MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 1521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018662	CCT	2	6	26826	26831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_018662	ATT	2	6	26854	26859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018662	TAA	2	6	26939	26944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018662	AT	3	6	26965	26970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018662	TCA	2	6	26971	26976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_018662	CAA	2	6	27197	27202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471912
507	NC_018662	AAC	2	6	27232	27237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471912
508	NC_018662	CAT	2	6	27271	27276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471912
509	NC_018662	AATA	2	8	27341	27348	75 %	25 %	0 %	0 %	407471912
510	NC_018662	GACT	2	8	27387	27394	25 %	25 %	25 %	25 %	407471912
511	NC_018662	TCG	2	6	27398	27403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_018662	TAC	2	6	27494	27499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_018662	CAG	2	6	27529	27534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018662	AGC	2	6	27608	27613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018662	AAT	2	6	27624	27629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018662	AAG	2	6	27692	27697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018662	AAGAG	2	10	27701	27710	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018662	C	6	6	27714	27719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
519	NC_018662	A	7	7	27742	27748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018662	T	8	8	27761	27768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018662	GTT	2	6	27770	27775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018662	TAA	2	6	27789	27794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018662	A	6	6	27814	27819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018662	TAG	2	6	27841	27846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018662	TCCA	2	8	27860	27867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_018662	TAAT	2	8	27877	27884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018662	AT	3	6	27923	27928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018662	TTC	2	6	28057	28062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_018662	AGT	2	6	28232	28237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018662	TAC	2	6	28246	28251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_018662	GCCT	2	8	28257	28264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_018662	ATA	3	9	28380	28388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018662	CGC	2	6	28409	28414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_018662	CGG	2	6	28489	28494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_018662	G	10	10	28520	28529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018662	TTG	2	6	28591	28596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018662	GC	3	6	28609	28614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_018662	AAC	2	6	28626	28631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_018662	GAT	2	6	28637	28642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018662	C	6	6	28720	28725	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
541	NC_018662	A	8	8	28747	28754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018662	AACT	2	8	28784	28791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_018662	GTC	2	6	28806	28811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_018662	ATG	2	6	28903	28908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018662	GAAA	2	8	28963	28970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018662	A	6	6	28991	28996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018662	CCT	2	6	28997	29002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_018662	AAT	2	6	29013	29018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018662	ATGG	2	8	29111	29118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018662	G	6	6	29117	29122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018662	CAG	2	6	29280	29285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_018662	GTC	2	6	29338	29343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_018662	ATA	2	6	29383	29388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018662	GTG	2	6	29404	29409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018662	TAA	2	6	29429	29434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018662	GGC	2	6	29456	29461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_018662	CAT	2	6	29474	29479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_018662	A	6	6	29496	29501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018662	G	6	6	29577	29582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018662	TAT	2	6	29604	29609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018662	AAC	2	6	29676	29681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_018662	TAA	2	6	29714	29719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018662	CAA	2	6	29739	29744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018662	A	6	6	29743	29748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018662	CAG	2	6	29756	29761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018662	AAG	2	6	29883	29888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018662	ACG	2	6	29934	29939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_018662	CTT	2	6	29941	29946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_018662	CCAG	2	8	29947	29954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_018662	ATC	2	6	30212	30217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_018662	GA	3	6	30231	30236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018662	GGT	2	6	30243	30248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018662	CAG	2	6	30323	30328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_018662	ACA	2	6	30474	30479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_018662	TGATGC	2	12	30590	30601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
576	NC_018662	ATA	2	6	30823	30828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018662	CAA	2	6	30848	30853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_018662	TAA	2	6	30899	30904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018662	AAAC	2	8	30926	30933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_018662	TGA	2	6	30980	30985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018662	GCA	2	6	31007	31012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_018662	A	6	6	31051	31056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018662	ATG	2	6	31060	31065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018662	TCCT	2	8	31155	31162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_018662	AATG	2	8	31241	31248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018662	ATTT	2	8	31336	31343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018662	AGC	2	6	31380	31385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_018662	GTGG	2	8	31413	31420	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018662	CAT	2	6	31485	31490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_018662	ACC	2	6	31582	31587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_018662	GAC	2	6	31755	31760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_018662	CTG	2	6	31803	31808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018662	GA	3	6	31843	31848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018662	TGA	2	6	31882	31887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018662	ATA	2	6	31915	31920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018662	CTGGAG	2	12	31932	31943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
597	NC_018662	A	7	7	32159	32165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018662	AATG	2	8	32174	32181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018662	TTC	2	6	32183	32188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_018662	ACG	2	6	32218	32223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_018662	CATT	2	8	32238	32245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_018662	T	6	6	32267	32272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018662	TTAT	2	8	32304	32311	25 %	75 %	0 %	0 %	407471913
604	NC_018662	TAC	2	6	32319	32324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471913
605	NC_018662	TCA	2	6	32341	32346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471913
606	NC_018662	ATC	2	6	32434	32439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471913
607	NC_018662	ACA	2	6	32444	32449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471913
608	NC_018662	CGC	2	6	32462	32467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471913
609	NC_018662	TA	3	6	32507	32512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018662	CCG	2	6	32635	32640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471914
611	NC_018662	AAC	2	6	32735	32740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471914
612	NC_018662	TGCTCC	2	12	32896	32907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407471914
613	NC_018662	ATG	2	6	32966	32971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471914
614	NC_018662	GCT	2	6	32992	32997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471914
615	NC_018662	GAT	2	6	33033	33038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471914
616	NC_018662	GCTGAT	2	12	33208	33219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407471915
617	NC_018662	CTC	2	6	33319	33324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471915
618	NC_018662	TGT	2	6	33377	33382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471915
619	NC_018662	A	6	6	33383	33388	100 %	0 %	0 %	0 %	407471915
620	NC_018662	GCT	2	6	33456	33461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
621	NC_018662	CT	3	6	33460	33465	0 %	50 %	0 %	50 %	407471916
622	NC_018662	GAA	2	6	33556	33561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471916
623	NC_018662	GAA	2	6	33568	33573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471916
624	NC_018662	CGT	2	6	33655	33660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
625	NC_018662	CTG	2	6	33682	33687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
626	NC_018662	AAC	2	6	33689	33694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471916
627	NC_018662	TCG	2	6	33771	33776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
628	NC_018662	GAA	2	6	33823	33828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471916
629	NC_018662	AAC	2	6	33884	33889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471916
630	NC_018662	AGC	2	6	33901	33906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471916
631	NC_018662	A	7	7	33936	33942	100 %	0 %	0 %	0 %	407471916
632	NC_018662	TGC	2	6	34144	34149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
633	NC_018662	CGC	2	6	34160	34165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471916
634	NC_018662	ATG	2	6	34169	34174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471916
635	NC_018662	TGA	2	6	34190	34195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471916
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637	NC_018662	GAA	2	6	34251	34256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471916
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