MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Enterobacter aerogenes EA1509E plasmid pEA1509_A

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020180	CAAAGA	2	12	15	26	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	444324185
2	NC_020180	GGTGAA	2	12	234	245	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	444324185
3	NC_020180	TGCCAA	2	12	2371	2382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	444324188
4	NC_020180	GAGCTT	2	12	6463	6474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	444324195
5	NC_020180	ACGGCC	2	12	16871	16882	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	444324217
6	NC_020180	TGCTTT	2	12	16960	16971	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	444324217
7	NC_020180	ACAAAG	2	12	21317	21328	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	444324225
8	NC_020180	ATCAAG	2	12	21736	21747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	444324226
9	NC_020180	TCGAAG	2	12	21830	21841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	444324226
10	NC_020180	AGCAGG	2	12	24313	24324	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	444324230
11	NC_020180	TCAAAG	2	12	25543	25554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	444324232
12	NC_020180	TCGCCG	2	12	25945	25956	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	444324234
13	NC_020180	CAGTGT	2	12	26772	26783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	444324235
14	NC_020180	GGGGCA	2	12	30177	30188	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020180	ACTACG	2	12	33008	33019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	444324249
16	NC_020180	GGAAGC	2	12	37375	37386	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	444324257
17	NC_020180	TGGATC	2	12	41084	41095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	444324264
18	NC_020180	CCGGAG	2	12	43545	43556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	444324269
19	NC_020180	GAACTC	2	12	44072	44083	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	444324269
20	NC_020180	GCCTTT	2	12	45801	45812	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	444324271
21	NC_020180	GATGGC	2	12	49452	49463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	444324273
22	NC_020180	GAAAGC	2	12	54041	54052	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	444324280
23	NC_020180	AGCGGA	2	12	58063	58074	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	444324286
24	NC_020180	CTCTTC	2	12	58433	58444	0 %	50 %	0 %	50 %	444324287
25	NC_020180	GCATGG	2	12	64938	64949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	444324289
26	NC_020180	GGGACC	2	12	66628	66639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	444324290
27	NC_020180	CAATCG	2	12	67831	67842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	444324291
28	NC_020180	GACAAA	2	12	69714	69725	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	444324293
29	NC_020180	AGGTAG	2	12	74615	74626	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	444324297
30	NC_020180	TGCCGG	2	12	84585	84596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	444324308
31	NC_020180	CGCAAT	2	12	86724	86735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020180	GGTGCT	2	12	104624	104635	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	444324341
33	NC_020180	CAGTAC	2	12	106229	106240	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	444324342
34	NC_020180	AGCTAC	2	12	107705	107716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	444324342
35	NC_020180	GCTATG	2	12	108321	108332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	444324342
36	NC_020180	CCTATG	2	12	108978	108989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	444324342
37	NC_020180	TCTGAA	2	12	109618	109629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	444324343
38	NC_020180	TTAAAG	2	12	110030	110041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020180	GCCGCA	2	12	110615	110626	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	444324345
40	NC_020180	AAACAA	2	12	112219	112230	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020180	TAAGCT	2	12	115872	115883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020180	CTGGTC	2	12	116228	116239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324354
43	NC_020180	GACGGT	2	12	118992	119003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	444324358
44	NC_020180	TGCCTG	2	12	135044	135055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324377
45	NC_020180	CGTGGG	2	12	137464	137475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	444324379
46	NC_020180	TTACCT	2	12	139272	139283	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444324380
47	NC_020180	AGCGCG	2	12	140371	140382	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	444324382
48	NC_020180	GGCAGG	2	12	140456	140467	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	444324382
49	NC_020180	GACCAG	2	12	143455	143466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324387
50	NC_020180	CCCCTC	2	12	145825	145836	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
51	NC_020180	CACCGG	2	12	152450	152461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	444324396
52	NC_020180	CCTTGG	2	12	157561	157572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324399

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.