MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O78

Total Repeats: 98697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020163	T	6	6	239749	239754	0 %	100 %	0 %	0 %	443615545
5002	NC_020163	T	6	6	239759	239764	0 %	100 %	0 %	0 %	443615545
5003	NC_020163	AT	3	6	239775	239780	50 %	50 %	0 %	0 %	443615545
5004	NC_020163	ACA	2	6	239895	239900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_020163	TA	4	8	239907	239914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020163	GCAAT	2	10	239916	239925	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_020163	GGC	2	6	239993	239998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_020163	CAA	2	6	240110	240115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	443615546
5009	NC_020163	TTC	2	6	240141	240146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615546
5010	NC_020163	AAT	2	6	240165	240170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	443615546
5011	NC_020163	CTTCG	2	10	240294	240303	0 %	40 %	20 %	40 %	443615546
5012	NC_020163	CGC	2	6	240390	240395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615546
5013	NC_020163	ACA	2	6	240512	240517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	443615546
5014	NC_020163	TCA	2	6	240580	240585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615546
5015	NC_020163	AGC	2	6	240638	240643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615546
5016	NC_020163	CAC	2	6	240710	240715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	443615546
5017	NC_020163	TAAAT	2	10	240732	240741	60 %	40 %	0 %	0 %	443615546
5018	NC_020163	ATA	2	6	240880	240885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	443615546
5019	NC_020163	TA	3	6	240895	240900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_020163	TGA	2	6	240912	240917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020163	ATAA	2	8	240919	240926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020163	TTA	2	6	240932	240937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020163	CTG	2	6	240954	240959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	443615547
5024	NC_020163	TCC	2	6	241010	241015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	443615547
5025	NC_020163	ACC	2	6	241033	241038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	443615547
5026	NC_020163	ACAT	2	8	241046	241053	50 %	25 %	0 %	25 %	443615547
5027	NC_020163	GGT	2	6	241063	241068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615547
5028	NC_020163	TCT	2	6	241070	241075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615547
5029	NC_020163	TCA	2	6	241142	241147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615547
5030	NC_020163	TGAG	2	8	241167	241174	25 %	25 %	50 %	0 %	443615547
5031	NC_020163	ACCTT	2	10	241175	241184	20 %	40 %	0 %	40 %	443615547
5032	NC_020163	TCA	2	6	241197	241202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615547
5033	NC_020163	CGC	2	6	241251	241256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615547
5034	NC_020163	TGC	2	6	241311	241316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_020163	TCA	2	6	241320	241325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_020163	GGTT	2	8	241344	241351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020163	AGA	2	6	241366	241371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_020163	GCC	2	6	241387	241392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_020163	GGAT	2	8	241394	241401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_020163	CGT	2	6	241415	241420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_020163	TGT	2	6	241504	241509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_020163	CCG	2	6	241590	241595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_020163	CAC	2	6	241645	241650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_020163	CAT	3	9	241746	241754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_020163	GTTT	2	8	241779	241786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_020163	ACG	2	6	241834	241839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_020163	A	7	7	241941	241947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020163	TCT	2	6	241993	241998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615548
5049	NC_020163	TCT	2	6	242108	242113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615548
5050	NC_020163	GGT	2	6	242128	242133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615548
5051	NC_020163	CGT	2	6	242163	242168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	443615548
5052	NC_020163	GGCA	2	8	242175	242182	25 %	0 %	50 %	25 %	443615548
5053	NC_020163	CAA	2	6	242196	242201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	443615548
5054	NC_020163	TCA	2	6	242225	242230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615548
5055	NC_020163	CAGGG	2	10	242283	242292	20 %	0 %	60 %	20 %	443615548
5056	NC_020163	CTG	2	6	242301	242306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	443615548
5057	NC_020163	CTT	2	6	242334	242339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615548
5058	NC_020163	TTTG	2	8	242385	242392	0 %	75 %	25 %	0 %	443615548
5059	NC_020163	T	7	7	242413	242419	0 %	100 %	0 %	0 %	443615548
5060	NC_020163	CAGG	2	8	242460	242467	25 %	0 %	50 %	25 %	443615548
5061	NC_020163	CTG	2	6	242537	242542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	443615548
5062	NC_020163	ATCA	2	8	242560	242567	50 %	25 %	0 %	25 %	443615548
5063	NC_020163	TGG	2	6	242568	242573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615548
5064	NC_020163	GAA	2	6	242579	242584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	443615548
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5068	NC_020163	CAG	2	6	242773	242778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615549
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5071	NC_020163	TGA	2	6	242959	242964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615549
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5073	NC_020163	T	6	6	243035	243040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020163	GCC	2	6	243080	243085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615550
5075	NC_020163	TCTG	2	8	243102	243109	0 %	50 %	25 %	25 %	443615550
5076	NC_020163	CGA	2	6	243180	243185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615550
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5079	NC_020163	TGAA	2	8	243384	243391	50 %	25 %	25 %	0 %	443615550
