	25074	25 %	25 %	25 %	25 %	529229900
87	NC_021987	CATA	2	8	25207	25214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021987	TATT	2	8	25285	25292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021987	TAAA	2	8	25336	25343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021987	AAAT	2	8	25480	25487	75 %	25 %	0 %	0 %	529229901
91	NC_021987	TTCT	2	8	25523	25530	0 %	75 %	0 %	25 %	529229901
92	NC_021987	AACA	2	8	25748	25755	75 %	0 %	0 %	25 %	529229901
93	NC_021987	TTAA	2	8	25914	25921	50 %	50 %	0 %	0 %	529229902
94	NC_021987	AACC	2	8	26395	26402	50 %	0 %	0 %	50 %	529229902
95	NC_021987	ATTG	2	8	26424	26431	25 %	50 %	25 %	0 %	529229902
96	NC_021987	GATA	2	8	26683	26690	50 %	25 %	25 %	0 %	529229902
97	NC_021987	AACA	2	8	26969	26976	75 %	0 %	0 %	25 %	529229902
98	NC_021987	ATAA	2	8	27099	27106	75 %	25 %	0 %	0 %	529229902
99	NC_021987	GATA	2	8	27212	27219	50 %	25 %	25 %	0 %	529229902
100	NC_021987	CGTT	2	8	28295	28302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021987	CTGT	2	8	29213	29220	0 %	50 %	25 %	25 %	529229904
102	NC_021987	TAAC	2	8	29232	29239	50 %	25 %	0 %	25 %	529229904
103	NC_021987	TTGA	2	8	30168	30175	25 %	50 %	25 %	0 %	529229905
104	NC_021987	TTTA	2	8	30385	30392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021987	TTAA	2	8	30454	30461	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
106	NC_021987	TTAC	2	8	30540	30547	25 %	50 %	0 %	25 %	529247610
107	NC_021987	ATTA	2	8	30680	30687	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
108	NC_021987	TAGA	2	8	30730	30737	50 %	25 %	25 %	0 %	529247610
109	NC_021987	ATTT	2	8	30857	30864	25 %	75 %	0 %	0 %	529247610
110	NC_021987	CATT	2	8	30957	30964	25 %	50 %	0 %	25 %	529247610
111	NC_021987	TCTT	2	8	30977	30984	0 %	75 %	0 %	25 %	529247610
112	NC_021987	TCTT	2	8	31441	31448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021987	AATG	2	8	31694	31701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021987	CATA	2	8	31897	31904	50 %	25 %	0 %	25 %	529229907
115	NC_021987	ATTT	2	8	32001	32008	25 %	75 %	0 %	0 %	529229907
116	NC_021987	TTAA	2	8	32080	32087	50 %	50 %	0 %	0 %	529229907
117	NC_021987	TTTC	2	8	32231	32238	0 %	75 %	0 %	25 %	529229907
118	NC_021987	ATTT	2	8	32754	32761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021987	ATCA	2	8	33072	33079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021987	GATG	2	8	33297	33304	25 %	25 %	50 %	0 %	529229908
121	NC_021987	GAAA	2	8	34250	34257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021987	TCAA	2	8	34471	34478	50 %	25 %	0 %	25 %	529229910
123	NC_021987	GAAA	2	8	34571	34578	75 %	0 %	25 %	0 %	529229910
124	NC_021987	ATGG	2	8	34931	34938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021987	TTGG	2	8	35301	35308	0 %	50 %	50 %	0 %	529229911
126	NC_021987	AATC	2	8	35631	35638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021987	TTCC	2	8	35942	35949	0 %	50 %	0 %	50 %	529229912
128	NC_021987	GAGC	2	8	36357	36364	25 %	0 %	50 %	25 %	529229912
129	NC_021987	AGAA	2	8	36392	36399	75 %	0 %	25 %	0 %	529229912
130	NC_021987	CTGC	2	8	36415	36422	0 %	25 %	25 %	50 %	529229912
131	NC_021987	ATTA	2	8	37172	37179	50 %	50 %	0 %	0 %	529229913
132	NC_021987	CTTT	2	8	37647	37654	0 %	75 %	0 %	25 %	529229914
133	NC_021987	CTTC	2	8	37950	37957	0 %	50 %	0 %	50 %	529229914
134	NC_021987	GTTA	2	8	38326	38333	25 %	50 %	25 %	0 %	529229914
135	NC_021987	CATC	2	8	38627	38634	25 %	25 %	0 %	50 %	529229915
136	NC_021987	AAAT	2	8	38838	38845	75 %	25 %	0 %	0 %	529229915
137	NC_021987	GCTT	2	8	39150	39157	0 %	50 %	25 %	25 %	529229915
138	NC_021987	TTGG	2	8	39781	39788	0 %	50 %	50 %	0 %	529229916
139	NC_021987	TGCT	2	8	39853	39860	0 %	50 %	25 %	25 %	529229916
140	NC_021987	TACT	2	8	40290	40297	25 %	50 %	0 %	25 %	529229916
141	NC_021987	CATT	2	8	40341	40348	25 %	50 %	0 %	25 %	529229916
142	NC_021987	TTCA	2	8	40349	40356	25 %	50 %	0 %	25 %	529229916
143	NC_021987	AGCA	2	8	42145	42152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021987	GCTG	2	8	42363	42370	0 %	25 %	50 %	25 %	529229920
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.