MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 1521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018662	GCG	2	6	50110	50115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471929
1002	NC_018662	CTC	2	6	50289	50294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471929
1003	NC_018662	ATC	2	6	50343	50348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471929
1004	NC_018662	CCG	2	6	50399	50404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471929
1005	NC_018662	ACC	2	6	50438	50443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471929
1006	NC_018662	ATG	2	6	50506	50511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471929
1007	NC_018662	ATA	2	6	50516	50521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471929
1008	NC_018662	GCG	2	6	50522	50527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471929
1009	NC_018662	GCC	2	6	50560	50565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471929
1010	NC_018662	CAG	2	6	50610	50615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471929
1011	NC_018662	GCG	2	6	50643	50648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471929
1012	NC_018662	TCA	2	6	50657	50662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471929
1013	NC_018662	GAT	2	6	50669	50674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471929
1014	NC_018662	GTG	2	6	50772	50777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471929
1015	NC_018662	TTGTT	2	10	51020	51029	0 %	80 %	20 %	0 %	407471929
1016	NC_018662	GAA	2	6	51167	51172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018662	CGC	3	9	51209	51217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_018662	TGC	2	6	51229	51234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_018662	GGCT	2	8	51252	51259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_018662	G	6	6	51269	51274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018662	GCC	2	6	51362	51367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_018662	CGC	2	6	51409	51414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_018662	GGC	2	6	51482	51487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_018662	CAG	2	6	51559	51564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_018662	ATG	2	6	51743	51748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018662	TAA	2	6	51814	51819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018662	TCC	2	6	51864	51869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_018662	TCG	2	6	51912	51917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_018662	AGT	2	6	51927	51932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018662	AGC	2	6	51951	51956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_018662	CAT	2	6	51977	51982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_018662	CAG	2	6	52001	52006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_018662	TGC	2	6	52073	52078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_018662	CGC	2	6	52143	52148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_018662	GAC	2	6	52159	52164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_018662	C	7	7	52188	52194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1037	NC_018662	AGA	2	6	52214	52219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018662	GAA	2	6	52315	52320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018662	TTC	2	6	52359	52364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018662	TGA	2	6	52412	52417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018662	CGC	2	6	52430	52435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_018662	CAGC	2	8	52438	52445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_018662	GCA	2	6	52468	52473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_018662	ACT	2	6	52637	52642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_018662	GCCA	2	8	52654	52661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_018662	CCTG	2	8	52717	52724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_018662	GAG	2	6	52739	52744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018662	CTTG	2	8	52767	52774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_018662	GCT	2	6	52815	52820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_018662	CGAC	2	8	52855	52862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_018662	TCC	2	6	52886	52891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_018662	GTG	2	6	52919	52924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018662	TTC	2	6	52963	52968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_018662	ATC	2	6	52994	52999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_018662	TTG	2	6	53108	53113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018662	CAGA	2	8	53147	53154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_018662	GCCC	2	8	53179	53186	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1058	NC_018662	GTAA	2	8	53204	53211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018662	CCAC	2	8	53218	53225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1060	NC_018662	AAC	2	6	53394	53399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_018662	TCTT	2	8	53460	53467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_018662	TGC	2	6	53481	53486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_018662	GAT	2	6	53509	53514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018662	CAG	2	6	53606	53611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_018662	CAT	2	6	53615	53620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471930
1066	NC_018662	T	6	6	53620	53625	0 %	100 %	0 %	0 %	407471930
1067	NC_018662	CTC	2	6	53641	53646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471930
1068	NC_018662	GCG	2	6	53689	53694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471930
