MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	AT	5	10	653	662	50 %	50 %	0 %	0 %	408671449
2	NC_018742	CA	3	6	1775	1780	50 %	0 %	0 %	50 %	408671450
3	NC_018742	AT	3	6	2980	2985	50 %	50 %	0 %	0 %	408671450
4	NC_018742	AT	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018742	TA	3	6	4598	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	408671451
6	NC_018742	AT	4	8	4780	4787	50 %	50 %	0 %	0 %	408671451
7	NC_018742	GT	3	6	5558	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	408671452
8	NC_018742	TC	3	6	6546	6551	0 %	50 %	0 %	50 %	408671453
9	NC_018742	GA	3	6	7505	7510	50 %	0 %	50 %	0 %	408671454
10	NC_018742	AC	3	6	10080	10085	50 %	0 %	0 %	50 %	408671458
11	NC_018742	GT	3	6	11150	11155	0 %	50 %	50 %	0 %	408671459
12	NC_018742	CA	3	6	11704	11709	50 %	0 %	0 %	50 %	408671460
13	NC_018742	TC	3	6	11756	11761	0 %	50 %	0 %	50 %	408671460
14	NC_018742	TG	3	6	12580	12585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018742	AG	3	6	12716	12721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018742	AT	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	408671461
17	NC_018742	AT	3	6	13826	13831	50 %	50 %	0 %	0 %	408671462
18	NC_018742	GA	3	6	14544	14549	50 %	0 %	50 %	0 %	408671463
19	NC_018742	TA	3	6	15736	15741	50 %	50 %	0 %	0 %	408671464
20	NC_018742	GT	3	6	16403	16408	0 %	50 %	50 %	0 %	408671464
21	NC_018742	AT	4	8	16582	16589	50 %	50 %	0 %	0 %	408671464
22	NC_018742	AT	3	6	16653	16658	50 %	50 %	0 %	0 %	408671464
23	NC_018742	AG	3	6	16752	16757	50 %	0 %	50 %	0 %	408671464
24	NC_018742	TA	3	6	18069	18074	50 %	50 %	0 %	0 %	408671466
25	NC_018742	GT	3	6	21374	21379	0 %	50 %	50 %	0 %	408671469
26	NC_018742	TA	3	6	22437	22442	50 %	50 %	0 %	0 %	408671470
27	NC_018742	TA	3	6	23055	23060	50 %	50 %	0 %	0 %	408671470
28	NC_018742	TA	3	6	23424	23429	50 %	50 %	0 %	0 %	408671470
29	NC_018742	CA	4	8	23583	23590	50 %	0 %	0 %	50 %	408671470
30	NC_018742	TG	4	8	24635	24642	0 %	50 %	50 %	0 %	408671470
31	NC_018742	GT	3	6	25190	25195	0 %	50 %	50 %	0 %	408671470
32	NC_018742	TG	3	6	25484	25489	0 %	50 %	50 %	0 %	408671470
33	NC_018742	AT	3	6	26123	26128	50 %	50 %	0 %	0 %	408671471
34	NC_018742	CA	3	6	26212	26217	50 %	0 %	0 %	50 %	408671472
35	NC_018742	TA	3	6	27303	27308	50 %	50 %	0 %	0 %	408671472
36	NC_018742	AG	3	6	27485	27490	50 %	0 %	50 %	0 %	408671473
37	NC_018742	TA	3	6	27632	27637	50 %	50 %	0 %	0 %	408671473
38	NC_018742	CT	3	6	28004	28009	0 %	50 %	0 %	50 %	408671474
39	NC_018742	GT	3	6	28736	28741	0 %	50 %	50 %	0 %	408671474
40	NC_018742	AT	3	6	28811	28816	50 %	50 %	0 %	0 %	408671474
41	NC_018742	CA	3	6	30387	30392	50 %	0 %	0 %	50 %	408671475
42	NC_018742	GT	3	6	31530	31535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018742	AC	3	6	31802	31807	50 %	0 %	0 %	50 %	408671476
44	NC_018742	AG	3	6	32896	32901	50 %	0 %	50 %	0 %	408671477
45	NC_018742	AC	3	6	32979	32984	50 %	0 %	0 %	50 %	408671477
46	NC_018742	AT	3	6	33490	33495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018742	AT	3	6	34233	34238	50 %	50 %	0 %	0 %	408671479
48	NC_018742	TA	3	6	35048	35053	50 %	50 %	0 %	0 %	408671479
49	NC_018742	AC	4	8	35107	35114	50 %	0 %	0 %	50 %	408671479
