MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Enterobacter aerogenes EA1509E plasmid pEA1509_B

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020182	TCA	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020182	TTC	2	6	185	190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444324408
3	NC_020182	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444324408
4	NC_020182	CCG	2	6	320	325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324408
5	NC_020182	AAC	2	6	359	364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324408
6	NC_020182	ACG	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324409
7	NC_020182	GCG	2	6	524	529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324409
8	NC_020182	ATG	2	6	624	629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324409
9	NC_020182	TGA	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324409
10	NC_020182	TAA	2	6	701	706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324409
11	NC_020182	CCA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324410
12	NC_020182	CTG	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324410
13	NC_020182	CAG	2	6	837	842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324410
14	NC_020182	CCT	2	6	878	883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324410
15	NC_020182	CCA	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324410
16	NC_020182	GCC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324410
17	NC_020182	TTA	2	6	1251	1256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444324411
18	NC_020182	GCT	2	6	1267	1272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324411
19	NC_020182	GGA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444324411
20	NC_020182	CCA	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324412
21	NC_020182	CGG	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324412
22	NC_020182	TCC	2	6	1458	1463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324412
23	NC_020182	ATC	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324412
24	NC_020182	ACC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324412
25	NC_020182	TCG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324412
26	NC_020182	TCA	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324412
27	NC_020182	CAC	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324412
28	NC_020182	ATG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324412
29	NC_020182	TCC	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324412
30	NC_020182	AAC	2	6	1986	1991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324413
31	NC_020182	TGC	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324413
32	NC_020182	TCG	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324413
33	NC_020182	GCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324413
34	NC_020182	CAG	2	6	2495	2500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324413
35	NC_020182	CCA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324413
36	NC_020182	CCG	2	6	2545	2550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324413
37	NC_020182	GCC	2	6	2560	2565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324413
38	NC_020182	CCG	2	6	2578	2583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324413
39	NC_020182	ATC	3	9	2704	2712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324414
40	NC_020182	CGC	2	6	2724	2729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
41	NC_020182	CTG	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324414
42	NC_020182	CCT	2	6	2919	2924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324414
43	NC_020182	CGG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324414
44	NC_020182	CGC	2	6	3022	3027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
45	NC_020182	GCC	2	6	3050	3055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
46	NC_020182	CAG	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
47	NC_020182	ATG	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324414
48	NC_020182	TCG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324414
49	NC_020182	GCC	3	9	3373	3381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
50	NC_020182	CGC	3	9	3502	3510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
51	NC_020182	CTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324414
52	NC_020182	CGC	2	6	3562	3567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
53	NC_020182	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
54	NC_020182	CAG	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
55	NC_020182	GCG	2	6	3747	3752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324414
56	NC_020182	ACC	2	6	3782	3787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324414
57	NC_020182	TGG	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	444324414
58	NC_020182	CAG	2	6	4098	4103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
59	NC_020182	AGC	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
60	NC_020182	CAG	2	6	4135	4140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
61	NC_020182	GCA	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
62	NC_020182	TAA	2	6	4217	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324414
63	NC_020182	TAT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444324415
64	NC_020182	GGC	3	9	4731	4739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324416
65	NC_020182	GTG	2	6	4750	4755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	444324416
66	NC_020182	CAC	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324416
67	NC_020182	GGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444324417
68	NC_020182	GGC	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324417
69	NC_020182	ACC	2	6	4928	4933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020182	AGC	2	6	4946	4951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020182	TGC	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020182	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020182	TAT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020182	CCT	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020182	GCG	2	6	5383	5388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020182	ATC	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324418
77	NC_020182	CTG	2	6	5803	5808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020182	GCA	2	6	5869	5874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020182	ACC	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324419
80	NC_020182	GGT	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	444324419
81	NC_020182	AAG	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444324419
82	NC_020182	AGG	2	6	6160	6165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444324420
83	NC_020182	AGA	2	6	6225	6230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444324420
84	NC_020182	ATC	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020182	TTA	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444324421
86	NC_020182	CAT	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324421
87	NC_020182	CAC	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324421
88	NC_020182	ACC	4	12	6809	6820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324422
89	NC_020182	AAT	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324422
90	NC_020182	ATC	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324422
91	NC_020182	CAG	2	6	7222	7227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324422
92	NC_020182	AGC	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324422
93	NC_020182	CTG	2	6	7370	7375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324422
94	NC_020182	TCC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324422
95	NC_020182	ACC	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324422
96	NC_020182	AAT	2	6	7544	7549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324422
97	NC_020182	CCA	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324422
98	NC_020182	TGC	2	6	7707	7712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324422
99	NC_020182	CAT	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324422
100	NC_020182	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324422
101	NC_020182	GCA	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324422
102	NC_020182	CCA	2	6	8052	8057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020182	ACC	2	6	8093	8098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020182	CCG	2	6	8109	8114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_020182	CGT	2	6	8165	8170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020182	ACC	3	9	8201	8209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_020182	TGA	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020182	ACC	2	6	8261	8266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020182	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324423
110	NC_020182	GTT	2	6	8623	8628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444324423
111	NC_020182	TGA	2	6	8653	8658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324423
112	NC_020182	GCA	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
113	NC_020182	ACA	2	6	8882	8887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324424
114	NC_020182	ATG	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324424
115	NC_020182	GCA	2	6	8968	8973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
116	NC_020182	CAG	2	6	8981	8986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
117	NC_020182	GCA	2	6	9051	9056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
118	NC_020182	CGG	2	6	9197	9202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020182	CAA	2	6	9220	9225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.