MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	GC	3	6	1390	1395	0 %	0 %	50 %	50 %	407471878
2	NC_018662	CT	4	8	1907	1914	0 %	50 %	0 %	50 %	407471879
3	NC_018662	TA	3	6	2202	2207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018662	TG	3	6	2535	2540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018662	AT	3	6	2725	2730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018662	AG	3	6	3361	3366	50 %	0 %	50 %	0 %	407471882
7	NC_018662	CA	3	6	3643	3648	50 %	0 %	0 %	50 %	407471883
8	NC_018662	TG	3	6	5066	5071	0 %	50 %	50 %	0 %	407471884
9	NC_018662	AT	3	6	5187	5192	50 %	50 %	0 %	0 %	407471884
10	NC_018662	AG	3	6	5364	5369	50 %	0 %	50 %	0 %	407471884
11	NC_018662	TA	3	6	5974	5979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018662	GT	3	6	6199	6204	0 %	50 %	50 %	0 %	407471885
13	NC_018662	GC	3	6	6820	6825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018662	AG	3	6	7008	7013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018662	AT	3	6	7290	7295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018662	TC	3	6	7519	7524	0 %	50 %	0 %	50 %	407471887
17	NC_018662	GA	3	6	7586	7591	50 %	0 %	50 %	0 %	407471887
18	NC_018662	CA	4	8	7704	7711	50 %	0 %	0 %	50 %	407471887
19	NC_018662	GT	3	6	7728	7733	0 %	50 %	50 %	0 %	407471888
20	NC_018662	GA	3	6	8484	8489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018662	GA	3	6	11815	11820	50 %	0 %	50 %	0 %	407471894
22	NC_018662	AT	3	6	12022	12027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018662	CA	3	6	12093	12098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018662	TG	3	6	12926	12931	0 %	50 %	50 %	0 %	407471896
25	NC_018662	TC	3	6	13240	13245	0 %	50 %	0 %	50 %	407471897
26	NC_018662	AT	3	6	15521	15526	50 %	50 %	0 %	0 %	407471900
27	NC_018662	CT	3	6	16420	16425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018662	CA	3	6	16596	16601	50 %	0 %	0 %	50 %	407471902
29	NC_018662	GT	3	6	16725	16730	0 %	50 %	50 %	0 %	407471902
30	NC_018662	CT	3	6	18348	18353	0 %	50 %	0 %	50 %	407471905
31	NC_018662	GT	3	6	19093	19098	0 %	50 %	50 %	0 %	407471905
32	NC_018662	AC	3	6	19213	19218	50 %	0 %	0 %	50 %	407471905
33	NC_018662	GA	3	6	19260	19265	50 %	0 %	50 %	0 %	407471905
34	NC_018662	TG	3	6	20091	20096	0 %	50 %	50 %	0 %	407471905
35	NC_018662	CT	3	6	20212	20217	0 %	50 %	0 %	50 %	407471905
36	NC_018662	TG	3	6	20712	20717	0 %	50 %	50 %	0 %	407471905
37	NC_018662	CT	3	6	21303	21308	0 %	50 %	0 %	50 %	407471905
38	NC_018662	AT	3	6	23340	23345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018662	CA	3	6	23706	23711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018662	CA	4	8	25275	25282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018662	TA	4	8	25343	25350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018662	CA	3	6	25953	25958	50 %	0 %	0 %	50 %	407471911
43	NC_018662	AT	3	6	26201	26206	50 %	50 %	0 %	0 %	407471911
44	NC_018662	AT	3	6	26965	26970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018662	AT	3	6	27923	27928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018662	GC	3	6	28609	28614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018662	GA	3	6	30231	30236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018662	GA	3	6	31843	31848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018662	TA	3	6	32507	32512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018662	CT	3	6	33460	33465	0 %	50 %	0 %	50 %	407471916
51	NC_018662	AT	3	6	34269	34274	50 %	50 %	0 %	0 %	407471916
52	NC_018662	TA	3	6	34511	34516	50 %	50 %	0 %	0 %	407471916
53	NC_018662	AC	3	6	34683	34688	50 %	0 %	0 %	50 %	407471916
54	NC_018662	GA	3	6	34710	34715	50 %	0 %	50 %	0 %	407471916
55	NC_018662	AT	3	6	35296	35301	50 %	50 %	0 %	0 %	407471917
56	NC_018662	GA	3	6	35899	35904	50 %	0 %	50 %	0 %	407471917
57	NC_018662	TA	3	6	36266	36271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018662	GA	4	8	36813	36820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018662	AT	3	6	36826	36831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018662	AG	3	6	37033	37038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018662	AT	3	6	37469	37474	50 %	50 %	0 %	0 %	407471918
62	NC_018662	TA	3	6	37761	37766	50 %	50 %	0 %	0 %	407471918
63	NC_018662	AT	3	6	38202	38207	50 %	50 %	0 %	0 %	407471918
64	NC_018662	GA	3	6	38651	38656	50 %	0 %	50 %	0 %	407471919
65	NC_018662	AT	3	6	38831	38836	50 %	50 %	0 %	0 %	407471919
66	NC_018662	TA	3	6	39293	39298	50 %	50 %	0 %	0 %	407471920
