MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL05

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018745	AATA	2	8	400	407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018745	AGAT	2	8	679	686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018745	AAAC	2	8	868	875	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018745	TGAC	2	8	955	962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018745	ATAA	2	8	1102	1109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018745	TAAA	2	8	1924	1931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018745	TACC	2	8	2287	2294	25 %	25 %	0 %	50 %	408671638
8	NC_018745	AAAT	2	8	2371	2378	75 %	25 %	0 %	0 %	408671638
9	NC_018745	GAAG	2	8	2823	2830	50 %	0 %	50 %	0 %	408671638
10	NC_018745	AAAT	2	8	3211	3218	75 %	25 %	0 %	0 %	408671638
11	NC_018745	ATTT	2	8	3597	3604	25 %	75 %	0 %	0 %	408671638
12	NC_018745	TTTG	2	8	3838	3845	0 %	75 %	25 %	0 %	408671638
13	NC_018745	ATTT	2	8	4123	4130	25 %	75 %	0 %	0 %	408671638
14	NC_018745	AATG	2	8	4350	4357	50 %	25 %	25 %	0 %	408671638
15	NC_018745	CTTA	2	8	5943	5950	25 %	50 %	0 %	25 %	408671638
16	NC_018745	GGGT	2	8	6049	6056	0 %	25 %	75 %	0 %	408671638
17	NC_018745	ATCT	2	8	6190	6197	25 %	50 %	0 %	25 %	408671638
18	NC_018745	GATG	2	8	6282	6289	25 %	25 %	50 %	0 %	408671638
19	NC_018745	AAAT	2	8	6298	6305	75 %	25 %	0 %	0 %	408671638
20	NC_018745	ACTA	2	8	6313	6320	50 %	25 %	0 %	25 %	408671638
21	NC_018745	AATT	2	8	6455	6462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018745	CACC	2	8	6789	6796	25 %	0 %	0 %	75 %	408671639
23	NC_018745	AATA	2	8	6851	6858	75 %	25 %	0 %	0 %	408671639
24	NC_018745	GCCG	2	8	6998	7005	0 %	0 %	50 %	50 %	408671639
25	NC_018745	TGGT	2	8	7438	7445	0 %	50 %	50 %	0 %	408671639
26	NC_018745	GTAT	2	8	7837	7844	25 %	50 %	25 %	0 %	408671640
27	NC_018745	GAAC	2	8	7930	7937	50 %	0 %	25 %	25 %	408671640
28	NC_018745	ACTT	2	8	8372	8379	25 %	50 %	0 %	25 %	408671640
29	NC_018745	TGTA	2	8	8918	8925	25 %	50 %	25 %	0 %	408671640
30	NC_018745	TGGT	2	8	8929	8936	0 %	50 %	50 %	0 %	408671640
31	NC_018745	TTTC	2	8	8987	8994	0 %	75 %	0 %	25 %	408671640
32	NC_018745	AAAC	2	8	9006	9013	75 %	0 %	0 %	25 %	408671640
33	NC_018745	ATTG	2	8	9113	9120	25 %	50 %	25 %	0 %	408671640
34	NC_018745	TAAA	2	8	9647	9654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018745	ACAA	2	8	9799	9806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018745	GAGT	2	8	10913	10920	25 %	25 %	50 %	0 %	408671641
37	NC_018745	GGCT	2	8	11302	11309	0 %	25 %	50 %	25 %	408671641
38	NC_018745	TCAG	2	8	11510	11517	25 %	25 %	25 %	25 %	408671641
39	NC_018745	ATTC	2	8	12181	12188	25 %	50 %	0 %	25 %	408671641
40	NC_018745	TGAT	2	8	12362	12369	25 %	50 %	25 %	0 %	408671641
41	NC_018745	AAAT	2	8	12412	12419	75 %	25 %	0 %	0 %	408671641
42	NC_018745	TTTG	2	8	12459	12466	0 %	75 %	25 %	0 %	408671642
43	NC_018745	GTAG	2	8	12537	12544	25 %	25 %	50 %	0 %	408671642
44	NC_018745	TTTC	2	8	12826	12833	0 %	75 %	0 %	25 %	408671643
45	NC_018745	CTTC	2	8	13009	13016	0 %	50 %	0 %	50 %	408671643
46	NC_018745	CTTT	2	8	13026	13033	0 %	75 %	0 %	25 %	408671643
47	NC_018745	TCTT	2	8	13376	13383	0 %	75 %	0 %	25 %	408671643
48	NC_018745	TATT	2	8	13464	13471	25 %	75 %	0 %	0 %	408671643
49	NC_018745	ATAA	2	8	14209	14216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018745	TAGT	2	8	14415	14422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018745	TTAG	2	8	14424	14431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018745	ACTA	2	8	14991	14998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018745	CTAT	2	8	15146	15153	25 %	50 %	0 %	25 %	408671644
