MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 DNA

Total Repeats: 81475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020518	TTC	2	6	169967	169972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332383
3502	NC_020518	TGA	2	6	169975	169980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332383
3503	NC_020518	TGG	2	6	170050	170055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332383
3504	NC_020518	TCA	2	6	170094	170099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332383
3505	NC_020518	GTC	2	6	170120	170125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332383
3506	NC_020518	CAA	2	6	170128	170133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332383
3507	NC_020518	GTT	2	6	170138	170143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332383
3508	NC_020518	GGT	2	6	170453	170458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332383
3509	NC_020518	CGG	2	6	170518	170523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332383
3510	NC_020518	ATCGGT	2	12	170528	170539	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	471332383
3511	NC_020518	TGG	2	6	170583	170588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332383
3512	NC_020518	TAT	2	6	170620	170625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471332383
3513	NC_020518	TCC	2	6	170711	170716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471332383
3514	NC_020518	GTGAT	2	10	170742	170751	20 %	40 %	40 %	0 %	471332383
3515	NC_020518	CAG	2	6	170776	170781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332383
3516	NC_020518	GCA	2	6	170823	170828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332383
3517	NC_020518	GCA	2	6	170884	170889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332383
3518	NC_020518	AGC	2	6	170891	170896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332383
3519	NC_020518	CAA	2	6	170953	170958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332383
3520	NC_020518	AAC	2	6	170984	170989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332383
3521	NC_020518	GAA	2	6	171025	171030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332383
3522	NC_020518	GTGAT	2	10	171033	171042	20 %	40 %	40 %	0 %	471332383
3523	NC_020518	CAG	2	6	171056	171061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332383
3524	NC_020518	GCG	2	6	171135	171140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332383
3525	NC_020518	CAC	2	6	171227	171232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_020518	TCA	2	6	171247	171252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_020518	TACGT	2	10	171278	171287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3528	NC_020518	GGA	2	6	171315	171320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020518	TGGC	3	12	171325	171336	0 %	25 %	50 %	25 %	471332384
3530	NC_020518	CAT	2	6	171383	171388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332384
3531	NC_020518	GCG	2	6	171436	171441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332384
3532	NC_020518	GTC	2	6	171501	171506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332384
3533	NC_020518	ATG	2	6	171663	171668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332384
3534	NC_020518	TTG	2	6	171693	171698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332384
3535	NC_020518	GAA	2	6	171720	171725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332384
3536	NC_020518	TGA	2	6	171730	171735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332384
3537	NC_020518	GATC	2	8	171794	171801	25 %	25 %	25 %	25 %	471332384
3538	NC_020518	TCAA	2	8	171802	171809	50 %	25 %	0 %	25 %	471332384
3539	NC_020518	GTG	2	6	171816	171821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332384
3540	NC_020518	TTG	2	6	171826	171831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332384
3541	NC_020518	ACA	2	6	171878	171883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332384
3542	NC_020518	TAA	2	6	171914	171919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332384
3543	NC_020518	TGG	2	6	171922	171927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332384
3544	NC_020518	TGG	2	6	171949	171954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332384
3545	NC_020518	AGA	2	6	171995	172000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332384
3546	NC_020518	AAC	2	6	172018	172023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332384
3547	NC_020518	ACG	2	6	172128	172133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332384
3548	NC_020518	TGG	3	9	172135	172143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332384
3549	NC_020518	GCT	2	6	172168	172173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332384
3550	NC_020518	TGC	2	6	172288	172293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332384
3551	NC_020518	GGC	2	6	172304	172309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332384
3552	NC_020518	GTT	2	6	172352	172357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332384
3553	NC_020518	TGA	2	6	172430	172435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332384
3554	NC_020518	TGC	2	6	172441	172446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332384
3555	NC_020518	GGC	2	6	172500	172505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_020518	ATT	2	6	172569	172574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471332385
3557	NC_020518	GACT	2	8	172627	172634	25 %	25 %	25 %	25 %	471332385
3558	NC_020518	GTC	2	6	172648	172653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332385
3559	NC_020518	TCA	2	6	172712	172717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332385
3560	NC_020518	CTT	2	6	172752	172757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332385
3561	NC_020518	CGA	2	6	172782	172787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332385
3562	NC_020518	GTT	2	6	172876	172881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332385
3563	NC_020518	TTC	2	6	172912	172917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332385
3564	NC_020518	TGGCC	2	10	173003	173012	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3565	NC_020518	TTC	2	6	173046	173051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_020518	A	6	6	173078	173083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020518	GGC	2	6	173147	173152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332386
3568	NC_020518	CCACG	2	10	173180	173189	20 %	0 %	20 %	60 %	471332386
3569	NC_020518	ACCA	2	8	173268	173275	50 %	0 %	0 %	50 %	471332386
3570	NC_020518	CCG	2	6	173293	173298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332386
3571	NC_020518	TCA	2	6	173332	173337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332386
3572	NC_020518	CTT	2	6	173345	173350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332386
3573	NC_020518	ACA	2	6	173495	173500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332386
3574	NC_020518	T	7	7	173542	173548	0 %	100 %	0 %	0 %	471332386
3575	NC_020518	G	6	6	173609	173614	0 %	0 %	100 %	0 %	471332386
3576	NC_020518	ATA	2	6	173657	173662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332386
3577	NC_020518	CGC	2	6	173669	173674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332386
3578	NC_020518	TGC	2	6	173790	173795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332386
3579	NC_020518	A	6	6	173805	173810	100 %	0 %	0 %	0 %	471332386
3580	NC_020518	TCG	2	6	173888	173893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332386
3581	NC_020518	CGG	2	6	173914	173919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332386
