MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Echinicola vietnamensis DSM 17526 chromosome

Total Repeats: 105142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019904	TCT	2	6	259027	259032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795656
5002	NC_019904	TA	3	6	259035	259040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019904	AC	3	6	259063	259068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_019904	AT	3	6	259129	259134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_019904	AAAG	2	8	259218	259225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019904	TCA	2	6	259324	259329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795657
5007	NC_019904	CCA	2	6	259366	259371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795657
5008	NC_019904	TAG	2	6	259456	259461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795657
5009	NC_019904	ACCA	2	8	259475	259482	50 %	0 %	0 %	50 %	431795657
5010	NC_019904	TGA	2	6	259523	259528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795657
5011	NC_019904	CCA	2	6	259534	259539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795657
5012	NC_019904	ATT	2	6	259643	259648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431795658
5013	NC_019904	GAA	2	6	259698	259703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431795658
5014	NC_019904	AAC	2	6	259731	259736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431795658
5015	NC_019904	CAG	2	6	259750	259755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431795658
5016	NC_019904	ATCC	2	8	259784	259791	25 %	25 %	0 %	50 %	431795658
5017	NC_019904	TCA	2	6	259795	259800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795658
5018	NC_019904	CTT	2	6	259806	259811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5019	NC_019904	CCT	2	6	259912	259917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431795658
5020	NC_019904	AAC	2	6	259986	259991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431795658
5021	NC_019904	TTC	2	6	260034	260039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5022	NC_019904	CTT	2	6	260044	260049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5023	NC_019904	TGGA	3	12	260061	260072	25 %	25 %	50 %	0 %	431795658
5024	NC_019904	ACC	2	6	260093	260098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795658
5025	NC_019904	TCT	3	9	260151	260159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5026	NC_019904	TTTACC	2	12	260192	260203	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	431795658
5027	NC_019904	GTTT	2	8	260208	260215	0 %	75 %	25 %	0 %	431795658
5028	NC_019904	CTT	2	6	260254	260259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5029	NC_019904	ATA	2	6	260325	260330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431795658
5030	NC_019904	TTC	2	6	260528	260533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5031	NC_019904	TGTT	2	8	260619	260626	0 %	75 %	25 %	0 %	431795658
5032	NC_019904	ATCAT	2	10	260844	260853	40 %	40 %	0 %	20 %	431795658
5033	NC_019904	GAAG	2	8	260868	260875	50 %	0 %	50 %	0 %	431795658
5034	NC_019904	AGA	2	6	260924	260929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431795658
5035	NC_019904	TCT	2	6	260994	260999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5036	NC_019904	GAA	2	6	261020	261025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431795658
5037	NC_019904	TCA	2	6	261042	261047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795658
5038	NC_019904	CT	3	6	261074	261079	0 %	50 %	0 %	50 %	431795658
5039	NC_019904	CAG	2	6	261085	261090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431795658
5040	NC_019904	ATC	2	6	261104	261109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795658
5041	NC_019904	CTT	2	6	261121	261126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795658
5042	NC_019904	ATC	2	6	261143	261148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795658
5043	NC_019904	GAT	2	6	261158	261163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795658
5044	NC_019904	GTT	2	6	261170	261175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431795658
5045	NC_019904	GAT	2	6	261473	261478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795658
5046	NC_019904	ATT	2	6	261491	261496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431795658
5047	NC_019904	CGT	2	6	261518	261523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431795658
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5049	NC_019904	CT	3	6	261547	261552	0 %	50 %	0 %	50 %	431795658
5050	NC_019904	AGC	2	6	261581	261586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431795658
5051	NC_019904	GTT	3	9	261648	261656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431795658
5052	NC_019904	GA	3	6	261738	261743	50 %	0 %	50 %	0 %	431795659
5053	NC_019904	TG	3	6	261768	261773	0 %	50 %	50 %	0 %	431795659
5054	NC_019904	T	6	6	261781	261786	0 %	100 %	0 %	0 %	431795659
5055	NC_019904	GAT	2	6	261820	261825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795659
5056	NC_019904	CAT	2	6	261844	261849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795659
5057	NC_019904	CTT	2	6	261863	261868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795659
5058	NC_019904	ATC	2	6	261881	261886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795659
5059	NC_019904	TCTT	2	8	261906	261913	0 %	75 %	0 %	25 %	431795659
5060	NC_019904	T	6	6	262003	262008	0 %	100 %	0 %	0 %	431795659
5061	NC_019904	CTTCT	2	10	262036	262045	0 %	60 %	0 %	40 %	431795659