50	NC_018742	AC	3	6	35726	35731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018742	AT	4	8	35734	35741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018742	AT	4	8	35810	35817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018742	GA	4	8	36033	36040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018742	AC	3	6	36614	36619	50 %	0 %	0 %	50 %	408671480
55	NC_018742	TG	3	6	37720	37725	0 %	50 %	50 %	0 %	408671481
56	NC_018742	AT	3	6	38267	38272	50 %	50 %	0 %	0 %	408671481
57	NC_018742	TA	3	6	38330	38335	50 %	50 %	0 %	0 %	408671481
58	NC_018742	AG	3	6	38669	38674	50 %	0 %	50 %	0 %	408671481
59	NC_018742	TC	3	6	39003	39008	0 %	50 %	0 %	50 %	408671481
60	NC_018742	AC	3	6	39323	39328	50 %	0 %	0 %	50 %	408671481
61	NC_018742	CA	3	6	40286	40291	50 %	0 %	0 %	50 %	408671482
62	NC_018742	AG	3	6	40564	40569	50 %	0 %	50 %	0 %	408671482
63	NC_018742	TA	3	6	40763	40768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018742	CT	3	6	40868	40873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018742	GA	3	6	44112	44117	50 %	0 %	50 %	0 %	408671486
66	NC_018742	AT	3	6	44872	44877	50 %	50 %	0 %	0 %	408671487
67	NC_018742	TA	3	6	48193	48198	50 %	50 %	0 %	0 %	408671488
68	NC_018742	AC	3	6	48644	48649	50 %	0 %	0 %	50 %	408671488
69	NC_018742	CA	3	6	48833	48838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018742	CA	3	6	50056	50061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018742	TA	3	6	51469	51474	50 %	50 %	0 %	0 %	408671490
72	NC_018742	AG	3	6	53968	53973	50 %	0 %	50 %	0 %	408671492
73	NC_018742	GA	3	6	55464	55469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018742	GA	3	6	55946	55951	50 %	0 %	50 %	0 %	408671494
75	NC_018742	TA	3	6	56101	56106	50 %	50 %	0 %	0 %	408671494
76	NC_018742	GA	3	6	56657	56662	50 %	0 %	50 %	0 %	408671494
77	NC_018742	TA	5	10	56728	56737	50 %	50 %	0 %	0 %	408671494
78	NC_018742	AT	3	6	56793	56798	50 %	50 %	0 %	0 %	408671494
79	NC_018742	AT	3	6	59109	59114	50 %	50 %	0 %	0 %	408671496
80	NC_018742	AT	3	6	60610	60615	50 %	50 %	0 %	0 %	408671498
81	NC_018742	AT	3	6	61165	61170	50 %	50 %	0 %	0 %	408671499
82	NC_018742	AG	3	6	63993	63998	50 %	0 %	50 %	0 %	408671503
83	NC_018742	TG	3	6	65075	65080	0 %	50 %	50 %	0 %	408671506
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85	NC_018742	TC	3	6	67214	67219	0 %	50 %	0 %	50 %	408671508
86	NC_018742	TA	3	6	68385	68390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018742	AT	3	6	69062	69067	50 %	50 %	0 %	0 %	408671510
88	NC_018742	GA	3	6	69137	69142	50 %	0 %	50 %	0 %	408671510
89	NC_018742	TA	3	6	70051	70056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018742	TA	3	6	70810	70815	50 %	50 %	0 %	0 %	408671511
91	NC_018742	TC	3	6	70851	70856	0 %	50 %	0 %	50 %	408671511
92	NC_018742	AT	3	6	71245	71250	50 %	50 %	0 %	0 %	408671512
93	NC_018742	TA	3	6	71663	71668	50 %	50 %	0 %	0 %	408671512
94	NC_018742	TA	3	6	72244	72249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018742	AG	3	6	72652	72657	50 %	0 %	50 %	0 %	408671513
96	NC_018742	TG	3	6	74370	74375	0 %	50 %	50 %	0 %	408671515
