MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	TC	3	6	724	729	0 %	50 %	0 %	50 %	408671741
2	NC_018743	TG	3	6	1547	1552	0 %	50 %	50 %	0 %	408671741
3	NC_018743	TG	3	6	3058	3063	0 %	50 %	50 %	0 %	408671741
4	NC_018743	TA	3	6	4184	4189	50 %	50 %	0 %	0 %	408671742
5	NC_018743	TG	3	6	5013	5018	0 %	50 %	50 %	0 %	408671742
6	NC_018743	TG	3	6	5514	5519	0 %	50 %	50 %	0 %	408671742
7	NC_018743	TA	3	6	6415	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	408671743
8	NC_018743	AT	3	6	6504	6509	50 %	50 %	0 %	0 %	408671743
9	NC_018743	CT	3	6	9901	9906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018743	CT	3	6	11038	11043	0 %	50 %	0 %	50 %	408671744
11	NC_018743	TA	3	6	11163	11168	50 %	50 %	0 %	0 %	408671744
12	NC_018743	AT	3	6	11669	11674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018743	TG	3	6	13186	13191	0 %	50 %	50 %	0 %	408671747
14	NC_018743	GA	3	6	13570	13575	50 %	0 %	50 %	0 %	408671747
15	NC_018743	CA	3	6	15348	15353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018743	AT	3	6	15701	15706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018743	TA	3	6	15812	15817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018743	AT	3	6	16340	16345	50 %	50 %	0 %	0 %	408671748
19	NC_018743	AT	3	6	17693	17698	50 %	50 %	0 %	0 %	408671750
20	NC_018743	TA	3	6	17769	17774	50 %	50 %	0 %	0 %	408671750
21	NC_018743	AT	3	6	18180	18185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018743	CT	3	6	18942	18947	0 %	50 %	0 %	50 %	408671752
23	NC_018743	AT	3	6	19888	19893	50 %	50 %	0 %	0 %	408671753
24	NC_018743	AC	3	6	21025	21030	50 %	0 %	0 %	50 %	408671753
25	NC_018743	AC	3	6	21061	21066	50 %	0 %	0 %	50 %	408671753
26	NC_018743	CA	3	6	21604	21609	50 %	0 %	0 %	50 %	408671753
27	NC_018743	AT	3	6	21873	21878	50 %	50 %	0 %	0 %	408671753
28	NC_018743	AG	3	6	23052	23057	50 %	0 %	50 %	0 %	408671755
29	NC_018743	TA	3	6	23365	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	408671755
30	NC_018743	AT	3	6	23438	23443	50 %	50 %	0 %	0 %	408671755
31	NC_018743	AT	3	6	24166	24171	50 %	50 %	0 %	0 %	408671756
32	NC_018743	AC	3	6	24347	24352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018743	TA	4	8	24437	24444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018743	AT	3	6	25267	25272	50 %	50 %	0 %	0 %	408671758
35	NC_018743	AC	3	6	25591	25596	50 %	0 %	0 %	50 %	408671758
36	NC_018743	GA	3	6	25693	25698	50 %	0 %	50 %	0 %	408671758
37	NC_018743	TC	3	6	25837	25842	0 %	50 %	0 %	50 %	408671758
38	NC_018743	TG	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
39	NC_018743	TA	3	6	28628	28633	50 %	50 %	0 %	0 %	408671758
40	NC_018743	TG	3	6	28642	28647	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
41	NC_018743	AC	3	6	28738	28743	50 %	0 %	0 %	50 %	408671758
42	NC_018743	TA	3	6	28826	28831	50 %	50 %	0 %	0 %	408671758
43	NC_018743	TG	3	6	28915	28920	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
44	NC_018743	AC	3	6	29334	29339	50 %	0 %	0 %	50 %	408671758
45	NC_018743	TG	3	6	30313	30318	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
46	NC_018743	AT	3	6	30534	30539	50 %	50 %	0 %	0 %	408671759
47	NC_018743	AT	3	6	31872	31877	50 %	50 %	0 %	0 %	408671760
48	NC_018743	CA	3	6	32245	32250	50 %	0 %	0 %	50 %	408671761
49	NC_018743	CA	3	6	32835	32840	50 %	0 %	0 %	50 %	408671761
50	NC_018743	GT	3	6	35087	35092	0 %	50 %	50 %	0 %	408671761
51	NC_018743	TA	3	6	37566	37571	50 %	50 %	0 %	0 %	408671761
52	NC_018743	CA	3	6	38934	38939	50 %	0 %	0 %	50 %	408671761
53	NC_018743	AC	3	6	42823	42828	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
54	NC_018743	CA	3	6	43244	43249	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
55	NC_018743	CA	3	6	43483	43488	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
56	NC_018743	CA	3	6	44258	44263	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
57	NC_018743	CA	3	6	45430	45435	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
58	NC_018743	CT	3	6	48210	48215	0 %	50 %	0 %	50 %	408671763
59	NC_018743	GT	3	6	49371	49376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018743	CT	3	6	49578	49583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018743	TA	3	6	50177	50182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018743	TC	3	6	50819	50824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018743	AT	3	6	50895	50900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018743	TA	3	6	53199	53204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018743	TA	3	6	53393	53398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018743	TG	3	6	53541	53546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018743	TA	3	6	53563	53568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018743	TA	3	6	53582	53587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018743	AG	3	6	54591	54596	50 %	0 %	50 %	0 %	408671766
70	NC_018743	TA	3	6	55042	55047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018743	GA	3	6	55175	55180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018743	GT	3	6	55181	55186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018743	AG	3	6	55495	55500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018743	AT	3	6	55805	55810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018743	AG	3	6	55863	55868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018743	TA	3	6	56617	56622	50 %	50 %	0 %	0 %	408671767
77	NC_018743	TA	3	6	56643	56648	50 %	50 %	0 %	0 %	408671767
78	NC_018743	AC	3	6	57760	57765	50 %	0 %	0 %	50 %	408671768
79	NC_018743	TA	3	6	58646	58651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.