5062	NC_019904	AGA	2	6	262065	262070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431795659
5063	NC_019904	CTT	2	6	262087	262092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795659
5064	NC_019904	GAA	2	6	262155	262160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431795659
5065	NC_019904	GTTT	2	8	262198	262205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019904	T	6	6	262217	262222	0 %	100 %	0 %	0 %	431795660
5067	NC_019904	CTG	2	6	262279	262284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431795660
5068	NC_019904	GAT	2	6	262301	262306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795660
5069	NC_019904	ACC	2	6	262340	262345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795660
5070	NC_019904	CTT	2	6	262408	262413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795660
5071	NC_019904	GTG	2	6	262476	262481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431795660
5072	NC_019904	AC	4	8	262493	262500	50 %	0 %	0 %	50 %	431795660
5073	NC_019904	CCT	2	6	262502	262507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431795660
5074	NC_019904	CTAA	2	8	262569	262576	50 %	25 %	0 %	25 %	431795660
5075	NC_019904	TGT	2	6	262578	262583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431795660
5076	NC_019904	TAG	2	6	262585	262590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795660
5077	NC_019904	ATTT	2	8	262606	262613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_019904	ACAA	2	8	262665	262672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_019904	CTG	2	6	262982	262987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431795661
5080	NC_019904	TCT	3	9	263001	263009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795661
5081	NC_019904	TTA	2	6	263010	263015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431795661
5082	NC_019904	TTA	2	6	263042	263047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_019904	A	7	7	263141	263147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019904	TAT	2	6	263190	263195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431795662
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5086	NC_019904	GAA	2	6	263241	263246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431795662
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5089	NC_019904	CAA	2	6	263351	263356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431795662
5090	NC_019904	CTCA	2	8	263384	263391	25 %	25 %	0 %	50 %	431795662
5091	NC_019904	GTC	2	6	263400	263405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431795662
5092	NC_019904	GGAA	2	8	263410	263417	50 %	0 %	50 %	0 %	431795662
5093	NC_019904	AGC	2	6	263450	263455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431795662
5094	NC_019904	TC	3	6	263499	263504	0 %	50 %	0 %	50 %	431795662
5095	NC_019904	TCA	2	6	263547	263552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
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5098	NC_019904	CAT	2	6	263726	263731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5099	NC_019904	TTCA	2	8	263801	263808	25 %	50 %	0 %	25 %	431795662
5100	NC_019904	CTT	2	6	263951	263956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795662
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5102	NC_019904	CCG	2	6	264043	264048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431795662
5103	NC_019904	ACC	2	6	264095	264100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795662
5104	NC_019904	ACT	2	6	264237	264242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5105	NC_019904	ATC	2	6	264305	264310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5106	NC_019904	ATG	2	6	264339	264344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5107	NC_019904	AG	3	6	264411	264416	50 %	0 %	50 %	0 %	431795662
5108	NC_019904	CAT	2	6	264505	264510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5109	NC_019904	TGATTT	2	12	264511	264522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	431795662
5110	NC_019904	TGA	2	6	264577	264582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5111	NC_019904	TTC	3	9	264590	264598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795662
5112	NC_019904	ACA	2	6	264606	264611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431795662
5113	NC_019904	GCG	2	6	264720	264725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431795662
5114	NC_019904	TACA	2	8	264793	264800	50 %	25 %	0 %	25 %	431795662
5115	NC_019904	TTC	2	6	264890	264895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795662
5116	NC_019904	GAT	2	6	264905	264910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5117	NC_019904	GATC	2	8	264928	264935	25 %	25 %	25 %	25 %	431795662
5118	NC_019904	CAT	2	6	264937	264942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5119	NC_019904	TCA	2	6	264990	264995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5120	NC_019904	CTT	2	6	265183	265188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795662
5121	NC_019904	CT	3	6	265295	265300	0 %	50 %	0 %	50 %	431795662
5122	NC_019904	CAT	3	9	265322	265330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5123	NC_019904	TCC	3	9	265356	265364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431795662
5124	NC_019904	TCA	2	6	265372	265377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5125	NC_019904	CCTTCG	2	12	265492	265503	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	431795662
5126	NC_019904	AAT	2	6	265529	265534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431795662