54	NC_018745	ATTT	2	8	15753	15760	25 %	75 %	0 %	0 %	408671644
55	NC_018745	ATCA	2	8	15767	15774	50 %	25 %	0 %	25 %	408671644
56	NC_018745	TATG	2	8	15865	15872	25 %	50 %	25 %	0 %	408671644
57	NC_018745	TGAT	2	8	16418	16425	25 %	50 %	25 %	0 %	408671645
58	NC_018745	CATT	2	8	17430	17437	25 %	50 %	0 %	25 %	408671647
59	NC_018745	TTGA	2	8	18486	18493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018745	GATA	2	8	19046	19053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018745	TCAA	2	8	19087	19094	50 %	25 %	0 %	25 %	408671648
62	NC_018745	AAAT	2	8	19207	19214	75 %	25 %	0 %	0 %	408671648
63	NC_018745	CATT	2	8	19369	19376	25 %	50 %	0 %	25 %	408671648
64	NC_018745	ATTT	2	8	19881	19888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018745	TATT	2	8	20058	20065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018745	AAGA	2	8	20260	20267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018745	TGGA	2	8	20827	20834	25 %	25 %	50 %	0 %	408671649
68	NC_018745	TATT	2	8	20961	20968	25 %	75 %	0 %	0 %	408671649
69	NC_018745	TAAA	2	8	21291	21298	75 %	25 %	0 %	0 %	408671649
70	NC_018745	TGTA	2	8	21366	21373	25 %	50 %	25 %	0 %	408671649
71	NC_018745	ATTT	2	8	21516	21523	25 %	75 %	0 %	0 %	408671649
72	NC_018745	TGAT	2	8	21570	21577	25 %	50 %	25 %	0 %	408671649
73	NC_018745	ATTA	2	8	21940	21947	50 %	50 %	0 %	0 %	408671650
74	NC_018745	CAAA	2	8	22532	22539	75 %	0 %	0 %	25 %	408671650
75	NC_018745	ATTG	2	8	22766	22773	25 %	50 %	25 %	0 %	408671651
76	NC_018745	TACA	2	8	22979	22986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018745	TCAT	2	8	22988	22995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018745	ACGT	2	8	24042	24049	25 %	25 %	25 %	25 %	408671652
79	NC_018745	AATA	2	8	24172	24179	75 %	25 %	0 %	0 %	408671652
80	NC_018745	ATTC	2	8	24205	24212	25 %	50 %	0 %	25 %	408671652
81	NC_018745	ATAA	2	8	27112	27119	75 %	25 %	0 %	0 %	408671653
82	NC_018745	AGTT	2	8	27252	27259	25 %	50 %	25 %	0 %	408671653
83	NC_018745	TTGG	2	8	27299	27306	0 %	50 %	50 %	0 %	408671653
84	NC_018745	ATAA	2	8	27837	27844	75 %	25 %	0 %	0 %	408671654
85	NC_018745	GATA	2	8	28036	28043	50 %	25 %	25 %	0 %	408671654
86	NC_018745	ATGT	2	8	28340	28347	25 %	50 %	25 %	0 %	408671654
87	NC_018745	GTTT	2	8	28490	28497	0 %	75 %	25 %	0 %	408671654
88	NC_018745	TAAA	2	8	28503	28510	75 %	25 %	0 %	0 %	408671654
89	NC_018745	TTAA	2	8	28843	28850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018745	AAAC	2	8	28862	28869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018745	AAAT	2	8	29083	29090	75 %	25 %	0 %	0 %	408671655
92	NC_018745	ATGA	2	8	29363	29370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018745	ATAA	2	8	29462	29469	75 %	25 %	0 %	0 %	408671656
94	NC_018745	ATTA	2	8	29878	29885	50 %	50 %	0 %	0 %	408671656
95	NC_018745	TTGG	2	8	30102	30109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018745	TAGG	2	8	30275	30282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018745	TCTT	2	8	30306	30313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018745	GCCT	2	8	30423	30430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018745	CATT	2	8	30553	30560	25 %	50 %	0 %	25 %	408671657
100	NC_018745	TAAA	2	8	31454	31461	75 %	25 %	0 %	0 %	408671657
101	NC_018745	TTAT	2	8	32055	32062	25 %	75 %	0 %	0 %	408671657
102	NC_018745	GGTG	2	8	32852	32859	0 %	25 %	75 %	0 %	408671657
103	NC_018745	GTTT	2	8	33055	33062	0 %	75 %	25 %	0 %	408671658
104	NC_018745	TTTC	2	8	33169	33176	0 %	75 %	0 %	25 %	408671658
105	NC_018745	AAAT	2	8	33946	33953	75 %	25 %	0 %	0 %	408671658

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.