97	NC_018742	TA	3	6	74685	74690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018742	GA	3	6	74788	74793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018742	CA	3	6	75452	75457	50 %	0 %	0 %	50 %	408671516
100	NC_018742	AT	3	6	75788	75793	50 %	50 %	0 %	0 %	408671516
101	NC_018742	CA	3	6	77812	77817	50 %	0 %	0 %	50 %	408671517
102	NC_018742	AG	3	6	79029	79034	50 %	0 %	50 %	0 %	408671518
103	NC_018742	AG	3	6	79983	79988	50 %	0 %	50 %	0 %	408671518
104	NC_018742	TC	3	6	80154	80159	0 %	50 %	0 %	50 %	408671519
105	NC_018742	GA	3	6	82051	82056	50 %	0 %	50 %	0 %	408671521
106	NC_018742	AT	3	6	82121	82126	50 %	50 %	0 %	0 %	408671521
107	NC_018742	TC	3	6	82843	82848	0 %	50 %	0 %	50 %	408671521
108	NC_018742	GA	3	6	83385	83390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018742	CT	3	6	83535	83540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018742	GA	3	6	83632	83637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018742	CA	3	6	83685	83690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018742	GA	3	6	84630	84635	50 %	0 %	50 %	0 %	408671522
113	NC_018742	GT	3	6	86598	86603	0 %	50 %	50 %	0 %	408671524
114	NC_018742	TC	3	6	88070	88075	0 %	50 %	0 %	50 %	408671527
115	NC_018742	AC	4	8	88384	88391	50 %	0 %	0 %	50 %	408671527
116	NC_018742	GT	3	6	88899	88904	0 %	50 %	50 %	0 %	408671528
117	NC_018742	CT	3	6	89895	89900	0 %	50 %	0 %	50 %	408671528
118	NC_018742	TA	3	6	90326	90331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018742	TC	3	6	91237	91242	0 %	50 %	0 %	50 %	408671529
120	NC_018742	TA	3	6	92896	92901	50 %	50 %	0 %	0 %	408671530
121	NC_018742	TG	3	6	93378	93383	0 %	50 %	50 %	0 %	408671530
122	NC_018742	AG	3	6	93899	93904	50 %	0 %	50 %	0 %	408671531
123	NC_018742	GA	3	6	94472	94477	50 %	0 %	50 %	0 %	408671531
124	NC_018742	GA	3	6	95014	95019	50 %	0 %	50 %	0 %	408671532
125	NC_018742	GA	3	6	96622	96627	50 %	0 %	50 %	0 %	408671533
126	NC_018742	TA	3	6	98820	98825	50 %	50 %	0 %	0 %	408671535
127	NC_018742	TA	3	6	102401	102406	50 %	50 %	0 %	0 %	408671537
128	NC_018742	AC	3	6	102503	102508	50 %	0 %	0 %	50 %	408671538
129	NC_018742	CA	3	6	102738	102743	50 %	0 %	0 %	50 %	408671538
130	NC_018742	AC	3	6	103789	103794	50 %	0 %	0 %	50 %	408671539
131	NC_018742	AT	3	6	104715	104720	50 %	50 %	0 %	0 %	408671539
132	NC_018742	AT	3	6	105301	105306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018742	AT	3	6	106880	106885	50 %	50 %	0 %	0 %	408671541
134	NC_018742	TA	3	6	107452	107457	50 %	50 %	0 %	0 %	408671541
135	NC_018742	AT	3	6	107851	107856	50 %	50 %	0 %	0 %	408671541
136	NC_018742	TG	3	6	108712	108717	0 %	50 %	50 %	0 %	408671542
137	NC_018742	AC	3	6	109129	109134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018742	AT	3	6	109524	109529	50 %	50 %	0 %	0 %	408671543
139	NC_018742	GA	3	6	111080	111085	50 %	0 %	50 %	0 %	408671544
140	NC_018742	TA	3	6	111130	111135	50 %	50 %	0 %	0 %	408671544
141	NC_018742	AT	3	6	113081	113086	50 %	50 %	0 %	0 %	408671546
142	NC_018742	TA	3	6	113285	113290	50 %	50 %	0 %	0 %	408671547
143	NC_018742	CT	3	6	113712	113717	0 %	50 %	0 %	50 %	408671547
144	NC_018742	TC	4	8	113971	113978	0 %	50 %	0 %	50 %	408671547
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.