5127	NC_019904	CAT	2	6	265537	265542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
5128	NC_019904	ATC	2	6	265598	265603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
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5130	NC_019904	GAT	2	6	265652	265657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5131	NC_019904	CTG	2	6	265658	265663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431795662
5132	NC_019904	CCA	2	6	265762	265767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795662
5133	NC_019904	GAT	2	6	265844	265849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5134	NC_019904	CTT	2	6	265897	265902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795662
5135	NC_019904	CTT	2	6	265911	265916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795662
5136	NC_019904	ATA	2	6	265928	265933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431795662
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5138	NC_019904	TGA	2	6	266317	266322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
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5140	NC_019904	CAAG	2	8	266434	266441	50 %	0 %	25 %	25 %	431795662
5141	NC_019904	GTT	2	6	266633	266638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431795662
5142	NC_019904	GAT	2	6	266642	266647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5143	NC_019904	CCA	2	6	266691	266696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795662
5144	NC_019904	ACC	2	6	266748	266753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795662
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5147	NC_019904	ATC	2	6	266888	266893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795662
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5152	NC_019904	GATT	2	8	267073	267080	25 %	50 %	25 %	0 %	431795662
5153	NC_019904	GTA	2	6	267095	267100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5154	NC_019904	CTT	2	6	267116	267121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795662
5155	NC_019904	GGTA	2	8	267122	267129	25 %	25 %	50 %	0 %	431795662
5156	NC_019904	TG	3	6	267178	267183	0 %	50 %	50 %	0 %	431795662
5157	NC_019904	ACC	2	6	267192	267197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795662
5158	NC_019904	ATG	2	6	267267	267272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795662
5159	NC_019904	GTT	2	6	267473	267478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431795662
5160	NC_019904	T	6	6	267482	267487	0 %	100 %	0 %	0 %	431795662
5161	NC_019904	T	6	6	267489	267494	0 %	100 %	0 %	0 %	431795662
5162	NC_019904	TTTGT	2	10	267508	267517	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_019904	CAT	2	6	267687	267692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795663
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5173	NC_019904	TCT	2	6	268047	268052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795663
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5183	NC_019904	TGA	2	6	268548	268553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795663
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5188	NC_019904	T	6	6	268714	268719	0 %	100 %	0 %	0 %	431795663
5189	NC_019904	AAC	2	6	268730	268735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431795663
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5194	NC_019904	TTC	2	6	268984	268989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795663
5195	NC_019904	CTCGC	2	10	268990	268999	0 %	20 %	20 %	60 %	431795663
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5202	NC_019904	TGA	2	6	269337	269342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795663
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5213	NC_019904	GCTC	2	8	269921	269928	0 %	25 %	25 %	50 %	431795663
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5232	NC_019904	AAAT	2	8	270772	270779	75 %	25 %	0 %	0 %	431795663
5233	NC_019904	T	6	6	270838	270843	0 %	100 %	0 %	0 %	431795663
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5236	NC_019904	A	6	6	271325	271330	100 %	0 %	0 %	0 %	431795663
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5239	NC_019904	ATT	2	6	271585	271590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431795664
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5241	NC_019904	CTT	2	6	271660	271665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431795664
5242	NC_019904	ACT	2	6	271743	271748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431795664
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5484	NC_019904	T	7	7	283195	283201	0 %	100 %	0 %	0 %	431795676
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5492	NC_019904	CCA	2	6	283528	283533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431795676
5493	NC_019904	A	6	6	283601	283606	100 %	0 %	0 %	0 %	431795676
5494	NC_019904	TCC	2	6	283653	283658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431795676
5495	NC_019904	CTG	2	6	283670	283675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431795676
5496	NC_019904	ATG	2	6	283698	283703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795676
5497	NC_019904	GGT	2	6	283706	283711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431795676
5498	NC_019904	ATGG	2	8	283724	283731	25 %	25 %	50 %	0 %	431795676
5499	NC_019904	GAT	2	6	283745	283750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431795676
5500	NC_019904	A	6	6	283829	283834	100 %	0 %	0 %	0 %	431795676

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