3582	NC_020518	ATC	2	6	173926	173931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332386
3583	NC_020518	A	7	7	173944	173950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_020518	CGT	2	6	173959	173964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_020518	GCA	2	6	173998	174003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332387
3586	NC_020518	AAC	2	6	174107	174112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332387
3587	NC_020518	CCG	2	6	174121	174126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332387
3588	NC_020518	CTT	2	6	174214	174219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332387
3589	NC_020518	GC	4	8	174248	174255	0 %	0 %	50 %	50 %	471332387
3590	NC_020518	ATG	2	6	174276	174281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332387
3591	NC_020518	CGC	2	6	174310	174315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332387
3592	NC_020518	TCA	2	6	174402	174407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332387
3593	NC_020518	CCG	2	6	174478	174483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332387
3594	NC_020518	TGG	2	6	174485	174490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332387
3595	NC_020518	CTT	2	6	174505	174510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332387
3596	NC_020518	TCG	2	6	174525	174530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332387
3597	NC_020518	AG	3	6	174611	174616	50 %	0 %	50 %	0 %	471332387
3598	NC_020518	T	6	6	174626	174631	0 %	100 %	0 %	0 %	471332387
3599	NC_020518	T	6	6	174664	174669	0 %	100 %	0 %	0 %	471332387
3600	NC_020518	CAG	2	6	174695	174700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332387
3601	NC_020518	TGGC	2	8	174745	174752	0 %	25 %	50 %	25 %	471332387
3602	NC_020518	AAT	2	6	174785	174790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332387
3603	NC_020518	CTG	2	6	174800	174805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332387
3604	NC_020518	CTG	2	6	174890	174895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332388
3605	NC_020518	TTA	2	6	174903	174908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471332388
3606	NC_020518	TCT	2	6	174945	174950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332388
3607	NC_020518	CTCG	2	8	174952	174959	0 %	25 %	25 %	50 %	471332388
3608	NC_020518	CAG	2	6	175028	175033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332388
3609	NC_020518	CGGT	2	8	175074	175081	0 %	25 %	50 %	25 %	471332388
3610	NC_020518	GTG	2	6	175284	175289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332388
3611	NC_020518	CGT	2	6	175300	175305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332388
3612	NC_020518	GCG	2	6	175319	175324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332388
3613	NC_020518	CGG	2	6	175342	175347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332388
3614	NC_020518	TAA	2	6	175448	175453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332388
3615	NC_020518	GCCAG	2	10	175465	175474	20 %	0 %	40 %	40 %	471332388
3616	NC_020518	TCG	2	6	175542	175547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332388
3617	NC_020518	AGT	2	6	175563	175568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332388
3618	NC_020518	CGT	2	6	175632	175637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332388
3619	NC_020518	GCT	2	6	175639	175644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332388
3620	NC_020518	TGG	2	6	175708	175713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332388
3621	NC_020518	CTT	2	6	175771	175776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332388
3622	NC_020518	TGA	2	6	175789	175794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332388
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3624	NC_020518	CGC	3	9	175945	175953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332388
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3723	NC_020518	TGGTG	2	10	180868	180877	0 %	40 %	60 %	0 %	471332392
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3736	NC_020518	ATAA	2	8	181454	181461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3737	NC_020518	TTG	2	6	181516	181521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3738	NC_020518	GC	3	6	181543	181548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3739	NC_020518	AAATA	2	10	181609	181618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3740	NC_020518	TAA	2	6	181622	181627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3741	NC_020518	TG	4	8	181683	181690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3742	NC_020518	GTCTG	2	10	181694	181703	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3743	NC_020518	CTG	2	6	181838	181843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332393
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3746	NC_020518	GCC	2	6	182038	182043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332393
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3748	NC_020518	CGT	2	6	182057	182062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332393
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3758	NC_020518	GCA	2	6	182425	182430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332394
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3783	NC_020518	AGT	2	6	183656	183661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3785	NC_020518	A	6	6	183755	183760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3842	NC_020518	GCT	2	6	186818	186823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332398
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3862	NC_020518	GTC	2	6	188028	188033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332398
3863	NC_020518	GCA	2	6	188120	188125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332398
3864	NC_020518	AACC	2	8	188207	188214	50 %	0 %	0 %	50 %	471332398
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3982	NC_020518	CGA	2	6	194661	194666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332405
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3985	NC_020518	TG	3	6	194723	194728	0 %	50 %	50 %	0 %	471332405
3986	NC_020518	GTAAC	2	10	194786	194795	40 %	20 %	20 %	20 %	471332405
3987	NC_020518	TGA	2	6	194913	194918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332405
3988	NC_020518	GAA	2	6	194920	194925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332405
3989	NC_020518	GCC	2	6	194936	194941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332405
3990	NC_020518	TGG	2	6	195092	195097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332405
3991	NC_020518	CTG	2	6	195142	195147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332405
3992	NC_020518	ATC	2	6	195274	195279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332405
3993	NC_020518	GGC	2	6	195294	195299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332405
3994	NC_020518	CCCG	2	8	195375	195382	0 %	0 %	25 %	75 %	471332405
3995	NC_020518	AGCCG	2	10	195414	195423	20 %	0 %	40 %	40 %	471332405
3996	NC_020518	GAA	2	6	195451	195456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332405
3997	NC_020518	GC	3	6	195478	195483	0 %	0 %	50 %	50 %	471332405
3998	NC_020518	GGTGG	2	10	195523	195532	0 %	20 %	80 %	0 %	471332405
3999	NC_020518	CAT	2	6	195675	195680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332405
4000	NC_020518	GAT	2	6	195696	195701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332405

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