5080	NC_020163	ACA	2	6	243471	243476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	443615550
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5090	NC_020163	TGG	2	6	244054	244059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615551
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5096	NC_020163	GGC	2	6	244271	244276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615551
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5099	NC_020163	GCA	2	6	244353	244358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615551
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5107	NC_020163	CAT	2	6	244748	244753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615551
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5109	NC_020163	ATG	2	6	244882	244887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615551
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5113	NC_020163	TA	3	6	245113	245118	50 %	50 %	0 %	0 %	443615551
5114	NC_020163	TCA	2	6	245124	245129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615551
5115	NC_020163	AT	3	6	245145	245150	50 %	50 %	0 %	0 %	443615551
5116	NC_020163	CA	3	6	245156	245161	50 %	0 %	0 %	50 %	443615551
5117	NC_020163	A	7	7	245178	245184	100 %	0 %	0 %	0 %	443615551
5118	NC_020163	AGAA	2	8	245195	245202	75 %	0 %	25 %	0 %	443615551
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5124	NC_020163	GATA	2	8	245424	245431	50 %	25 %	25 %	0 %	443615551
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5126	NC_020163	ATGT	2	8	245520	245527	25 %	50 %	25 %	0 %	443615551
5127	NC_020163	TAATT	2	10	245624	245633	40 %	60 %	0 %	0 %	443615551
5128	NC_020163	ATG	3	9	245791	245799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615551
5129	NC_020163	GCAG	2	8	245967	245974	25 %	0 %	50 %	25 %	443615551
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5140	NC_020163	GTTTT	2	10	246505	246514	0 %	80 %	20 %	0 %	443615551
5141	NC_020163	A	6	6	246625	246630	100 %	0 %	0 %	0 %	443615551
5142	NC_020163	GTCAG	2	10	246635	246644	20 %	20 %	40 %	20 %	443615551
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5154	NC_020163	ATA	2	6	247247	247252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5160	NC_020163	CT	3	6	247575	247580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5161	NC_020163	T	8	8	247598	247605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_020163	AT	3	6	247651	247656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_020163	GTAT	2	8	247675	247682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5173	NC_020163	CTC	2	6	248314	248319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5174	NC_020163	TAT	2	6	248323	248328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5176	NC_020163	TTA	2	6	248386	248391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5179	NC_020163	T	6	6	248420	248425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5190	NC_020163	AT	3	6	248891	248896	50 %	50 %	0 %	0 %	443615553
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5195	NC_020163	TG	3	6	248973	248978	0 %	50 %	50 %	0 %	443615553
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5203	NC_020163	ATT	2	6	249568	249573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5204	NC_020163	GAT	2	6	249619	249624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5234	NC_020163	CGG	2	6	250706	250711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615555
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5242	NC_020163	TAT	2	6	251243	251248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_020163	TTC	2	6	251303	251308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615557
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5245	NC_020163	CTT	2	6	251484	251489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615557
5246	NC_020163	T	6	6	251546	251551	0 %	100 %	0 %	0 %	443615557
5247	NC_020163	CAAG	2	8	251584	251591	50 %	0 %	25 %	25 %	443615557
5248	NC_020163	CCTT	2	8	251610	251617	0 %	50 %	0 %	50 %	443615557
5249	NC_020163	CA	3	6	251718	251723	50 %	0 %	0 %	50 %	443615557
5250	NC_020163	AACG	2	8	251741	251748	50 %	0 %	25 %	25 %	443615557
5251	NC_020163	GTT	2	6	251776	251781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	443615557
5252	NC_020163	GTTCA	2	10	251801	251810	20 %	40 %	20 %	20 %	443615557
5253	NC_020163	ACG	2	6	251831	251836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615557
5254	NC_020163	TAAC	2	8	251952	251959	50 %	25 %	0 %	25 %	443615557
5255	NC_020163	GTT	2	6	251993	251998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	443615557
5256	NC_020163	GTA	2	6	252145	252150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615557
5257	NC_020163	TGA	2	6	252182	252187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615557
5258	NC_020163	GTG	2	6	252322	252327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615557
5259	NC_020163	A	6	6	252511	252516	100 %	0 %	0 %	0 %	443615558
5260	NC_020163	GGAC	2	8	252565	252572	25 %	0 %	50 %	25 %	443615558
5261	NC_020163	ATT	2	6	252648	252653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	443615558
5262	NC_020163	GAA	3	9	252684	252692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	443615558
5263	NC_020163	CGG	2	6	252713	252718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615558
5264	NC_020163	CGG	2	6	252727	252732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615558
5265	NC_020163	ATG	2	6	252772	252777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615558
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5267	NC_020163	ATC	2	6	253008	253013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615558
5268	NC_020163	CACG	2	8	253014	253021	25 %	0 %	25 %	50 %	443615558
5269	NC_020163	GAAA	2	8	253049	253056	75 %	0 %	25 %	0 %	443615558
5270	NC_020163	CGC	2	6	253069	253074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615558
5271	NC_020163	GT	3	6	253087	253092	0 %	50 %	50 %	0 %	443615558
5272	NC_020163	GGT	2	6	253137	253142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615558
5273	NC_020163	ATGG	2	8	253182	253189	25 %	25 %	50 %	0 %	443615558
5274	NC_020163	GGC	2	6	253232	253237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615558
5275	NC_020163	GC	3	6	253295	253300	0 %	0 %	50 %	50 %	443615558
5276	NC_020163	GC	3	6	253393	253398	0 %	0 %	50 %	50 %	443615558