67	NC_018662	TA	3	6	39936	39941	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
68	NC_018662	TC	3	6	40399	40404	0 %	50 %	0 %	50 %	407471921
69	NC_018662	TA	3	6	40478	40483	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
70	NC_018662	TC	3	6	40566	40571	0 %	50 %	0 %	50 %	407471921
71	NC_018662	AT	3	6	40666	40671	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
72	NC_018662	TA	3	6	40797	40802	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
73	NC_018662	CT	3	6	41476	41481	0 %	50 %	0 %	50 %	407471922
74	NC_018662	TC	3	6	41496	41501	0 %	50 %	0 %	50 %	407471922
75	NC_018662	TA	3	6	41909	41914	50 %	50 %	0 %	0 %	407471922
76	NC_018662	TA	4	8	42202	42209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018662	AT	3	6	42237	42242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018662	TG	3	6	42273	42278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018662	AT	3	6	42295	42300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018662	GC	3	6	44203	44208	0 %	0 %	50 %	50 %	407471925
81	NC_018662	AT	3	6	44891	44896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018662	TA	3	6	46457	46462	50 %	50 %	0 %	0 %	407471926
83	NC_018662	TC	3	6	46862	46867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018662	AT	3	6	46881	46886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018662	AT	3	6	47034	47039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018662	TC	3	6	47229	47234	0 %	50 %	0 %	50 %	407471927
87	NC_018662	AT	3	6	48401	48406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018662	TA	3	6	48524	48529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018662	AG	3	6	48544	48549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018662	TG	3	6	49382	49387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018662	GC	3	6	54142	54147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018662	TA	3	6	54750	54755	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
93	NC_018662	GA	3	6	54830	54835	50 %	0 %	50 %	0 %	407471931
94	NC_018662	AT	3	6	55088	55093	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
95	NC_018662	TA	3	6	55139	55144	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
96	NC_018662	TC	3	6	57417	57422	0 %	50 %	0 %	50 %	407471934
97	NC_018662	GA	3	6	58645	58650	50 %	0 %	50 %	0 %	407471936
98	NC_018662	AT	3	6	59252	59257	50 %	50 %	0 %	0 %	407471937
99	NC_018662	AT	3	6	59634	59639	50 %	50 %	0 %	0 %	407471938
100	NC_018662	TA	3	6	59679	59684	50 %	50 %	0 %	0 %	407471938
101	NC_018662	TA	3	6	60794	60799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018662	CT	3	6	64035	64040	0 %	50 %	0 %	50 %	407471944
103	NC_018662	CT	3	6	64836	64841	0 %	50 %	0 %	50 %	407471946
104	NC_018662	AT	3	6	65539	65544	50 %	50 %	0 %	0 %	407471948
105	NC_018662	AT	4	8	66475	66482	50 %	50 %	0 %	0 %	407471950
106	NC_018662	TC	3	6	66573	66578	0 %	50 %	0 %	50 %	407471950
107	NC_018662	AT	3	6	66691	66696	50 %	50 %	0 %	0 %	407471950
108	NC_018662	CT	3	6	66765	66770	0 %	50 %	0 %	50 %	407471950
109	NC_018662	GT	3	6	67466	67471	0 %	50 %	50 %	0 %	407471951
110	NC_018662	TA	3	6	67848	67853	50 %	50 %	0 %	0 %	407471951
111	NC_018662	AT	3	6	68734	68739	50 %	50 %	0 %	0 %	407471951
112	NC_018662	AT	3	6	69209	69214	50 %	50 %	0 %	0 %	407471951
113	NC_018662	AT	3	6	69415	69420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018662	TA	3	6	69550	69555	50 %	50 %	0 %	0 %	407471952
115	NC_018662	CA	3	6	70610	70615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018662	GA	3	6	71099	71104	50 %	0 %	50 %	0 %	407471955
117	NC_018662	AG	4	8	71567	71574	50 %	0 %	50 %	0 %	407471955
118	NC_018662	AG	3	6	71619	71624	50 %	0 %	50 %	0 %	407471955
119	NC_018662	GC	3	6	71842	71847	0 %	0 %	50 %	50 %	407471956
120	NC_018662	TG	3	6	72211	72216	0 %	50 %	50 %	0 %	407471957
121	NC_018662	CG	3	6	72219	72224	0 %	0 %	50 %	50 %	407471957
122	NC_018662	TC	3	6	72446	72451	0 %	50 %	0 %	50 %	407471957
123	NC_018662	CA	3	6	73052	73057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018662	CG	3	6	73669	73674	0 %	0 %	50 %	50 %	407471959
125	NC_018662	AC	3	6	73932	73937	50 %	0 %	0 %	50 %	407471960
126	NC_018662	AC	3	6	74810	74815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018662	AC	3	6	75150	75155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018662	TC	3	6	75216	75221	0 %	50 %	0 %	50 %	407471961
129	NC_018662	AT	3	6	75236	75241	50 %	50 %	0 %	0 %	407471961

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.