1069	NC_018662	GGT	2	6	53743	53748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471930
1070	NC_018662	ATT	2	6	54043	54048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018662	TTC	2	6	54066	54071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_018662	GC	3	6	54142	54147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_018662	TAT	2	6	54156	54161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018662	GCC	2	6	54171	54176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_018662	GGC	2	6	54206	54211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_018662	TGT	3	9	54281	54289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_018662	CAG	2	6	54310	54315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_018662	GAT	2	6	54390	54395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_018662	ATAA	2	8	54506	54513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018662	TAA	2	6	54569	54574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018662	T	6	6	54657	54662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018662	AAAAC	2	10	54685	54694	80 %	0 %	0 %	20 %	407471931
1083	NC_018662	TA	3	6	54750	54755	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
1084	NC_018662	GAAG	2	8	54788	54795	50 %	0 %	50 %	0 %	407471931
1085	NC_018662	GA	3	6	54830	54835	50 %	0 %	50 %	0 %	407471931
1086	NC_018662	AATA	2	8	54838	54845	75 %	25 %	0 %	0 %	407471931
1087	NC_018662	AGA	2	6	54864	54869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471931
1088	NC_018662	AGC	2	6	54905	54910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471931
1089	NC_018662	TGA	2	6	54939	54944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471931
1090	NC_018662	AAT	2	6	55000	55005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471931
1091	NC_018662	ATG	2	6	55059	55064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471931
1092	NC_018662	AT	3	6	55088	55093	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
1093	NC_018662	ACA	2	6	55113	55118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471931
1094	NC_018662	TA	3	6	55139	55144	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
1095	NC_018662	CTT	2	6	55156	55161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471931
1096	NC_018662	TAT	2	6	55219	55224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471931
1097	NC_018662	AGC	2	6	55324	55329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471931
1098	NC_018662	CAT	2	6	55395	55400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471931
1099	NC_018662	ATT	2	6	55491	55496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018662	GTCA	2	8	55606	55613	25 %	25 %	25 %	25 %	407471932
1101	NC_018662	ACTTAT	2	12	55695	55706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407471932
1102	NC_018662	ATG	2	6	55767	55772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471932
1103	NC_018662	GTT	2	6	55814	55819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471932
1104	NC_018662	GAA	2	6	55826	55831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471932
1105	NC_018662	GGAA	2	8	55841	55848	50 %	0 %	50 %	0 %	407471932
1106	NC_018662	TGC	2	6	55862	55867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471932
1107	NC_018662	GTT	2	6	55878	55883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471932
1108	NC_018662	CCA	2	6	55959	55964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471932
1109	NC_018662	TGAT	2	8	55983	55990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018662	TGA	2	6	56060	56065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018662	A	6	6	56070	56075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018662	TCA	2	6	56115	56120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_018662	TCA	2	6	56140	56145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018662	ACT	2	6	56176	56181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_018662	GCCA	2	8	56200	56207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_018662	CTG	2	6	56240	56245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471933
1117	NC_018662	TGT	2	6	56246	56251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471933
1118	NC_018662	TTG	2	6	56277	56282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471933
1119	NC_018662	TAC	2	6	56297	56302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471933
1120	NC_018662	CAA	2	6	56321	56326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471933
1121	NC_018662	CTGA	2	8	56353	56360	25 %	25 %	25 %	25 %	407471933
1122	NC_018662	ACC	2	6	56456	56461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471933
1123	NC_018662	AGC	2	6	56495	56500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471933
1124	NC_018662	TCA	2	6	56607	56612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471933
1125	NC_018662	GTTC	2	8	56719	56726	0 %	50 %	25 %	25 %	407471933
1126	NC_018662	A	6	6	56796	56801	100 %	0 %	0 %	0 %	407471933
1127	NC_018662	GCAT	2	8	56802	56809	25 %	25 %	25 %	25 %	407471933
1128	NC_018662	CTG	2	6	56876	56881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471933
1129	NC_018662	TTG	2	6	56964	56969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471933
1130	NC_018662	CGAA	2	8	56985	56992	50 %	0 %	25 %	25 %	407471933
1131	NC_018662	GCA	2	6	57138	57143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_018662	ATG	2	6	57224	57229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018662	TCT	2	6	57231	57236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_018662	GAAA	2	8	57241	57248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018662	CTA	2	6	57255	57260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_018662	TTC	2	6	57286	57291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_018662	TTC	2	6	57376	57381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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