5277	NC_020163	GGC	2	6	253405	253410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615558
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5279	NC_020163	AGT	2	6	253510	253515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5280	NC_020163	CAC	2	6	253522	253527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5281	NC_020163	ATT	2	6	253571	253576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_020163	CAT	2	6	253626	253631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615559
5283	NC_020163	ACT	2	6	253638	253643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615559
5284	NC_020163	T	6	6	253657	253662	0 %	100 %	0 %	0 %	443615559
5285	NC_020163	CGC	2	6	253704	253709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615559
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5287	NC_020163	TGA	2	6	253757	253762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615559
5288	NC_020163	TGC	2	6	253769	253774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	443615559
5289	NC_020163	TAC	2	6	253781	253786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615559
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5292	NC_020163	GAT	2	6	253884	253889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5293	NC_020163	TACA	2	8	253982	253989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5294	NC_020163	AAAG	2	8	254002	254009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_020163	CAG	2	6	254047	254052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615560
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5300	NC_020163	TGA	2	6	254296	254301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615560
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5309	NC_020163	GCAG	2	8	254690	254697	25 %	0 %	50 %	25 %	443615560
5310	NC_020163	CGC	2	6	254701	254706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615560
5311	NC_020163	GCCT	2	8	254776	254783	0 %	25 %	25 %	50 %	443615560
5312	NC_020163	TGCC	2	8	254820	254827	0 %	25 %	25 %	50 %	443615560
5313	NC_020163	GGC	2	6	254858	254863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615560
5314	NC_020163	AATTC	2	10	255002	255011	40 %	40 %	0 %	20 %	443615560
5315	NC_020163	TCC	2	6	255025	255030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5316	NC_020163	CAA	2	6	255124	255129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	443615561
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5319	NC_020163	AACG	2	8	255236	255243	50 %	0 %	25 %	25 %	443615561
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5323	NC_020163	GCG	2	6	255449	255454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	443615561
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5325	NC_020163	GAT	2	6	255505	255510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615561
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5328	NC_020163	GAA	2	6	255640	255645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	443615561
5329	NC_020163	GTT	2	6	255688	255693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	443615561
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5332	NC_020163	A	7	7	255749	255755	100 %	0 %	0 %	0 %	443615561
5333	NC_020163	ATC	2	6	255782	255787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615561
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5343	NC_020163	CTC	2	6	256045	256050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	443615561
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5346	NC_020163	GGT	2	6	256237	256242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615561
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5348	NC_020163	TATC	2	8	256354	256361	25 %	50 %	0 %	25 %	443615561
5349	NC_020163	TGA	2	6	256363	256368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	443615561
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5351	NC_020163	AAC	2	6	256422	256427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	443615561
5352	NC_020163	ACG	3	9	256506	256514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615561
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5357	NC_020163	TCT	2	6	256694	256699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	443615562
5358	NC_020163	CG	3	6	256706	256711	0 %	0 %	50 %	50 %	443615562
5359	NC_020163	GAA	2	6	256752	256757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	443615562
5360	NC_020163	TGCG	2	8	256768	256775	0 %	25 %	50 %	25 %	443615562
5361	NC_020163	G	6	6	256775	256780	0 %	0 %	100 %	0 %	443615562
5362	NC_020163	T	6	6	256812	256817	0 %	100 %	0 %	0 %	443615562
5363	NC_020163	CGA	2	6	256834	256839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615562
5364	NC_020163	CCG	2	6	256861	256866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615562
5365	NC_020163	GAA	2	6	256875	256880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	443615562
5366	NC_020163	GCTG	2	8	256883	256890	0 %	25 %	50 %	25 %	443615562
5367	NC_020163	ATC	2	6	256993	256998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615562
5368	NC_020163	GC	4	8	257052	257059	0 %	0 %	50 %	50 %	443615562
5369	NC_020163	AAC	2	6	257089	257094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	443615562
5370	NC_020163	CTG	2	6	257163	257168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	443615562
5371	NC_020163	CAT	2	6	257204	257209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	443615562
5372	NC_020163	CGC	2	6	257224	257229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	443615562
5373	NC_020163	CGTG	2	8	257300	257307	0 %	25 %	50 %	25 %	443615562
5374	NC_020163	TGG	2	6	257336	257341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	443615562
5375	NC_020163	CG	3	6	257407	257412	0 %	0 %	50 %	50 %	443615562
5376	NC_020163	TTA	2	6	257605	257610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	443615562
5377	NC_020163	GCG	2	6	257685	257690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5378	NC_020163	CTT	2	6	257848	257853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5379	NC_020163	ACC	2	6	257872	257877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5497	NC_020163	GGCA	2	8	263850	263857	25 %	0 %	50 %	25 %	443615568
5498	NC_020163	GTT	2	6	263866	263871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	443615568
5499	NC_020163	CAG	2	6	263944	263949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	443615568
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